MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

< Previous12...3435363738394041424344...202203Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021810	T	6	6	901007	901012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19002	NC_021810	TGAC	2	8	901191	901198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19003	NC_021810	CAC	2	6	901221	901226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19004	NC_021810	TCA	2	6	901264	901269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_021810	GCATTA	2	12	901418	901429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19006	NC_021810	CCT	2	6	901432	901437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19007	NC_021810	TA	3	6	901478	901483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_021810	TGA	2	6	901490	901495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_021810	A	6	6	901543	901548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19010	NC_021810	TAA	3	9	901564	901572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_021810	TCA	2	6	901610	901615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_021810	GCA	2	6	901638	901643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_021810	TTAT	2	8	901665	901672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_021810	T	6	6	901709	901714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_021810	ATG	2	6	901768	901773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_021810	GTA	2	6	901872	901877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_021810	TAT	2	6	901883	901888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19018	NC_021810	ATTT	2	8	901901	901908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19019	NC_021810	GAT	2	6	901951	901956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525815041
19020	NC_021810	ATT	2	6	902008	902013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525815041
19021	NC_021810	A	6	6	902090	902095	100 %	0 %	0 %	0 %	525815041
19022	NC_021810	TTG	2	6	902154	902159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525815041
19023	NC_021810	TTTC	2	8	902163	902170	0 %	75 %	0 %	25 %	525815041
19024	NC_021810	CGA	2	6	902180	902185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815041
19025	NC_021810	GCAT	2	8	902226	902233	25 %	25 %	25 %	25 %	525815041
19026	NC_021810	ATT	2	6	902309	902314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525815041
19027	NC_021810	CGATGA	2	12	902320	902331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525815041
19028	NC_021810	CAG	2	6	902456	902461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815041
19029	NC_021810	ATA	2	6	902549	902554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525815041
19030	NC_021810	TAT	2	6	902585	902590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_021810	ATT	2	6	902597	902602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_021810	AGG	2	6	902634	902639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_021810	TCAT	2	8	902665	902672	25 %	50 %	0 %	25 %	525815042
19034	NC_021810	CAG	2	6	902687	902692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19035	NC_021810	TCCC	2	8	902712	902719	0 %	25 %	0 %	75 %	525815042
19036	NC_021810	GGC	2	6	902721	902726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525815042
19037	NC_021810	GTCA	2	8	902764	902771	25 %	25 %	25 %	25 %	525815042
19038	NC_021810	GCC	2	6	902775	902780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525815042
19039	NC_021810	TAT	2	6	902793	902798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525815042
19040	NC_021810	AC	3	6	902931	902936	50 %	0 %	0 %	50 %	525815042
19041	NC_021810	CGGGA	2	10	902958	902967	20 %	0 %	60 %	20 %	525815042
19042	NC_021810	AAT	2	6	903028	903033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525815042
19043	NC_021810	TATT	2	8	903089	903096	25 %	75 %	0 %	0 %	525815042
19044	NC_021810	CGA	2	6	903210	903215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19045	NC_021810	GTC	2	6	903301	903306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19046	NC_021810	TAC	2	6	903327	903332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525815042
19047	NC_021810	GCA	2	6	903439	903444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19048	NC_021810	TCC	3	9	903445	903453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525815042
19049	NC_021810	CAA	2	6	903468	903473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525815042
19050	NC_021810	CTA	2	6	903476	903481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525815042
19051	NC_021810	GA	3	6	903542	903547	50 %	0 %	50 %	0 %	525815042
19052	NC_021810	GGCG	2	8	903666	903673	0 %	0 %	75 %	25 %	525815042
19053	NC_021810	GGC	2	6	903712	903717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525815042
19054	NC_021810	TTG	2	6	903719	903724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525815042
19055	NC_021810	TTC	2	6	903729	903734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525815042
19056	NC_021810	AGG	2	6	903735	903740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525815042
19057	NC_021810	TGC	2	6	903768	903773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19058	NC_021810	GCA	2	6	903804	903809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19059	NC_021810	CGT	2	6	903860	903865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19060	NC_021810	CGG	2	6	903881	903886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525815042
19061	NC_021810	CAG	2	6	903936	903941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19062	NC_021810	CTGAC	2	10	903953	903962	20 %	20 %	20 %	40 %	525815042
19063	NC_021810	CGG	2	6	904050	904055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525815042
19064	NC_021810	GAT	3	9	904084	904092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525815042
19065	NC_021810	TTG	2	6	904142	904147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525815042
