MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57002	NC_021812	GCA	2	6	2706575	2706580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830558
57003	NC_021812	TGGG	2	8	2706600	2706607	0 %	25 %	75 %	0 %	525830558
57004	NC_021812	A	6	6	2706690	2706695	100 %	0 %	0 %	0 %	525830558
57005	NC_021812	GAA	2	6	2706744	2706749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830558
57006	NC_021812	GAT	2	6	2706788	2706793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830558
57007	NC_021812	CAGC	2	8	2706883	2706890	25 %	0 %	25 %	50 %	525830558
57008	NC_021812	TCA	2	6	2706918	2706923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828510
57009	NC_021812	GCA	2	6	2706954	2706959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828510
57010	NC_021812	CCG	2	6	2707004	2707009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828510
57011	NC_021812	GC	3	6	2707014	2707019	0 %	0 %	50 %	50 %	525828510
57012	NC_021812	CGC	2	6	2707056	2707061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828510
57013	NC_021812	TGG	2	6	2707062	2707067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828510
57014	NC_021812	GAA	2	6	2707093	2707098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828510
57015	NC_021812	CAGCG	2	10	2707102	2707111	20 %	0 %	40 %	40 %	525828510
57016	NC_021812	TCA	2	6	2707134	2707139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828510
57017	NC_021812	CAT	2	6	2707162	2707167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828510
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57044	NC_021812	A	6	6	2708051	2708056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57104	NC_021812	GC	3	6	2710956	2710961	0 %	0 %	50 %	50 %	525828512
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57118	NC_021812	CAA	2	6	2711413	2711418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828512
57119	NC_021812	TGA	3	9	2711448	2711456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828512
57120	NC_021812	ATC	2	6	2711504	2711509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828512
57121	NC_021812	TGA	2	6	2711511	2711516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828512
57122	NC_021812	ACG	2	6	2711520	2711525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828512
57123	NC_021812	GCG	2	6	2711579	2711584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828512
57124	NC_021812	GCC	2	6	2711618	2711623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828512
57125	NC_021812	GGC	2	6	2711671	2711676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828512
57126	NC_021812	TCG	2	6	2711692	2711697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828512
57127	NC_021812	AGA	2	6	2711734	2711739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828512
57128	NC_021812	GCC	2	6	2711758	2711763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828512
57129	NC_021812	TGG	2	6	2711784	2711789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828512
57130	NC_021812	TGA	2	6	2711862	2711867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828513
57131	NC_021812	GAT	2	6	2711992	2711997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828513
57132	NC_021812	GGT	2	6	2712031	2712036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828513
57133	NC_021812	CCA	2	6	2712054	2712059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828513
57134	NC_021812	T	6	6	2712080	2712085	0 %	100 %	0 %	0 %	525828513
57135	NC_021812	TGA	2	6	2712116	2712121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828514
57136	NC_021812	TCA	2	6	2712229	2712234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828514
57137	NC_021812	GGC	2	6	2712294	2712299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828514
57138	NC_021812	ATC	2	6	2712303	2712308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828514
57139	NC_021812	CGC	2	6	2712344	2712349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828514
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57141	NC_021812	CAT	2	6	2712407	2712412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828514
57142	NC_021812	GCC	2	6	2712441	2712446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828514
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57144	NC_021812	ATC	2	6	2712528	2712533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828514
57145	NC_021812	A	8	8	2712576	2712583	100 %	0 %	0 %	0 %	525828514
57146	NC_021812	CGG	2	6	2712608	2712613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828514
57147	NC_021812	GTC	2	6	2712633	2712638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828514
57148	NC_021812	GAT	2	6	2712641	2712646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828514
57149	NC_021812	GCC	2	6	2712711	2712716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828514
57150	NC_021812	AGC	2	6	2712718	2712723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828514
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57152	NC_021812	TCA	2	6	2712770	2712775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828514
57153	NC_021812	CG	3	6	2712793	2712798	0 %	0 %	50 %	50 %	525828514
57154	NC_021812	TGT	2	6	2712898	2712903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57155	NC_021812	ACT	2	6	2712954	2712959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57156	NC_021812	AATA	2	8	2713010	2713017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57157	NC_021812	TGG	2	6	2713231	2713236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828515
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57159	NC_021812	AAG	2	6	2713267	2713272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828515
57160	NC_021812	GCG	2	6	2713309	2713314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828515
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57168	NC_021812	ATCG	2	8	2713563	2713570	25 %	25 %	25 %	25 %	525828515
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57170	NC_021812	A	7	7	2713586	2713592	100 %	0 %	0 %	0 %	525828515
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57172	NC_021812	ATT	2	6	2713851	2713856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828515
57173	NC_021812	GC	3	6	2713876	2713881	0 %	0 %	50 %	50 %	525828515
57174	NC_021812	GCG	2	6	2713945	2713950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828515
57175	NC_021812	TAC	2	6	2713983	2713988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828515
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57179	NC_021812	A	7	7	2714391	2714397	100 %	0 %	0 %	0 %	525828516
57180	NC_021812	CGG	2	6	2714542	2714547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828516
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57185	NC_021812	T	6	6	2715051	2715056	0 %	100 %	0 %	0 %	525828516
57186	NC_021812	TGA	2	6	2715082	2715087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828516
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57188	NC_021812	TGGCGC	2	12	2715154	2715165	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525828516
57189	NC_021812	CTG	2	6	2715218	2715223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828516
57190	NC_021812	CGGCG	2	10	2715308	2715317	0 %	0 %	60 %	40 %	525828516
57191	NC_021812	GAG	2	6	2715469	2715474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525828516
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57195	NC_021812	TTACGG	2	12	2715555	2715566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525828517
