MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_021812	CGA	2	6	2663388	2663393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828479
56003	NC_021812	TTC	2	6	2663401	2663406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828479
56004	NC_021812	CTG	2	6	2663455	2663460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828479
56005	NC_021812	CAG	2	6	2663470	2663475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828479
56006	NC_021812	TTGG	2	8	2663543	2663550	0 %	50 %	50 %	0 %	525828479
56007	NC_021812	TGA	2	6	2663603	2663608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828479
56008	NC_021812	A	6	6	2663608	2663613	100 %	0 %	0 %	0 %	525828479
56009	NC_021812	CGTG	2	8	2663682	2663689	0 %	25 %	50 %	25 %	525828479
56010	NC_021812	TGCCAA	2	12	2663718	2663729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525828479
56011	NC_021812	CCGG	2	8	2663735	2663742	0 %	0 %	50 %	50 %	525828479
56012	NC_021812	AGA	2	6	2663825	2663830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828479
56013	NC_021812	CAAAAT	2	12	2663847	2663858	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525828479
56014	NC_021812	ACCA	2	8	2663938	2663945	50 %	0 %	0 %	50 %	525828479
56015	NC_021812	GGCG	2	8	2663974	2663981	0 %	0 %	75 %	25 %	525828479
56016	NC_021812	GAA	2	6	2664031	2664036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828479
56017	NC_021812	AGA	2	6	2664051	2664056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828479
56018	NC_021812	GTC	2	6	2664081	2664086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828479
56019	NC_021812	TTA	2	6	2664122	2664127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828480
56020	NC_021812	CAG	2	6	2664137	2664142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828480
56021	NC_021812	GGC	2	6	2664158	2664163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828480
56022	NC_021812	CTC	2	6	2664194	2664199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525828480
56023	NC_021812	CG	4	8	2664256	2664263	0 %	0 %	50 %	50 %	525828480
56024	NC_021812	CTGC	2	8	2664425	2664432	0 %	25 %	25 %	50 %	525828480
56025	NC_021812	GAC	2	6	2664452	2664457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828480
56026	NC_021812	CTA	2	6	2664550	2664555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828480
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56028	NC_021812	CGG	2	6	2664718	2664723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828480
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56031	NC_021812	TGG	2	6	2664801	2664806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828480
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56033	NC_021812	GCA	2	6	2664902	2664907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828480
56034	NC_021812	GCGT	2	8	2664933	2664940	0 %	25 %	50 %	25 %	525828480
56035	NC_021812	GAA	2	6	2664992	2664997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828480
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56039	NC_021812	GTT	2	6	2665172	2665177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828480
56040	NC_021812	GC	3	6	2665282	2665287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56041	NC_021812	AC	4	8	2665311	2665318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56042	NC_021812	AT	3	6	2665339	2665344	50 %	50 %	0 %	0 %	525828481
56043	NC_021812	CTAT	2	8	2665467	2665474	25 %	50 %	0 %	25 %	525828481
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56049	NC_021812	GGCG	2	8	2665914	2665921	0 %	0 %	75 %	25 %	525828481
56050	NC_021812	CAG	2	6	2665964	2665969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828481
56051	NC_021812	AGAC	2	8	2666022	2666029	50 %	0 %	25 %	25 %	525828481
56052	NC_021812	GC	3	6	2666127	2666132	0 %	0 %	50 %	50 %	525828481
56053	NC_021812	CG	3	6	2666151	2666156	0 %	0 %	50 %	50 %	525828481
56054	NC_021812	GCGG	2	8	2666220	2666227	0 %	0 %	75 %	25 %	525828481
56055	NC_021812	GAT	2	6	2666246	2666251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828481
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56057	NC_021812	CTC	2	6	2666462	2666467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525828482
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56062	NC_021812	TCG	2	6	2666620	2666625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828482
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56088	NC_021812	TGG	2	6	2667709	2667714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828482
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56115	NC_021812	CAC	2	6	2669073	2669078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828483
