MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_021812	TTA	3	9	2754025	2754033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58002	NC_021812	T	6	6	2754049	2754054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58003	NC_021812	TCA	2	6	2754102	2754107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58004	NC_021812	CTT	2	6	2754109	2754114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58005	NC_021812	AGG	2	6	2754160	2754165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58006	NC_021812	TAATGC	2	12	2754168	2754179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58007	NC_021812	TGA	2	6	2754328	2754333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58008	NC_021812	AGTC	2	8	2754398	2754405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58009	NC_021812	A	6	6	2754585	2754590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58010	NC_021812	AG	3	6	2754647	2754652	50 %	0 %	50 %	0 %	525830566
58011	NC_021812	TAC	2	6	2754760	2754765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58012	NC_021812	ACG	2	6	2754802	2754807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58013	NC_021812	TTG	2	6	2754871	2754876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58014	NC_021812	CTT	2	6	2755003	2755008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830567
58015	NC_021812	GTT	3	9	2755018	2755026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830567
58016	NC_021812	CTG	2	6	2755163	2755168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830567
58017	NC_021812	ACG	3	9	2755169	2755177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830567
58018	NC_021812	TGAG	2	8	2755242	2755249	25 %	25 %	50 %	0 %	525830567
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58021	NC_021812	GGCT	2	8	2755320	2755327	0 %	25 %	50 %	25 %	525830567
58022	NC_021812	TGA	2	6	2755341	2755346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830567
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58025	NC_021812	CGG	2	6	2755444	2755449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830567
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58029	NC_021812	CG	3	6	2755654	2755659	0 %	0 %	50 %	50 %	525830567
58030	NC_021812	GAAC	2	8	2755662	2755669	50 %	0 %	25 %	25 %	525830567
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58032	NC_021812	GTAA	2	8	2755753	2755760	50 %	25 %	25 %	0 %	525830567
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58035	NC_021812	TTA	2	6	2756051	2756056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58036	NC_021812	TCAT	2	8	2756112	2756119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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58045	NC_021812	TGCGC	2	10	2756683	2756692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58046	NC_021812	TGC	3	9	2756708	2756716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58047	NC_021812	GGC	2	6	2756776	2756781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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58050	NC_021812	CTT	2	6	2757006	2757011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58051	NC_021812	GAACAC	2	12	2757021	2757032	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58052	NC_021812	CTT	2	6	2757033	2757038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58053	NC_021812	TG	3	6	2757065	2757070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58054	NC_021812	CTG	2	6	2757277	2757282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58055	NC_021812	GTT	2	6	2757315	2757320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58056	NC_021812	GCC	2	6	2757341	2757346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58057	NC_021812	GCG	2	6	2757360	2757365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58058	NC_021812	GAC	2	6	2757446	2757451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58059	NC_021812	TCT	2	6	2757494	2757499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58063	NC_021812	TAA	2	6	2757849	2757854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58064	NC_021812	T	6	6	2757954	2757959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58069	NC_021812	ATC	2	6	2758168	2758173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58072	NC_021812	TAA	2	6	2758207	2758212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58073	NC_021812	TAC	2	6	2758225	2758230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58099	NC_021812	T	6	6	2759210	2759215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58121	NC_021812	TGCG	2	8	2760158	2760165	0 %	25 %	50 %	25 %	525828549
58122	NC_021812	CGG	2	6	2760166	2760171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828549
58123	NC_021812	GAT	2	6	2760175	2760180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828549
58124	NC_021812	CAC	2	6	2760232	2760237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828549
58125	NC_021812	TGG	2	6	2760314	2760319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828549
58126	NC_021812	TTC	2	6	2760356	2760361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828549
58127	NC_021812	TGA	2	6	2760447	2760452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828549
58128	NC_021812	GTT	2	6	2760523	2760528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828549
58129	NC_021812	CGG	2	6	2760553	2760558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828549
58130	NC_021812	GGC	2	6	2760584	2760589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828549
58131	NC_021812	ACG	2	6	2760594	2760599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828549
