MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021810	ACCG	2	8	552230	552237	25 %	0 %	25 %	50 %	525814735
11502	NC_021810	CGG	2	6	552263	552268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814735
11503	NC_021810	CGT	2	6	552269	552274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814735
11504	NC_021810	ATG	2	6	552286	552291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814735
11505	NC_021810	CG	3	6	552293	552298	0 %	0 %	50 %	50 %	525814735
11506	NC_021810	GTTG	2	8	552311	552318	0 %	50 %	50 %	0 %	525814735
11507	NC_021810	GTG	2	6	552321	552326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814735
11508	NC_021810	AGCG	2	8	552372	552379	25 %	0 %	50 %	25 %	525814735
11509	NC_021810	GTG	2	6	552411	552416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814735
11510	NC_021810	GAC	2	6	552426	552431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814735
11511	NC_021810	ATTAC	2	10	552439	552448	40 %	40 %	0 %	20 %	525814735
11512	NC_021810	ACCG	2	8	552488	552495	25 %	0 %	25 %	50 %	525814735
11513	NC_021810	CGC	2	6	552515	552520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814735
11514	NC_021810	GTG	2	6	552645	552650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814735
11515	NC_021810	GGC	2	6	552654	552659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814735
11516	NC_021810	A	7	7	552720	552726	100 %	0 %	0 %	0 %	525814735
11517	NC_021810	CGC	2	6	552808	552813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11518	NC_021810	CGC	2	6	552833	552838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814736
11519	NC_021810	GA	3	6	552912	552917	50 %	0 %	50 %	0 %	525814736
11520	NC_021810	GC	4	8	552924	552931	0 %	0 %	50 %	50 %	525814736
11521	NC_021810	GGCGC	2	10	552994	553003	0 %	0 %	60 %	40 %	525814736
11522	NC_021810	GCC	2	6	553104	553109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814736
11523	NC_021810	CCAT	2	8	553155	553162	25 %	25 %	0 %	50 %	525814736
11524	NC_021810	TGG	2	6	553170	553175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814736
11525	NC_021810	GGA	3	9	553178	553186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814736
11526	NC_021810	ACA	2	6	553281	553286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_021810	AC	3	6	553338	553343	50 %	0 %	0 %	50 %	525814737
11528	NC_021810	TAC	2	6	553662	553667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814738
11529	NC_021810	GAA	2	6	553704	553709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814738
11530	NC_021810	GAAA	2	8	553712	553719	75 %	0 %	25 %	0 %	525814738
11531	NC_021810	GAA	2	6	553773	553778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814738
11532	NC_021810	A	6	6	553842	553847	100 %	0 %	0 %	0 %	525814738
11533	NC_021810	CT	3	6	553890	553895	0 %	50 %	0 %	50 %	525814738
11534	NC_021810	TCG	2	6	553907	553912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814738
11535	NC_021810	CCTT	2	8	553948	553955	0 %	50 %	0 %	50 %	525814738
11536	NC_021810	GCT	2	6	553982	553987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814738
11537	NC_021810	GGATG	2	10	554024	554033	20 %	20 %	60 %	0 %	525814738
11538	NC_021810	TCG	2	6	554068	554073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814738
11539	NC_021810	GCT	2	6	554074	554079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814738
11540	NC_021810	TCG	2	6	554152	554157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814738
11541	NC_021810	TTTG	2	8	554210	554217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_021810	ATTA	2	8	554253	554260	50 %	50 %	0 %	0 %	525814739
11543	NC_021810	TGCC	2	8	554286	554293	0 %	25 %	25 %	50 %	525814739
11544	NC_021810	TTA	2	6	554307	554312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814739
11545	NC_021810	GCTT	2	8	554332	554339	0 %	50 %	25 %	25 %	525814739
11546	NC_021810	TC	4	8	554341	554348	0 %	50 %	0 %	50 %	525814739
11547	NC_021810	CTG	2	6	554357	554362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11548	NC_021810	T	6	6	554397	554402	0 %	100 %	0 %	0 %	525814739
11549	NC_021810	ATC	2	6	554412	554417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814739
11550	NC_021810	CTG	2	6	554460	554465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11551	NC_021810	ATCC	2	8	554471	554478	25 %	25 %	0 %	50 %	525814739
11552	NC_021810	CGG	2	6	554524	554529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814739
11553	NC_021810	CG	3	6	554546	554551	0 %	0 %	50 %	50 %	525814739
11554	NC_021810	GCC	2	6	554574	554579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814739
11555	NC_021810	GCT	2	6	554624	554629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11556	NC_021810	ATT	2	6	554743	554748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814739
11557	NC_021810	CGAAA	2	10	554750	554759	60 %	0 %	20 %	20 %	525814739
11558	NC_021810	CTG	2	6	554808	554813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11559	NC_021810	CAA	2	6	554882	554887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814739
11560	NC_021810	CTA	2	6	554904	554909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814739
11561	NC_021810	CGC	2	6	555038	555043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814739
11562	NC_021810	ATC	2	6	555076	555081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814739
11563	NC_021810	TGC	2	6	555202	555207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11564	NC_021810	CGT	2	6	555255	555260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11565	NC_021810	TGA	3	9	555337	555345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814739
