MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021810	CCA	2	6	478069	478074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814645
10002	NC_021810	GCG	2	6	478081	478086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814645
10003	NC_021810	CTTA	2	8	478118	478125	25 %	50 %	0 %	25 %	525814645
10004	NC_021810	GCA	2	6	478144	478149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814645
10005	NC_021810	CGG	2	6	478152	478157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814645
10006	NC_021810	GAT	2	6	478159	478164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814645
10007	NC_021810	ATT	2	6	478169	478174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814645
10008	NC_021810	GATAAT	2	12	478190	478201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525814645
10009	NC_021810	GCC	2	6	478202	478207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814645
10010	NC_021810	GTC	2	6	478274	478279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814645
10011	NC_021810	CGT	2	6	478322	478327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814645
10012	NC_021810	CCG	2	6	478359	478364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814645
10013	NC_021810	GC	3	6	478392	478397	0 %	0 %	50 %	50 %	525814645
10014	NC_021810	CAG	2	6	478499	478504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814645
10015	NC_021810	GCA	2	6	478567	478572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814645
10016	NC_021810	GCGCCA	2	12	478579	478590	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525814645
10017	NC_021810	GGC	2	6	478667	478672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814645
10018	NC_021810	CA	3	6	478693	478698	50 %	0 %	0 %	50 %	525814645
10019	NC_021810	CCG	2	6	478705	478710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814645
10020	NC_021810	ATA	2	6	478719	478724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814645
10021	NC_021810	TCG	2	6	478737	478742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814645
10022	NC_021810	CCA	2	6	478753	478758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814645
10023	NC_021810	CTTTCG	2	12	478782	478793	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525814645
10024	NC_021810	CG	3	6	478875	478880	0 %	0 %	50 %	50 %	525814645
10025	NC_021810	TCG	2	6	478977	478982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814645
10026	NC_021810	GAA	2	6	479023	479028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814645
10027	NC_021810	GCC	2	6	479061	479066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814645
10028	NC_021810	GAA	2	6	479155	479160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814645
10029	NC_021810	CG	3	6	479182	479187	0 %	0 %	50 %	50 %	525814645
10030	NC_021810	CAA	2	6	479210	479215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814645
10031	NC_021810	CAA	2	6	479265	479270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814646
10032	NC_021810	CGC	2	6	479387	479392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814646
10033	NC_021810	ACC	2	6	479449	479454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814646
10034	NC_021810	CTG	2	6	479469	479474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814646
10035	NC_021810	CAG	2	6	479492	479497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814646
10036	NC_021810	TCA	2	6	479498	479503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814646
10037	NC_021810	GCA	2	6	479531	479536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814646
10038	NC_021810	GCG	2	6	479551	479556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814646
10039	NC_021810	CG	3	6	479558	479563	0 %	0 %	50 %	50 %	525814646
10040	NC_021810	AAC	2	6	479673	479678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814646
10041	NC_021810	CTG	2	6	479682	479687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814646
10042	NC_021810	AAT	2	6	479761	479766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814646
10043	NC_021810	CTG	2	6	479834	479839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814647
10044	NC_021810	ACTAC	2	10	479889	479898	40 %	20 %	0 %	40 %	525814647
10045	NC_021810	AAT	2	6	479957	479962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814647
10046	NC_021810	ACC	2	6	479988	479993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814647
10047	NC_021810	CTG	2	6	479999	480004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814647
10048	NC_021810	GC	3	6	480075	480080	0 %	0 %	50 %	50 %	525814647
10049	NC_021810	TGA	2	6	480100	480105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814647
10050	NC_021810	CAGTA	2	10	480171	480180	40 %	20 %	20 %	20 %	525814647
10051	NC_021810	ATG	2	6	480213	480218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814647
10052	NC_021810	GCA	2	6	480241	480246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814647
