MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_021812	GGT	2	6	2850823	2850828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828620
60002	NC_021812	ATG	2	6	2850983	2850988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828620
60003	NC_021812	GTC	2	6	2851026	2851031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830580
60004	NC_021812	CGG	2	6	2851048	2851053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830580
60005	NC_021812	GTC	2	6	2851107	2851112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830580
60006	NC_021812	CAG	2	6	2851121	2851126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830580
60007	NC_021812	TGA	2	6	2851130	2851135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830580
60008	NC_021812	GCG	2	6	2851344	2851349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830580
60009	NC_021812	TCG	2	6	2851393	2851398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830580
60010	NC_021812	ACATCG	2	12	2851463	2851474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525830580
60011	NC_021812	CGA	2	6	2851511	2851516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830580
60012	NC_021812	CGG	2	6	2851557	2851562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830580
60013	NC_021812	CCG	2	6	2851610	2851615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830580
60014	NC_021812	GCC	2	6	2851632	2851637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830580
60015	NC_021812	CCA	2	6	2851667	2851672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830580
60016	NC_021812	CAT	2	6	2851713	2851718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830580
60017	NC_021812	GC	3	6	2851744	2851749	0 %	0 %	50 %	50 %	525830580
60018	NC_021812	AAT	2	6	2851809	2851814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830580
60019	NC_021812	TGAA	2	8	2851834	2851841	50 %	25 %	25 %	0 %	525830580
60020	NC_021812	GGT	2	6	2851884	2851889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830580
60021	NC_021812	GCGA	2	8	2851890	2851897	25 %	0 %	50 %	25 %	525830580
60022	NC_021812	CGG	2	6	2851916	2851921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830580
60023	NC_021812	T	7	7	2852033	2852039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60024	NC_021812	ATA	2	6	2852053	2852058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60025	NC_021812	AT	3	6	2852075	2852080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60026	NC_021812	ATC	2	6	2852133	2852138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60027	NC_021812	T	6	6	2852147	2852152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60028	NC_021812	AC	3	6	2852174	2852179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60029	NC_021812	GA	3	6	2852210	2852215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60030	NC_021812	TGA	2	6	2852222	2852227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828621
60031	NC_021812	AAC	2	6	2852233	2852238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828621
60032	NC_021812	GTT	2	6	2852376	2852381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828621
60033	NC_021812	CGG	2	6	2852420	2852425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828621
60034	NC_021812	GAC	2	6	2852442	2852447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828621
60035	NC_021812	ATC	2	6	2852491	2852496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828621
60036	NC_021812	GCACC	2	10	2852506	2852515	20 %	0 %	20 %	60 %	525828621
60037	NC_021812	ACC	2	6	2852605	2852610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828621
60038	NC_021812	TGC	2	6	2852615	2852620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828621
60039	NC_021812	AGATC	2	10	2852733	2852742	40 %	20 %	20 %	20 %	525828621
60040	NC_021812	GAA	2	6	2852833	2852838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828621
60041	NC_021812	GCG	2	6	2853088	2853093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60042	NC_021812	CT	3	6	2853102	2853107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60043	NC_021812	TAT	2	6	2853152	2853157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828622
60044	NC_021812	GTG	2	6	2853207	2853212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828622
60045	NC_021812	CAG	2	6	2853225	2853230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828622
60046	NC_021812	GCG	2	6	2853237	2853242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828622
60047	NC_021812	GAC	2	6	2853245	2853250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828622
60048	NC_021812	CAC	2	6	2853296	2853301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828622
60049	NC_021812	TGG	2	6	2853457	2853462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828622
60050	NC_021812	GC	3	6	2853475	2853480	0 %	0 %	50 %	50 %	525828622
60051	NC_021812	GCGT	2	8	2853525	2853532	0 %	25 %	50 %	25 %	525828622
60052	NC_021812	CAA	2	6	2853571	2853576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828622
60053	NC_021812	CAGCGC	2	12	2853582	2853593	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525828622
60054	NC_021812	CGT	2	6	2853616	2853621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60055	NC_021812	ATG	2	6	2853632	2853637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60056	NC_021812	TCT	2	6	2853679	2853684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828623
60057	NC_021812	CGCC	2	8	2853698	2853705	0 %	0 %	25 %	75 %	525828623
60058	NC_021812	GT	4	8	2853750	2853757	0 %	50 %	50 %	0 %	525828623
60059	NC_021812	GAAA	2	8	2853782	2853789	75 %	0 %	25 %	0 %	525828623
60060	NC_021812	CGC	2	6	2853812	2853817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828623
60061	NC_021812	GC	3	6	2853816	2853821	0 %	0 %	50 %	50 %	525828623
60062	NC_021812	GGT	2	6	2853846	2853851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828623
60063	NC_021812	TTC	2	6	2853918	2853923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828623
60064	NC_021812	CGA	2	6	2853934	2853939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828623
60065	NC_021812	TAG	2	6	2853970	2853975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828623
60066	NC_021812	GCA	2	6	2854004	2854009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828623