56116	NC_021812	GCC	2	6	2669092	2669097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828483
56117	NC_021812	ATC	2	6	2669167	2669172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828483
56118	NC_021812	T	7	7	2669234	2669240	0 %	100 %	0 %	0 %	525828483
56119	NC_021812	GTTT	2	8	2669293	2669300	0 %	75 %	25 %	0 %	525828483
56120	NC_021812	T	6	6	2669366	2669371	0 %	100 %	0 %	0 %	525828483
56121	NC_021812	TGC	2	6	2669419	2669424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828483
56122	NC_021812	GAT	2	6	2669439	2669444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828483
56123	NC_021812	GCG	2	6	2669471	2669476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828483
56124	NC_021812	CAA	2	6	2669480	2669485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828483
56125	NC_021812	T	6	6	2669499	2669504	0 %	100 %	0 %	0 %	525828483
56126	NC_021812	CAA	2	6	2669552	2669557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828483
56127	NC_021812	GGC	2	6	2669565	2669570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828483
56128	NC_021812	CAC	2	6	2669604	2669609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828483
56129	NC_021812	GGC	2	6	2669706	2669711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828483
56130	NC_021812	CG	3	6	2669745	2669750	0 %	0 %	50 %	50 %	525828483
56131	NC_021812	CTGC	2	8	2669861	2669868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56132	NC_021812	GCAG	2	8	2669872	2669879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56133	NC_021812	TGGT	2	8	2669903	2669910	0 %	50 %	50 %	0 %	525828484
56134	NC_021812	T	6	6	2669913	2669918	0 %	100 %	0 %	0 %	525828484
56135	NC_021812	TTC	2	6	2669925	2669930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828484
56136	NC_021812	TTC	2	6	2669980	2669985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828484
56137	NC_021812	CAG	2	6	2670024	2670029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828484
56138	NC_021812	CTG	2	6	2670092	2670097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828484
56139	NC_021812	CGC	2	6	2670110	2670115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828484
56140	NC_021812	TTC	2	6	2670166	2670171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828484
56141	NC_021812	GCC	2	6	2670183	2670188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828484
56142	NC_021812	GCC	2	6	2670277	2670282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828484
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56144	NC_021812	TTC	2	6	2670369	2670374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828484
56145	NC_021812	GGT	2	6	2670402	2670407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828484
56146	NC_021812	GCAT	2	8	2670418	2670425	25 %	25 %	25 %	25 %	525828484
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56148	NC_021812	GGC	2	6	2670468	2670473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828484
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56150	NC_021812	GCC	2	6	2670610	2670615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828484
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56152	NC_021812	ACTG	2	8	2670680	2670687	25 %	25 %	25 %	25 %	525828484
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56156	NC_021812	GCC	4	12	2670810	2670821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828484
56157	NC_021812	T	7	7	2670836	2670842	0 %	100 %	0 %	0 %	525828484
56158	NC_021812	T	6	6	2670848	2670853	0 %	100 %	0 %	0 %	525828484
56159	NC_021812	GAT	2	6	2670888	2670893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828484
56160	NC_021812	GGC	2	6	2670897	2670902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828484
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56162	NC_021812	ACC	3	9	2671000	2671008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828484
56163	NC_021812	TGG	2	6	2671022	2671027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828484
56164	NC_021812	AAT	2	6	2671053	2671058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828484
56165	NC_021812	TCA	2	6	2671076	2671081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828484
56166	NC_021812	CTC	2	6	2671086	2671091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56167	NC_021812	TAAT	2	8	2671093	2671100	50 %	50 %	0 %	0 %	525828485
56168	NC_021812	T	6	6	2671102	2671107	0 %	100 %	0 %	0 %	525828485
56169	NC_021812	TGA	2	6	2671146	2671151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828485
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56172	NC_021812	ATAA	2	8	2671196	2671203	75 %	25 %	0 %	0 %	525828485
56173	NC_021812	AG	3	6	2671228	2671233	50 %	0 %	50 %	0 %	525828485
