MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_021812	TCGC	2	8	2546814	2546821	0 %	25 %	25 %	50 %	525828391
53502	NC_021812	GCC	2	6	2546879	2546884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828391
53503	NC_021812	TCG	2	6	2546901	2546906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828391
53504	NC_021812	GGC	2	6	2546938	2546943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828391
53505	NC_021812	CGCC	2	8	2546975	2546982	0 %	0 %	25 %	75 %	525828391
53506	NC_021812	AAGG	2	8	2547060	2547067	50 %	0 %	50 %	0 %	525828391
53507	NC_021812	CGCAC	2	10	2547115	2547124	20 %	0 %	20 %	60 %	525828391
53508	NC_021812	C	6	6	2547159	2547164	0 %	0 %	0 %	100 %	525828391
53509	NC_021812	CTG	2	6	2547215	2547220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828391
53510	NC_021812	CGC	2	6	2547227	2547232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828391
53511	NC_021812	GGT	2	6	2547316	2547321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828391
53512	NC_021812	GAT	2	6	2547323	2547328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828391
53513	NC_021812	TGC	2	6	2547570	2547575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828391
53514	NC_021812	T	6	6	2547617	2547622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53515	NC_021812	CGT	2	6	2547624	2547629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53516	NC_021812	ACACA	2	10	2547635	2547644	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53517	NC_021812	TGG	2	6	2547706	2547711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828392
53518	NC_021812	CTG	2	6	2547736	2547741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828392
53519	NC_021812	GAC	2	6	2547777	2547782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828392
53520	NC_021812	TGG	2	6	2547860	2547865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828392
53521	NC_021812	CGCT	2	8	2547892	2547899	0 %	25 %	25 %	50 %	525828392
53522	NC_021812	CTTAT	2	10	2547935	2547944	20 %	60 %	0 %	20 %	525828392
53523	NC_021812	CTGG	2	8	2547945	2547952	0 %	25 %	50 %	25 %	525828392
53524	NC_021812	GC	3	6	2547966	2547971	0 %	0 %	50 %	50 %	525828392
53525	NC_021812	TCTT	2	8	2548073	2548080	0 %	75 %	0 %	25 %	525828392
53526	NC_021812	GCC	2	6	2548081	2548086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828392
53527	NC_021812	TCA	2	6	2548100	2548105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828392
53528	NC_021812	GCA	2	6	2548110	2548115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828392
53529	NC_021812	CAC	2	6	2548149	2548154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828392
53530	NC_021812	TGG	2	6	2548160	2548165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828392
53531	NC_021812	TGA	2	6	2548175	2548180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828392
53532	NC_021812	GCGCA	2	10	2548198	2548207	20 %	0 %	40 %	40 %	525828392
53533	NC_021812	GCC	2	6	2548210	2548215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828392
53534	NC_021812	GTT	2	6	2548266	2548271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525828392
53535	NC_021812	GC	3	6	2548283	2548288	0 %	0 %	50 %	50 %	525828392
53536	NC_021812	GAT	2	6	2548326	2548331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53537	NC_021812	AAT	2	6	2548363	2548368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828393
53538	NC_021812	CAAA	2	8	2548389	2548396	75 %	0 %	0 %	25 %	525828393
53539	NC_021812	GC	3	6	2548528	2548533	0 %	0 %	50 %	50 %	525828393
53540	NC_021812	A	6	6	2548566	2548571	100 %	0 %	0 %	0 %	525828393
53541	NC_021812	CGC	3	9	2548672	2548680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828393
53542	NC_021812	T	6	6	2548687	2548692	0 %	100 %	0 %	0 %	525828393
53543	NC_021812	GC	3	6	2548695	2548700	0 %	0 %	50 %	50 %	525828393
53544	NC_021812	GCA	2	6	2548704	2548709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828393
53545	NC_021812	GCC	3	9	2548738	2548746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828393
53546	NC_021812	T	6	6	2548776	2548781	0 %	100 %	0 %	0 %	525828393
53547	NC_021812	GAT	2	6	2548783	2548788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828393
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53549	NC_021812	CGCC	2	8	2548812	2548819	0 %	0 %	25 %	75 %	525828393
53550	NC_021812	CGC	2	6	2548830	2548835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828393
53551	NC_021812	CAT	2	6	2548855	2548860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828393
53552	NC_021812	CTT	2	6	2548863	2548868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828393
53553	NC_021812	CAG	2	6	2548884	2548889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828393
53554	NC_021812	GAA	2	6	2548900	2548905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828393
53555	NC_021812	CGGGGC	2	12	2548911	2548922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828393
53556	NC_021812	T	6	6	2549022	2549027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53557	NC_021812	ACT	2	6	2549037	2549042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828394
53558	NC_021812	TCA	2	6	2549048	2549053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828394
53559	NC_021812	GC	3	6	2549064	2549069	0 %	0 %	50 %	50 %	525828394
53560	NC_021812	CGT	2	6	2549187	2549192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828394
53561	NC_021812	CGG	2	6	2549206	2549211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828394
53562	NC_021812	TCA	2	6	2549222	2549227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828394
53563	NC_021812	CCG	2	6	2549282	2549287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828394
53564	NC_021812	CGA	2	6	2549319	2549324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828394
53565	NC_021812	CG	3	6	2549372	2549377	0 %	0 %	50 %	50 %	525828394
53566	NC_021812	TGC	2	6	2549402	2549407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828394
53567	NC_021812	ATGA	2	8	2549434	2549441	50 %	25 %	25 %	0 %	525828394
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53569	NC_021812	CAT	2	6	2549634	2549639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828394
53570	NC_021812	GGC	3	9	2549721	2549729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828394
53571	NC_021812	ACG	2	6	2549818	2549823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828394
53572	NC_021812	GCAG	2	8	2549867	2549874	25 %	0 %	50 %	25 %	525828394
53573	NC_021812	TAG	2	6	2549906	2549911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828394
