MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021810	GATC	2	8	409345	409352	25 %	25 %	25 %	25 %	525814577
8502	NC_021810	TTG	2	6	409353	409358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814577
8503	NC_021810	GCC	2	6	409380	409385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814577
8504	NC_021810	AAT	2	6	409415	409420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814577
8505	NC_021810	GATCG	2	10	409454	409463	20 %	20 %	40 %	20 %	525814577
8506	NC_021810	GCA	2	6	409477	409482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814577
8507	NC_021810	CCG	2	6	409537	409542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814577
8508	NC_021810	CCA	2	6	409570	409575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814577
8509	NC_021810	TGC	2	6	409658	409663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814577
8510	NC_021810	CG	3	6	409670	409675	0 %	0 %	50 %	50 %	525814577
8511	NC_021810	CAG	2	6	409727	409732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814577
8512	NC_021810	GCG	2	6	409789	409794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814577
8513	NC_021810	GCC	2	6	409841	409846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814577
8514	NC_021810	CG	3	6	409918	409923	0 %	0 %	50 %	50 %	525814577
8515	NC_021810	ACCG	2	8	409925	409932	25 %	0 %	25 %	50 %	525814577
8516	NC_021810	TCCA	2	8	410061	410068	25 %	25 %	0 %	50 %	525814577
8517	NC_021810	CGC	2	6	410074	410079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814577
8518	NC_021810	CGC	2	6	410083	410088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814577
8519	NC_021810	CCG	2	6	410094	410099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814577
8520	NC_021810	GCC	2	6	410105	410110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814577
8521	NC_021810	AT	3	6	410118	410123	50 %	50 %	0 %	0 %	525814577
8522	NC_021810	CGG	2	6	410130	410135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814577
8523	NC_021810	CA	3	6	410141	410146	50 %	0 %	0 %	50 %	525814577
8524	NC_021810	TCA	2	6	410187	410192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814577
8525	NC_021810	ACC	2	6	410244	410249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814578
8526	NC_021810	GAA	2	6	410363	410368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814578
8527	NC_021810	GGCCA	2	10	410373	410382	20 %	0 %	40 %	40 %	525814578
8528	NC_021810	CAG	2	6	410402	410407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814578
8529	NC_021810	GCC	2	6	410448	410453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814578
8530	NC_021810	TGC	2	6	410619	410624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814578
8531	NC_021810	AAT	2	6	410640	410645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814578
8532	NC_021810	CGC	2	6	410681	410686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814578
8533	NC_021810	A	6	6	410756	410761	100 %	0 %	0 %	0 %	525814578
8534	NC_021810	GC	3	6	410788	410793	0 %	0 %	50 %	50 %	525814578
8535	NC_021810	TCTTT	2	10	410815	410824	0 %	80 %	0 %	20 %	525814578
8536	NC_021810	CAT	2	6	410846	410851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814578
8537	NC_021810	GAA	2	6	410910	410915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814578
8538	NC_021810	ACCA	2	8	410967	410974	50 %	0 %	0 %	50 %	525814578
8539	NC_021810	GCG	2	6	410998	411003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814578
8540	NC_021810	CTTT	2	8	411008	411015	0 %	75 %	0 %	25 %	525814578
8541	NC_021810	AAG	2	6	411054	411059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814578
8542	NC_021810	AGA	2	6	411064	411069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814578
8543	NC_021810	AATGCC	2	12	411158	411169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525814578
8544	NC_021810	CTG	2	6	411173	411178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814578
8545	NC_021810	A	6	6	411307	411312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_021810	CAAC	2	8	411414	411421	50 %	0 %	0 %	50 %	525814579
8547	NC_021810	ACGA	2	8	411455	411462	50 %	0 %	25 %	25 %	525814579
8548	NC_021810	TGC	2	6	411466	411471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814579
8549	NC_021810	GCC	2	6	411548	411553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814579
8550	NC_021810	CTG	2	6	411642	411647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814580
8551	NC_021810	CGA	2	6	411667	411672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814580
8552	NC_021810	CAA	2	6	411710	411715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814580
8553	NC_021810	CGC	2	6	411731	411736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814580
8554	NC_021810	CTT	2	6	411764	411769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814580
8555	NC_021810	ATC	2	6	411781	411786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814580
8556	NC_021810	GTT	2	6	411869	411874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814580
8557	NC_021810	ACC	2	6	411876	411881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814580
8558	NC_021810	A	6	6	411903	411908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_021810	GC	3	6	411943	411948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8560	NC_021810	GAA	2	6	412021	412026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_021810	A	8	8	412025	412032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_021810	GCG	2	6	412059	412064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_021810	T	6	6	412065	412070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_021810	A	6	6	412170	412175	100 %	0 %	0 %	0 %	525814581
8565	NC_021810	ATT	2	6	412274	412279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814581
8566	NC_021810	GCG	3	9	412281	412289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814581
8567	NC_021810	GAT	2	6	412306	412311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814581
8568	NC_021810	CG	3	6	412324	412329	0 %	0 %	50 %	50 %	525814581
8569	NC_021810	CGC	2	6	412366	412371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814581
8570	NC_021810	GCT	2	6	412399	412404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814581
