MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_021810	CTGG	2	8	4731851	4731858	0 %	25 %	50 %	25 %	525818653
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100004	NC_021810	GTC	2	6	4731882	4731887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818653
100005	NC_021810	TCA	2	6	4731904	4731909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818653
100006	NC_021810	CGCC	2	8	4731959	4731966	0 %	0 %	25 %	75 %	525818653
100007	NC_021810	AAC	2	6	4731991	4731996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525818653
100008	NC_021810	AT	3	6	4732159	4732164	50 %	50 %	0 %	0 %	525818654
100009	NC_021810	ATT	2	6	4732204	4732209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818654
100010	NC_021810	TATG	2	8	4732527	4732534	25 %	50 %	25 %	0 %	525818654
100011	NC_021810	TCG	2	6	4732548	4732553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818654
100012	NC_021810	TAT	2	6	4732573	4732578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818654
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100016	NC_021810	GC	3	6	4732719	4732724	0 %	0 %	50 %	50 %	525818654
100017	NC_021810	TAT	2	6	4732743	4732748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818654
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100020	NC_021810	ATA	2	6	4732867	4732872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100021	NC_021810	AGT	2	6	4732876	4732881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100022	NC_021810	GGCA	2	8	4732908	4732915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100023	NC_021810	T	7	7	4732965	4732971	0 %	100 %	0 %	0 %	525818655
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100041	NC_021810	ACCA	2	8	4733901	4733908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100042	NC_021810	GAT	2	6	4733915	4733920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100043	NC_021810	TA	4	8	4733921	4733928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100044	NC_021810	TAC	2	6	4733934	4733939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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100047	NC_021810	ATA	2	6	4733956	4733961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100055	NC_021810	CAG	2	6	4734236	4734241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525818656
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100062	NC_021810	CGAT	2	8	4734492	4734499	25 %	25 %	25 %	25 %	525818656
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100088	NC_021810	A	6	6	4735705	4735710	100 %	0 %	0 %	0 %	525818657
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100104	NC_021810	ATT	2	6	4736317	4736322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100105	NC_021810	AT	3	6	4736328	4736333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100106	NC_021810	CCCG	2	8	4736398	4736405	0 %	0 %	25 %	75 %	525818659
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100116	NC_021810	ATT	2	6	4736722	4736727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818659
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100119	NC_021810	TCA	2	6	4736857	4736862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818660
100120	NC_021810	TCA	2	6	4736914	4736919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818660
100121	NC_021810	GAT	2	6	4736921	4736926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525818660
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100127	NC_021810	T	6	6	4737224	4737229	0 %	100 %	0 %	0 %	525818660
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100131	NC_021810	CTG	2	6	4737393	4737398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818660
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100138	NC_021810	GCC	3	9	4737911	4737919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818661
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100148	NC_021810	GGCG	2	8	4738359	4738366	0 %	0 %	75 %	25 %	525818662
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100211	NC_021810	TTA	2	6	4741831	4741836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100213	NC_021810	TA	3	6	4741967	4741972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100214	NC_021810	ATG	2	6	4742001	4742006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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100218	NC_021810	TCC	2	6	4742210	4742215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100219	NC_021810	GAT	2	6	4742249	4742254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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100221	NC_021810	ATT	2	6	4742319	4742324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100222	NC_021810	A	7	7	4742329	4742335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100223	NC_021810	ATA	2	6	4742493	4742498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100224	NC_021810	AGC	2	6	4742499	4742504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100225	NC_021810	A	8	8	4742515	4742522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100226	NC_021810	CT	4	8	4742604	4742611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100227	NC_021810	AGTT	2	8	4742649	4742656	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100228	NC_021810	ATT	2	6	4742665	4742670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100229	NC_021810	AAT	2	6	4742709	4742714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100230	NC_021810	ATA	2	6	4742766	4742771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100231	NC_021810	CAG	2	6	4742799	4742804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100232	NC_021810	TTA	2	6	4742847	4742852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100233	NC_021810	TAT	2	6	4742881	4742886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100234	NC_021810	TCCTGT	2	12	4742902	4742913	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525818667
