MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54502	NC_021812	GCG	2	6	2592287	2592292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54503	NC_021812	CAG	2	6	2592354	2592359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830539
54504	NC_021812	GTC	2	6	2592476	2592481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830539
54505	NC_021812	AGGAC	2	10	2592534	2592543	40 %	0 %	40 %	20 %	525830539
54506	NC_021812	TGC	2	6	2592580	2592585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830539
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54508	NC_021812	GCA	3	9	2592717	2592725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828427
54509	NC_021812	AGA	2	6	2592743	2592748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828427
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54511	NC_021812	CGG	2	6	2592785	2592790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828427
54512	NC_021812	GAA	2	6	2592809	2592814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828427
54513	NC_021812	A	6	6	2592837	2592842	100 %	0 %	0 %	0 %	525828427
54514	NC_021812	AGT	2	6	2592896	2592901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828427
54515	NC_021812	CAT	2	6	2592959	2592964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828427
54516	NC_021812	TAAA	2	8	2592980	2592987	75 %	25 %	0 %	0 %	525828427
54517	NC_021812	GGC	2	6	2592997	2593002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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54519	NC_021812	TACC	2	8	2593131	2593138	25 %	25 %	0 %	50 %	525828428
54520	NC_021812	CGT	2	6	2593164	2593169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828428
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54528	NC_021812	CAG	2	6	2593570	2593575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828428
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54543	NC_021812	CCA	2	6	2594097	2594102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828428
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54553	NC_021812	TCG	2	6	2594474	2594479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828428
54554	NC_021812	GCT	2	6	2594514	2594519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828428
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54558	NC_021812	ACA	2	6	2594634	2594639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54583	NC_021812	A	7	7	2595547	2595553	100 %	0 %	0 %	0 %	525828429
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54588	NC_021812	AT	3	6	2595724	2595729	50 %	50 %	0 %	0 %	525828430
54589	NC_021812	GCTT	2	8	2595750	2595757	0 %	50 %	25 %	25 %	525828430
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54601	NC_021812	GA	3	6	2596286	2596291	50 %	0 %	50 %	0 %	525828431
54602	NC_021812	TAACA	2	10	2596303	2596312	60 %	20 %	0 %	20 %	525828431
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54604	NC_021812	ACTTT	2	10	2596510	2596519	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54605	NC_021812	AGAA	2	8	2596556	2596563	75 %	0 %	25 %	0 %	525828432
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54618	NC_021812	AT	3	6	2597192	2597197	50 %	50 %	0 %	0 %	525828432
54619	NC_021812	T	6	6	2597197	2597202	0 %	100 %	0 %	0 %	525828432
54620	NC_021812	CGCCAG	2	12	2597209	2597220	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525828432
54621	NC_021812	CGCA	2	8	2597242	2597249	25 %	0 %	25 %	50 %	525828432
54622	NC_021812	CGC	2	6	2597272	2597277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828432
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54624	NC_021812	GTC	2	6	2597308	2597313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828432
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54630	NC_021812	CGCC	2	8	2597505	2597512	0 %	0 %	25 %	75 %	525828432
54631	NC_021812	GCC	4	12	2597518	2597529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828432
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54634	NC_021812	TGCCC	2	10	2597589	2597598	0 %	20 %	20 %	60 %	525828432
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54637	NC_021812	GCTTTC	2	12	2597666	2597677	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525828432
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54642	NC_021812	GAG	2	6	2597798	2597803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525828432
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54648	NC_021812	GCG	2	6	2597991	2597996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828432
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54650	NC_021812	CG	3	6	2598034	2598039	0 %	0 %	50 %	50 %	525828432
54651	NC_021812	CAT	2	6	2598088	2598093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828432
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54654	NC_021812	CAACTG	2	12	2598264	2598275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525830540
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54683	NC_021812	GTG	3	9	2599915	2599923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830540
54684	NC_021812	TTTA	2	8	2599946	2599953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54685	NC_021812	CTCA	2	8	2600002	2600009	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54686	NC_021812	TAC	2	6	2600021	2600026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54688	NC_021812	ATT	2	6	2600074	2600079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54689	NC_021812	TATT	2	8	2600098	2600105	25 %	75 %	0 %	0 %	525828433
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54703	NC_021812	C	6	6	2600649	2600654	0 %	0 %	0 %	100 %	525828433
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54710	NC_021812	CGT	2	6	2601025	2601030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828433