60067	NC_021812	CAT	2	6	2854035	2854040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828623
60068	NC_021812	GCC	2	6	2854053	2854058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828623
60069	NC_021812	GAT	2	6	2854119	2854124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828623
60070	NC_021812	ATA	2	6	2854177	2854182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828623
60071	NC_021812	GC	3	6	2854200	2854205	0 %	0 %	50 %	50 %	525828623
60072	NC_021812	ATCA	2	8	2854248	2854255	50 %	25 %	0 %	25 %	525828623
60073	NC_021812	TGT	2	6	2854265	2854270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828623
60074	NC_021812	TCA	2	6	2854295	2854300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828623
60075	NC_021812	TCG	2	6	2854306	2854311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828623
60076	NC_021812	GGTTG	2	10	2854326	2854335	0 %	40 %	60 %	0 %	525828623
60077	NC_021812	ATC	2	6	2854354	2854359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828623
60078	NC_021812	TTC	2	6	2854365	2854370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828623
60079	NC_021812	GCA	2	6	2854421	2854426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828623
60080	NC_021812	GC	3	6	2854440	2854445	0 %	0 %	50 %	50 %	525828623
60081	NC_021812	GTC	2	6	2854458	2854463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828623
60082	NC_021812	ATCCC	2	10	2854620	2854629	20 %	20 %	0 %	60 %	525828623
60083	NC_021812	AAT	2	6	2854754	2854759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828623
60084	NC_021812	TG	3	6	2854775	2854780	0 %	50 %	50 %	0 %	525828623
60085	NC_021812	CCG	2	6	2854789	2854794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828623
60086	NC_021812	ATG	2	6	2854801	2854806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828623
60087	NC_021812	GCGT	2	8	2854814	2854821	0 %	25 %	50 %	25 %	525828623
60088	NC_021812	CGT	2	6	2854826	2854831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828623
60089	NC_021812	TCC	2	6	2854837	2854842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525828623
60090	NC_021812	CTGT	2	8	2854920	2854927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60091	NC_021812	GGT	2	6	2854981	2854986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60092	NC_021812	T	6	6	2855023	2855028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60093	NC_021812	GCG	2	6	2855078	2855083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828624
60094	NC_021812	GCCC	2	8	2855084	2855091	0 %	0 %	25 %	75 %	525828624
60095	NC_021812	GAC	2	6	2855093	2855098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828624
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60097	NC_021812	TTG	2	6	2855162	2855167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828624
60098	NC_021812	CGGCTG	2	12	2855227	2855238	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525828624
60099	NC_021812	AGC	3	9	2855361	2855369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828624
60100	NC_021812	CCG	2	6	2855374	2855379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828624
60101	NC_021812	GAG	2	6	2855418	2855423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525828624
60102	NC_021812	CTG	2	6	2855465	2855470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828624
60103	NC_021812	CGC	2	6	2855510	2855515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828624
60104	NC_021812	ATC	2	6	2855538	2855543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828624
60105	NC_021812	ATA	2	6	2855561	2855566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828624
60106	NC_021812	TAT	2	6	2855620	2855625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828624
60107	NC_021812	CGC	2	6	2855666	2855671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828624
60108	NC_021812	CAGG	2	8	2855697	2855704	25 %	0 %	50 %	25 %	525828624
60109	NC_021812	TTG	2	6	2855835	2855840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828624
60110	NC_021812	CCA	2	6	2855975	2855980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828624
60111	NC_021812	GGC	2	6	2855990	2855995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828624
60112	NC_021812	GGT	2	6	2856044	2856049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828624
60113	NC_021812	T	6	6	2856082	2856087	0 %	100 %	0 %	0 %	525828624
60114	NC_021812	GC	3	6	2856112	2856117	0 %	0 %	50 %	50 %	525828624
60115	NC_021812	TAC	2	6	2856170	2856175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828624
60116	NC_021812	AAATA	2	10	2856179	2856188	80 %	20 %	0 %	0 %	525828624
60117	NC_021812	GC	3	6	2856205	2856210	0 %	0 %	50 %	50 %	525828624
60118	NC_021812	GTC	2	6	2856261	2856266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828624
60119	NC_021812	CGC	2	6	2856322	2856327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828624
60120	NC_021812	CGC	2	6	2856427	2856432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828624
60121	NC_021812	TTGG	2	8	2856489	2856496	0 %	50 %	50 %	0 %	525828624
60122	NC_021812	CG	3	6	2856578	2856583	0 %	0 %	50 %	50 %	525828624
60123	NC_021812	TAA	2	6	2856663	2856668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828624
60124	NC_021812	GCG	2	6	2856718	2856723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828624
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60126	NC_021812	AAAC	2	8	2856848	2856855	75 %	0 %	0 %	25 %	525828624
60127	NC_021812	GC	3	6	2856868	2856873	0 %	0 %	50 %	50 %	525828624
60128	NC_021812	ACA	2	6	2856892	2856897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828624
60129	NC_021812	CTG	2	6	2856935	2856940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828624
60130	NC_021812	CG	3	6	2856959	2856964	0 %	0 %	50 %	50 %	525828624
60131	NC_021812	GCA	2	6	2856981	2856986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828624
60132	NC_021812	ATG	2	6	2857045	2857050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828624
60133	NC_021812	GGC	2	6	2857088	2857093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828624
60134	NC_021812	TCA	2	6	2857099	2857104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828624
60135	NC_021812	TCA	2	6	2857127	2857132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830581