10053	NC_021810	CCA	2	6	480304	480309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814647
10054	NC_021810	GGC	2	6	480332	480337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814648
10055	NC_021810	CGG	2	6	480433	480438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814648
10056	NC_021810	CAT	2	6	480472	480477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814648
10057	NC_021810	CAG	3	9	480559	480567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814648
10058	NC_021810	GC	3	6	480620	480625	0 %	0 %	50 %	50 %	525814648
10059	NC_021810	GGA	2	6	480643	480648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814648
10060	NC_021810	ACC	2	6	480650	480655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814648
10061	NC_021810	CCA	2	6	480683	480688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814648
10062	NC_021810	CGG	2	6	480777	480782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814648
10063	NC_021810	TCGCA	2	10	480831	480840	20 %	20 %	20 %	40 %	525814648
10064	NC_021810	GCG	2	6	481029	481034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814648
10065	NC_021810	CAG	2	6	481039	481044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814648
10066	NC_021810	CG	3	6	481055	481060	0 %	0 %	50 %	50 %	525814648
10067	NC_021810	CAG	2	6	481087	481092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814648
10068	NC_021810	T	6	6	481100	481105	0 %	100 %	0 %	0 %	525814648
10069	NC_021810	AAATA	2	10	481206	481215	80 %	20 %	0 %	0 %	525814648
10070	NC_021810	GGC	2	6	481269	481274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814648
10071	NC_021810	CCA	2	6	481299	481304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814648
10072	NC_021810	ACT	2	6	481426	481431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814649
10073	NC_021810	CGC	2	6	481447	481452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814649
10074	NC_021810	GCC	3	9	481481	481489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814649
10075	NC_021810	GC	3	6	481490	481495	0 %	0 %	50 %	50 %	525814649
10076	NC_021810	CA	3	6	481496	481501	50 %	0 %	0 %	50 %	525814649
10077	NC_021810	GCA	2	6	481570	481575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814649
10078	NC_021810	GC	3	6	481576	481581	0 %	0 %	50 %	50 %	525814649
10079	NC_021810	CGC	3	9	481579	481587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814649
10080	NC_021810	CGG	2	6	481631	481636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814649
10081	NC_021810	CCA	2	6	481651	481656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814649
10082	NC_021810	TCG	2	6	481782	481787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814649
10083	NC_021810	AG	3	6	481845	481850	50 %	0 %	50 %	0 %	525814649
10084	NC_021810	ACG	2	6	481859	481864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814649
10085	NC_021810	TAAT	2	8	481869	481876	50 %	50 %	0 %	0 %	525814649
10086	NC_021810	TCG	2	6	481884	481889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814649
10087	NC_021810	CAC	2	6	481897	481902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814649
10088	NC_021810	AGA	3	9	481913	481921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814649
10089	NC_021810	ACC	3	9	481964	481972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814649
10090	NC_021810	GCC	2	6	482031	482036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814649
10091	NC_021810	CG	3	6	482096	482101	0 %	0 %	50 %	50 %	525814649
10092	NC_021810	CG	3	6	482143	482148	0 %	0 %	50 %	50 %	525814649
10093	NC_021810	TAA	2	6	482185	482190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814649
10094	NC_021810	T	6	6	482203	482208	0 %	100 %	0 %	0 %	525814649
10095	NC_021810	AAG	2	6	482217	482222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814649
10096	NC_021810	CGGA	2	8	482246	482253	25 %	0 %	50 %	25 %	525814649
10097	NC_021810	CAT	2	6	482296	482301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814649
10098	NC_021810	T	6	6	482459	482464	0 %	100 %	0 %	0 %	525814649
10099	NC_021810	ACCA	2	8	482522	482529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_021810	GCA	2	6	482533	482538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_021810	ATC	2	6	482555	482560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_021810	A	6	6	482629	482634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_021810	CAG	2	6	482636	482641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_021810	TGC	2	6	482692	482697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_021810	GC	3	6	482739	482744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10106	NC_021810	T	6	6	482802	482807	0 %	100 %	0 %	0 %	525814650
10107	NC_021810	AGT	2	6	482821	482826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814650
10108	NC_021810	GAG	2	6	482830	482835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814650
10109	NC_021810	A	7	7	482838	482844	100 %	0 %	0 %	0 %	525814650
