MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 101287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021810	CCTTC	2	10	339672	339681	0 %	40 %	0 %	60 %	525814510
7002	NC_021810	GCC	2	6	339718	339723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814510
7003	NC_021810	CTG	2	6	339752	339757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
7004	NC_021810	GCT	2	6	339787	339792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
7005	NC_021810	ACC	2	6	339863	339868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814510
7006	NC_021810	TCA	2	6	339959	339964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814510
7007	NC_021810	ACC	2	6	339974	339979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814510
7008	NC_021810	CTG	2	6	340010	340015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
7009	NC_021810	GTC	2	6	340016	340021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
7010	NC_021810	TGC	2	6	340035	340040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
7011	NC_021810	TCG	2	6	340084	340089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
7012	NC_021810	GCCT	2	8	340112	340119	0 %	25 %	25 %	50 %	525814510
7013	NC_021810	GCG	2	6	340128	340133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814510
7014	NC_021810	CTT	2	6	340141	340146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814510
7015	NC_021810	GCC	2	6	340160	340165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814510
7016	NC_021810	TACT	2	8	340216	340223	25 %	50 %	0 %	25 %	525814510
7017	NC_021810	GGC	2	6	340294	340299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814510
7018	NC_021810	GCT	3	9	340339	340347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
7019	NC_021810	GTG	2	6	340352	340357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814510
7020	NC_021810	TG	3	6	340365	340370	0 %	50 %	50 %	0 %	525814510
7021	NC_021810	GCG	2	6	340374	340379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814510
7022	NC_021810	TGC	2	6	340404	340409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
7023	NC_021810	GTA	2	6	340463	340468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814510
7024	NC_021810	TAT	2	6	340480	340485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814510
7025	NC_021810	TGTTC	2	10	340534	340543	0 %	60 %	20 %	20 %	525814510
7026	NC_021810	CCCT	2	8	340800	340807	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7027	NC_021810	ACG	2	6	340832	340837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_021810	TG	3	6	340897	340902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_021810	TGCT	2	8	340907	340914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7030	NC_021810	ACT	2	6	341058	341063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814511
7031	NC_021810	TTAT	2	8	341146	341153	25 %	75 %	0 %	0 %	525814511
7032	NC_021810	GCT	2	6	341175	341180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814511
7033	NC_021810	GCC	2	6	341185	341190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814511
7034	NC_021810	TGC	2	6	341270	341275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814511
7035	NC_021810	GCTG	2	8	341324	341331	0 %	25 %	50 %	25 %	525814511
7036	NC_021810	CT	3	6	341359	341364	0 %	50 %	0 %	50 %	525814511
7037	NC_021810	ATC	2	6	341381	341386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814511
7038	NC_021810	GCT	2	6	341463	341468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814511
7039	NC_021810	CCA	2	6	341471	341476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814511
7040	NC_021810	CG	3	6	341502	341507	0 %	0 %	50 %	50 %	525814511
7041	NC_021810	TTC	2	6	341515	341520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814511
7042	NC_021810	TTG	2	6	341536	341541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814511
7043	NC_021810	CTG	2	6	341572	341577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814511
7044	NC_021810	TGC	3	9	341630	341638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814511
7045	NC_021810	GTG	2	6	341641	341646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814511
7046	NC_021810	T	6	6	341653	341658	0 %	100 %	0 %	0 %	525814511
7047	NC_021810	AAG	2	6	341692	341697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814511
7048	NC_021810	ATG	2	6	341791	341796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_021810	CG	3	6	341839	341844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_021810	CAT	2	6	341887	341892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_021810	CATT	2	8	341907	341914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7052	NC_021810	GCC	2	6	341977	341982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_021810	GTC	2	6	342023	342028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_021810	CAG	2	6	342032	342037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_021810	TCAC	2	8	342125	342132	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_021810	TAA	2	6	342164	342169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_021810	TTA	2	6	342191	342196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_021810	CAA	2	6	342370	342375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814512
7059	NC_021810	GC	3	6	342445	342450	0 %	0 %	50 %	50 %	525814512
7060	NC_021810	AGA	2	6	342481	342486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814512
7061	NC_021810	GCAAAA	2	12	342518	342529	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525814512
7062	NC_021810	A	7	7	342589	342595	100 %	0 %	0 %	0 %	525814512
7063	NC_021810	ACT	2	6	342609	342614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814512
7064	NC_021810	ACTC	2	8	342636	342643	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7065	NC_021810	GC	3	6	342687	342692	0 %	0 %	50 %	50 %	525814513
7066	NC_021810	GAA	2	6	342721	342726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814513