19066	NC_021810	ATA	2	6	904154	904159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525815042
19067	NC_021810	GGA	2	6	904162	904167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525815042
19068	NC_021810	AAGC	2	8	904238	904245	50 %	0 %	25 %	25 %	525815042
19069	NC_021810	TTG	2	6	904250	904255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525815042
19070	NC_021810	GTG	2	6	904276	904281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525815042
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19073	NC_021810	TCCG	2	8	904547	904554	0 %	25 %	25 %	50 %	525815042
19074	NC_021810	CAA	2	6	904575	904580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525815042
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19076	NC_021810	GTC	2	6	904860	904865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19077	NC_021810	GTGA	2	8	904867	904874	25 %	25 %	50 %	0 %	525815042
19078	NC_021810	ATCG	2	8	904942	904949	25 %	25 %	25 %	25 %	525815042
19079	NC_021810	GC	3	6	905093	905098	0 %	0 %	50 %	50 %	525815042
19080	NC_021810	GGT	2	6	905130	905135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525815042
19081	NC_021810	ATGG	2	8	905136	905143	25 %	25 %	50 %	0 %	525815042
19082	NC_021810	GAC	2	6	905155	905160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19083	NC_021810	GAT	2	6	905191	905196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525815042
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19085	NC_021810	ATA	2	6	905312	905317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525815042
19086	NC_021810	CAG	2	6	905349	905354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815042
19087	NC_021810	GAA	2	6	905370	905375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525815042
19088	NC_021810	GGTG	2	8	905451	905458	0 %	25 %	75 %	0 %	525815042
19089	NC_021810	AAC	2	6	905519	905524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19090	NC_021810	A	6	6	905598	905603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_021810	TTG	2	6	905769	905774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525815043
19092	NC_021810	CATA	2	8	905817	905824	50 %	25 %	0 %	25 %	525815043
19093	NC_021810	CGG	2	6	905835	905840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525815043
19094	NC_021810	CGC	2	6	905845	905850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525815043
19095	NC_021810	TAT	2	6	905857	905862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525815043
19096	NC_021810	ACC	2	6	905889	905894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525815043
19097	NC_021810	T	6	6	905903	905908	0 %	100 %	0 %	0 %	525815043
19098	NC_021810	GTT	2	6	905948	905953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525815043
19099	NC_021810	CAGG	2	8	906056	906063	25 %	0 %	50 %	25 %	525815043
19100	NC_021810	A	7	7	906103	906109	100 %	0 %	0 %	0 %	525815044
19101	NC_021810	CG	3	6	906131	906136	0 %	0 %	50 %	50 %	525815044
19102	NC_021810	CTG	2	6	906184	906189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525815044
19103	NC_021810	A	6	6	906298	906303	100 %	0 %	0 %	0 %	525815044
19104	NC_021810	GTT	2	6	906316	906321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525815044
19105	NC_021810	T	7	7	906478	906484	0 %	100 %	0 %	0 %	525815044
19106	NC_021810	AAT	2	6	906612	906617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525815044
19107	NC_021810	ACC	2	6	906649	906654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525815044
19108	NC_021810	TCT	2	6	906661	906666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525815044
19109	NC_021810	TGTT	2	8	906687	906694	0 %	75 %	25 %	0 %	525815044
19110	NC_021810	GAC	2	6	906699	906704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815044
19111	NC_021810	CAG	2	6	906720	906725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815044
19112	NC_021810	AGC	2	6	906734	906739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815044
19113	NC_021810	GGCG	2	8	906744	906751	0 %	0 %	75 %	25 %	525815044
19114	NC_021810	AAT	2	6	906759	906764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525815044
19115	NC_021810	AGA	2	6	906968	906973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19116	NC_021810	TA	4	8	907152	907159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19117	NC_021810	A	6	6	907169	907174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_021810	AGC	2	6	907252	907257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19119	NC_021810	TA	3	6	907264	907269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19120	NC_021810	TTA	2	6	907285	907290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19121	NC_021810	TAA	2	6	907311	907316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19122	NC_021810	TAAATA	2	12	907361	907372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19123	NC_021810	AAT	2	6	907410	907415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19124	NC_021810	CTAT	2	8	907423	907430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19125	NC_021810	GTTT	2	8	907454	907461	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19126	NC_021810	T	6	6	907459	907464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19127	NC_021810	CAAT	2	8	907465	907472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19128	NC_021810	CT	3	6	907477	907482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19129	NC_021810	ATA	2	6	907509	907514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19130	NC_021810	TTG	2	6	907521	907526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19131	NC_021810	AGAA	2	8	907586	907593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19132	NC_021810	TCA	2	6	907631	907636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19133	NC_021810	CAA	3	9	907703	907711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19134	NC_021810	GAAT	2	8	907713	907720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19135	NC_021810	ACG	2	6	907771	907776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815045
