MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59501	NC_021812	T	7	7	2827392	2827398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59502	NC_021812	GAT	2	6	2827403	2827408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59503	NC_021812	A	6	6	2827466	2827471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59504	NC_021812	TA	3	6	2827553	2827558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59505	NC_021812	TCC	2	6	2827615	2827620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59506	NC_021812	ACA	2	6	2827732	2827737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828602
59507	NC_021812	CACG	2	8	2827745	2827752	25 %	0 %	25 %	50 %	525828602
59508	NC_021812	TTC	2	6	2827756	2827761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828602
59509	NC_021812	T	6	6	2827785	2827790	0 %	100 %	0 %	0 %	525828602
59510	NC_021812	CG	3	6	2827797	2827802	0 %	0 %	50 %	50 %	525828602
59511	NC_021812	TCA	2	6	2827817	2827822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828602
59512	NC_021812	CTT	2	6	2827832	2827837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828602
59513	NC_021812	TCTTTT	2	12	2827894	2827905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525828602
59514	NC_021812	CGG	2	6	2827925	2827930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828602
59515	NC_021812	AG	4	8	2827939	2827946	50 %	0 %	50 %	0 %	525828602
59516	NC_021812	CCTG	2	8	2827948	2827955	0 %	25 %	25 %	50 %	525828602
59517	NC_021812	TGG	2	6	2827957	2827962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828602
59518	NC_021812	T	7	7	2828002	2828008	0 %	100 %	0 %	0 %	525828602
59519	NC_021812	CTT	2	6	2828012	2828017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828602
59520	NC_021812	GATA	2	8	2828045	2828052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59521	NC_021812	GC	3	6	2828064	2828069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59522	NC_021812	AGTG	2	8	2828070	2828077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59523	NC_021812	TTC	2	6	2828079	2828084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59524	NC_021812	ATT	2	6	2828134	2828139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59525	NC_021812	GAAA	2	8	2828174	2828181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59526	NC_021812	GGA	2	6	2828300	2828305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59527	NC_021812	CTT	2	6	2828339	2828344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828603
59528	NC_021812	CCAG	2	8	2828373	2828380	25 %	0 %	25 %	50 %	525828603
59529	NC_021812	CGC	3	9	2828406	2828414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828603
59530	NC_021812	TTCC	2	8	2828424	2828431	0 %	50 %	0 %	50 %	525828603
59531	NC_021812	GC	3	6	2828448	2828453	0 %	0 %	50 %	50 %	525828603
59532	NC_021812	ATTT	2	8	2828456	2828463	25 %	75 %	0 %	0 %	525828603
59533	NC_021812	CGG	2	6	2828483	2828488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828603
59534	NC_021812	AGA	3	9	2828503	2828511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828603
59535	NC_021812	CGG	2	6	2828522	2828527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59536	NC_021812	T	6	6	2828547	2828552	0 %	100 %	0 %	0 %	525828604
59537	NC_021812	AG	4	8	2828580	2828587	50 %	0 %	50 %	0 %	525828604
59538	NC_021812	TCG	2	6	2828593	2828598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828604
59539	NC_021812	CTG	2	6	2828609	2828614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828604
59540	NC_021812	GCG	4	12	2828665	2828676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828604
59541	NC_021812	GCAGT	2	10	2828690	2828699	20 %	20 %	40 %	20 %	525828604
59542	NC_021812	TCG	2	6	2828724	2828729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828604
59543	NC_021812	CGT	2	6	2828749	2828754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828604
59544	NC_021812	GTC	2	6	2828912	2828917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828604
59545	NC_021812	CGG	2	6	2828971	2828976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828604
59546	NC_021812	ATT	2	6	2829054	2829059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828604
59547	NC_021812	CCA	2	6	2829153	2829158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828605
59548	NC_021812	GCC	2	6	2829227	2829232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828605
59549	NC_021812	CCTGCG	2	12	2829237	2829248	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525828605
59550	NC_021812	CGC	3	9	2829274	2829282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828605
59551	NC_021812	AGC	2	6	2829332	2829337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828605
59552	NC_021812	CGC	2	6	2829498	2829503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828605
59553	NC_021812	TTC	2	6	2829505	2829510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828605
59554	NC_021812	CAC	2	6	2829523	2829528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828605
59555	NC_021812	CG	3	6	2829529	2829534	0 %	0 %	50 %	50 %	525828605
59556	NC_021812	TGA	2	6	2829569	2829574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828605
59557	NC_021812	CGA	2	6	2829714	2829719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828605
59558	NC_021812	GCGGAA	2	12	2829767	2829778	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525828605
59559	NC_021812	GGC	2	6	2829779	2829784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828605
59560	NC_021812	CGG	2	6	2829798	2829803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828605
59561	NC_021812	TCA	2	6	2829861	2829866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828605
59562	NC_021812	GTG	2	6	2829884	2829889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828605
59563	NC_021812	GAT	2	6	2829913	2829918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828605
59564	NC_021812	CAC	2	6	2829994	2829999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828605
59565	NC_021812	GTG	2	6	2830013	2830018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828605
59566	NC_021812	ACA	2	6	2830046	2830051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828605
59567	NC_021812	TGC	2	6	2830062	2830067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828605