7067	NC_021810	AGA	2	6	342756	342761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814513
7068	NC_021810	GC	4	8	342789	342796	0 %	0 %	50 %	50 %	525814513
7069	NC_021810	AG	3	6	342801	342806	50 %	0 %	50 %	0 %	525814513
7070	NC_021810	GTGAT	2	10	342830	342839	20 %	40 %	40 %	0 %	525814513
7071	NC_021810	CGC	3	9	342858	342866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814513
7072	NC_021810	GAT	2	6	342874	342879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814513
7073	NC_021810	CTG	2	6	342946	342951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814513
7074	NC_021810	CGT	2	6	342955	342960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814513
7075	NC_021810	TGG	2	6	343048	343053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814514
7076	NC_021810	GTA	2	6	343074	343079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814514
7077	NC_021810	GAA	2	6	343086	343091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814514
7078	NC_021810	GAT	2	6	343217	343222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814514
7079	NC_021810	CGG	2	6	343259	343264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814514
7080	NC_021810	GGA	2	6	343346	343351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814514
7081	NC_021810	AGC	2	6	343364	343369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814514
7082	NC_021810	GCT	2	6	343396	343401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814515
7083	NC_021810	TCAG	2	8	343404	343411	25 %	25 %	25 %	25 %	525814515
7084	NC_021810	CAG	2	6	343415	343420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814515
7085	NC_021810	CTGG	2	8	343453	343460	0 %	25 %	50 %	25 %	525814515
7086	NC_021810	ACC	2	6	343463	343468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814515
7087	NC_021810	AGC	2	6	343529	343534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814515
7088	NC_021810	CAA	2	6	343640	343645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814515
7089	NC_021810	TCTTT	2	10	343663	343672	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7090	NC_021810	TGG	2	6	343701	343706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_021810	T	6	6	343750	343755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_021810	A	6	6	343757	343762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_021810	TC	3	6	343810	343815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7094	NC_021810	ATG	2	6	343827	343832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_021810	AGC	3	9	343862	343870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_021810	A	6	6	343901	343906	100 %	0 %	0 %	0 %	525814516
7097	NC_021810	AGA	2	6	343909	343914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814516
7098	NC_021810	TTA	2	6	343956	343961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814516
7099	NC_021810	CA	3	6	343996	344001	50 %	0 %	0 %	50 %	525814516
7100	NC_021810	CTG	2	6	344036	344041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814516
7101	NC_021810	CGG	3	9	344065	344073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814516
7102	NC_021810	CTG	2	6	344084	344089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814516
7103	NC_021810	CAC	2	6	344104	344109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814516
7104	NC_021810	CGG	2	6	344215	344220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814516
7105	NC_021810	TTA	2	6	344225	344230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814516
7106	NC_021810	CTG	2	6	344270	344275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814516
7107	NC_021810	A	6	6	344308	344313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_021810	GA	4	8	344349	344356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_021810	G	6	6	344415	344420	0 %	0 %	100 %	0 %	525814517
7110	NC_021810	GC	3	6	344470	344475	0 %	0 %	50 %	50 %	525814517
7111	NC_021810	CGC	2	6	344501	344506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814517
7112	NC_021810	TGCC	2	8	344540	344547	0 %	25 %	25 %	50 %	525814517
7113	NC_021810	CGT	2	6	344612	344617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814517
7114	NC_021810	TGA	2	6	344651	344656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814517
7115	NC_021810	CGG	2	6	344665	344670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814517
7116	NC_021810	A	8	8	344772	344779	100 %	0 %	0 %	0 %	525814517
7117	NC_021810	CCG	2	6	344803	344808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814517
7118	NC_021810	TGGGC	2	10	344840	344849	0 %	20 %	60 %	20 %	525814517
7119	NC_021810	C	6	6	344871	344876	0 %	0 %	0 %	100 %	525814517
7120	NC_021810	GCAAA	2	10	344882	344891	60 %	0 %	20 %	20 %	525814517
7121	NC_021810	TAA	2	6	344927	344932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814517
7122	NC_021810	CCA	2	6	344956	344961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814517
7123	NC_021810	ATG	2	6	344974	344979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814517
7124	NC_021810	GC	3	6	345009	345014	0 %	0 %	50 %	50 %	525814517
7125	NC_021810	GAC	2	6	345086	345091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814517
7126	NC_021810	CAC	2	6	345237	345242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814517
7127	NC_021810	TCC	2	6	345354	345359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_021810	TTA	2	6	345368	345373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_021810	ATT	2	6	345453	345458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_021810	A	6	6	345491	345496	100 %	0 %	0 %	0 %	525814518
7131	NC_021810	GGC	2	6	345510	345515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814518
7132	NC_021810	CG	4	8	345516	345523	0 %	0 %	50 %	50 %	525814518
7133	NC_021810	ATC	2	6	345558	345563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814518
7134	NC_021810	CTG	2	6	345582	345587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814518
