MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021810	CGC	2	6	666436	666441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814831
14002	NC_021810	GC	3	6	666462	666467	0 %	0 %	50 %	50 %	525814831
14003	NC_021810	TGC	2	6	666524	666529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814831
14004	NC_021810	CCA	2	6	666531	666536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814831
14005	NC_021810	GTAC	2	8	666587	666594	25 %	25 %	25 %	25 %	525814831
14006	NC_021810	CTG	2	6	666613	666618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814831
14007	NC_021810	CGT	2	6	666703	666708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814831
14008	NC_021810	TTG	2	6	666773	666778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814831
14009	NC_021810	CAT	2	6	666802	666807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814831
14010	NC_021810	TAA	2	6	666823	666828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814831
14011	NC_021810	GCA	2	6	666896	666901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814832
14012	NC_021810	ATC	3	9	666919	666927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814832
14013	NC_021810	CCG	2	6	666940	666945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814832
14014	NC_021810	CG	3	6	666986	666991	0 %	0 %	50 %	50 %	525814832
14015	NC_021810	ACC	2	6	666994	666999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814832
14016	NC_021810	CCG	2	6	667007	667012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814832
14017	NC_021810	CAC	2	6	667050	667055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814832
14018	NC_021810	GGCG	2	8	667115	667122	0 %	0 %	75 %	25 %	525814832
14019	NC_021810	AAC	2	6	667126	667131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814832
14020	NC_021810	GCA	2	6	667265	667270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814832
14021	NC_021810	ACC	2	6	667297	667302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814832
14022	NC_021810	CCA	2	6	667313	667318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814832
14023	NC_021810	GCC	2	6	667386	667391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814832
14024	NC_021810	GCC	2	6	667461	667466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814832
14025	NC_021810	GTT	2	6	667479	667484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814832
14026	NC_021810	AGC	2	6	667486	667491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814832
14027	NC_021810	CGC	2	6	667541	667546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814832
14028	NC_021810	CAG	2	6	667580	667585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814832
14029	NC_021810	CGG	2	6	667586	667591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814832
14030	NC_021810	GGCA	2	8	667609	667616	25 %	0 %	50 %	25 %	525814832
14031	NC_021810	ATA	2	6	667635	667640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814832
14032	NC_021810	AGC	2	6	667648	667653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814832
14033	NC_021810	GCC	2	6	667683	667688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814832
14034	NC_021810	CAG	2	6	667701	667706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814832
14035	NC_021810	CAC	3	9	667719	667727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814832
14036	NC_021810	GAT	2	6	667746	667751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814832
14037	NC_021810	TCATGG	2	12	667757	667768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525814832
14038	NC_021810	CG	3	6	667787	667792	0 %	0 %	50 %	50 %	525814832
14039	NC_021810	CAG	2	6	667824	667829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814832
14040	NC_021810	ATCG	2	8	667866	667873	25 %	25 %	25 %	25 %	525814832
14041	NC_021810	GAAA	2	8	667940	667947	75 %	0 %	25 %	0 %	525814832
14042	NC_021810	A	7	7	667945	667951	100 %	0 %	0 %	0 %	525814832
14043	NC_021810	CGG	3	9	667991	667999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814832
14044	NC_021810	CCA	3	9	668003	668011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814832
14045	NC_021810	GCCA	2	8	668052	668059	25 %	0 %	25 %	50 %	525814832
14046	NC_021810	GAA	2	6	668064	668069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814832
14047	NC_021810	CGC	2	6	668073	668078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814832
14048	NC_021810	CAG	2	6	668159	668164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814833
14049	NC_021810	CAG	2	6	668174	668179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814833
14050	NC_021810	ACGAC	2	10	668185	668194	40 %	0 %	20 %	40 %	525814833
14051	NC_021810	CCG	2	6	668256	668261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814833
14052	NC_021810	ATC	2	6	668262	668267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814833
14053	NC_021810	TGC	2	6	668278	668283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814833
14054	NC_021810	CGCC	2	8	668377	668384	0 %	0 %	25 %	75 %	525814833
14055	NC_021810	GCC	2	6	668388	668393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814833
14056	NC_021810	CGGT	2	8	668430	668437	0 %	25 %	50 %	25 %	525814833
14057	NC_021810	TCC	2	6	668469	668474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814833
14058	NC_021810	TGG	2	6	668572	668577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814833
14059	NC_021810	GCT	2	6	668600	668605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814833
14060	NC_021810	CG	3	6	668650	668655	0 %	0 %	50 %	50 %	525814833
14061	NC_021810	CTCG	2	8	668758	668765	0 %	25 %	25 %	50 %	525814833