100235	NC_021810	A	6	6	4742921	4742926	100 %	0 %	0 %	0 %	525818667
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100356	NC_021810	T	6	6	4748914	4748919	0 %	100 %	0 %	0 %	525818672
100357	NC_021810	CCA	2	6	4748921	4748926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525818672
100358	NC_021810	TGG	2	6	4749089	4749094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525818672
100359	NC_021810	CGC	3	9	4749121	4749129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818672
100360	NC_021810	CAA	2	6	4749135	4749140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525818672
100361	NC_021810	TGC	2	6	4749153	4749158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818672
100362	NC_021810	CCT	2	6	4749222	4749227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525818672
100363	NC_021810	TCG	2	6	4749240	4749245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818672
100364	NC_021810	CAC	2	6	4749261	4749266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525818672
100365	NC_021810	ATA	2	6	4749281	4749286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525818672
100366	NC_021810	GCT	2	6	4749294	4749299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818672
100367	NC_021810	GCTTC	2	10	4749315	4749324	0 %	40 %	20 %	40 %	525818672
100368	NC_021810	CTTT	2	8	4749327	4749334	0 %	75 %	0 %	25 %	525818672
100369	NC_021810	TTTC	2	8	4749366	4749373	0 %	75 %	0 %	25 %	525818672
100370	NC_021810	TCA	2	6	4749417	4749422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818672
100371	NC_021810	TGG	2	6	4749450	4749455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525818672
100372	NC_021810	ATT	2	6	4749514	4749519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818672
100373	NC_021810	CTT	2	6	4749534	4749539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525818672
100374	NC_021810	CGT	2	6	4749646	4749651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818672
100375	NC_021810	CGC	2	6	4749682	4749687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818672
100376	NC_021810	G	6	6	4749739	4749744	0 %	0 %	100 %	0 %	525818672
100377	NC_021810	ATT	2	6	4749767	4749772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818672
100378	NC_021810	GCT	2	6	4749820	4749825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818673
100379	NC_021810	TTC	2	6	4749922	4749927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525818673
100380	NC_021810	GC	3	6	4749999	4750004	0 %	0 %	50 %	50 %	525818673
100381	NC_021810	T	6	6	4750029	4750034	0 %	100 %	0 %	0 %	525818673
100382	NC_021810	GAC	2	6	4750057	4750062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525818673
100383	NC_021810	ATTCA	2	10	4750102	4750111	40 %	40 %	0 %	20 %	525818673
100384	NC_021810	CGCTTC	2	12	4750126	4750137	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525818673
100385	NC_021810	CGC	2	6	4750152	4750157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818673
100386	NC_021810	TATT	2	8	4750205	4750212	25 %	75 %	0 %	0 %	525818673
100387	NC_021810	TGAG	2	8	4750236	4750243	25 %	25 %	50 %	0 %	525818673
100388	NC_021810	TAA	2	6	4750282	4750287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525818673
100389	NC_021810	AT	3	6	4750392	4750397	50 %	50 %	0 %	0 %	525818673
100390	NC_021810	GTT	2	6	4750436	4750441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525818673
100391	NC_021810	GCT	2	6	4750561	4750566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818673
100392	NC_021810	CTG	2	6	4750573	4750578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818673
100393	NC_021810	GC	3	6	4750579	4750584	0 %	0 %	50 %	50 %	525818673
100394	NC_021810	ATT	2	6	4750600	4750605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818673
100395	NC_021810	CTG	2	6	4750639	4750644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818673
100396	NC_021810	CTG	2	6	4750648	4750653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818673
100397	NC_021810	TAG	2	6	4750659	4750664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525818673
100398	NC_021810	AATGA	2	10	4750676	4750685	60 %	20 %	20 %	0 %	525818673
100399	NC_021810	GCTC	2	8	4750737	4750744	0 %	25 %	25 %	50 %	525818673
100400	NC_021810	GAG	2	6	4750785	4750790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525818673
100401	NC_021810	AAT	2	6	4750797	4750802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525818673
100402	NC_021810	ATA	2	6	4750817	4750822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525818673
100403	NC_021810	ATG	2	6	4750862	4750867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100404	NC_021810	AGC	2	6	4750913	4750918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525818674
100405	NC_021810	TGC	2	6	4751055	4751060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818674
100406	NC_021810	GCG	2	6	4751079	4751084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525818674
100407	NC_021810	ACC	2	6	4751108	4751113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525818674
100408	NC_021810	TTC	2	6	4751127	4751132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525818674
100409	NC_021810	GC	3	6	4751162	4751167	0 %	0 %	50 %	50 %	525818674
100410	NC_021810	TTA	2	6	4751271	4751276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818674
100411	NC_021810	CAT	2	6	4751335	4751340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818674
100412	NC_021810	TCG	2	6	4751350	4751355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818674
