MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_021812	TGC	2	6	3037242	3037247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828728
64003	NC_021812	GGGT	2	8	3037262	3037269	0 %	25 %	75 %	0 %	525828728
64004	NC_021812	GTG	2	6	3037316	3037321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828728
64005	NC_021812	GGC	2	6	3037363	3037368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828728
64006	NC_021812	GC	3	6	3037367	3037372	0 %	0 %	50 %	50 %	525828728
64007	NC_021812	CGGC	2	8	3037376	3037383	0 %	0 %	50 %	50 %	525828728
64008	NC_021812	CGG	2	6	3037548	3037553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828728
64009	NC_021812	TATGG	2	10	3037598	3037607	20 %	40 %	40 %	0 %	525828728
64010	NC_021812	CTG	2	6	3037613	3037618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828728
64011	NC_021812	CTG	3	9	3037697	3037705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828728
64012	NC_021812	CG	3	6	3037719	3037724	0 %	0 %	50 %	50 %	525828728
64013	NC_021812	AAAC	2	8	3037747	3037754	75 %	0 %	0 %	25 %	525828728
64014	NC_021812	ACCA	2	8	3037826	3037833	50 %	0 %	0 %	50 %	525828728
64015	NC_021812	GCT	2	6	3037870	3037875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828728
64016	NC_021812	GGGC	2	8	3037882	3037889	0 %	0 %	75 %	25 %	525828728
64017	NC_021812	CGG	4	12	3037941	3037952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828728
64018	NC_021812	TCGCA	2	10	3038000	3038009	20 %	20 %	20 %	40 %	525828728
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64020	NC_021812	GCG	2	6	3038107	3038112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828728
64021	NC_021812	G	6	6	3038117	3038122	0 %	0 %	100 %	0 %	525828728
64022	NC_021812	CG	3	6	3038219	3038224	0 %	0 %	50 %	50 %	525828728
64023	NC_021812	TGT	2	6	3038241	3038246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828728
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64035	NC_021812	CTGG	2	8	3038888	3038895	0 %	25 %	50 %	25 %	525828729
64036	NC_021812	GGCG	2	8	3038952	3038959	0 %	0 %	75 %	25 %	525828729
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64039	NC_021812	GC	3	6	3038982	3038987	0 %	0 %	50 %	50 %	525828729
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64086	NC_021812	A	7	7	3041247	3041253	100 %	0 %	0 %	0 %	525828730
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64102	NC_021812	CAT	2	6	3042103	3042108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828731
64103	NC_021812	AT	3	6	3042107	3042112	50 %	50 %	0 %	0 %	525828731
64104	NC_021812	TCA	2	6	3042113	3042118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828731
64105	NC_021812	ATT	2	6	3042160	3042165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828731
64106	NC_021812	GAT	2	6	3042166	3042171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828731
64107	NC_021812	ATA	2	6	3042215	3042220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828731
64108	NC_021812	TTA	2	6	3042317	3042322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828731
64109	NC_021812	ATG	2	6	3042337	3042342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828731
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64111	NC_021812	GTCG	2	8	3042408	3042415	0 %	25 %	50 %	25 %	525828731
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64113	NC_021812	CGG	2	6	3042482	3042487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828731
64114	NC_021812	GACG	2	8	3042495	3042502	25 %	0 %	50 %	25 %	525828731
64115	NC_021812	CAG	2	6	3042565	3042570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828731
64116	NC_021812	CTTG	2	8	3042586	3042593	0 %	50 %	25 %	25 %	525828731
64117	NC_021812	GAT	2	6	3042600	3042605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828731
64118	NC_021812	ATT	2	6	3042748	3042753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830631
64119	NC_021812	ATG	2	6	3042775	3042780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830631
64120	NC_021812	CGC	2	6	3042808	3042813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830631
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64122	NC_021812	TTC	2	6	3042834	3042839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830631
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64124	NC_021812	CCA	2	6	3042961	3042966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830631
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64129	NC_021812	TCT	2	6	3043206	3043211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830631
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64182	NC_021812	CAA	2	6	3045466	3045471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830632
64183	NC_021812	CAG	2	6	3045499	3045504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830632
64184	NC_021812	CGA	2	6	3045522	3045527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830632
64185	NC_021812	CCG	2	6	3045575	3045580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830632
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64187	NC_021812	AAG	2	6	3045636	3045641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830632
64188	NC_021812	GCC	2	6	3045667	3045672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830632
64189	NC_021812	AAT	2	6	3045739	3045744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830632
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64192	NC_021812	CTG	2	6	3045836	3045841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64193	NC_021812	AAGG	2	8	3045896	3045903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64194	NC_021812	TAC	2	6	3046138	3046143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828732