56174	NC_021812	CGC	2	6	2671257	2671262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828485
56175	NC_021812	GGC	2	6	2671264	2671269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828485
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56178	NC_021812	AT	3	6	2671370	2671375	50 %	50 %	0 %	0 %	525828485
56179	NC_021812	CGA	2	6	2671464	2671469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828485
56180	NC_021812	CGG	2	6	2671479	2671484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828485
56181	NC_021812	GACAA	2	10	2671499	2671508	60 %	0 %	20 %	20 %	525828485
56182	NC_021812	GCCA	2	8	2671520	2671527	25 %	0 %	25 %	50 %	525828485
56183	NC_021812	ATC	2	6	2671586	2671591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828485
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56185	NC_021812	GTT	2	6	2671758	2671763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828485
56186	NC_021812	AGC	2	6	2671790	2671795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828485
56187	NC_021812	GCG	2	6	2671817	2671822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828485
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56189	NC_021812	CCA	2	6	2671861	2671866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828485
56190	NC_021812	A	6	6	2671871	2671876	100 %	0 %	0 %	0 %	525828485
56191	NC_021812	GGCG	2	8	2671888	2671895	0 %	0 %	75 %	25 %	525828485
56192	NC_021812	CGAC	2	8	2671896	2671903	25 %	0 %	25 %	50 %	525828485
56193	NC_021812	CGA	2	6	2671908	2671913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828485
56194	NC_021812	TAA	2	6	2671962	2671967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828485
56195	NC_021812	ATA	2	6	2671984	2671989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828485
56196	NC_021812	ATA	2	6	2672024	2672029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828485
56197	NC_021812	ATG	2	6	2672040	2672045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828485
56198	NC_021812	CAT	2	6	2672095	2672100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828485
56199	NC_021812	ATA	2	6	2672136	2672141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828485
56200	NC_021812	TCA	3	9	2672178	2672186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828485
56201	NC_021812	AAG	2	6	2672228	2672233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828485
56202	NC_021812	AATA	2	8	2672281	2672288	75 %	25 %	0 %	0 %	525828485
56203	NC_021812	ACAG	2	8	2672298	2672305	50 %	0 %	25 %	25 %	525828485
56204	NC_021812	G	7	7	2672333	2672339	0 %	0 %	100 %	0 %	525828485
56205	NC_021812	TTG	2	6	2672407	2672412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56206	NC_021812	TGA	2	6	2672452	2672457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56207	NC_021812	AGG	2	6	2672533	2672538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56208	NC_021812	TC	3	6	2672590	2672595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56209	NC_021812	T	6	6	2672609	2672614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56210	NC_021812	ATGG	2	8	2672692	2672699	25 %	25 %	50 %	0 %	525828486
56211	NC_021812	CTG	2	6	2672707	2672712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828486
56212	NC_021812	CAT	2	6	2672721	2672726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828486
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56215	NC_021812	CCGT	2	8	2672796	2672803	0 %	25 %	25 %	50 %	525828486
56216	NC_021812	AAC	2	6	2672843	2672848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828486
56217	NC_021812	ACT	2	6	2672855	2672860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828486
56218	NC_021812	ATG	2	6	2672933	2672938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828486
56219	NC_021812	CTA	2	6	2673033	2673038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828486
56220	NC_021812	ATG	2	6	2673127	2673132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828486
56221	NC_021812	TAA	2	6	2673249	2673254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828486
56222	NC_021812	GAG	2	6	2673301	2673306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525828486
56223	NC_021812	GAT	2	6	2673342	2673347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828486
56224	NC_021812	CCCG	2	8	2673499	2673506	0 %	0 %	25 %	75 %	525828486