14062	NC_021810	AAT	3	9	668789	668797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814833
14063	NC_021810	CCA	2	6	668818	668823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814833
14064	NC_021810	CAT	3	9	668846	668854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814833
14065	NC_021810	GCG	2	6	668859	668864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814833
14066	NC_021810	CTG	2	6	669005	669010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814833
14067	NC_021810	CCCG	2	8	669055	669062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14068	NC_021810	GCGG	2	8	669067	669074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14069	NC_021810	TCT	2	6	669087	669092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_021810	TGGC	2	8	669248	669255	0 %	25 %	50 %	25 %	525814834
14071	NC_021810	CGG	2	6	669288	669293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814834
14072	NC_021810	TCTT	2	8	669326	669333	0 %	75 %	0 %	25 %	525814834
14073	NC_021810	CCG	2	6	669414	669419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814834
14074	NC_021810	CCGC	2	8	669422	669429	0 %	0 %	25 %	75 %	525814834
14075	NC_021810	GCA	2	6	669507	669512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814834
14076	NC_021810	GTA	2	6	669529	669534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814834
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14078	NC_021810	CGG	2	6	669606	669611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814834
14079	NC_021810	A	6	6	669622	669627	100 %	0 %	0 %	0 %	525814834
14080	NC_021810	GC	3	6	669670	669675	0 %	0 %	50 %	50 %	525814834
14081	NC_021810	GAG	2	6	669770	669775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814834
14082	NC_021810	CGG	2	6	669783	669788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814834
14083	NC_021810	ATC	2	6	669848	669853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814834
14084	NC_021810	CTTCAT	2	12	669861	669872	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525814834
14085	NC_021810	GCTG	2	8	669884	669891	0 %	25 %	50 %	25 %	525814834
14086	NC_021810	AGA	3	9	669895	669903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814834
14087	NC_021810	CGT	2	6	669933	669938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814834
14088	NC_021810	GCCACC	2	12	669953	669964	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525814834
14089	NC_021810	CAT	2	6	669984	669989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814834
14090	NC_021810	GC	4	8	670057	670064	0 %	0 %	50 %	50 %	525814834
14091	NC_021810	ATC	2	6	670132	670137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814834
14092	NC_021810	GCT	2	6	670157	670162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814834
14093	NC_021810	CAA	2	6	670167	670172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814834
14094	NC_021810	ATT	2	6	670181	670186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814834
14095	NC_021810	TGTTT	2	10	670236	670245	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_021810	T	6	6	670243	670248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_021810	GCA	2	6	670317	670322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_021810	ATA	2	6	670331	670336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_021810	ATA	2	6	670374	670379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_021810	A	8	8	670404	670411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_021810	AAT	2	6	670450	670455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_021810	TGC	2	6	670477	670482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_021810	GTT	2	6	670521	670526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_021810	A	6	6	670527	670532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_021810	TAA	2	6	670534	670539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_021810	A	6	6	670555	670560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_021810	GCCT	2	8	670574	670581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14108	NC_021810	TTC	2	6	670641	670646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814835
14109	NC_021810	GATC	2	8	670675	670682	25 %	25 %	25 %	25 %	525814835
14110	NC_021810	CCT	2	6	670710	670715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814835
14111	NC_021810	CG	3	6	670750	670755	0 %	0 %	50 %	50 %	525814835
14112	NC_021810	TTG	2	6	670769	670774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814835
14113	NC_021810	GC	3	6	670809	670814	0 %	0 %	50 %	50 %	525814835
14114	NC_021810	CGTG	2	8	670828	670835	0 %	25 %	50 %	25 %	525814835
14115	NC_021810	CGC	2	6	670847	670852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814835
14116	NC_021810	AGA	2	6	670873	670878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814835
14117	NC_021810	TCG	2	6	670904	670909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814835
14118	NC_021810	TGG	2	6	670910	670915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814835
14119	NC_021810	AAAG	2	8	671011	671018	75 %	0 %	25 %	0 %	525814835
14120	NC_021810	ACC	2	6	671070	671075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14121	NC_021810	GCAG	2	8	671102	671109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14122	NC_021810	TAAG	2	8	671142	671149	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_021810	TCG	2	6	671355	671360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814836
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14154	NC_021810	ATT	2	6	672377	672382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14155	NC_021810	GCTA	2	8	672384	672391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14161	NC_021810	CCAG	2	8	672751	672758	25 %	0 %	25 %	50 %	525814837
