MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_021810	CGC	2	6	386578	386583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814557
8003	NC_021810	TTG	2	6	386688	386693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814557
8004	NC_021810	AGC	2	6	386694	386699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814557
8005	NC_021810	CAG	2	6	386765	386770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814557
8006	NC_021810	GTA	2	6	386888	386893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_021810	GGC	2	6	386913	386918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_021810	TCA	2	6	386932	386937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_021810	AAC	3	9	386999	387007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_021810	CAA	2	6	387123	387128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814558
8011	NC_021810	CAA	2	6	387143	387148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814558
8012	NC_021810	GTT	2	6	387159	387164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814558
8013	NC_021810	AGCG	2	8	387261	387268	25 %	0 %	50 %	25 %	525814558
8014	NC_021810	CTT	2	6	387398	387403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814558
8015	NC_021810	CAA	2	6	387431	387436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814558
8016	NC_021810	CAG	2	6	387489	387494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814558
8017	NC_021810	ATC	2	6	387495	387500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814558
8018	NC_021810	GCC	2	6	387519	387524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814558
8019	NC_021810	GCA	2	6	387607	387612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814558
8020	NC_021810	TGCC	2	8	387620	387627	0 %	25 %	25 %	50 %	525814558
8021	NC_021810	TAAA	2	8	387633	387640	75 %	25 %	0 %	0 %	525814558
8022	NC_021810	ACA	2	6	387737	387742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814558
8023	NC_021810	CTG	2	6	387831	387836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814558
8024	NC_021810	A	6	6	387937	387942	100 %	0 %	0 %	0 %	525814558
8025	NC_021810	TGAA	2	8	387974	387981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_021810	CAA	2	6	388002	388007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_021810	CCAG	2	8	388013	388020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_021810	TCGC	2	8	388073	388080	0 %	25 %	25 %	50 %	525814559
8029	NC_021810	CTT	2	6	388122	388127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814559
8030	NC_021810	GA	3	6	388239	388244	50 %	0 %	50 %	0 %	525814559
8031	NC_021810	CTT	2	6	388257	388262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814559
8032	NC_021810	CCG	3	9	388265	388273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814559
8033	NC_021810	CAA	2	6	388278	388283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814559
8034	NC_021810	ACG	2	6	388363	388368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814559
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8036	NC_021810	TTCGAT	2	12	388426	388437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525814559
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8038	NC_021810	TCAG	2	8	388454	388461	25 %	25 %	25 %	25 %	525814559
8039	NC_021810	CG	3	6	388462	388467	0 %	0 %	50 %	50 %	525814559
8040	NC_021810	CGC	2	6	388557	388562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814559
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8042	NC_021810	TCG	2	6	388742	388747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814559
8043	NC_021810	CTT	2	6	388782	388787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814559
8044	NC_021810	CGG	2	6	388815	388820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814559
8045	NC_021810	AGA	3	9	388879	388887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814559
8046	NC_021810	CGC	2	6	388965	388970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814559
8047	NC_021810	GAC	2	6	388980	388985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814559
8048	NC_021810	ACG	2	6	388999	389004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814559
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8052	NC_021810	TCT	2	6	389342	389347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814559
8053	NC_021810	GCT	2	6	389355	389360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814559
8054	NC_021810	CAGC	2	8	389445	389452	25 %	0 %	25 %	50 %	525814559
8055	NC_021810	GCA	2	6	389453	389458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814559
8056	NC_021810	CG	3	6	389462	389467	0 %	0 %	50 %	50 %	525814559
8057	NC_021810	CGT	2	6	389475	389480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814559
8058	NC_021810	CTT	2	6	389520	389525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814559
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8060	NC_021810	CTG	3	9	389557	389565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814559
8061	NC_021810	ACC	2	6	389579	389584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814559
8062	NC_021810	CAG	2	6	389608	389613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814559
8063	NC_021810	CCA	2	6	389628	389633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814559
8064	NC_021810	ACC	2	6	389660	389665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814559
8065	NC_021810	GCTT	2	8	389673	389680	0 %	50 %	25 %	25 %	525814559
8066	NC_021810	CG	3	6	389736	389741	0 %	0 %	50 %	50 %	525814559
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8071	NC_021810	ACG	2	6	389956	389961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814559
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8073	NC_021810	CAG	2	6	389985	389990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814559
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8081	NC_021810	ATA	2	6	390224	390229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_021810	CGT	2	6	390235	390240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_021810	TCT	2	6	390251	390256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_021810	AACCCT	2	12	390279	390290	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8085	NC_021810	CG	3	6	390316	390321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8086	NC_021810	TCAT	2	8	390340	390347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8087	NC_021810	CAA	2	6	390350	390355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_021810	TGC	2	6	390376	390381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_021810	CTG	2	6	390385	390390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_021810	A	6	6	390392	390397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_021810	ACG	2	6	390515	390520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814560
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8093	NC_021810	ACG	2	6	390545	390550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814560
8094	NC_021810	T	6	6	390563	390568	0 %	100 %	0 %	0 %	525814560
8095	NC_021810	GGT	2	6	390592	390597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814560
8096	NC_021810	CGC	2	6	390771	390776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_021810	AAT	2	6	390788	390793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_021810	GCG	2	6	390808	390813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_021810	CT	3	6	390831	390836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_021810	CTA	2	6	390871	390876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814561