60136	NC_021812	CTC	3	9	2857159	2857167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830581
60137	NC_021812	AG	3	6	2857171	2857176	50 %	0 %	50 %	0 %	525830581
60138	NC_021812	AGG	2	6	2857183	2857188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830581
60139	NC_021812	CGA	2	6	2857204	2857209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830581
60140	NC_021812	A	7	7	2857215	2857221	100 %	0 %	0 %	0 %	525830581
60141	NC_021812	CAC	2	6	2857241	2857246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830581
60142	NC_021812	ATT	2	6	2857258	2857263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830581
60143	NC_021812	CGA	2	6	2857436	2857441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830581
60144	NC_021812	ACGC	2	8	2857502	2857509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60145	NC_021812	A	7	7	2857645	2857651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60146	NC_021812	GC	4	8	2857762	2857769	0 %	0 %	50 %	50 %	525830582
60147	NC_021812	CGT	2	6	2857820	2857825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830582
60148	NC_021812	TGG	2	6	2857875	2857880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830582
60149	NC_021812	CGA	2	6	2857881	2857886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830582
60150	NC_021812	GGC	3	9	2857888	2857896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830582
60151	NC_021812	GTA	2	6	2857929	2857934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830582
60152	NC_021812	GAG	2	6	2858024	2858029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830582
60153	NC_021812	CG	3	6	2858091	2858096	0 %	0 %	50 %	50 %	525830582
60154	NC_021812	GAT	2	6	2858137	2858142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830582
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60157	NC_021812	TG	3	6	2858246	2858251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60158	NC_021812	ACA	2	6	2858305	2858310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830583
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60181	NC_021812	AT	3	6	2859486	2859491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60182	NC_021812	ATG	2	6	2859554	2859559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60183	NC_021812	ATT	2	6	2859564	2859569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60184	NC_021812	TCA	2	6	2859595	2859600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60185	NC_021812	CGG	2	6	2859608	2859613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60186	NC_021812	TA	3	6	2859636	2859641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60187	NC_021812	T	6	6	2859648	2859653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60188	NC_021812	CGATCG	2	12	2859671	2859682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60189	NC_021812	T	6	6	2859684	2859689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60190	NC_021812	T	7	7	2859708	2859714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60191	NC_021812	CGA	2	6	2859930	2859935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828625
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60193	NC_021812	GCA	2	6	2860050	2860055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828625
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60200	NC_021812	GCC	2	6	2860303	2860308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828625
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60203	NC_021812	TGG	2	6	2860487	2860492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828625
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60211	NC_021812	CAG	2	6	2861029	2861034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828625
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60214	NC_021812	ATAA	2	8	2861159	2861166	75 %	25 %	0 %	0 %	525828625
60215	NC_021812	GATC	2	8	2861277	2861284	25 %	25 %	25 %	25 %	525828626
60216	NC_021812	GTG	2	6	2861406	2861411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828626
60217	NC_021812	CAG	2	6	2861524	2861529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828626
60218	NC_021812	GACG	2	8	2861557	2861564	25 %	0 %	50 %	25 %	525828626
60219	NC_021812	CTGG	2	8	2861583	2861590	0 %	25 %	50 %	25 %	525828626
60220	NC_021812	TGA	2	6	2861630	2861635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828626
60221	NC_021812	CTG	2	6	2861713	2861718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828626
60222	NC_021812	GCG	2	6	2861776	2861781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828626
60223	NC_021812	CAG	2	6	2861854	2861859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828626
60224	NC_021812	TGC	2	6	2861900	2861905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828626
60225	NC_021812	CAG	2	6	2861933	2861938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828626
60226	NC_021812	TGG	2	6	2861945	2861950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828626
60227	NC_021812	GCG	3	9	2861954	2861962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828626
60228	NC_021812	GCC	2	6	2862145	2862150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828626
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60230	NC_021812	GCC	2	6	2862208	2862213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828626
60231	NC_021812	CAG	2	6	2862217	2862222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828626
60232	NC_021812	CGC	2	6	2862278	2862283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828626
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60234	NC_021812	CGG	2	6	2862338	2862343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828626
60235	NC_021812	GCGG	2	8	2862351	2862358	0 %	0 %	75 %	25 %	525828626
60236	NC_021812	GCG	2	6	2862413	2862418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828626
60237	NC_021812	CGG	3	9	2862444	2862452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828626
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60246	NC_021812	TAT	2	6	2862818	2862823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60249	NC_021812	GC	3	6	2862910	2862915	0 %	0 %	50 %	50 %	525830584
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