MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021810	GC	3	6	574956	574961	0 %	0 %	50 %	50 %	525814753
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12008	NC_021810	TCA	2	6	575194	575199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814754
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12065	NC_021810	TACGCG	2	12	577990	578001	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525814756
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12120	NC_021810	A	6	6	580521	580526	100 %	0 %	0 %	0 %	525814759
12121	NC_021810	CGC	2	6	580548	580553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814759
12122	NC_021810	TATC	2	8	580587	580594	25 %	50 %	0 %	25 %	525814759
12123	NC_021810	TGT	2	6	580616	580621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814759
12124	NC_021810	CTT	2	6	580716	580721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814759
12125	NC_021810	CGC	2	6	580740	580745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814759
12126	NC_021810	CGC	2	6	580749	580754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814759
12127	NC_021810	CTTG	2	8	580782	580789	0 %	50 %	25 %	25 %	525814759
12128	NC_021810	CTGG	2	8	580793	580800	0 %	25 %	50 %	25 %	525814759
12129	NC_021810	CAG	2	6	580816	580821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814759
12130	NC_021810	ATA	2	6	580835	580840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814759
12131	NC_021810	TGC	2	6	580847	580852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814759
12132	NC_021810	GGC	3	9	580930	580938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814759
12133	NC_021810	CGT	2	6	580960	580965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814759
12134	NC_021810	CACC	2	8	580971	580978	25 %	0 %	0 %	75 %	525814759
12135	NC_021810	GCGTC	2	10	580989	580998	0 %	20 %	40 %	40 %	525814759
12136	NC_021810	GCC	2	6	581060	581065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814759
12137	NC_021810	CG	3	6	581128	581133	0 %	0 %	50 %	50 %	525814759
12138	NC_021810	CAG	2	6	581146	581151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814759
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12140	NC_021810	CGG	2	6	581223	581228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814759
12141	NC_021810	TGC	2	6	581250	581255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814759
12142	NC_021810	TTCT	2	8	581317	581324	0 %	75 %	0 %	25 %	525814759
12143	NC_021810	TGAA	2	8	581335	581342	50 %	25 %	25 %	0 %	525814759
12144	NC_021810	CCT	2	6	581358	581363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814759
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12148	NC_021810	ACC	2	6	581465	581470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814759
12149	NC_021810	CAC	2	6	581512	581517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814759
12150	NC_021810	CGT	2	6	581523	581528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814759
12151	NC_021810	ACC	2	6	581531	581536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814759
12152	NC_021810	CGC	2	6	581548	581553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814759
12153	NC_021810	GCG	2	6	581567	581572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814759
12154	NC_021810	TAT	2	6	581590	581595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814759
12155	NC_021810	GCG	3	9	581644	581652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814760
12156	NC_021810	CGTTAA	2	12	581669	581680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525814760
12157	NC_021810	CCG	2	6	581686	581691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814760
12158	NC_021810	CTT	2	6	581731	581736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814760
12159	NC_021810	TCG	2	6	581741	581746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814760
12160	NC_021810	TCGC	2	8	581783	581790	0 %	25 %	25 %	50 %	525814760
12161	NC_021810	CGG	2	6	581852	581857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814760
12162	NC_021810	CAAA	2	8	581891	581898	75 %	0 %	0 %	25 %	525814760
12163	NC_021810	TCA	2	6	581954	581959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814761
12164	NC_021810	C	6	6	582073	582078	0 %	0 %	0 %	100 %	525814761
12165	NC_021810	GCA	2	6	582098	582103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814761
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12169	NC_021810	CGTCAG	2	12	582303	582314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525814761
12170	NC_021810	GCG	2	6	582395	582400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814762
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12172	NC_021810	GTCA	2	8	582613	582620	25 %	25 %	25 %	25 %	525814762
12173	NC_021810	AGAT	2	8	582621	582628	50 %	25 %	25 %	0 %	525814762
12174	NC_021810	GCT	2	6	582693	582698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814762
12175	NC_021810	CGC	2	6	582715	582720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814762
12176	NC_021810	CGT	2	6	582727	582732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814762