8101	NC_021810	CGA	2	6	390882	390887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8102	NC_021810	TCG	2	6	390903	390908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8103	NC_021810	GC	3	6	390976	390981	0 %	0 %	50 %	50 %	525814561
8104	NC_021810	AAC	2	6	391040	391045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814561
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8106	NC_021810	GCC	2	6	391101	391106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814561
8107	NC_021810	CTG	2	6	391115	391120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8108	NC_021810	GAC	2	6	391195	391200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8109	NC_021810	TACGT	2	10	391206	391215	20 %	40 %	20 %	20 %	525814561
8110	NC_021810	GC	3	6	391216	391221	0 %	0 %	50 %	50 %	525814561
8111	NC_021810	ATC	2	6	391244	391249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814561
8112	NC_021810	AAT	2	6	391250	391255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814561
8113	NC_021810	TCCAGC	2	12	391290	391301	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525814561
8114	NC_021810	CAG	2	6	391325	391330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8115	NC_021810	CGGG	2	8	391346	391353	0 %	0 %	75 %	25 %	525814561
8116	NC_021810	CG	3	6	391357	391362	0 %	0 %	50 %	50 %	525814561
8117	NC_021810	CTT	2	6	391397	391402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814561
8118	NC_021810	GC	3	6	391468	391473	0 %	0 %	50 %	50 %	525814561
8119	NC_021810	GCT	2	6	391480	391485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8120	NC_021810	CAG	2	6	391592	391597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8121	NC_021810	GC	3	6	391663	391668	0 %	0 %	50 %	50 %	525814561
8122	NC_021810	GCA	2	6	391714	391719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8123	NC_021810	CAG	3	9	391751	391759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8124	NC_021810	ACG	3	9	391781	391789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8125	NC_021810	GAC	2	6	391792	391797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814561
8126	NC_021810	TCA	2	6	391798	391803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814561
8127	NC_021810	TCC	2	6	391805	391810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814562
8128	NC_021810	GTC	2	6	391816	391821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814562
8129	NC_021810	ACG	2	6	391831	391836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814562
8130	NC_021810	TTC	2	6	391837	391842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814562
8131	NC_021810	CAC	2	6	391852	391857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814562
8132	NC_021810	CCA	2	6	391890	391895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814562
8133	NC_021810	AGA	2	6	391908	391913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814562
8134	NC_021810	TCA	2	6	392097	392102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814562
8135	NC_021810	GAT	2	6	392137	392142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814562
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8138	NC_021810	ATC	2	6	392296	392301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8140	NC_021810	GGC	2	6	392327	392332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8141	NC_021810	GAGC	2	8	392378	392385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8142	NC_021810	GAC	2	6	392412	392417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8143	NC_021810	CGT	2	6	392485	392490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814563
8144	NC_021810	TTC	2	6	392496	392501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814563
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8146	NC_021810	GAT	2	6	392711	392716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814563
8147	NC_021810	CTG	2	6	392717	392722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814563
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8154	NC_021810	TTCACT	2	12	392940	392951	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525814563
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8161	NC_021810	CA	3	6	393298	393303	50 %	0 %	0 %	50 %	525814563
8162	NC_021810	AGGA	2	8	393375	393382	50 %	0 %	50 %	0 %	525814563
8163	NC_021810	ACCGC	2	10	393390	393399	20 %	0 %	20 %	60 %	525814563
8164	NC_021810	GCA	2	6	393445	393450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814563
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8167	NC_021810	GAAC	2	8	393502	393509	50 %	0 %	25 %	25 %	525814563
8168	NC_021810	CGC	2	6	393517	393522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814563
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8237	NC_021810	CTT	2	6	396427	396432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814564
8238	NC_021810	CAAC	2	8	396440	396447	50 %	0 %	0 %	50 %	525814564
8239	NC_021810	CGAT	2	8	396477	396484	25 %	25 %	25 %	25 %	525814564
8240	NC_021810	T	6	6	396515	396520	0 %	100 %	0 %	0 %	525814564
8241	NC_021810	TTG	2	6	396523	396528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814564
8242	NC_021810	T	6	6	396562	396567	0 %	100 %	0 %	0 %	525814564
8243	NC_021810	CAA	2	6	396601	396606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814564
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8245	NC_021810	CTT	2	6	396814	396819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814565
8246	NC_021810	TGG	2	6	396939	396944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814565
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8248	NC_021810	ATC	2	6	397074	397079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814565
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8250	NC_021810	A	6	6	397168	397173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8252	NC_021810	T	7	7	397247	397253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8253	NC_021810	CGA	2	6	397340	397345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8260	NC_021810	GAT	2	6	397644	397649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8262	NC_021810	TTCTA	2	10	397727	397736	20 %	60 %	0 %	20 %	525814566
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8364	NC_021810	CAGA	2	8	402576	402583	50 %	0 %	25 %	25 %	525814570
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8492	NC_021810	GTC	2	6	409079	409084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814577
8493	NC_021810	TCT	2	6	409104	409109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814577
8494	NC_021810	CTG	2	6	409124	409129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814577
8495	NC_021810	GAT	2	6	409132	409137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814577
8496	NC_021810	CTT	2	6	409177	409182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814577
8497	NC_021810	GAT	2	6	409205	409210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814577
8498	NC_021810	TCA	2	6	409216	409221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814577
8499	NC_021810	TTCCC	2	10	409278	409287	0 %	40 %	0 %	60 %	525814577
8500	NC_021810	TCGCTT	2	12	409306	409317	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525814577

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