7135	NC_021810	TGGC	2	8	345599	345606	0 %	25 %	50 %	25 %	525814518
7136	NC_021810	ACC	2	6	345633	345638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814518
7137	NC_021810	GTG	2	6	345665	345670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814518
7138	NC_021810	CGT	2	6	345684	345689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814518
7139	NC_021810	TGG	2	6	345714	345719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814518
7140	NC_021810	GGCT	2	8	345747	345754	0 %	25 %	50 %	25 %	525814518
7141	NC_021810	ATC	3	9	345756	345764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814518
7142	NC_021810	GGC	2	6	345835	345840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7143	NC_021810	GCG	2	6	345841	345846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7144	NC_021810	CG	3	6	345862	345867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7145	NC_021810	TATT	2	8	345869	345876	25 %	75 %	0 %	0 %	525814519
7146	NC_021810	CGC	2	6	345939	345944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814519
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7152	NC_021810	CAG	2	6	346118	346123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814519
7153	NC_021810	CG	4	8	346147	346154	0 %	0 %	50 %	50 %	525814519
7154	NC_021810	CCGCTA	2	12	346159	346170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525814519
7155	NC_021810	CGC	2	6	346171	346176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814519
7156	NC_021810	CGGCTC	2	12	346205	346216	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525814519
7157	NC_021810	TGA	2	6	346218	346223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814519
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7162	NC_021810	GCCA	2	8	346361	346368	25 %	0 %	25 %	50 %	525814519
7163	NC_021810	A	7	7	346430	346436	100 %	0 %	0 %	0 %	525814519
7164	NC_021810	CGT	2	6	346511	346516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814519
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7166	NC_021810	CAG	2	6	346556	346561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814519
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7171	NC_021810	AG	3	6	346857	346862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7172	NC_021810	TAA	2	6	346865	346870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7173	NC_021810	GAT	2	6	346872	346877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814520
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7187	NC_021810	AGCC	2	8	347573	347580	25 %	0 %	25 %	50 %	525814520
7188	NC_021810	A	6	6	347604	347609	100 %	0 %	0 %	0 %	525814521
7189	NC_021810	GAA	2	6	347615	347620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814521
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7193	NC_021810	AGCGC	2	10	347821	347830	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7194	NC_021810	TTA	3	9	347869	347877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814522
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7199	NC_021810	CGC	2	6	348043	348048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814522
7200	NC_021810	ATC	2	6	348101	348106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814522
7201	NC_021810	CTG	2	6	348128	348133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814522
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7204	NC_021810	GC	5	10	348282	348291	0 %	0 %	50 %	50 %	525814522
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7221	NC_021810	AAC	3	9	349183	349191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7222	NC_021810	AGC	2	6	349239	349244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814523
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7230	NC_021810	AAG	2	6	349542	349547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814523
7231	NC_021810	CAGC	2	8	349596	349603	25 %	0 %	25 %	50 %	525814523
7232	NC_021810	CGC	2	6	349609	349614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814523
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7235	NC_021810	ATAA	2	8	349836	349843	75 %	25 %	0 %	0 %	525814523
7236	NC_021810	TAA	2	6	349870	349875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814523
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7240	NC_021810	CCA	2	6	349939	349944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814523
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7242	NC_021810	CCA	2	6	350038	350043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814523
7243	NC_021810	GC	3	6	350188	350193	0 %	0 %	50 %	50 %	525814523
7244	NC_021810	TAA	2	6	350195	350200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814523
7245	NC_021810	TAA	2	6	350278	350283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814523
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7248	NC_021810	GAA	2	6	350371	350376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814523
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7251	NC_021810	GCA	2	6	350589	350594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7253	NC_021810	TGT	2	6	350734	350739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7367	NC_021810	GAT	2	6	356456	356461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814527
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7496	NC_021810	GAT	2	6	362621	362626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814532
7497	NC_021810	GCA	2	6	362671	362676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814532
7498	NC_021810	TGA	3	9	362680	362688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814532
7499	NC_021810	ACC	2	6	362781	362786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814532
7500	NC_021810	ATG	2	6	362832	362837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814532

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