56225	NC_021812	TGC	2	6	2673555	2673560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56226	NC_021812	T	7	7	2673564	2673570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56227	NC_021812	GTA	2	6	2673633	2673638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56228	NC_021812	TAC	2	6	2673655	2673660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56229	NC_021812	ACG	2	6	2673676	2673681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56230	NC_021812	TAC	2	6	2673698	2673703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56231	NC_021812	GCG	2	6	2673710	2673715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56232	NC_021812	AG	3	6	2673740	2673745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56233	NC_021812	CT	3	6	2673765	2673770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56234	NC_021812	AGCGGA	2	12	2673857	2673868	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525828487
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56452	NC_021812	TGG	2	6	2684957	2684962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828494
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56455	NC_021812	TGG	2	6	2685070	2685075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828494
56456	NC_021812	GCG	2	6	2685131	2685136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828494
56457	NC_021812	TCA	2	6	2685146	2685151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828494
56458	NC_021812	GTC	2	6	2685163	2685168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56459	NC_021812	CACG	2	8	2685174	2685181	25 %	0 %	25 %	50 %	525828494
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56463	NC_021812	GGCG	2	8	2685438	2685445	0 %	0 %	75 %	25 %	525828494
56464	NC_021812	ATC	2	6	2685457	2685462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828494
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56466	NC_021812	GTGC	2	8	2685471	2685478	0 %	25 %	50 %	25 %	525828494
56467	NC_021812	GCA	2	6	2685486	2685491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56468	NC_021812	ATGG	2	8	2685507	2685514	25 %	25 %	50 %	0 %	525828494
56469	NC_021812	TCG	2	6	2685515	2685520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56470	NC_021812	GGC	2	6	2685525	2685530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828494
56471	NC_021812	GCG	2	6	2685557	2685562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828494
56472	NC_021812	TGGC	2	8	2685573	2685580	0 %	25 %	50 %	25 %	525828494
56473	NC_021812	CGA	2	6	2685641	2685646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56474	NC_021812	CAG	2	6	2685687	2685692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56475	NC_021812	CCG	2	6	2685775	2685780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828494
56476	NC_021812	CAA	2	6	2685826	2685831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828494
56477	NC_021812	ACC	2	6	2685934	2685939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828494
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56479	NC_021812	CGC	2	6	2686016	2686021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828494
56480	NC_021812	TGA	2	6	2686104	2686109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828494
56481	NC_021812	GCTG	2	8	2686115	2686122	0 %	25 %	50 %	25 %	525828494
56482	NC_021812	CAG	2	6	2686147	2686152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56483	NC_021812	ATC	2	6	2686223	2686228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828494
56484	NC_021812	ACG	2	6	2686340	2686345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56485	NC_021812	A	6	6	2686373	2686378	100 %	0 %	0 %	0 %	525828494
56486	NC_021812	GTCC	2	8	2686431	2686438	0 %	25 %	25 %	50 %	525828494
56487	NC_021812	GGC	2	6	2686504	2686509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828494
56488	NC_021812	TTA	2	6	2686523	2686528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828494
56489	NC_021812	GC	4	8	2686544	2686551	0 %	0 %	50 %	50 %	525828494
56490	NC_021812	GGC	2	6	2686684	2686689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828494
56491	NC_021812	GC	3	6	2686772	2686777	0 %	0 %	50 %	50 %	525828494
56492	NC_021812	ACG	2	6	2686780	2686785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56493	NC_021812	TGG	2	6	2686787	2686792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828494
56494	NC_021812	CGGTC	2	10	2686839	2686848	0 %	20 %	40 %	40 %	525828494
56495	NC_021812	AGC	2	6	2686905	2686910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828494
56496	NC_021812	TGGC	2	8	2686949	2686956	0 %	25 %	50 %	25 %	525828495
56497	NC_021812	GAT	2	6	2686979	2686984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828495
56498	NC_021812	CTGG	2	8	2687023	2687030	0 %	25 %	50 %	25 %	525828495
56499	NC_021812	GGC	2	6	2687056	2687061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828495
56500	NC_021812	A	6	6	2687082	2687087	100 %	0 %	0 %	0 %	525828495

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