MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

< Previous12...3031323334353637383940...202203Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021810	CGC	2	6	803887	803892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814951
17002	NC_021810	GC	3	6	803956	803961	0 %	0 %	50 %	50 %	525814951
17003	NC_021810	AGG	2	6	804154	804159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814951
17004	NC_021810	CGATA	2	10	804161	804170	40 %	20 %	20 %	20 %	525814951
17005	NC_021810	CGC	2	6	804195	804200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814951
17006	NC_021810	GAA	2	6	804294	804299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814951
17007	NC_021810	AG	3	6	804323	804328	50 %	0 %	50 %	0 %	525814951
17008	NC_021810	GCA	2	6	804416	804421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814951
17009	NC_021810	CAT	2	6	804451	804456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814951
17010	NC_021810	GGC	2	6	804562	804567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_021810	AGCGC	2	10	804635	804644	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17012	NC_021810	CAG	2	6	804702	804707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814952
17013	NC_021810	CAT	2	6	804735	804740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814952
17014	NC_021810	GCC	2	6	804777	804782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814952
17015	NC_021810	GCA	2	6	804787	804792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814952
17016	NC_021810	CCT	2	6	804932	804937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814952
17017	NC_021810	GGT	2	6	804951	804956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814952
17018	NC_021810	TCC	2	6	804982	804987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814952
17019	NC_021810	T	6	6	805104	805109	0 %	100 %	0 %	0 %	525814952
17020	NC_021810	CGATAT	2	12	805112	805123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525814952
17021	NC_021810	CT	3	6	805207	805212	0 %	50 %	0 %	50 %	525814952
17022	NC_021810	GC	3	6	805225	805230	0 %	0 %	50 %	50 %	525814952
17023	NC_021810	AC	3	6	805284	805289	50 %	0 %	0 %	50 %	525814952
17024	NC_021810	CATC	2	8	805355	805362	25 %	25 %	0 %	50 %	525814952
17025	NC_021810	GAA	2	6	805371	805376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814952
17026	NC_021810	GCC	2	6	805392	805397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814952
17027	NC_021810	AAT	2	6	805416	805421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814952
17028	NC_021810	CGC	2	6	805523	805528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814952
17029	NC_021810	ACG	2	6	805540	805545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814952
17030	NC_021810	GAC	2	6	805548	805553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814952
17031	NC_021810	CGG	2	6	805557	805562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814952
17032	NC_021810	CAG	2	6	805590	805595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814952
17033	NC_021810	GCG	2	6	805604	805609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814952
17034	NC_021810	CAC	2	6	805629	805634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814952
17035	NC_021810	CGC	2	6	805644	805649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814952
17036	NC_021810	CAA	2	6	805680	805685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814952
17037	NC_021810	ACG	2	6	805714	805719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814952
17038	NC_021810	CCT	2	6	805778	805783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814952
17039	NC_021810	AGG	2	6	805796	805801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814952
17040	NC_021810	GATC	2	8	805817	805824	25 %	25 %	25 %	25 %	525814952
17041	NC_021810	GCG	2	6	805993	805998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814952
17042	NC_021810	T	6	6	806019	806024	0 %	100 %	0 %	0 %	525814952
17043	NC_021810	GGA	2	6	806028	806033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814952
17044	NC_021810	ATA	2	6	806079	806084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814952
17045	NC_021810	CGG	2	6	806093	806098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814952
17046	NC_021810	CAC	2	6	806111	806116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814952
17047	NC_021810	GCA	2	6	806375	806380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814953
17048	NC_021810	AT	3	6	806381	806386	50 %	50 %	0 %	0 %	525814953
17049	NC_021810	GGA	2	6	806400	806405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814953
17050	NC_021810	GAA	2	6	806442	806447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814953
17051	NC_021810	CAT	2	6	806454	806459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814953
17052	NC_021810	TGG	2	6	806512	806517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814953
17053	NC_021810	GC	3	6	806608	806613	0 %	0 %	50 %	50 %	525814953
17054	NC_021810	GTT	2	6	806645	806650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814953
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17056	NC_021810	GCG	2	6	806700	806705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814953
17057	NC_021810	GCA	2	6	806732	806737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814953
17058	NC_021810	GGC	2	6	806778	806783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814953
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17060	NC_021810	CGT	2	6	806908	806913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814953
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17062	NC_021810	GGCGCT	2	12	806921	806932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525814953
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17065	NC_021810	CGAA	2	8	806969	806976	50 %	0 %	25 %	25 %	525814953