11566	NC_021810	CG	3	6	555442	555447	0 %	0 %	50 %	50 %	525814739
11567	NC_021810	TCGG	2	8	555465	555472	0 %	25 %	50 %	25 %	525814739
11568	NC_021810	ATT	2	6	555576	555581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814739
11569	NC_021810	CGG	2	6	555622	555627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814739
11570	NC_021810	GGC	2	6	555717	555722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814739
11571	NC_021810	ATG	2	6	555775	555780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814739
11572	NC_021810	AAG	2	6	555796	555801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814739
11573	NC_021810	CGCT	2	8	555841	555848	0 %	25 %	25 %	50 %	525814739
11574	NC_021810	GAC	2	6	556001	556006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11575	NC_021810	AC	3	6	556019	556024	50 %	0 %	0 %	50 %	525814739
11576	NC_021810	CAG	2	6	556089	556094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11577	NC_021810	CAGGC	2	10	556109	556118	20 %	0 %	40 %	40 %	525814739
11578	NC_021810	AAC	2	6	556186	556191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814739
11579	NC_021810	CAT	2	6	556202	556207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814739
11580	NC_021810	TCG	2	6	556236	556241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814739
11581	NC_021810	ACC	2	6	556360	556365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814740
11582	NC_021810	CCA	3	9	556418	556426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814740
11583	NC_021810	CG	3	6	556505	556510	0 %	0 %	50 %	50 %	525814740
11584	NC_021810	CAG	2	6	556548	556553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814740
11585	NC_021810	GTA	2	6	556646	556651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814740
11586	NC_021810	TAA	2	6	556664	556669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814740
11587	NC_021810	GCCA	2	8	556683	556690	25 %	0 %	25 %	50 %	525814740
11588	NC_021810	CCG	2	6	556792	556797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814740
11589	NC_021810	GCACT	2	10	556881	556890	20 %	20 %	20 %	40 %	525814740
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11591	NC_021810	CA	3	6	556922	556927	50 %	0 %	0 %	50 %	525814740
11592	NC_021810	GCC	2	6	556960	556965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814740
11593	NC_021810	CGC	2	6	556970	556975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814740
11594	NC_021810	ACC	3	9	556996	557004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814740
11595	NC_021810	AAT	2	6	557064	557069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814740
11596	NC_021810	CGG	2	6	557072	557077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814740
11597	NC_021810	TTCG	2	8	557232	557239	0 %	50 %	25 %	25 %	525814740
11598	NC_021810	CCG	2	6	557422	557427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814740
11599	NC_021810	CTG	2	6	557451	557456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814740
11600	NC_021810	CCG	2	6	557498	557503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814740
11601	NC_021810	TCA	2	6	557527	557532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814740
11602	NC_021810	GC	3	6	557539	557544	0 %	0 %	50 %	50 %	525814740
11603	NC_021810	ACC	2	6	557577	557582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_021810	A	6	6	557629	557634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_021810	GGA	2	6	557664	557669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814741
11606	NC_021810	CAG	2	6	557677	557682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814741
11607	NC_021810	CAC	2	6	557938	557943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814741
11608	NC_021810	TGA	2	6	557972	557977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814741
11609	NC_021810	GA	3	6	558069	558074	50 %	0 %	50 %	0 %	525814741
11610	NC_021810	T	6	6	558081	558086	0 %	100 %	0 %	0 %	525814741
11611	NC_021810	CAT	2	6	558123	558128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814741
11612	NC_021810	GGC	2	6	558220	558225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_021810	AG	3	6	558305	558310	50 %	0 %	50 %	0 %	525814742
11614	NC_021810	CGC	2	6	558322	558327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814742
11615	NC_021810	AGA	2	6	558409	558414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814742
11616	NC_021810	TGCGC	2	10	558415	558424	0 %	20 %	40 %	40 %	525814742
11617	NC_021810	AAACG	2	10	558438	558447	60 %	0 %	20 %	20 %	525814742
11618	NC_021810	AGT	2	6	558469	558474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814742
11619	NC_021810	CT	3	6	558525	558530	0 %	50 %	0 %	50 %	525814742
11620	NC_021810	TGCCC	2	10	558627	558636	0 %	20 %	20 %	60 %	525814742
11621	NC_021810	GGC	2	6	558719	558724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814742
11622	NC_021810	TGA	2	6	558771	558776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814742
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11624	NC_021810	CGG	2	6	558934	558939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814743
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11641	NC_021810	GCCAG	2	10	559753	559762	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11642	NC_021810	ACG	2	6	559804	559809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11645	NC_021810	TAA	2	6	559879	559884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11646	NC_021810	CTTT	2	8	560006	560013	0 %	75 %	0 %	25 %	525814745