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14244	NC_021810	CGC	2	6	676504	676509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814840
14245	NC_021810	CTT	2	6	676521	676526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814840
14246	NC_021810	GCG	2	6	676641	676646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814840
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14250	NC_021810	GCC	2	6	676793	676798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814840
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14257	NC_021810	TA	3	6	676951	676956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14258	NC_021810	A	7	7	676967	676973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_021810	TGA	2	6	676974	676979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14261	NC_021810	A	6	6	677055	677060	100 %	0 %	0 %	0 %	525814841
14262	NC_021810	ACTC	2	8	677064	677071	25 %	25 %	0 %	50 %	525814841
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14353	NC_021810	GCT	2	6	680234	680239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814845
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14362	NC_021810	CGG	2	6	680629	680634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814845
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14364	NC_021810	GCG	2	6	680703	680708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814845
14365	NC_021810	GGT	2	6	680771	680776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814845
14366	NC_021810	TGC	2	6	680782	680787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814845
14367	NC_021810	GTT	2	6	680799	680804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814845
14368	NC_021810	GC	3	6	680841	680846	0 %	0 %	50 %	50 %	525814845
14369	NC_021810	GCG	2	6	680913	680918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814845
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14373	NC_021810	ATG	2	6	681040	681045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814845
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14382	NC_021810	CCCG	2	8	681354	681361	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14383	NC_021810	GCG	2	6	681362	681367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14384	NC_021810	CTTT	2	8	681397	681404	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14385	NC_021810	ATT	2	6	681411	681416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14386	NC_021810	ATT	2	6	681426	681431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14400	NC_021810	CCGC	2	8	682200	682207	0 %	0 %	25 %	75 %	525814846
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14404	NC_021810	CCG	2	6	682397	682402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814846
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14432	NC_021810	TAT	2	6	683571	683576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14434	NC_021810	CAA	2	6	683611	683616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14451	NC_021810	GAA	2	6	684357	684362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14452	NC_021810	CTG	2	6	684400	684405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814849
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14465	NC_021810	GAT	3	9	684932	684940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814850
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14467	NC_021810	GCC	2	6	685019	685024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814850
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14474	NC_021810	GGC	2	6	685384	685389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814850
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14477	NC_021810	CCATA	2	10	685470	685479	40 %	20 %	0 %	40 %	525814850
14478	NC_021810	CG	3	6	685501	685506	0 %	0 %	50 %	50 %	525814850
14479	NC_021810	GACG	2	8	685541	685548	25 %	0 %	50 %	25 %	525814850
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14483	NC_021810	ATC	2	6	685811	685816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814850
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14485	NC_021810	A	6	6	685862	685867	100 %	0 %	0 %	0 %	525814850
14486	NC_021810	T	7	7	685893	685899	0 %	100 %	0 %	0 %	525814850
14487	NC_021810	GGC	2	6	685935	685940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814850
14488	NC_021810	ATA	2	6	685970	685975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814850
14489	NC_021810	CAT	2	6	686007	686012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814850
14490	NC_021810	CAC	2	6	686152	686157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14491	NC_021810	ACA	2	6	686164	686169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14492	NC_021810	TTTTC	2	10	686172	686181	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14493	NC_021810	GC	3	6	686189	686194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14494	NC_021810	AGT	2	6	686205	686210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14495	NC_021810	A	7	7	686252	686258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14496	NC_021810	CAA	2	6	686261	686266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14497	NC_021810	CTG	2	6	686316	686321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814851
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14499	NC_021810	CGG	2	6	686365	686370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814851
14500	NC_021810	ATT	2	6	686373	686378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814851

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