17066	NC_021810	CGG	2	6	807083	807088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814953
17067	NC_021810	CTGG	2	8	807221	807228	0 %	25 %	50 %	25 %	525814953
17068	NC_021810	GCA	2	6	807230	807235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814953
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17070	NC_021810	AAG	2	6	807434	807439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_021810	AAT	2	6	807462	807467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_021810	ATTTA	2	10	807486	807495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_021810	ATA	2	6	807519	807524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814954
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17079	NC_021810	ATG	2	6	807743	807748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814954
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17085	NC_021810	CTG	2	6	807874	807879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814954
17086	NC_021810	CAAC	2	8	807916	807923	50 %	0 %	0 %	50 %	525814954
17087	NC_021810	CGT	2	6	807945	807950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814954
17088	NC_021810	TCC	2	6	807989	807994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814954
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17090	NC_021810	GCGG	2	8	808096	808103	0 %	0 %	75 %	25 %	525814954
17091	NC_021810	GC	3	6	808110	808115	0 %	0 %	50 %	50 %	525814954
17092	NC_021810	CGC	2	6	808246	808251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814954
17093	NC_021810	GCG	2	6	808265	808270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814954
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17098	NC_021810	TGGC	2	8	808475	808482	0 %	25 %	50 %	25 %	525814954
17099	NC_021810	GCG	2	6	808518	808523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814954
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17104	NC_021810	TGC	2	6	808835	808840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814954
17105	NC_021810	GCG	2	6	808841	808846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814954
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17107	NC_021810	GGC	2	6	808909	808914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814954
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17110	NC_021810	TCA	2	6	809096	809101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814954
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17113	NC_021810	AG	3	6	809155	809160	50 %	0 %	50 %	0 %	525814954
17114	NC_021810	T	6	6	809254	809259	0 %	100 %	0 %	0 %	525814954
17115	NC_021810	CGT	2	6	809308	809313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814954
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17118	NC_021810	CAT	2	6	809417	809422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814955
17119	NC_021810	GCA	2	6	809447	809452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814955
17120	NC_021810	GCC	2	6	809464	809469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814955
17121	NC_021810	CGT	2	6	809495	809500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814955
17122	NC_021810	GGC	2	6	809517	809522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814955
17123	NC_021810	CAGG	2	8	809568	809575	25 %	0 %	50 %	25 %	525814955
17124	NC_021810	GCC	2	6	809611	809616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814955
17125	NC_021810	GCC	2	6	809743	809748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814955
17126	NC_021810	CGCA	2	8	809763	809770	25 %	0 %	25 %	50 %	525814955
17127	NC_021810	ATC	2	6	809806	809811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814955
17128	NC_021810	T	6	6	809814	809819	0 %	100 %	0 %	0 %	525814955
17129	NC_021810	CGA	2	6	809822	809827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814955
17130	NC_021810	GCCC	2	8	809843	809850	0 %	0 %	25 %	75 %	525814955
17131	NC_021810	GCT	2	6	809900	809905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814955
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17133	NC_021810	CCA	2	6	809972	809977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814955
17134	NC_021810	TCA	2	6	810071	810076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814955
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17140	NC_021810	CCCG	2	8	810359	810366	0 %	0 %	25 %	75 %	525814955
17141	NC_021810	GC	4	8	810398	810405	0 %	0 %	50 %	50 %	525814955
17142	NC_021810	CTT	2	6	810431	810436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814955
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17144	NC_021810	CG	4	8	810596	810603	0 %	0 %	50 %	50 %	525814955
17145	NC_021810	ACC	2	6	810631	810636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814955
17146	NC_021810	AGAA	2	8	810663	810670	75 %	0 %	25 %	0 %	525814955
17147	NC_021810	CGAT	2	8	810691	810698	25 %	25 %	25 %	25 %	525814955
17148	NC_021810	GCTG	2	8	810707	810714	0 %	25 %	50 %	25 %	525814955
17149	NC_021810	TGG	2	6	810757	810762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17150	NC_021810	AC	3	6	810921	810926	50 %	0 %	0 %	50 %	525814956
17151	NC_021810	CGG	2	6	810942	810947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814956
17152	NC_021810	T	6	6	811060	811065	0 %	100 %	0 %	0 %	525814956
17153	NC_021810	GCA	2	6	811075	811080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814956
17154	NC_021810	TTG	2	6	811094	811099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814956
17155	NC_021810	GC	3	6	811109	811114	0 %	0 %	50 %	50 %	525814956
17156	NC_021810	CAG	2	6	811229	811234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814956
17157	NC_021810	AT	3	6	811239	811244	50 %	50 %	0 %	0 %	525814956
17158	NC_021810	GAT	2	6	811250	811255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814956
17159	NC_021810	TAA	2	6	811360	811365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814956