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11734	NC_021810	T	8	8	564316	564323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11735	NC_021810	CGG	2	6	564363	564368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11738	NC_021810	CAA	2	6	564498	564503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11739	NC_021810	GC	3	6	564583	564588	0 %	0 %	50 %	50 %	525814748
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11742	NC_021810	TCA	2	6	564758	564763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814748
11743	NC_021810	GCG	2	6	564920	564925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814748
11744	NC_021810	TTG	2	6	564931	564936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814748
11745	NC_021810	ACC	2	6	564979	564984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814748
11746	NC_021810	TTC	2	6	565003	565008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814748
11747	NC_021810	GC	3	6	565013	565018	0 %	0 %	50 %	50 %	525814748
11748	NC_021810	CTGG	2	8	565026	565033	0 %	25 %	50 %	25 %	525814748
11749	NC_021810	TGG	2	6	565093	565098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814748
11750	NC_021810	CTG	2	6	565102	565107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814748
11751	NC_021810	TCA	2	6	565176	565181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814748
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11754	NC_021810	CCAA	2	8	565322	565329	50 %	0 %	0 %	50 %	525814748
11755	NC_021810	CGCGAC	2	12	565395	565406	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525814749
11756	NC_021810	TCG	2	6	565414	565419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814749
11757	NC_021810	CTG	2	6	565455	565460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814749
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11762	NC_021810	TCT	2	6	565657	565662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814749
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11789	NC_021810	ATT	2	6	566794	566799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11790	NC_021810	TAA	2	6	566857	566862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11791	NC_021810	ATTC	2	8	566903	566910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11792	NC_021810	ATA	2	6	566913	566918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11793	NC_021810	TGACC	2	10	566943	566952	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11794	NC_021810	ATAAA	2	10	566966	566975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11795	NC_021810	TCT	2	6	566993	566998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11796	NC_021810	TCA	2	6	567006	567011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11797	NC_021810	CT	3	6	567024	567029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11798	NC_021810	ATTA	2	8	567056	567063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11799	NC_021810	A	6	6	567085	567090	100 %	0 %	0 %	0 %	525814750
11800	NC_021810	CTATCG	2	12	567098	567109	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525814750
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11814	NC_021810	GCG	2	6	567497	567502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814750
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11850	NC_021810	CGA	2	6	568674	568679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814750
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11853	NC_021810	GGCG	2	8	568770	568777	0 %	0 %	75 %	25 %	525814750
11854	NC_021810	CTG	2	6	568780	568785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814750
11855	NC_021810	CAT	2	6	568806	568811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814750
11856	NC_021810	A	6	6	568836	568841	100 %	0 %	0 %	0 %	525814750
11857	NC_021810	CGTG	2	8	568857	568864	0 %	25 %	50 %	25 %	525814750
11858	NC_021810	A	7	7	568898	568904	100 %	0 %	0 %	0 %	525814750
11859	NC_021810	GC	3	6	568952	568957	0 %	0 %	50 %	50 %	525814750
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11861	NC_021810	GTGAGC	2	12	569053	569064	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525814750
11862	NC_021810	GAT	2	6	569125	569130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814750
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11981	NC_021810	TTA	2	6	573800	573805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814752
11982	NC_021810	CAG	2	6	573844	573849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814752
11983	NC_021810	CG	4	8	573858	573865	0 %	0 %	50 %	50 %	525814752
11984	NC_021810	TGC	2	6	573956	573961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814752
11985	NC_021810	TTGGT	2	10	573989	573998	0 %	60 %	40 %	0 %	525814752
11986	NC_021810	ACA	2	6	573999	574004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814752
11987	NC_021810	GCC	2	6	574013	574018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814752
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11989	NC_021810	GCT	2	6	574248	574253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814752
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11991	NC_021810	CAT	2	6	574616	574621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814753
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11998	NC_021810	A	6	6	574830	574835	100 %	0 %	0 %	0 %	525814753
11999	NC_021810	CTT	2	6	574840	574845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814753
12000	NC_021810	ATA	2	6	574859	574864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814753

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