12177	NC_021810	CCG	2	6	582744	582749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814762
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12179	NC_021810	CCT	2	6	582774	582779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814762
12180	NC_021810	A	6	6	582783	582788	100 %	0 %	0 %	0 %	525814762
12181	NC_021810	TCG	2	6	582801	582806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814762
12182	NC_021810	CAG	3	9	582820	582828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814762
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12184	NC_021810	GCC	2	6	582882	582887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814762
12185	NC_021810	CGG	2	6	582969	582974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814763
12186	NC_021810	CGG	2	6	582978	582983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814763
12187	NC_021810	GC	3	6	583000	583005	0 %	0 %	50 %	50 %	525814763
12188	NC_021810	ACG	2	6	583051	583056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814763
12189	NC_021810	CGT	2	6	583083	583088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814763
12190	NC_021810	CG	3	6	583094	583099	0 %	0 %	50 %	50 %	525814763
12191	NC_021810	CCAGA	2	10	583155	583164	40 %	0 %	20 %	40 %	525814763
12192	NC_021810	GCC	2	6	583169	583174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814763
12193	NC_021810	GCA	2	6	583190	583195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814763
12194	NC_021810	CAG	2	6	583226	583231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814763
12195	NC_021810	CTTTG	2	10	583280	583289	0 %	60 %	20 %	20 %	525814763
12196	NC_021810	CGG	2	6	583292	583297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814763
12197	NC_021810	CGG	2	6	583425	583430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814763
12198	NC_021810	AG	3	6	583470	583475	50 %	0 %	50 %	0 %	525814763
12199	NC_021810	TCA	2	6	583574	583579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814763
12200	NC_021810	CCA	2	6	583590	583595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814763
12201	NC_021810	TGC	2	6	583651	583656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814763
12202	NC_021810	TAC	2	6	583759	583764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12203	NC_021810	CG	3	6	583765	583770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12204	NC_021810	TATT	2	8	583830	583837	25 %	75 %	0 %	0 %	525814764
12205	NC_021810	CTG	2	6	583860	583865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814764
12206	NC_021810	CCG	2	6	584037	584042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814764
12207	NC_021810	GGTA	2	8	584108	584115	25 %	25 %	50 %	0 %	525814764
12208	NC_021810	CTT	2	6	584198	584203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814764
12209	NC_021810	ACGC	2	8	584216	584223	25 %	0 %	25 %	50 %	525814764
12210	NC_021810	ATCT	2	8	584313	584320	25 %	50 %	0 %	25 %	525814764
12211	NC_021810	GCG	2	6	584346	584351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814764
12212	NC_021810	GC	3	6	584472	584477	0 %	0 %	50 %	50 %	525814764
12213	NC_021810	AT	3	6	584513	584518	50 %	50 %	0 %	0 %	525814764
12214	NC_021810	GCA	2	6	584699	584704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814764
12215	NC_021810	TAA	2	6	584726	584731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814764
12216	NC_021810	A	7	7	584814	584820	100 %	0 %	0 %	0 %	525814764
12217	NC_021810	GCT	2	6	584858	584863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814764
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12220	NC_021810	CAG	2	6	584982	584987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814764
12221	NC_021810	CGC	2	6	584995	585000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814764
12222	NC_021810	GTC	2	6	585015	585020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814764
12223	NC_021810	TGG	2	6	585063	585068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814764
12224	NC_021810	CGG	2	6	585143	585148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814764
12225	NC_021810	CG	3	6	585177	585182	0 %	0 %	50 %	50 %	525814764
12226	NC_021810	CCG	2	6	585232	585237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814764
12227	NC_021810	CCG	2	6	585336	585341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814764
12228	NC_021810	GTG	2	6	585393	585398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814764
12229	NC_021810	GC	3	6	585413	585418	0 %	0 %	50 %	50 %	525814764
12230	NC_021810	GCG	2	6	585435	585440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814764
12231	NC_021810	CGCTGG	2	12	585493	585504	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525814764
12232	NC_021810	CCT	2	6	585511	585516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814764
12233	NC_021810	GC	3	6	585534	585539	0 %	0 %	50 %	50 %	525814764
12234	NC_021810	CGG	2	6	585560	585565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814764
12235	NC_021810	TCA	2	6	585586	585591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814764