58132	NC_021812	CGG	2	6	2760600	2760605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828549
58133	NC_021812	CAT	3	9	2760634	2760642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828549
58134	NC_021812	CTG	2	6	2760677	2760682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828549
58135	NC_021812	CTA	2	6	2760703	2760708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828549
58136	NC_021812	GCCGC	2	10	2760925	2760934	0 %	0 %	40 %	60 %	525828550
58137	NC_021812	CGAA	2	8	2760945	2760952	50 %	0 %	25 %	25 %	525828550
58138	NC_021812	GTT	2	6	2760972	2760977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828550
58139	NC_021812	AGGA	2	8	2761001	2761008	50 %	0 %	50 %	0 %	525828550
58140	NC_021812	AAC	2	6	2761105	2761110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828550
58141	NC_021812	CGG	2	6	2761374	2761379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828550
58142	NC_021812	ATC	2	6	2761451	2761456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828550
58143	NC_021812	AGTTC	2	10	2761500	2761509	20 %	40 %	20 %	20 %	525828550
58144	NC_021812	GTC	2	6	2761595	2761600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828550
58145	NC_021812	GCC	2	6	2761608	2761613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828550
58146	NC_021812	ACC	2	6	2761639	2761644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828550
58147	NC_021812	CAC	2	6	2761650	2761655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828550
58148	NC_021812	ACG	2	6	2761661	2761666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828550
58149	NC_021812	GTG	2	6	2761761	2761766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828550
58150	NC_021812	GAT	2	6	2761809	2761814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828550
58151	NC_021812	CGC	2	6	2761816	2761821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828550
58152	NC_021812	TGG	2	6	2762033	2762038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828550
58153	NC_021812	GC	3	6	2762231	2762236	0 %	0 %	50 %	50 %	525828550
58154	NC_021812	GCG	2	6	2762258	2762263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828550
58155	NC_021812	GCG	2	6	2762303	2762308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828550
58156	NC_021812	GGT	2	6	2762396	2762401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828550
58157	NC_021812	GCC	2	6	2762429	2762434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828550
58158	NC_021812	GAC	2	6	2762473	2762478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828550
58159	NC_021812	GTG	2	6	2762491	2762496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828550
58160	NC_021812	CTT	2	6	2762499	2762504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828550
58161	NC_021812	GAT	2	6	2762523	2762528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828550
58162	NC_021812	GCG	2	6	2762548	2762553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828550
58163	NC_021812	ATG	2	6	2762578	2762583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828550
58164	NC_021812	GAT	2	6	2762589	2762594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828550
58165	NC_021812	CAG	2	6	2762773	2762778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828550
58166	NC_021812	CGTG	2	8	2762805	2762812	0 %	25 %	50 %	25 %	525828550
58167	NC_021812	ACT	2	6	2762820	2762825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828550
58168	NC_021812	CAA	2	6	2762835	2762840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828550
58169	NC_021812	GCG	2	6	2762996	2763001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828550
58170	NC_021812	AAGGC	2	10	2763002	2763011	40 %	0 %	40 %	20 %	525828550
58171	NC_021812	GC	3	6	2763010	2763015	0 %	0 %	50 %	50 %	525828550
58172	NC_021812	GTG	2	6	2763121	2763126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828550
58173	NC_021812	CCG	2	6	2763272	2763277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828551
58174	NC_021812	CTG	2	6	2763310	2763315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828551
58175	NC_021812	CTG	2	6	2763445	2763450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828551
58176	NC_021812	CGC	2	6	2763468	2763473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828551
58177	NC_021812	GCG	2	6	2763613	2763618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828551
58178	NC_021812	GCG	2	6	2763647	2763652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828551
58179	NC_021812	TGA	2	6	2763686	2763691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828551
58180	NC_021812	TGT	2	6	2763692	2763697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828551
58181	NC_021812	ATCA	2	8	2763763	2763770	50 %	25 %	0 %	25 %	525828551
58182	NC_021812	T	6	6	2763793	2763798	0 %	100 %	0 %	0 %	525828551
58183	NC_021812	TAAA	2	8	2764043	2764050	75 %	25 %	0 %	0 %	525828551
58184	NC_021812	TCT	2	6	2764094	2764099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828551
58185	NC_021812	GAC	2	6	2764185	2764190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828551
58186	NC_021812	GTA	2	6	2764211	2764216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828551
58187	NC_021812	GCG	2	6	2764218	2764223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828551
58188	NC_021812	CG	3	6	2764335	2764340	0 %	0 %	50 %	50 %	525828551
58189	NC_021812	CGT	2	6	2764419	2764424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828551
58190	NC_021812	CGC	2	6	2764506	2764511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828551