100413	NC_021810	TTC	2	6	4751370	4751375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525818674
100414	NC_021810	GC	3	6	4751503	4751508	0 %	0 %	50 %	50 %	525818674
100415	NC_021810	GC	3	6	4751572	4751577	0 %	0 %	50 %	50 %	525818674
100416	NC_021810	TAC	2	6	4751587	4751592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818674
100417	NC_021810	CAT	2	6	4751618	4751623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818674
100418	NC_021810	A	6	6	4751768	4751773	100 %	0 %	0 %	0 %	525818674
100419	NC_021810	CTGC	2	8	4751785	4751792	0 %	25 %	25 %	50 %	525818674
100420	NC_021810	ATT	2	6	4751840	4751845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818674
100421	NC_021810	GC	3	6	4751947	4751952	0 %	0 %	50 %	50 %	525818674
100422	NC_021810	CTG	2	6	4751988	4751993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818674
100423	NC_021810	CTGT	2	8	4752043	4752050	0 %	50 %	25 %	25 %	525818674
100424	NC_021810	ATT	2	6	4752071	4752076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818674
100425	NC_021810	GCG	2	6	4752084	4752089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525818674
100426	NC_021810	AGA	2	6	4752203	4752208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525818675
100427	NC_021810	CCG	2	6	4752226	4752231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818675
100428	NC_021810	CTG	2	6	4752278	4752283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818675
100429	NC_021810	TAA	2	6	4752343	4752348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525818675
100430	NC_021810	ACC	2	6	4752365	4752370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525818675
100431	NC_021810	TTTA	2	8	4752416	4752423	25 %	75 %	0 %	0 %	525818675
100432	NC_021810	TACC	2	8	4752430	4752437	25 %	25 %	0 %	50 %	525818675
100433	NC_021810	TGC	2	6	4752532	4752537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818675
100434	NC_021810	CTT	2	6	4752575	4752580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525818675
100435	NC_021810	CAT	2	6	4752593	4752598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818675
100436	NC_021810	CGC	3	9	4752623	4752631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818675
100437	NC_021810	ACC	2	6	4752651	4752656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525818675
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100439	NC_021810	CAA	2	6	4752697	4752702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525818675
100440	NC_021810	TGC	2	6	4752703	4752708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818675
100441	NC_021810	CTG	2	6	4752824	4752829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818675
100442	NC_021810	CGC	2	6	4752848	4752853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818675
100443	NC_021810	CCA	2	6	4752871	4752876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525818675
100444	NC_021810	CAGC	2	8	4752895	4752902	25 %	0 %	25 %	50 %	525818675
100445	NC_021810	AGC	2	6	4752954	4752959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525818675
100446	NC_021810	GC	3	6	4752958	4752963	0 %	0 %	50 %	50 %	525818675
100447	NC_021810	TTC	2	6	4753109	4753114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525818675
100448	NC_021810	GGCG	2	8	4753162	4753169	0 %	0 %	75 %	25 %	525818675
100449	NC_021810	GGC	2	6	4753217	4753222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525818675
100450	NC_021810	CTT	2	6	4753345	4753350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525818675
100451	NC_021810	ATTT	2	8	4753417	4753424	25 %	75 %	0 %	0 %	525818675
100452	NC_021810	T	6	6	4753439	4753444	0 %	100 %	0 %	0 %	525818675
100453	NC_021810	CCT	2	6	4753513	4753518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525818675
100454	NC_021810	ATC	2	6	4753584	4753589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818675
100455	NC_021810	GCG	2	6	4753704	4753709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525818675
100456	NC_021810	GGC	2	6	4753716	4753721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525818675
100457	NC_021810	CCA	2	6	4753792	4753797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525818675
100458	NC_021810	CCG	2	6	4753816	4753821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818675
100459	NC_021810	GCC	2	6	4753860	4753865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818675
100460	NC_021810	ATT	2	6	4753929	4753934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525818676
100461	NC_021810	TGC	2	6	4753952	4753957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818676
100462	NC_021810	CCG	2	6	4753965	4753970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818676
100463	NC_021810	GCC	2	6	4754063	4754068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818676
100464	NC_021810	TAA	2	6	4754077	4754082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525818676
100465	NC_021810	A	8	8	4754098	4754105	100 %	0 %	0 %	0 %	525818676
100466	NC_021810	T	6	6	4754173	4754178	0 %	100 %	0 %	0 %	525818676
100467	NC_021810	CCG	2	6	4754190	4754195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525818676
100468	NC_021810	GTC	2	6	4754271	4754276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525818676
100469	NC_021810	CAT	2	6	4754317	4754322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525818676
100470	NC_021810	TTC	2	6	4754398	4754403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525818676
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100475	NC_021810	A	6	6	4754524	4754529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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