8571	NC_021810	ATG	3	9	412407	412415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814581
8572	NC_021810	TGG	2	6	412416	412421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814581
8573	NC_021810	GCC	2	6	412475	412480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814581
8574	NC_021810	GAT	2	6	412522	412527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814581
8575	NC_021810	TGC	2	6	412599	412604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814581
8576	NC_021810	TGA	2	6	412608	412613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814581
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8578	NC_021810	GCC	3	9	412688	412696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814581
8579	NC_021810	CTG	2	6	412796	412801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814581
8580	NC_021810	TGA	2	6	412843	412848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814581
8581	NC_021810	ACCT	2	8	412864	412871	25 %	25 %	0 %	50 %	525814581
8582	NC_021810	GAT	2	6	412918	412923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814581
8583	NC_021810	TCT	2	6	412957	412962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814581
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8585	NC_021810	AGCG	2	8	413016	413023	25 %	0 %	50 %	25 %	525814581
8586	NC_021810	GAA	3	9	413024	413032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814581
8587	NC_021810	CA	3	6	413103	413108	50 %	0 %	0 %	50 %	525814581
8588	NC_021810	TAA	2	6	413179	413184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_021810	GCC	2	6	413254	413259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8590	NC_021810	CGT	2	6	413311	413316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8591	NC_021810	GTT	2	6	413320	413325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_021810	GATG	2	8	413354	413361	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_021810	AAGC	2	8	413368	413375	50 %	0 %	25 %	25 %	525814582
8594	NC_021810	A	6	6	413417	413422	100 %	0 %	0 %	0 %	525814582
8595	NC_021810	ATT	2	6	413516	413521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814582
8596	NC_021810	GGAAC	2	10	413534	413543	40 %	0 %	40 %	20 %	525814582
8597	NC_021810	CGCA	2	8	413579	413586	25 %	0 %	25 %	50 %	525814582
8598	NC_021810	TAA	2	6	413623	413628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814582
8599	NC_021810	AAC	2	6	413661	413666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_021810	GC	4	8	413744	413751	0 %	0 %	50 %	50 %	525814583
8601	NC_021810	CGAT	2	8	413779	413786	25 %	25 %	25 %	25 %	525814583
8602	NC_021810	TCG	2	6	413807	413812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814583
8603	NC_021810	AG	3	6	413886	413891	50 %	0 %	50 %	0 %	525814583
8604	NC_021810	CG	3	6	413938	413943	0 %	0 %	50 %	50 %	525814583
8605	NC_021810	CCA	2	6	414020	414025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814583
8606	NC_021810	TCGG	2	8	414055	414062	0 %	25 %	50 %	25 %	525814583
8607	NC_021810	GCG	2	6	414074	414079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814583
8608	NC_021810	GA	3	6	414233	414238	50 %	0 %	50 %	0 %	525814583
8609	NC_021810	GCC	2	6	414244	414249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814583
8610	NC_021810	GCA	2	6	414281	414286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814583
8611	NC_021810	CGC	3	9	414296	414304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814583
8612	NC_021810	TGCCC	2	10	414341	414350	0 %	20 %	20 %	60 %	525814583
8613	NC_021810	CG	4	8	414407	414414	0 %	0 %	50 %	50 %	525814583
8614	NC_021810	ATG	2	6	414424	414429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814583
8615	NC_021810	GTC	2	6	414430	414435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814583
8616	NC_021810	GGC	2	6	414450	414455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814583
8617	NC_021810	GTT	2	6	414575	414580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814583
8618	NC_021810	CG	3	6	414610	414615	0 %	0 %	50 %	50 %	525814583
8619	NC_021810	C	6	6	414628	414633	0 %	0 %	0 %	100 %	525814583
8620	NC_021810	AG	3	6	414637	414642	50 %	0 %	50 %	0 %	525814583
8621	NC_021810	GC	3	6	414694	414699	0 %	0 %	50 %	50 %	525814583
8622	NC_021810	GC	3	6	414722	414727	0 %	0 %	50 %	50 %	525814583
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8748	NC_021810	CGTTGC	2	12	421199	421210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814592
8749	NC_021810	GCT	2	6	421223	421228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814592
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8752	NC_021810	TGC	3	9	421297	421305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814592
8753	NC_021810	CTG	2	6	421434	421439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814593
8754	NC_021810	CGT	2	6	421492	421497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814593
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8781	NC_021810	CTG	2	6	422928	422933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814595
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8862	NC_021810	GCCT	3	12	426824	426835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8863	NC_021810	A	6	6	426917	426922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8864	NC_021810	CGG	2	6	427104	427109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814601
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8992	NC_021810	CG	3	6	433284	433289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8993	NC_021810	TGT	2	6	433338	433343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814606
8994	NC_021810	GCA	2	6	433453	433458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814606
8995	NC_021810	TTTC	2	8	433528	433535	0 %	75 %	0 %	25 %	525814606
8996	NC_021810	GAT	2	6	433588	433593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814606
8997	NC_021810	GCC	2	6	433619	433624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814606
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8999	NC_021810	CAG	2	6	433655	433660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814606
9000	NC_021810	CCAA	2	8	433694	433701	50 %	0 %	0 %	50 %	525814606

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