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64200	NC_021812	GTT	2	6	3046514	3046519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828732
64201	NC_021812	TGA	2	6	3046554	3046559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828732
64202	NC_021812	TGG	2	6	3046584	3046589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828732
64203	NC_021812	CAG	2	6	3046591	3046596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828732
64204	NC_021812	TAT	2	6	3046597	3046602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828732
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64215	NC_021812	GAT	2	6	3047087	3047092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828732
64216	NC_021812	CTG	2	6	3047096	3047101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828732
64217	NC_021812	GGC	2	6	3047179	3047184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828732
64218	NC_021812	GCC	2	6	3047192	3047197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828732
64219	NC_021812	GATC	2	8	3047224	3047231	25 %	25 %	25 %	25 %	525828732
64220	NC_021812	TAAA	2	8	3047253	3047260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64221	NC_021812	A	6	6	3047258	3047263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64222	NC_021812	TCTG	2	8	3047285	3047292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64223	NC_021812	TGGG	2	8	3047337	3047344	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64224	NC_021812	T	7	7	3047418	3047424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64225	NC_021812	GCT	2	6	3047455	3047460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64226	NC_021812	ATT	2	6	3047468	3047473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64227	NC_021812	G	6	6	3047485	3047490	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64228	NC_021812	CG	3	6	3047533	3047538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64229	NC_021812	GAG	2	6	3047546	3047551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64230	NC_021812	GGGAAA	2	12	3047614	3047625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64231	NC_021812	TGC	2	6	3047657	3047662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64232	NC_021812	TGG	2	6	3047679	3047684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64233	NC_021812	GGGT	2	8	3047693	3047700	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64234	NC_021812	CG	3	6	3047732	3047737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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64353	NC_021812	ACG	2	6	3053435	3053440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828738
64354	NC_021812	CG	3	6	3053543	3053548	0 %	0 %	50 %	50 %	525828738
64355	NC_021812	GGC	2	6	3053647	3053652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828738
64356	NC_021812	GCG	2	6	3053655	3053660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828738
64357	NC_021812	GGCGC	2	10	3053680	3053689	0 %	0 %	60 %	40 %	525828738
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64359	NC_021812	CG	3	6	3053819	3053824	0 %	0 %	50 %	50 %	525828738
64360	NC_021812	GCT	2	6	3053902	3053907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828738
64361	NC_021812	CTG	2	6	3053911	3053916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828738
64362	NC_021812	TTC	2	6	3053944	3053949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828738
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64365	NC_021812	GCA	2	6	3054033	3054038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828738
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64368	NC_021812	CGC	2	6	3054111	3054116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828738
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64372	NC_021812	GAGGTC	2	12	3054385	3054396	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525828738
64373	NC_021812	AAT	2	6	3054397	3054402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828738
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64375	NC_021812	GCG	3	9	3054441	3054449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828738
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64379	NC_021812	GGT	2	6	3054526	3054531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828738
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64381	NC_021812	CGA	2	6	3054648	3054653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828738
64382	NC_021812	CTT	2	6	3054685	3054690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828738
64383	NC_021812	AGCG	2	8	3054704	3054711	25 %	0 %	50 %	25 %	525828738
64384	NC_021812	CAG	2	6	3054727	3054732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828738
64385	NC_021812	CTG	2	6	3054760	3054765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828738
64386	NC_021812	GTACC	2	10	3054828	3054837	20 %	20 %	20 %	40 %	525828738
64387	NC_021812	TTTC	2	8	3054932	3054939	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64388	NC_021812	AAAT	2	8	3054955	3054962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64389	NC_021812	A	6	6	3054983	3054988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64390	NC_021812	ATTT	2	8	3054991	3054998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64391	NC_021812	CATGG	2	10	3055022	3055031	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64392	NC_021812	CGC	2	6	3055097	3055102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830634
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64434	NC_021812	CGA	2	6	3056520	3056525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830634