54711	NC_021812	TTC	2	6	2601036	2601041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54712	NC_021812	TGT	2	6	2601064	2601069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828434
54713	NC_021812	CGAC	2	8	2601143	2601150	25 %	0 %	25 %	50 %	525828434
54714	NC_021812	TCAAT	2	10	2601167	2601176	40 %	40 %	0 %	20 %	525828434
54715	NC_021812	CAC	2	6	2601243	2601248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828434
54716	NC_021812	CAT	2	6	2601309	2601314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828434
54717	NC_021812	GGC	2	6	2601351	2601356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828435
54718	NC_021812	TCG	2	6	2601381	2601386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828435
54719	NC_021812	GGT	2	6	2601527	2601532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828435
54720	NC_021812	TGC	2	6	2601561	2601566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828435
54721	NC_021812	TCA	2	6	2601658	2601663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828435
54722	NC_021812	GC	3	6	2601718	2601723	0 %	0 %	50 %	50 %	525828435
54723	NC_021812	GCC	2	6	2601729	2601734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828435
54724	NC_021812	TGA	2	6	2601772	2601777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828435
54725	NC_021812	CGGG	2	8	2601785	2601792	0 %	0 %	75 %	25 %	525828435
54726	NC_021812	TGC	2	6	2601825	2601830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828435
54727	NC_021812	CGT	2	6	2601839	2601844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828435
54728	NC_021812	CAC	2	6	2601845	2601850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828435
54729	NC_021812	CAA	3	9	2601884	2601892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828435
54730	NC_021812	ATAG	2	8	2601899	2601906	50 %	25 %	25 %	0 %	525828435
54731	NC_021812	GC	3	6	2601942	2601947	0 %	0 %	50 %	50 %	525828435
54732	NC_021812	CCG	2	6	2602063	2602068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828435
54733	NC_021812	TCA	2	6	2602134	2602139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828435
54734	NC_021812	CTGC	2	8	2602321	2602328	0 %	25 %	25 %	50 %	525828435
54735	NC_021812	ACC	2	6	2602340	2602345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828435
54736	NC_021812	T	6	6	2602364	2602369	0 %	100 %	0 %	0 %	525828435
54737	NC_021812	GC	3	6	2602388	2602393	0 %	0 %	50 %	50 %	525828435
54738	NC_021812	GTA	2	6	2602437	2602442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828435
54739	NC_021812	CCA	2	6	2602492	2602497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828435
54740	NC_021812	CCT	2	6	2602624	2602629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525828435
54741	NC_021812	CGA	2	6	2602678	2602683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828435
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54743	NC_021812	GCCAG	2	10	2602710	2602719	20 %	0 %	40 %	40 %	525828435
54744	NC_021812	GCC	2	6	2602797	2602802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828435
54745	NC_021812	CAA	2	6	2602829	2602834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828435
54746	NC_021812	CAC	2	6	2602843	2602848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828435
54747	NC_021812	CGT	2	6	2602861	2602866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828435
54748	NC_021812	GCC	2	6	2602883	2602888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828435
54749	NC_021812	ACC	2	6	2602935	2602940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828435
54750	NC_021812	CGT	2	6	2602969	2602974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54751	NC_021812	CTC	2	6	2603017	2603022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54752	NC_021812	A	8	8	2603041	2603048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54753	NC_021812	ATA	2	6	2603137	2603142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54754	NC_021812	CAC	3	9	2603145	2603153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54755	NC_021812	T	7	7	2603270	2603276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54756	NC_021812	T	6	6	2603321	2603326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54757	NC_021812	TCC	2	6	2603363	2603368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54758	NC_021812	CTT	2	6	2603399	2603404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54759	NC_021812	TTC	2	6	2603421	2603426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54761	NC_021812	A	6	6	2603480	2603485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54762	NC_021812	TCT	2	6	2603510	2603515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54763	NC_021812	AGG	2	6	2603537	2603542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54796	NC_021812	GA	3	6	2605364	2605369	50 %	0 %	50 %	0 %	525828437
54797	NC_021812	GTC	2	6	2605408	2605413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828437
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54800	NC_021812	CGGG	2	8	2605602	2605609	0 %	0 %	75 %	25 %	525828438
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54810	NC_021812	CAG	2	6	2606197	2606202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828438