10110	NC_021810	GCCA	2	8	482856	482863	25 %	0 %	25 %	50 %	525814650
10111	NC_021810	CGC	2	6	482864	482869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814650
10112	NC_021810	CGC	2	6	482891	482896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814650
10113	NC_021810	AAT	2	6	483174	483179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814650
10114	NC_021810	GGC	2	6	483317	483322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814650
10115	NC_021810	CCG	2	6	483383	483388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814650
10116	NC_021810	CTT	2	6	483398	483403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814650
10117	NC_021810	GAT	2	6	483434	483439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814650
10118	NC_021810	CCG	2	6	483461	483466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814650
10119	NC_021810	TCAA	2	8	483508	483515	50 %	25 %	0 %	25 %	525814650
10120	NC_021810	GTC	2	6	483558	483563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814650
10121	NC_021810	C	6	6	483583	483588	0 %	0 %	0 %	100 %	525814650
10122	NC_021810	GCG	2	6	483595	483600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814650
10123	NC_021810	CCGCG	2	10	483603	483612	0 %	0 %	40 %	60 %	525814650
10124	NC_021810	CTT	2	6	483758	483763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814650
10125	NC_021810	AGC	2	6	483781	483786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814650
10126	NC_021810	CAG	2	6	483816	483821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814650
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10129	NC_021810	ATC	3	9	483937	483945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814650
10130	NC_021810	CAG	2	6	483981	483986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814650
10131	NC_021810	GCG	2	6	484045	484050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814650
10132	NC_021810	GC	3	6	484124	484129	0 %	0 %	50 %	50 %	525814650
10133	NC_021810	GC	3	6	484137	484142	0 %	0 %	50 %	50 %	525814650
10134	NC_021810	CAGC	2	8	484245	484252	25 %	0 %	25 %	50 %	525814650
10135	NC_021810	GCG	2	6	484301	484306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814650
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10137	NC_021810	AGTG	2	8	484318	484325	25 %	25 %	50 %	0 %	525814650
10138	NC_021810	TCG	2	6	484519	484524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814650
10139	NC_021810	GCG	2	6	484529	484534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814650
10140	NC_021810	GTCGCC	2	12	484579	484590	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525814650
10141	NC_021810	AGC	2	6	484678	484683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814650
10142	NC_021810	TCG	2	6	484703	484708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814650
10143	NC_021810	GC	3	6	484785	484790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10144	NC_021810	TAC	2	6	484804	484809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10145	NC_021810	ATCT	2	8	484818	484825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10146	NC_021810	CAG	2	6	484943	484948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814651
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10148	NC_021810	GAT	2	6	485095	485100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814651
10149	NC_021810	TAC	2	6	485169	485174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814651
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10151	NC_021810	GGC	2	6	485207	485212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814651
10152	NC_021810	CTGG	2	8	485242	485249	0 %	25 %	50 %	25 %	525814651
10153	NC_021810	CTGC	2	8	485255	485262	0 %	25 %	25 %	50 %	525814651
10154	NC_021810	AGC	2	6	485270	485275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814651
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10158	NC_021810	GCG	3	9	485388	485396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814651
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10165	NC_021810	TGA	2	6	485724	485729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814651
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10169	NC_021810	AAGAT	2	10	485885	485894	60 %	20 %	20 %	0 %	525814651
10170	NC_021810	A	7	7	485912	485918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10171	NC_021810	TTAA	2	8	485926	485933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10172	NC_021810	TATT	2	8	485935	485942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10173	NC_021810	AC	3	6	485954	485959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10174	NC_021810	TGT	2	6	485985	485990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10175	NC_021810	TGA	2	6	486017	486022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814652
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10177	NC_021810	GCC	2	6	486118	486123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814652