12236	NC_021810	GCG	2	6	585613	585618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814764
12237	NC_021810	AGC	2	6	585742	585747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814764
12238	NC_021810	CGC	2	6	585826	585831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814764
12239	NC_021810	CGC	2	6	585844	585849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814764
12240	NC_021810	GC	3	6	585868	585873	0 %	0 %	50 %	50 %	525814764
12241	NC_021810	GCG	2	6	585924	585929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814764
12242	NC_021810	CGG	2	6	585953	585958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814764
12243	NC_021810	CGT	2	6	586016	586021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814764
12244	NC_021810	CCG	2	6	586052	586057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814764
12245	NC_021810	GCG	2	6	586117	586122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814764
12246	NC_021810	GC	3	6	586129	586134	0 %	0 %	50 %	50 %	525814764
12247	NC_021810	CGC	3	9	586195	586203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814764
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12253	NC_021810	T	6	6	586390	586395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12269	NC_021810	AATT	2	8	587128	587135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12271	NC_021810	GCT	2	6	587373	587378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814766
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12273	NC_021810	AGCGC	2	10	587494	587503	20 %	0 %	40 %	40 %	525814766
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12282	NC_021810	GAA	2	6	587925	587930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814766
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12325	NC_021810	GCC	2	6	589486	589491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12326	NC_021810	ATATTG	2	12	589550	589561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525814767
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12336	NC_021810	CGA	2	6	589830	589835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814767
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12340	NC_021810	GC	3	6	590010	590015	0 %	0 %	50 %	50 %	525814767
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12344	NC_021810	TCC	2	6	590237	590242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814768
12345	NC_021810	CG	3	6	590275	590280	0 %	0 %	50 %	50 %	525814768
12346	NC_021810	CG	3	6	590294	590299	0 %	0 %	50 %	50 %	525814768
12347	NC_021810	GAT	2	6	590311	590316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814768
12348	NC_021810	TCG	2	6	590367	590372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814768
12349	NC_021810	ACGG	2	8	590413	590420	25 %	0 %	50 %	25 %	525814768
12350	NC_021810	CGG	2	6	590487	590492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814768
12351	NC_021810	A	6	6	590511	590516	100 %	0 %	0 %	0 %	525814768
12352	NC_021810	AAGA	2	8	590576	590583	75 %	0 %	25 %	0 %	525814768
12353	NC_021810	AG	3	6	590639	590644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12354	NC_021810	TACC	2	8	590755	590762	25 %	25 %	0 %	50 %	525814769
12355	NC_021810	CTG	2	6	590792	590797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814769
12356	NC_021810	CTG	2	6	590810	590815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814769
12357	NC_021810	AAT	2	6	590897	590902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814769
12358	NC_021810	CAG	3	9	590903	590911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814769
12359	NC_021810	GCG	2	6	590916	590921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814769
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12362	NC_021810	GGA	2	6	591196	591201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814769
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12483	NC_021810	TGG	2	6	596442	596447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814772
12484	NC_021810	CGG	2	6	596491	596496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814772
12485	NC_021810	AG	4	8	596509	596516	50 %	0 %	50 %	0 %	525814772
12486	NC_021810	GGC	2	6	596553	596558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814772
12487	NC_021810	TCC	2	6	596577	596582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814772
12488	NC_021810	TCA	2	6	596599	596604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814772
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12490	NC_021810	CTG	2	6	596639	596644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814772
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12493	NC_021810	TCT	2	6	596846	596851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814773
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12499	NC_021810	GC	3	6	597099	597104	0 %	0 %	50 %	50 %	525814773
12500	NC_021810	GAC	2	6	597123	597128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814773

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