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19138	NC_021810	ATGCCG	2	12	907830	907841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525815045
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19142	NC_021810	ATC	2	6	908064	908069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525815045
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19153	NC_021810	GCG	2	6	908511	908516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19154	NC_021810	TAC	2	6	908552	908557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19155	NC_021810	GC	3	6	908576	908581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19156	NC_021810	TGG	2	6	908616	908621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19157	NC_021810	TAA	2	6	908648	908653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525815046
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19229	NC_021810	TTTTA	2	10	912292	912301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19230	NC_021810	CAT	2	6	912318	912323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19232	NC_021810	A	6	6	912362	912367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19233	NC_021810	TAT	2	6	912369	912374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525815049
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19241	NC_021810	GTC	2	6	912897	912902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525815049
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19244	NC_021810	GC	3	6	913000	913005	0 %	0 %	50 %	50 %	525815049
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19246	NC_021810	T	6	6	913066	913071	0 %	100 %	0 %	0 %	525815049
19247	NC_021810	GAA	2	6	913075	913080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19248	NC_021810	CGT	2	6	913133	913138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19249	NC_021810	CGG	2	6	913144	913149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19250	NC_021810	ACATGA	2	12	913170	913181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19251	NC_021810	ATT	2	6	913214	913219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19252	NC_021810	TGC	2	6	913247	913252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19253	NC_021810	AGC	2	6	913267	913272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19254	NC_021810	GCGT	2	8	913282	913289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19255	NC_021810	GAT	2	6	913300	913305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19256	NC_021810	TTA	2	6	913354	913359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19257	NC_021810	GTTT	2	8	913417	913424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19258	NC_021810	T	6	6	913429	913434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19259	NC_021810	A	7	7	913443	913449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19260	NC_021810	ATG	2	6	913530	913535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19261	NC_021810	A	7	7	913545	913551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19262	NC_021810	ACA	2	6	913556	913561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19263	NC_021810	A	6	6	913570	913575	100 %	0 %	0 %	0 %	525815050
19264	NC_021810	CCA	2	6	913582	913587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525815050
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19267	NC_021810	CAT	2	6	913655	913660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525815050
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19302	NC_021810	CG	3	6	915285	915290	0 %	0 %	50 %	50 %	525815051
19303	NC_021810	CGT	2	6	915330	915335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525815051
19304	NC_021810	CG	3	6	915388	915393	0 %	0 %	50 %	50 %	525815051
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19308	NC_021810	GAG	2	6	915544	915549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19351	NC_021810	CCA	2	6	917383	917388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525815053
19352	NC_021810	CGA	2	6	917401	917406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525815053
19353	NC_021810	CG	5	10	917417	917426	0 %	0 %	50 %	50 %	525815053
19354	NC_021810	GTT	2	6	917512	917517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525815053
19355	NC_021810	GATA	2	8	917518	917525	50 %	25 %	25 %	0 %	525815053
19356	NC_021810	CAA	2	6	917552	917557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525815054
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19358	NC_021810	T	7	7	917615	917621	0 %	100 %	0 %	0 %	525815054
19359	NC_021810	CCG	2	6	917647	917652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525815054
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19367	NC_021810	ATA	2	6	917931	917936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525815054
19368	NC_021810	CCG	2	6	917998	918003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525815054
19369	NC_021810	CGC	2	6	918088	918093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525815054
19370	NC_021810	T	6	6	918097	918102	0 %	100 %	0 %	0 %	525815054
19371	NC_021810	TTC	2	6	918104	918109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525815054
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19374	NC_021810	T	6	6	918218	918223	0 %	100 %	0 %	0 %	525815054
19375	NC_021810	GAT	2	6	918224	918229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525815054
19376	NC_021810	CCAG	2	8	918295	918302	25 %	0 %	25 %	50 %	525815054
19377	NC_021810	CG	4	8	918354	918361	0 %	0 %	50 %	50 %	525815054
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19423	NC_021810	TGA	2	6	920521	920526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525815058
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19489	NC_021810	GGC	2	6	924342	924347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525815060
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