MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus Bmb9393 plasmid pBmb9393

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021657	CAA	2	6	4	9	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021657	AAG	2	6	68	73	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021657	ATTT	2	8	93	100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021657	TAT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021657	AAT	3	9	406	414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021657	ATT	2	6	433	438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021657	CAG	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021657	TAA	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021657	AT	3	6	472	477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021657	CAT	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021657	GAA	2	6	656	661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021657	CTT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021657	CTT	2	6	725	730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021657	TTC	2	6	849	854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021657	ATTTTT	2	12	896	907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021657	A	6	6	923	928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021657	AAAT	2	8	1139	1146	75 %	25 %	0 %	0 %	521147366
18	NC_021657	AT	3	6	1145	1150	50 %	50 %	0 %	0 %	521147366
19	NC_021657	ACAA	2	8	1160	1167	75 %	0 %	0 %	25 %	521147366
20	NC_021657	T	6	6	1192	1197	0 %	100 %	0 %	0 %	521147366
21	NC_021657	T	6	6	1238	1243	0 %	100 %	0 %	0 %	521147366
22	NC_021657	TA	3	6	1290	1295	50 %	50 %	0 %	0 %	521147366
23	NC_021657	TAA	2	6	1305	1310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521147366
24	NC_021657	TCG	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021657	TCA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021657	TTC	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521147367
27	NC_021657	T	6	6	1500	1505	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
28	NC_021657	A	6	6	1563	1568	100 %	0 %	0 %	0 %	521147367
29	NC_021657	GATA	2	8	1572	1579	50 %	25 %	25 %	0 %	521147367
30	NC_021657	T	6	6	1622	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
31	NC_021657	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521147367
32	NC_021657	TTA	2	6	1719	1724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521147367
33	NC_021657	AAT	2	6	1725	1730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521147367
34	NC_021657	TAT	3	9	1773	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521147367
35	NC_021657	T	6	6	1791	1796	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
36	NC_021657	GAACTT	2	12	1797	1808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521147367
37	NC_021657	TTG	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	521147367
38	NC_021657	TAATA	2	10	1866	1875	60 %	40 %	0 %	0 %	521147367
39	NC_021657	ATTT	2	8	1896	1903	25 %	75 %	0 %	0 %	521147367
40	NC_021657	ATC	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521147367
41	NC_021657	T	7	7	1944	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
42	NC_021657	CTAC	2	8	1994	2001	25 %	25 %	0 %	50 %	521147367
43	NC_021657	T	7	7	2002	2008	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
44	NC_021657	ATT	2	6	2032	2037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521147367
45	NC_021657	TCA	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521147367
46	NC_021657	CATTA	2	10	2071	2080	40 %	40 %	0 %	20 %	521147367
47	NC_021657	TGC	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521147367
48	NC_021657	AT	3	6	2129	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	521147367
49	NC_021657	CAT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521147367
50	NC_021657	TA	3	6	2223	2228	50 %	50 %	0 %	0 %	521147367
51	NC_021657	TC	3	6	2304	2309	0 %	50 %	0 %	50 %	521147367
52	NC_021657	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521147367
53	NC_021657	T	6	6	2353	2358	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
54	NC_021657	AAC	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021657	A	7	7	2422	2428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021657	TATG	2	8	2447	2454	25 %	50 %	25 %	0 %	521147368
57	NC_021657	T	6	6	2455	2460	0 %	100 %	0 %	0 %	521147368
58	NC_021657	T	7	7	2505	2511	0 %	100 %	0 %	0 %	521147368
59	NC_021657	TTA	2	6	2574	2579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521147368
60	NC_021657	AAGA	2	8	2587	2594	75 %	0 %	25 %	0 %	521147368
61	NC_021657	A	7	7	2625	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	521147368
62	NC_021657	T	6	6	2646	2651	0 %	100 %	0 %	0 %	521147368
63	NC_021657	TTC	2	6	2666	2671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521147368
64	NC_021657	CAA	2	6	2692	2697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	521147368
65	NC_021657	AT	4	8	2730	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021657	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021657	GATT	2	8	2770	2777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021657	GAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021657	CCT	2	6	2803	2808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_021657	AGG	2	6	2832	2837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021657	TAA	2	6	2854	2859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021657	ATT	2	6	2901	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.