54811	NC_021812	ATG	2	6	2606388	2606393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54812	NC_021812	AAAAGA	2	12	2606394	2606405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54813	NC_021812	A	9	9	2606451	2606459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54814	NC_021812	ATT	2	6	2606479	2606484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54815	NC_021812	GA	3	6	2606498	2606503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54816	NC_021812	ACGG	2	8	2606578	2606585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54817	NC_021812	CAGG	2	8	2606613	2606620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54818	NC_021812	ACC	2	6	2606795	2606800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54819	NC_021812	GCC	2	6	2606809	2606814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54820	NC_021812	GCG	2	6	2606859	2606864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54821	NC_021812	AGTC	2	8	2606881	2606888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54822	NC_021812	TCCT	2	8	2606905	2606912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54823	NC_021812	GCC	2	6	2606924	2606929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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54825	NC_021812	ATT	2	6	2606944	2606949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54827	NC_021812	AC	3	6	2607070	2607075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54828	NC_021812	CGT	3	9	2607088	2607096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54830	NC_021812	C	6	6	2607274	2607279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54831	NC_021812	ACG	2	6	2607323	2607328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54832	NC_021812	TGA	2	6	2607403	2607408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54833	NC_021812	CCG	2	6	2607431	2607436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54834	NC_021812	ACC	2	6	2607518	2607523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54835	NC_021812	CCT	2	6	2607600	2607605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54836	NC_021812	CTC	2	6	2607637	2607642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54837	NC_021812	AGG	2	6	2607654	2607659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54838	NC_021812	CCA	2	6	2607681	2607686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54839	NC_021812	GGT	2	6	2607741	2607746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54840	NC_021812	CAT	2	6	2607936	2607941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54841	NC_021812	GCC	2	6	2608011	2608016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54842	NC_021812	TAA	2	6	2608136	2608141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54843	NC_021812	CAGC	2	8	2608149	2608156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54844	NC_021812	GACT	2	8	2608167	2608174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54845	NC_021812	TC	3	6	2608265	2608270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54846	NC_021812	ACC	2	6	2608295	2608300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54847	NC_021812	TTG	2	6	2608367	2608372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54848	NC_021812	TCG	2	6	2608391	2608396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54849	NC_021812	AC	4	8	2608435	2608442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54850	NC_021812	C	6	6	2608495	2608500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54851	NC_021812	AC	3	6	2608700	2608705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54852	NC_021812	AACG	2	8	2608737	2608744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54853	NC_021812	TCGCT	2	10	2608784	2608793	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54854	NC_021812	CTTT	2	8	2608914	2608921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54855	NC_021812	ATG	2	6	2608924	2608929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54856	NC_021812	GCT	2	6	2608930	2608935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54857	NC_021812	GTT	2	6	2609020	2609025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54860	NC_021812	TCGGT	2	10	2609266	2609275	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54861	NC_021812	GTAC	2	8	2609478	2609485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54862	NC_021812	GTCA	2	8	2609561	2609568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54863	NC_021812	GGA	2	6	2609584	2609589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54865	NC_021812	CG	3	6	2609686	2609691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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54872	NC_021812	GTT	2	6	2610077	2610082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54979	NC_021812	TCG	2	6	2615187	2615192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828440
54980	NC_021812	CGC	2	6	2615248	2615253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828440
54981	NC_021812	CGC	2	6	2615372	2615377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828440
54982	NC_021812	TCAC	2	8	2615400	2615407	25 %	25 %	0 %	50 %	525828440
54983	NC_021812	TAA	2	6	2615422	2615427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828440
54984	NC_021812	GA	3	6	2615431	2615436	50 %	0 %	50 %	0 %	525828440
54985	NC_021812	TAG	2	6	2615479	2615484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828440
54986	NC_021812	CTG	2	6	2615498	2615503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828441
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54989	NC_021812	CGG	3	9	2615575	2615583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828441
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54994	NC_021812	TCG	2	6	2615811	2615816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828441
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54998	NC_021812	CAG	2	6	2615888	2615893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828441
54999	NC_021812	AGT	2	6	2615936	2615941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828441
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