MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

< Previous12345678910111213...202203Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_021810	T	6	6	95396	95401	0 %	100 %	0 %	0 %	525814271
2004	NC_021810	GGCG	2	8	95416	95423	0 %	0 %	75 %	25 %	525814272
2005	NC_021810	GAA	2	6	95424	95429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814272
2006	NC_021810	A	6	6	95471	95476	100 %	0 %	0 %	0 %	525814272
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2012	NC_021810	CAT	2	6	95820	95825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814273
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2127	NC_021810	GCT	2	6	101612	101617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814277
2128	NC_021810	T	6	6	101627	101632	0 %	100 %	0 %	0 %	525814277
2129	NC_021810	CGC	2	6	101723	101728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2130	NC_021810	CTT	2	6	101803	101808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_021810	T	7	7	101807	101813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_021810	CTGG	2	8	101862	101869	0 %	25 %	50 %	25 %	525814278
2133	NC_021810	ACGCTG	2	12	101878	101889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525814278
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2136	NC_021810	CACG	2	8	101968	101975	25 %	0 %	25 %	50 %	525814278
2137	NC_021810	GGC	3	9	101988	101996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814278
2138	NC_021810	GCT	2	6	102015	102020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814278
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2156	NC_021810	TGC	2	6	102613	102618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2157	NC_021810	TTA	2	6	102641	102646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2158	NC_021810	TAT	2	6	102653	102658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2159	NC_021810	TAT	2	6	102679	102684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2160	NC_021810	GCA	2	6	102771	102776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814279
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2165	NC_021810	ATA	2	6	103102	103107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2166	NC_021810	GCTC	2	8	103147	103154	0 %	25 %	25 %	50 %	525814280
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2247	NC_021810	GCGGA	2	10	107196	107205	20 %	0 %	60 %	20 %	525814282
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2249	NC_021810	TCA	2	6	107258	107263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814282
2250	NC_021810	CAC	2	6	107301	107306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814282
2251	NC_021810	CCA	2	6	107321	107326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814282
2252	NC_021810	GCG	2	6	107387	107392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814282
2253	NC_021810	GCTG	2	8	107414	107421	0 %	25 %	50 %	25 %	525814282
2254	NC_021810	TA	3	6	107429	107434	50 %	50 %	0 %	0 %	525814282
2255	NC_021810	A	8	8	107694	107701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_021810	AAT	2	6	107753	107758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2257	NC_021810	CAAT	2	8	107764	107771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2258	NC_021810	CG	3	6	107798	107803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2259	NC_021810	A	9	9	107895	107903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2260	NC_021810	CAA	2	6	107943	107948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2261	NC_021810	CAC	2	6	107983	107988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2262	NC_021810	CAG	2	6	108015	108020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2263	NC_021810	CGG	2	6	108114	108119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2264	NC_021810	TAT	2	6	108189	108194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2265	NC_021810	TTA	2	6	108257	108262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814283
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2267	NC_021810	CAG	2	6	108361	108366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814283
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2270	NC_021810	T	6	6	108465	108470	0 %	100 %	0 %	0 %	525814283
2271	NC_021810	TGGC	2	8	108688	108695	0 %	25 %	50 %	25 %	525814283
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2275	NC_021810	TGA	2	6	109011	109016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814283
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2280	NC_021810	CTG	2	6	109382	109387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814284
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2282	NC_021810	GTC	2	6	109430	109435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814284
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2297	NC_021810	ATG	2	6	110257	110262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814284
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2312	NC_021810	CG	3	6	111196	111201	0 %	0 %	50 %	50 %	525814285
2313	NC_021810	GGC	2	6	111209	111214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814285
2314	NC_021810	CGG	2	6	111226	111231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814285
2315	NC_021810	ATC	2	6	111242	111247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814285
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2319	NC_021810	GGC	2	6	111404	111409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814285
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2323	NC_021810	AGAA	2	8	111573	111580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2324	NC_021810	A	6	6	111582	111587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2325	NC_021810	CCG	2	6	111696	111701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814286
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2331	NC_021810	GCC	2	6	111973	111978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814286
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2342	NC_021810	CGC	2	6	112421	112426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814286
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2344	NC_021810	GC	3	6	112631	112636	0 %	0 %	50 %	50 %	525814287
2345	NC_021810	GC	3	6	112691	112696	0 %	0 %	50 %	50 %	525814287
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2349	NC_021810	GCC	2	6	112850	112855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814287
2350	NC_021810	AAC	2	6	112970	112975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814287
2351	NC_021810	AAT	2	6	112983	112988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814287