57196	NC_021812	GCG	2	6	2715582	2715587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828517
57197	NC_021812	GAT	2	6	2715649	2715654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828517
57198	NC_021812	GTG	2	6	2715728	2715733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828517
57199	NC_021812	TTGCT	2	10	2715745	2715754	0 %	60 %	20 %	20 %	525828517
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57202	NC_021812	CTGG	2	8	2715847	2715854	0 %	25 %	50 %	25 %	525828517
57203	NC_021812	TCA	2	6	2715913	2715918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828517
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57206	NC_021812	TGGC	2	8	2716136	2716143	0 %	25 %	50 %	25 %	525828517
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57210	NC_021812	GCC	2	6	2716370	2716375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828517
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57213	NC_021812	GCA	2	6	2716453	2716458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828517
57214	NC_021812	CG	3	6	2716516	2716521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57215	NC_021812	T	8	8	2716543	2716550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57216	NC_021812	CGA	2	6	2716590	2716595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828518
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57218	NC_021812	GCG	2	6	2716706	2716711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828518
57219	NC_021812	GTAT	2	8	2716717	2716724	25 %	50 %	25 %	0 %	525828518
57220	NC_021812	GCT	2	6	2716761	2716766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828518
57221	NC_021812	CGA	2	6	2716790	2716795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828518
57222	NC_021812	TGG	2	6	2716826	2716831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828518
57223	NC_021812	GC	4	8	2716850	2716857	0 %	0 %	50 %	50 %	525828518
57224	NC_021812	TC	3	6	2716863	2716868	0 %	50 %	0 %	50 %	525828518
57225	NC_021812	CGC	2	6	2716896	2716901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828518
57226	NC_021812	GCT	2	6	2716925	2716930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828518
57227	NC_021812	GGC	2	6	2716959	2716964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828518
57228	NC_021812	GCC	2	6	2717044	2717049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828518
57229	NC_021812	CG	3	6	2717086	2717091	0 %	0 %	50 %	50 %	525828518
57230	NC_021812	CTG	2	6	2717095	2717100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828518
57231	NC_021812	T	7	7	2717169	2717175	0 %	100 %	0 %	0 %	525828519
57232	NC_021812	GTT	2	6	2717190	2717195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828519
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57234	NC_021812	TCT	2	6	2717209	2717214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828519
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57237	NC_021812	TGC	2	6	2717314	2717319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828519
57238	NC_021812	CG	3	6	2717326	2717331	0 %	0 %	50 %	50 %	525828519
57239	NC_021812	GCT	2	6	2717363	2717368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828519
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57304	NC_021812	CTAC	2	8	2720315	2720322	25 %	25 %	0 %	50 %	525828521
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57330	NC_021812	TG	3	6	2721536	2721541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57331	NC_021812	T	6	6	2721577	2721582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57332	NC_021812	TAA	2	6	2721640	2721645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830560
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57342	NC_021812	T	6	6	2722141	2722146	0 %	100 %	0 %	0 %	525828522
57343	NC_021812	ATGA	2	8	2722212	2722219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57344	NC_021812	GCG	2	6	2722231	2722236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57345	NC_021812	TAAA	2	8	2722277	2722284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57346	NC_021812	GCC	2	6	2722290	2722295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57347	NC_021812	ACG	2	6	2722347	2722352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57348	NC_021812	TCA	2	6	2722376	2722381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57349	NC_021812	AT	3	6	2722392	2722397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57350	NC_021812	CCT	2	6	2722449	2722454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57351	NC_021812	GC	3	6	2722523	2722528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57352	NC_021812	CA	3	6	2722554	2722559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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57376	NC_021812	A	6	6	2724061	2724066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57377	NC_021812	ATGA	2	8	2724126	2724133	50 %	25 %	25 %	0 %	525828524
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57471	NC_021812	GCT	2	6	2729462	2729467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830564
57472	NC_021812	CG	3	6	2729549	2729554	0 %	0 %	50 %	50 %	525830564
57473	NC_021812	CGC	2	6	2729612	2729617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830564
57474	NC_021812	TAT	2	6	2729642	2729647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830564
57475	NC_021812	TGGC	2	8	2729648	2729655	0 %	25 %	50 %	25 %	525830564
57476	NC_021812	CGC	2	6	2729669	2729674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830564
57477	NC_021812	GTG	2	6	2729706	2729711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830564
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57479	NC_021812	CTTT	2	8	2729836	2729843	0 %	75 %	0 %	25 %	525830564
57480	NC_021812	CTT	2	6	2729941	2729946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830564
57481	NC_021812	GCT	2	6	2729999	2730004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830564
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57483	NC_021812	TG	3	6	2730032	2730037	0 %	50 %	50 %	0 %	525830564
57484	NC_021812	GGC	3	9	2730056	2730064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830564
57485	NC_021812	TCCA	2	8	2730162	2730169	25 %	25 %	0 %	50 %	525830564
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57490	NC_021812	GGC	2	6	2730296	2730301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830564
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57492	NC_021812	ACG	2	6	2730355	2730360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57493	NC_021812	GTC	2	6	2730364	2730369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57494	NC_021812	AAT	2	6	2730377	2730382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57495	NC_021812	GGC	2	6	2730416	2730421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828529
57496	NC_021812	T	7	7	2730436	2730442	0 %	100 %	0 %	0 %	525828529
57497	NC_021812	ATC	2	6	2730620	2730625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828529
57498	NC_021812	GCT	2	6	2730652	2730657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828529
57499	NC_021812	TGA	2	6	2730727	2730732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828529
57500	NC_021812	CCG	2	6	2730847	2730852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828529

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