MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes HSC5

Total Repeats: 38839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021807	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021807	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021807	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021807	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021807	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021807	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021807	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021807	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	525808974
9	NC_021807	T	6	6	310	315	0 %	100 %	0 %	0 %	525808974
10	NC_021807	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808974
11	NC_021807	A	7	7	395	401	100 %	0 %	0 %	0 %	525808974
12	NC_021807	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808974
13	NC_021807	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808974
14	NC_021807	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	525808974
15	NC_021807	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808974
16	NC_021807	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808974
17	NC_021807	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808974
18	NC_021807	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	525808974
19	NC_021807	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808974
20	NC_021807	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	525808974
21	NC_021807	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808974
22	NC_021807	A	7	7	895	901	100 %	0 %	0 %	0 %	525808974
23	NC_021807	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	525808974
24	NC_021807	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808974
25	NC_021807	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808974
26	NC_021807	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	525808974
27	NC_021807	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808974
28	NC_021807	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808974
29	NC_021807	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525808974
30	NC_021807	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	525808974
31	NC_021807	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808974
32	NC_021807	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808974
33	NC_021807	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808974
34	NC_021807	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525808974
35	NC_021807	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808974
36	NC_021807	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	525808974
37	NC_021807	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021807	TC	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021807	TA	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021807	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021807	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021807	TAAA	2	8	1726	1733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021807	ATT	2	6	1769	1774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
44	NC_021807	TCA	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808975
45	NC_021807	GTAA	2	8	1920	1927	50 %	25 %	25 %	0 %	525808975
46	NC_021807	TTA	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
47	NC_021807	T	7	7	1982	1988	0 %	100 %	0 %	0 %	525808975
48	NC_021807	ATT	2	6	1995	2000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
49	NC_021807	AAC	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525808975
50	NC_021807	GTT	2	6	2052	2057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808975
51	NC_021807	AAG	2	6	2122	2127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808975
52	NC_021807	ATT	2	6	2162	2167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
53	NC_021807	TAT	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
54	NC_021807	GTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808975
55	NC_021807	GACT	2	8	2279	2286	25 %	25 %	25 %	25 %	525808975
56	NC_021807	CAG	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808975
57	NC_021807	GA	3	6	2366	2371	50 %	0 %	50 %	0 %	525808975
58	NC_021807	CAG	2	6	2377	2382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808975
59	NC_021807	GAT	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808975
60	NC_021807	TTA	2	6	2505	2510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808975
61	NC_021807	GTT	2	6	2532	2537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808975
62	NC_021807	GGTAA	2	10	2667	2676	40 %	20 %	40 %	0 %	525808975
63	NC_021807	AGTC	2	8	2697	2704	25 %	25 %	25 %	25 %	525808975
64	NC_021807	GAA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808975
65	NC_021807	AATT	2	8	2851	2858	50 %	50 %	0 %	0 %	525808975
66	NC_021807	TAAG	2	8	2877	2884	50 %	25 %	25 %	0 %	525808975
67	NC_021807	T	7	7	2905	2911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021807	TTA	2	6	2913	2918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021807	ATA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021807	TGAAA	2	10	2977	2986	60 %	20 %	20 %	0 %	525808976
71	NC_021807	A	6	6	2984	2989	100 %	0 %	0 %	0 %	525808976
72	NC_021807	ATG	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808976
73	NC_021807	A	7	7	3130	3136	100 %	0 %	0 %	0 %	525808976
74	NC_021807	TAAA	2	8	3161	3168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021807	A	6	6	3203	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021807	AGA	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021807	AAT	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021807	TCT	2	6	3404	3409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021807	TCT	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021807	T	6	6	3433	3438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021807	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021807	TTGA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021807	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808977
84	NC_021807	GCT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808977
85	NC_021807	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	525808977
86	NC_021807	A	7	7	3661	3667	100 %	0 %	0 %	0 %	525808977
87	NC_021807	AAAT	2	8	3741	3748	75 %	25 %	0 %	0 %	525808977
88	NC_021807	TGA	3	9	3801	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808977
89	NC_021807	TCAA	2	8	3907	3914	50 %	25 %	0 %	25 %	525808977
90	NC_021807	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	525808977
91	NC_021807	GTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808977
92	NC_021807	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525808977
93	NC_021807	CAAA	2	8	4161	4168	75 %	0 %	0 %	25 %	525808977
94	NC_021807	AGT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808977
95	NC_021807	AGA	3	9	4224	4232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808977
96	NC_021807	AGA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808977
97	NC_021807	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808977
98	NC_021807	ATC	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808977
99	NC_021807	CAG	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808977
100	NC_021807	GCT	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525808977
101	NC_021807	TAT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808977
102	NC_021807	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808977
103	NC_021807	AAG	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808977
104	NC_021807	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808977
105	NC_021807	TGT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808977
106	NC_021807	CAT	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808977
107	NC_021807	GAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808978
108	NC_021807	TTG	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525808978
109	NC_021807	A	6	6	4712	4717	100 %	0 %	0 %	0 %	525808978
110	NC_021807	GAT	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808978
111	NC_021807	TTA	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808978
112	NC_021807	CTA	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808978
113	NC_021807	AAT	2	6	4867	4872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808978
114	NC_021807	CTA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525808978
115	NC_021807	ATG	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808978
116	NC_021807	TTACGT	2	12	4969	4980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525808978
117	NC_021807	CAG	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808978
118	NC_021807	GAC	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525808978
119	NC_021807	TTA	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808978
120	NC_021807	ATA	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525808978
121	NC_021807	TTTA	2	8	5183	5190	25 %	75 %	0 %	0 %	525808978
122	NC_021807	A	6	6	5207	5212	100 %	0 %	0 %	0 %	525808978
123	NC_021807	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
124	NC_021807	ACC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525808979
125	NC_021807	GAT	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
126	NC_021807	A	9	9	5380	5388	100 %	0 %	0 %	0 %	525808979
127	NC_021807	TGA	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
128	NC_021807	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	525808979
129	NC_021807	TGA	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
130	NC_021807	T	6	6	5820	5825	0 %	100 %	0 %	0 %	525808979
131	NC_021807	GAT	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
132	NC_021807	AAC	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525808979
133	NC_021807	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
134	NC_021807	GAT	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525808979
135	NC_021807	A	6	6	5994	5999	100 %	0 %	0 %	0 %	525808979
136	NC_021807	AGA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525808979
137	NC_021807	A	6	6	6029	6034	100 %	0 %	0 %	0 %	525808979
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139	NC_021807	ATT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525808979
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