2352	NC_021810	CTG	2	6	113043	113048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814287
2353	NC_021810	CGC	2	6	113096	113101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814287
2354	NC_021810	GCA	2	6	113141	113146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814287
2355	NC_021810	GCT	2	6	113174	113179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814287
2356	NC_021810	TAA	2	6	113206	113211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814287
2357	NC_021810	C	7	7	113235	113241	0 %	0 %	0 %	100 %	525814287
2358	NC_021810	T	8	8	113272	113279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2359	NC_021810	TCA	2	6	113331	113336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2360	NC_021810	CGCC	2	8	113401	113408	0 %	0 %	25 %	75 %	525814288
2361	NC_021810	GAT	2	6	113561	113566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814288
2362	NC_021810	CAC	2	6	113654	113659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814288
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2364	NC_021810	CAT	2	6	113693	113698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814288
2365	NC_021810	GA	3	6	113721	113726	50 %	0 %	50 %	0 %	525814288
2366	NC_021810	ACC	2	6	113886	113891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814288
2367	NC_021810	GTG	2	6	113916	113921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814288
2368	NC_021810	GCG	2	6	113947	113952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814288
2369	NC_021810	ATG	2	6	113964	113969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814288
2370	NC_021810	CTG	2	6	113984	113989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814288
2371	NC_021810	AGC	2	6	114000	114005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814288
2372	NC_021810	CGGCG	2	10	114019	114028	0 %	0 %	60 %	40 %	525814288
2373	NC_021810	AAT	2	6	114048	114053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814288
2374	NC_021810	CCCT	2	8	114059	114066	0 %	25 %	0 %	75 %	525814288
2375	NC_021810	TCA	2	6	114102	114107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814288
2376	NC_021810	GCA	2	6	114130	114135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814288
2377	NC_021810	GCA	2	6	114139	114144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814288
2378	NC_021810	GCCA	2	8	114177	114184	25 %	0 %	25 %	50 %	525814288
2379	NC_021810	AAT	2	6	114215	114220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814288
2380	NC_021810	GCAG	2	8	114231	114238	25 %	0 %	50 %	25 %	525814288
2381	NC_021810	CG	3	6	114257	114262	0 %	0 %	50 %	50 %	525814288
2382	NC_021810	A	6	6	114297	114302	100 %	0 %	0 %	0 %	525814288
2383	NC_021810	ATAC	2	8	114335	114342	50 %	25 %	0 %	25 %	525814288
2384	NC_021810	AG	3	6	114380	114385	50 %	0 %	50 %	0 %	525814288
2385	NC_021810	GCG	2	6	114391	114396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814288
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2387	NC_021810	CAAT	2	8	114445	114452	50 %	25 %	0 %	25 %	525814288
2388	NC_021810	CGAGC	2	10	114485	114494	20 %	0 %	40 %	40 %	525814288
2389	NC_021810	AGCC	2	8	114549	114556	25 %	0 %	25 %	50 %	525814288
2390	NC_021810	AAT	2	6	114561	114566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814288
2391	NC_021810	CAT	2	6	114587	114592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814288
2392	NC_021810	CTG	2	6	114594	114599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814288
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2394	NC_021810	AAAC	2	8	114718	114725	75 %	0 %	0 %	25 %	525814288
2395	NC_021810	CGT	2	6	114735	114740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814288
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2397	NC_021810	T	7	7	114951	114957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2398	NC_021810	ACC	2	6	114960	114965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2399	NC_021810	TAT	2	6	114999	115004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2400	NC_021810	AT	3	6	115011	115016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2401	NC_021810	A	7	7	115061	115067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2402	NC_021810	T	6	6	115095	115100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2403	NC_021810	GCCA	2	8	115154	115161	25 %	0 %	25 %	50 %	525814289
2404	NC_021810	GCG	2	6	115202	115207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814289
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2431	NC_021810	ATCG	2	8	116820	116827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2432	NC_021810	ATTT	2	8	116857	116864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2433	NC_021810	CAT	2	6	116870	116875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2435	NC_021810	TAAA	2	8	116903	116910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2436	NC_021810	TGGT	2	8	116928	116935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2437	NC_021810	CTG	2	6	116947	116952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2466	NC_021810	TAG	2	6	118440	118445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2467	NC_021810	A	7	7	118478	118484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2468	NC_021810	CTG	2	6	118539	118544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814292
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2486	NC_021810	TCGC	2	8	119164	119171	0 %	25 %	25 %	50 %	525814292
2487	NC_021810	CTT	2	6	119210	119215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814292
2488	NC_021810	GATC	2	8	119239	119246	25 %	25 %	25 %	25 %	525814292
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2490	NC_021810	TGG	2	6	119297	119302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814292
2491	NC_021810	GGC	2	6	119318	119323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814292
2492	NC_021810	GC	3	6	119322	119327	0 %	0 %	50 %	50 %	525814292
2493	NC_021810	CGC	3	9	119325	119333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814292
2494	NC_021810	CAA	2	6	119360	119365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814292
2495	NC_021810	GATG	2	8	119414	119421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2496	NC_021810	T	6	6	119489	119494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_021810	TCGC	2	8	119523	119530	0 %	25 %	25 %	50 %	525814293
2498	NC_021810	CTGT	2	8	119552	119559	0 %	50 %	25 %	25 %	525814293
2499	NC_021810	GGC	2	6	119632	119637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814293
2500	NC_021810	ACG	2	6	119656	119661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814293

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