MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021810	TCCA	2	8	644104	644111	25 %	25 %	0 %	50 %	525814809
13503	NC_021810	CCA	2	6	644126	644131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814809
13504	NC_021810	ACG	2	6	644148	644153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814809
13505	NC_021810	CG	3	6	644198	644203	0 %	0 %	50 %	50 %	525814809
13506	NC_021810	GGTG	2	8	644222	644229	0 %	25 %	75 %	0 %	525814809
13507	NC_021810	CGC	2	6	644304	644309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814809
13508	NC_021810	TGA	2	6	644321	644326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814809
13509	NC_021810	GTC	2	6	644337	644342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814809
13510	NC_021810	GCG	2	6	644355	644360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814809
13511	NC_021810	CCAT	2	8	644450	644457	25 %	25 %	0 %	50 %	525814809
13512	NC_021810	GGC	2	6	644522	644527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814809
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13517	NC_021810	CT	3	6	644773	644778	0 %	50 %	0 %	50 %	525814809
13518	NC_021810	CGA	2	6	644842	644847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814809
13519	NC_021810	CCAT	2	8	644887	644894	25 %	25 %	0 %	50 %	525814809
13520	NC_021810	GC	3	6	644906	644911	0 %	0 %	50 %	50 %	525814809
13521	NC_021810	GGTG	2	8	644933	644940	0 %	25 %	75 %	0 %	525814809
13522	NC_021810	TCG	2	6	644998	645003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814809
13523	NC_021810	CTG	2	6	645012	645017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814809
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13529	NC_021810	CGT	2	6	645393	645398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_021810	A	7	7	645514	645520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_021810	CCG	2	6	645557	645562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13532	NC_021810	GGC	2	6	645566	645571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13533	NC_021810	GCA	2	6	645648	645653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814810
13534	NC_021810	CGG	2	6	645669	645674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814810
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13558	NC_021810	GC	3	6	646776	646781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13569	NC_021810	GACC	2	8	647403	647410	25 %	0 %	25 %	50 %	525814812
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13601	NC_021810	GCA	2	6	648740	648745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814813
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13603	NC_021810	GCG	2	6	648817	648822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814813
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13605	NC_021810	T	6	6	648884	648889	0 %	100 %	0 %	0 %	525814813
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13619	NC_021810	CG	3	6	649636	649641	0 %	0 %	50 %	50 %	525814814
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13672	NC_021810	GAG	2	6	652347	652352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13737	NC_021810	AATA	2	8	655205	655212	75 %	25 %	0 %	0 %	525814819
13738	NC_021810	CAG	2	6	655296	655301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814819
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13742	NC_021810	T	6	6	655583	655588	0 %	100 %	0 %	0 %	525814820
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13745	NC_021810	GC	3	6	655728	655733	0 %	0 %	50 %	50 %	525814820
13746	NC_021810	CTG	2	6	655787	655792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814820
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13753	NC_021810	TCG	2	6	656037	656042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814820
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13764	NC_021810	CTG	2	6	656577	656582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814821
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13795	NC_021810	CTGG	2	8	658080	658087	0 %	25 %	50 %	25 %	525814822
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13809	NC_021810	ATCG	2	8	658875	658882	25 %	25 %	25 %	25 %	525814822
13810	NC_021810	GCA	3	9	658907	658915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814822
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13822	NC_021810	A	6	6	659270	659275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13846	NC_021810	TGC	2	6	660026	660031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814824
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13856	NC_021810	GCA	2	6	660346	660351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814824
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13863	NC_021810	CGC	2	6	660690	660695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814825
13864	NC_021810	TCA	2	6	660948	660953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814825
13865	NC_021810	GGT	2	6	661012	661017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814825
13866	NC_021810	CGA	2	6	661025	661030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814825
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13872	NC_021810	CCG	2	6	661160	661165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814825
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13919	NC_021810	CCA	2	6	663012	663017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814827
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13921	NC_021810	CAG	2	6	663040	663045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814827
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13923	NC_021810	TCG	2	6	663078	663083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814827
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13926	NC_021810	GAT	2	6	663293	663298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814827
13927	NC_021810	TGCA	2	8	663338	663345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13928	NC_021810	ACG	2	6	663391	663396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814828
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13959	NC_021810	ACATG	2	10	664745	664754	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13960	NC_021810	T	6	6	664776	664781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13961	NC_021810	A	8	8	664787	664794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13962	NC_021810	AG	3	6	664809	664814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13963	NC_021810	GAAAA	2	10	664838	664847	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13964	NC_021810	TGGC	2	8	664900	664907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13965	NC_021810	CAG	2	6	664910	664915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13970	NC_021810	AAC	2	6	665154	665159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814829
13971	NC_021810	ATC	2	6	665190	665195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814829
13972	NC_021810	CTT	2	6	665203	665208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13973	NC_021810	GGT	2	6	665210	665215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13974	NC_021810	TTCG	2	8	665388	665395	0 %	50 %	25 %	25 %	525814830
13975	NC_021810	CAG	2	6	665397	665402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814830
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13977	NC_021810	CTG	2	6	665547	665552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814830
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13979	NC_021810	CAG	2	6	665589	665594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814830
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13981	NC_021810	GC	3	6	665618	665623	0 %	0 %	50 %	50 %	525814830
13982	NC_021810	CTG	2	6	665640	665645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814830
13983	NC_021810	CGCT	2	8	665667	665674	0 %	25 %	25 %	50 %	525814830
13984	NC_021810	A	7	7	665751	665757	100 %	0 %	0 %	0 %	525814830
13985	NC_021810	TCT	2	6	665776	665781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814830
13986	NC_021810	CGC	2	6	665803	665808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814830
13987	NC_021810	ACC	2	6	665884	665889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814830
13988	NC_021810	GC	3	6	665902	665907	0 %	0 %	50 %	50 %	525814830
13989	NC_021810	CGC	2	6	665912	665917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814830
13990	NC_021810	AGC	2	6	665929	665934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814830
13991	NC_021810	CGT	2	6	666002	666007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814830
13992	NC_021810	T	6	6	666062	666067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13993	NC_021810	GTT	2	6	666109	666114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814831
13994	NC_021810	GCG	2	6	666144	666149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814831
13995	NC_021810	CAC	2	6	666160	666165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814831
13996	NC_021810	GTG	2	6	666224	666229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814831
13997	NC_021810	GCC	2	6	666296	666301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814831
13998	NC_021810	TCG	2	6	666305	666310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814831
13999	NC_021810	CTGGC	2	10	666386	666395	0 %	20 %	40 %	40 %	525814831
14000	NC_021810	CAG	2	6	666409	666414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814831

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