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17162	NC_021810	CAA	2	6	811624	811629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17163	NC_021810	GTT	2	6	811696	811701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17164	NC_021810	T	7	7	811700	811706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17165	NC_021810	CT	3	6	811743	811748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17166	NC_021810	CTACA	2	10	811832	811841	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17167	NC_021810	AAG	2	6	811907	811912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17168	NC_021810	TAT	2	6	812015	812020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814957
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17170	NC_021810	GGT	2	6	812044	812049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814957
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17172	NC_021810	GAT	2	6	812084	812089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814957
17173	NC_021810	ACCT	2	8	812091	812098	25 %	25 %	0 %	50 %	525814957
17174	NC_021810	GCT	2	6	812105	812110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814957
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17181	NC_021810	CGG	2	6	812377	812382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814957
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17184	NC_021810	TGC	2	6	812440	812445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814957
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17188	NC_021810	TCT	2	6	812560	812565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814957
17189	NC_021810	CTG	2	6	812604	812609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814957
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17192	NC_021810	CAT	2	6	812663	812668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814957
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17194	NC_021810	CGG	2	6	812786	812791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814957
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17196	NC_021810	GGC	2	6	812882	812887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814957
17197	NC_021810	CTG	2	6	812919	812924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814957
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17200	NC_021810	CATGA	2	10	812979	812988	40 %	20 %	20 %	20 %	525814957
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17219	NC_021810	CTG	2	6	813816	813821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814957
17220	NC_021810	A	6	6	813828	813833	100 %	0 %	0 %	0 %	525814957
17221	NC_021810	GGC	2	6	813877	813882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17222	NC_021810	GAG	2	6	813932	813937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17223	NC_021810	CTG	2	6	814114	814119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814958
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17229	NC_021810	ATC	2	6	814408	814413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814958
17230	NC_021810	CAC	2	6	814437	814442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814958
17231	NC_021810	TGA	2	6	814460	814465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814958
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17234	NC_021810	TTCCGC	2	12	814548	814559	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525814958
17235	NC_021810	TCG	2	6	814607	814612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814958
17236	NC_021810	TCA	2	6	814752	814757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814958
17237	NC_021810	CG	3	6	814792	814797	0 %	0 %	50 %	50 %	525814958
17238	NC_021810	GTG	2	6	814798	814803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814958
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17364	NC_021810	GAA	2	6	819997	820002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814963
17365	NC_021810	CGC	2	6	820074	820079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814963
17366	NC_021810	CGC	2	6	820251	820256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814963
17367	NC_021810	GAA	2	6	820405	820410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814963
17368	NC_021810	GCCA	2	8	820423	820430	25 %	0 %	25 %	50 %	525814963
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17379	NC_021810	GACT	2	8	821250	821257	25 %	25 %	25 %	25 %	525814963
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17382	NC_021810	CGG	2	6	821348	821353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814963
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17392	NC_021810	AAC	2	6	822232	822237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17393	NC_021810	AATA	2	8	822383	822390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17394	NC_021810	TGT	2	6	822408	822413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17395	NC_021810	ACA	2	6	822426	822431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17396	NC_021810	CAA	2	6	822536	822541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814964
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17470	NC_021810	CCGC	2	8	825805	825812	0 %	0 %	25 %	75 %	525814966
17471	NC_021810	CTG	2	6	825927	825932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814966
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17474	NC_021810	C	6	6	826181	826186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17475	NC_021810	CAT	2	6	826200	826205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814967
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17483	NC_021810	CGC	2	6	826404	826409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814967
17484	NC_021810	GAC	2	6	826437	826442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814967
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