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10185	NC_021810	TA	3	6	486500	486505	50 %	50 %	0 %	0 %	525814652
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10207	NC_021810	T	6	6	487823	487828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10208	NC_021810	AGA	2	6	487842	487847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10209	NC_021810	CA	3	6	487852	487857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10210	NC_021810	A	6	6	488034	488039	100 %	0 %	0 %	0 %	525814654
10211	NC_021810	GAA	2	6	488055	488060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814654
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10213	NC_021810	GCA	2	6	488147	488152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814654
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10221	NC_021810	CCGT	2	8	488659	488666	0 %	25 %	25 %	50 %	525814655
10222	NC_021810	CTTTAT	2	12	488793	488804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525814655
10223	NC_021810	A	6	6	488866	488871	100 %	0 %	0 %	0 %	525814655
10224	NC_021810	CGA	2	6	488913	488918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814655
10225	NC_021810	ATC	2	6	488965	488970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814655
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10229	NC_021810	CCA	2	6	489201	489206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814655
10230	NC_021810	GAA	2	6	489217	489222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814655
10231	NC_021810	GCGT	2	8	489283	489290	0 %	25 %	50 %	25 %	525814655
10232	NC_021810	CGG	2	6	489443	489448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814655
10233	NC_021810	CA	3	6	489465	489470	50 %	0 %	0 %	50 %	525814655
10234	NC_021810	GGC	2	6	489577	489582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814655
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10238	NC_021810	T	6	6	489883	489888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10239	NC_021810	CAT	2	6	489911	489916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10240	NC_021810	TTC	2	6	489931	489936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10242	NC_021810	GC	3	6	489988	489993	0 %	0 %	50 %	50 %	525814656
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10259	NC_021810	CTG	2	6	490631	490636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814657
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10263	NC_021810	TGG	2	6	490785	490790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814657
10264	NC_021810	GCG	2	6	490802	490807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814657
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10278	NC_021810	TGC	2	6	491328	491333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814657
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10302	NC_021810	CAT	2	6	492603	492608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10308	NC_021810	GCA	2	6	492755	492760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10351	NC_021810	A	6	6	494923	494928	100 %	0 %	0 %	0 %	525814661
10352	NC_021810	TATG	2	8	494940	494947	25 %	50 %	25 %	0 %	525814661
10353	NC_021810	TGA	2	6	494957	494962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814661
10354	NC_021810	A	6	6	494967	494972	100 %	0 %	0 %	0 %	525814661
10355	NC_021810	ACC	2	6	495016	495021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814661
10356	NC_021810	GC	4	8	495033	495040	0 %	0 %	50 %	50 %	525814661
10357	NC_021810	A	6	6	495054	495059	100 %	0 %	0 %	0 %	525814661
10358	NC_021810	A	6	6	495082	495087	100 %	0 %	0 %	0 %	525814661
10359	NC_021810	GATG	2	8	495129	495136	25 %	25 %	50 %	0 %	525814661
10360	NC_021810	GC	3	6	495167	495172	0 %	0 %	50 %	50 %	525814661
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10365	NC_021810	ATT	2	6	495347	495352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814661
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10422	NC_021810	TAA	2	6	498764	498769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10488	NC_021810	GAA	2	6	501885	501890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814666
10489	NC_021810	TAC	2	6	501978	501983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814666
10490	NC_021810	AAT	2	6	501987	501992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814666
10491	NC_021810	GCTTTA	2	12	502030	502041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525814666
10492	NC_021810	GAA	2	6	502107	502112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814666
10493	NC_021810	TGAT	2	8	502240	502247	25 %	50 %	25 %	0 %	525814666
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10498	NC_021810	TGC	2	6	502531	502536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814666
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10500	NC_021810	AGC	2	6	502679	502684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814666

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