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53576	NC_021812	GTTT	2	8	2549961	2549968	0 %	75 %	25 %	0 %	525828394
53577	NC_021812	CCA	2	6	2549994	2549999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828394
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53581	NC_021812	GAT	2	6	2550145	2550150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828394
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53583	NC_021812	CTA	2	6	2550248	2550253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828394
53584	NC_021812	AAT	2	6	2550289	2550294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828394
53585	NC_021812	GTG	2	6	2550305	2550310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828394
53586	NC_021812	TCG	2	6	2550311	2550316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828394
53587	NC_021812	CGGA	2	8	2550388	2550395	25 %	0 %	50 %	25 %	525828394
53588	NC_021812	GAT	2	6	2550465	2550470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828394
53589	NC_021812	CAG	2	6	2550511	2550516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828394
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53591	NC_021812	CGC	3	9	2550589	2550597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828394
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53593	NC_021812	ACG	2	6	2550656	2550661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828394
53594	NC_021812	CAA	2	6	2550679	2550684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828394
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53598	NC_021812	GA	3	6	2550918	2550923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53599	NC_021812	CAATC	2	10	2550943	2550952	40 %	20 %	0 %	40 %	525828395
53600	NC_021812	AGA	2	6	2550953	2550958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828395
53601	NC_021812	ACGCCG	2	12	2550973	2550984	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525828395
53602	NC_021812	CGC	2	6	2551094	2551099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828395
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53604	NC_021812	AT	3	6	2551186	2551191	50 %	50 %	0 %	0 %	525828395
53605	NC_021812	ATC	2	6	2551209	2551214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525828395
53606	NC_021812	CCAG	2	8	2551250	2551257	25 %	0 %	25 %	50 %	525828395
53607	NC_021812	CCA	2	6	2551467	2551472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828395
53608	NC_021812	AGT	2	6	2551643	2551648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828395
53609	NC_021812	GAT	2	6	2551704	2551709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828395
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53611	NC_021812	CTT	2	6	2551754	2551759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828395
53612	NC_021812	TGGC	2	8	2551787	2551794	0 %	25 %	50 %	25 %	525828395
53613	NC_021812	AAC	2	6	2551795	2551800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525828395
53614	NC_021812	AC	3	6	2551888	2551893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53615	NC_021812	GTTA	2	8	2551900	2551907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53616	NC_021812	CTT	2	6	2551911	2551916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53617	NC_021812	ACA	2	6	2551927	2551932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53618	NC_021812	AAG	2	6	2551936	2551941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53619	NC_021812	ATA	2	6	2551943	2551948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53852	NC_021812	GCC	2	6	2562955	2562960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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53854	NC_021812	GCG	2	6	2562999	2563004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828407
53855	NC_021812	GGC	2	6	2563025	2563030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828407
53856	NC_021812	TTC	2	6	2563189	2563194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828407
53857	NC_021812	GTG	2	6	2563210	2563215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828407
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53861	NC_021812	GAA	2	6	2563453	2563458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828407
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53882	NC_021812	CAG	2	6	2564680	2564685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828407
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53884	NC_021812	CGG	2	6	2564802	2564807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828407
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53909	NC_021812	AAAG	2	8	2565701	2565708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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53911	NC_021812	ATT	2	6	2565780	2565785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53914	NC_021812	CT	3	6	2565847	2565852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53915	NC_021812	TGAT	2	8	2565875	2565882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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53952	NC_021812	GCTGG	2	10	2567508	2567517	0 %	20 %	60 %	20 %	525828409
53953	NC_021812	GC	3	6	2567562	2567567	0 %	0 %	50 %	50 %	525828409
53954	NC_021812	TCC	2	6	2567617	2567622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830536
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53956	NC_021812	A	7	7	2567683	2567689	100 %	0 %	0 %	0 %	525830536
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53959	NC_021812	A	6	6	2567881	2567886	100 %	0 %	0 %	0 %	525830536
53960	NC_021812	GCG	2	6	2567890	2567895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830536
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53962	NC_021812	GGC	2	6	2567922	2567927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830536
53963	NC_021812	TGA	2	6	2567943	2567948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830536
53964	NC_021812	ACA	2	6	2567952	2567957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830536
53965	NC_021812	GCT	2	6	2567997	2568002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830536
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53967	NC_021812	GCT	2	6	2568078	2568083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830536
53968	NC_021812	ACG	2	6	2568138	2568143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830536
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53970	NC_021812	ATT	2	6	2568202	2568207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830536
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