59568	NC_021812	CAGC	2	8	2830203	2830210	25 %	0 %	25 %	50 %	525828605
59569	NC_021812	CTC	2	6	2830389	2830394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59570	NC_021812	GCC	2	6	2830444	2830449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59571	NC_021812	T	6	6	2830493	2830498	0 %	100 %	0 %	0 %	525830578
59572	NC_021812	CAG	2	6	2830505	2830510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830578
59573	NC_021812	TGG	2	6	2830531	2830536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830578
59574	NC_021812	TCA	2	6	2830563	2830568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830578
59575	NC_021812	TGA	2	6	2830591	2830596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830578
59576	NC_021812	GCG	2	6	2830620	2830625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830578
59577	NC_021812	TCT	3	9	2830653	2830661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830578
59578	NC_021812	TACCG	2	10	2830733	2830742	20 %	20 %	20 %	40 %	525830578
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59580	NC_021812	GTT	2	6	2830843	2830848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830578
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59582	NC_021812	GTT	2	6	2830928	2830933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830578
59583	NC_021812	CTC	2	6	2830940	2830945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830578
59584	NC_021812	TGC	2	6	2831067	2831072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830578
59585	NC_021812	CG	3	6	2831093	2831098	0 %	0 %	50 %	50 %	525830578
59586	NC_021812	GGTCA	2	10	2831102	2831111	20 %	20 %	40 %	20 %	525830578
59587	NC_021812	CGG	2	6	2831138	2831143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830578
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59589	NC_021812	GCC	2	6	2831304	2831309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830578
59590	NC_021812	TCATG	2	10	2831338	2831347	20 %	40 %	20 %	20 %	525830578
59591	NC_021812	ACG	2	6	2831351	2831356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830578
59592	NC_021812	TCT	3	9	2831376	2831384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830578
59593	NC_021812	CAG	2	6	2831402	2831407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830578
59594	NC_021812	GCC	2	6	2831439	2831444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830578
59595	NC_021812	GA	3	6	2831524	2831529	50 %	0 %	50 %	0 %	525830578
59596	NC_021812	CCG	2	6	2831535	2831540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830578
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59599	NC_021812	GCCGC	2	10	2831664	2831673	0 %	0 %	40 %	60 %	525830578
59600	NC_021812	GAA	2	6	2831702	2831707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830578
59601	NC_021812	CAG	2	6	2831717	2831722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830578
59602	NC_021812	GAA	2	6	2831759	2831764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830578
59603	NC_021812	CTG	2	6	2831789	2831794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830578
59604	NC_021812	CAA	2	6	2831860	2831865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830578
59605	NC_021812	GCA	2	6	2831881	2831886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830578
59606	NC_021812	CCA	2	6	2831896	2831901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830578
59607	NC_021812	CGCC	2	8	2831911	2831918	0 %	0 %	25 %	75 %	525830578
59608	NC_021812	CCG	2	6	2831944	2831949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830578
59609	NC_021812	GTT	2	6	2832008	2832013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830578
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59614	NC_021812	GAC	2	6	2832193	2832198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830578
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59616	NC_021812	GCA	2	6	2832223	2832228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830578
59617	NC_021812	ATC	2	6	2832237	2832242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830578
59618	NC_021812	ACCA	2	8	2832245	2832252	50 %	0 %	0 %	50 %	525830578
59619	NC_021812	ACC	2	6	2832277	2832282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830578
59620	NC_021812	AATA	2	8	2832290	2832297	75 %	25 %	0 %	0 %	525830578
59621	NC_021812	ATA	2	6	2832306	2832311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830578
59622	NC_021812	CTT	2	6	2832414	2832419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59623	NC_021812	TGTAG	2	10	2832485	2832494	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59624	NC_021812	AG	3	6	2832578	2832583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59625	NC_021812	A	7	7	2832620	2832626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59626	NC_021812	TTG	2	6	2832697	2832702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59627	NC_021812	CCT	2	6	2832806	2832811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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59655	NC_021812	CGG	2	6	2834125	2834130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828607
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59735	NC_021812	TGC	2	6	2837589	2837594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828609
59736	NC_021812	CGT	2	6	2837635	2837640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828609
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59967	NC_021812	TTA	2	6	2848993	2848998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828618
59968	NC_021812	CAG	2	6	2849177	2849182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828618
59969	NC_021812	CCA	2	6	2849218	2849223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828618
59970	NC_021812	CAA	2	6	2849260	2849265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828618
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59997	NC_021812	TAA	2	6	2850694	2850699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828620
59998	NC_021812	TGATT	2	10	2850708	2850717	20 %	60 %	20 %	0 %	525828620
59999	NC_021812	GCG	2	6	2850784	2850789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828620
60000	NC_021812	CAG	2	6	2850810	2850815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828620

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