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64437	NC_021812	CTGG	2	8	3056577	3056584	0 %	25 %	50 %	25 %	525830634
64438	NC_021812	GCGCG	2	10	3056621	3056630	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64439	NC_021812	ATC	2	6	3056665	3056670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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64441	NC_021812	TTG	2	6	3056850	3056855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64442	NC_021812	A	7	7	3056949	3056955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64443	NC_021812	TGA	2	6	3056956	3056961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828739
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64448	NC_021812	CGG	3	9	3057163	3057171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828739
64449	NC_021812	CGG	2	6	3057220	3057225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828739
64450	NC_021812	ACC	2	6	3057291	3057296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828739
64451	NC_021812	CCCG	2	8	3057332	3057339	0 %	0 %	25 %	75 %	525828739
64452	NC_021812	TGA	2	6	3057347	3057352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828739
64453	NC_021812	TCTG	2	8	3057472	3057479	0 %	50 %	25 %	25 %	525828739
64454	NC_021812	TGC	2	6	3057505	3057510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828739
64455	NC_021812	CG	3	6	3057520	3057525	0 %	0 %	50 %	50 %	525828739
64456	NC_021812	GCA	2	6	3057566	3057571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828739
64457	NC_021812	GAAG	2	8	3057627	3057634	50 %	0 %	50 %	0 %	525828739
64458	NC_021812	GCA	2	6	3057674	3057679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828739
64459	NC_021812	GAT	2	6	3057704	3057709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828739
64460	NC_021812	GGC	2	6	3057722	3057727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828739
64461	NC_021812	CCA	2	6	3057782	3057787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828739
64462	NC_021812	AGC	2	6	3057805	3057810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828739
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64464	NC_021812	TGA	2	6	3057970	3057975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828739
64465	NC_021812	CGAA	2	8	3057978	3057985	50 %	0 %	25 %	25 %	525828739
64466	NC_021812	GAA	2	6	3057989	3057994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828739
64467	NC_021812	CGA	2	6	3058064	3058069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828739
64468	NC_021812	GGC	2	6	3058106	3058111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828739
64469	NC_021812	TGG	2	6	3058123	3058128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828739
64470	NC_021812	GGT	2	6	3058151	3058156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828739
64471	NC_021812	ATC	2	6	3058185	3058190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828740
64472	NC_021812	GCG	2	6	3058216	3058221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64473	NC_021812	GC	3	6	3058298	3058303	0 %	0 %	50 %	50 %	525828740
64474	NC_021812	GCT	2	6	3058313	3058318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828740
64475	NC_021812	CGG	2	6	3058333	3058338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64476	NC_021812	GCG	2	6	3058360	3058365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64477	NC_021812	CGA	2	6	3058379	3058384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828740
64478	NC_021812	CGG	2	6	3058427	3058432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64479	NC_021812	TGC	2	6	3058477	3058482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828740
64480	NC_021812	CGG	2	6	3058538	3058543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64481	NC_021812	CAGC	2	8	3058619	3058626	25 %	0 %	25 %	50 %	525828740
64482	NC_021812	GGC	3	9	3058662	3058670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64483	NC_021812	GCG	3	9	3058671	3058679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64484	NC_021812	GTC	2	6	3058683	3058688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828740
64485	NC_021812	CG	3	6	3058726	3058731	0 %	0 %	50 %	50 %	525828740
64486	NC_021812	CAC	2	6	3058745	3058750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828740
64487	NC_021812	GGC	2	6	3058766	3058771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64488	NC_021812	CGT	2	6	3058841	3058846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828740
64489	NC_021812	CGT	2	6	3058883	3058888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828740
64490	NC_021812	GGC	2	6	3058899	3058904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64491	NC_021812	CGGGC	2	10	3058907	3058916	0 %	0 %	60 %	40 %	525828740
64492	NC_021812	TGA	2	6	3058930	3058935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828740
64493	NC_021812	AAC	2	6	3058945	3058950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828740
64494	NC_021812	CGC	2	6	3058964	3058969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828740
64495	NC_021812	GCG	2	6	3059027	3059032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64496	NC_021812	CGG	3	9	3059047	3059055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828740
64497	NC_021812	CGCTGG	2	12	3059089	3059100	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525828740
64498	NC_021812	TGG	3	9	3059158	3059166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828740
64499	NC_021812	TG	3	6	3059285	3059290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64500	NC_021812	CGA	2	6	3059378	3059383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828741

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