58191	NC_021812	GCG	2	6	2764665	2764670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828551
58192	NC_021812	GATGG	2	10	2764767	2764776	20 %	20 %	60 %	0 %	525828551
58193	NC_021812	GAT	2	6	2764788	2764793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828551
58194	NC_021812	GCA	2	6	2764872	2764877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828551
58195	NC_021812	CAC	2	6	2764897	2764902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828551
58196	NC_021812	CAAT	2	8	2764938	2764945	50 %	25 %	0 %	25 %	525828551
58197	NC_021812	CAG	2	6	2765036	2765041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58198	NC_021812	CGC	3	9	2765055	2765063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58199	NC_021812	CGG	2	6	2765083	2765088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828552
58200	NC_021812	GCC	2	6	2765119	2765124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828552
58201	NC_021812	CG	3	6	2765239	2765244	0 %	0 %	50 %	50 %	525828552
58202	NC_021812	GGC	2	6	2765284	2765289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828552
58203	NC_021812	GCC	2	6	2765317	2765322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828552
58204	NC_021812	TGC	2	6	2765342	2765347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828552
58205	NC_021812	CCG	2	6	2765361	2765366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828552
58206	NC_021812	ATCAGC	2	12	2765384	2765395	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525828552
58207	NC_021812	CGA	2	6	2765397	2765402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828552
58208	NC_021812	GTT	2	6	2765449	2765454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828552
58209	NC_021812	CGC	2	6	2765526	2765531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828552
58210	NC_021812	GCT	2	6	2765568	2765573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828552
58211	NC_021812	ATA	2	6	2765677	2765682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828552
58212	NC_021812	GCC	2	6	2765771	2765776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828552
58213	NC_021812	AAG	2	6	2765790	2765795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828552
58214	NC_021812	CAG	2	6	2765827	2765832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828552
58215	NC_021812	GAT	2	6	2765833	2765838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828552
58216	NC_021812	GAC	2	6	2765848	2765853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828552
58217	NC_021812	GGC	2	6	2765902	2765907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828552
58218	NC_021812	GCC	3	9	2765911	2765919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828552
58219	NC_021812	AAT	2	6	2765956	2765961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828552
58220	NC_021812	CAC	2	6	2765965	2765970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828552
58221	NC_021812	GC	3	6	2766001	2766006	0 %	0 %	50 %	50 %	525828552
58222	NC_021812	GCC	2	6	2766071	2766076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828552
58223	NC_021812	ATC	2	6	2766077	2766082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828552
58224	NC_021812	CGC	2	6	2766096	2766101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828552
58225	NC_021812	TGGA	2	8	2766161	2766168	25 %	25 %	50 %	0 %	525828552
58226	NC_021812	TTTGA	2	10	2766199	2766208	20 %	60 %	20 %	0 %	525828552
58227	NC_021812	ATA	2	6	2766209	2766214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828552
58228	NC_021812	TGC	2	6	2766254	2766259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828552
58229	NC_021812	CAG	2	6	2766331	2766336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828552
58230	NC_021812	GCG	2	6	2766369	2766374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828552
58231	NC_021812	AATT	2	8	2766394	2766401	50 %	50 %	0 %	0 %	525828552
58232	NC_021812	GTG	2	6	2766476	2766481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58233	NC_021812	GCGA	2	8	2766527	2766534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58234	NC_021812	A	6	6	2766550	2766555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58235	NC_021812	TA	3	6	2766572	2766577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58236	NC_021812	A	6	6	2766629	2766634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58237	NC_021812	CGC	2	6	2766722	2766727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828553
58238	NC_021812	TGC	2	6	2766736	2766741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828553
58239	NC_021812	GTCT	2	8	2766764	2766771	0 %	50 %	25 %	25 %	525828553
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58347	NC_021812	GCT	2	6	2770976	2770981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828555
58348	NC_021812	CGCTGG	2	12	2771035	2771046	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525828555
58349	NC_021812	ATC	2	6	2771104	2771109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828555
58350	NC_021812	ATG	3	9	2771113	2771121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828555
58351	NC_021812	AATC	2	8	2771201	2771208	50 %	25 %	0 %	25 %	525828555
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58353	NC_021812	CCG	3	9	2771333	2771341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828555
58354	NC_021812	TAA	2	6	2771556	2771561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830570
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58475	NC_021812	GCC	2	6	2778240	2778245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828560
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