MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus CA-347

Total Repeats: 67917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021554	TAA	2	6	41648	41653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021554	TAA	2	6	41684	41689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021554	A	7	7	41724	41730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021554	ATG	2	6	41780	41785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065000
1005	NC_021554	TA	3	6	41841	41846	50 %	50 %	0 %	0 %	514065000
1006	NC_021554	TCTT	2	8	41910	41917	0 %	75 %	0 %	25 %	514065000
1007	NC_021554	GTTTAA	2	12	41985	41996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065000
1008	NC_021554	ATGT	2	8	42144	42151	25 %	50 %	25 %	0 %	514065000
1009	NC_021554	TCA	2	6	42212	42217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065000
1010	NC_021554	TAA	2	6	42230	42235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065000
1011	NC_021554	T	6	6	42238	42243	0 %	100 %	0 %	0 %	514065000
1012	NC_021554	TTC	2	6	42251	42256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065000
1013	NC_021554	ATG	2	6	42310	42315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065000
1014	NC_021554	AT	3	6	42348	42353	50 %	50 %	0 %	0 %	514065000
1015	NC_021554	TAG	2	6	42380	42385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065000
1016	NC_021554	AGA	2	6	42444	42449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021554	T	6	6	42543	42548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021554	ATGAG	2	10	42553	42562	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021554	CTT	2	6	42600	42605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021554	ATA	2	6	42657	42662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021554	TTAA	2	8	42671	42678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021554	AAAAAT	2	12	42679	42690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021554	CAT	2	6	42764	42769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065001
1024	NC_021554	GCT	2	6	42775	42780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514065001
1025	NC_021554	AAC	2	6	42836	42841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065001
1026	NC_021554	TCAT	2	8	42848	42855	25 %	50 %	0 %	25 %	514065001
1027	NC_021554	GAT	2	6	42856	42861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065001
1028	NC_021554	TGAAT	2	10	42900	42909	40 %	40 %	20 %	0 %	514065001
1029	NC_021554	ATG	2	6	42911	42916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065001
1030	NC_021554	TTGGT	2	10	42942	42951	0 %	60 %	40 %	0 %	514065001
1031	NC_021554	GAT	2	6	42985	42990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065001
1032	NC_021554	GTA	2	6	42991	42996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065001
1033	NC_021554	AATAT	2	10	43010	43019	60 %	40 %	0 %	0 %	514065001
1034	NC_021554	GAA	2	6	43096	43101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065001
1035	NC_021554	AAG	2	6	43127	43132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065001
1036	NC_021554	TGT	2	6	43152	43157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065001
1037	NC_021554	AGA	2	6	43173	43178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065001
1038	NC_021554	TTCGT	2	10	43221	43230	0 %	60 %	20 %	20 %	514065001
1039	NC_021554	AAG	2	6	43322	43327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065001
1040	NC_021554	AAAC	2	8	43356	43363	75 %	0 %	0 %	25 %	514065001
1041	NC_021554	A	6	6	43512	43517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021554	AAGA	2	8	43529	43536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021554	GA	3	6	43535	43540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021554	AT	3	6	43542	43547	50 %	50 %	0 %	0 %	514065002
1045	NC_021554	GAT	2	6	43555	43560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065002
1046	NC_021554	TAG	2	6	43565	43570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065002
1047	NC_021554	CAAAA	2	10	43581	43590	80 %	0 %	0 %	20 %	514065002
1048	NC_021554	AGA	3	9	43605	43613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065002
1049	NC_021554	CAA	2	6	43628	43633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065002
1050	NC_021554	AT	3	6	43647	43652	50 %	50 %	0 %	0 %	514065002
1051	NC_021554	GCAT	2	8	43709	43716	25 %	25 %	25 %	25 %	514065002
1052	NC_021554	AGA	2	6	43746	43751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065002
1053	NC_021554	GAA	2	6	43765	43770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065002
1054	NC_021554	TTA	2	6	43805	43810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065002
1055	NC_021554	A	7	7	43872	43878	100 %	0 %	0 %	0 %	514065002
1056	NC_021554	AATGAA	2	12	43915	43926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065002
1057	NC_021554	TTA	2	6	43958	43963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065002
1058	NC_021554	ATA	2	6	43971	43976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065002
1059	NC_021554	T	6	6	44038	44043	0 %	100 %	0 %	0 %	514065003
1060	NC_021554	TCA	2	6	44063	44068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065003
1061	NC_021554	TAGC	2	8	44096	44103	25 %	25 %	25 %	25 %	514065003
1062	NC_021554	CAT	3	9	44140	44148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065003
1063	NC_021554	ACC	2	6	44178	44183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514065003
1064	NC_021554	TCT	2	6	44270	44275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065003
1065	NC_021554	TTTA	2	8	44284	44291	25 %	75 %	0 %	0 %	514065003
1066	NC_021554	TTG	2	6	44296	44301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065003
1067	NC_021554	ATA	2	6	44339	44344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065003
1068	NC_021554	TTC	2	6	44348	44353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065003
1069	NC_021554	TAA	2	6	44377	44382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065003
1070	NC_021554	ATT	2	6	44404	44409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065003
1071	NC_021554	TAA	2	6	44485	44490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065003
1072	NC_021554	TTTG	2	8	44509	44516	0 %	75 %	25 %	0 %	514065003
1073	NC_021554	T	6	6	44572	44577	0 %	100 %	0 %	0 %	514065003
1074	NC_021554	TGA	2	6	44641	44646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065003
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1077	NC_021554	TTG	2	6	44846	44851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065003
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1079	NC_021554	TAT	2	6	44883	44888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065003
1080	NC_021554	TTC	2	6	44890	44895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065003
1081	NC_021554	CATA	2	8	44907	44914	50 %	25 %	0 %	25 %	514065003
1082	NC_021554	TAA	2	6	44953	44958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065003
1083	NC_021554	TGT	2	6	45009	45014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065003
1084	NC_021554	TAGT	2	8	45045	45052	25 %	50 %	25 %	0 %	514065003
1085	NC_021554	T	6	6	45070	45075	0 %	100 %	0 %	0 %	514065003
1086	NC_021554	ATGT	2	8	45090	45097	25 %	50 %	25 %	0 %	514065003
1087	NC_021554	TAT	2	6	45111	45116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065003
1088	NC_021554	CAT	2	6	45201	45206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065003
1089	NC_021554	TTC	2	6	45238	45243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065003
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1091	NC_021554	T	7	7	45369	45375	0 %	100 %	0 %	0 %	514065003
1092	NC_021554	ATC	2	6	45400	45405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065003
1093	NC_021554	TGT	2	6	45428	45433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065003
1094	NC_021554	T	6	6	45484	45489	0 %	100 %	0 %	0 %	514065003
1095	NC_021554	AAT	2	6	45628	45633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065003
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1097	NC_021554	AAATT	2	10	45680	45689	60 %	40 %	0 %	0 %	514065003
1098	NC_021554	GTTT	2	8	45715	45722	0 %	75 %	25 %	0 %	514065003
1099	NC_021554	T	6	6	45748	45753	0 %	100 %	0 %	0 %	514065003
1100	NC_021554	T	7	7	45766	45772	0 %	100 %	0 %	0 %	514065003
1101	NC_021554	TAT	2	6	45813	45818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065003
1102	NC_021554	AT	3	6	45817	45822	50 %	50 %	0 %	0 %	514065003
1103	NC_021554	TAT	2	6	45930	45935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065003
1104	NC_021554	AT	3	6	45964	45969	50 %	50 %	0 %	0 %	514065003
1105	NC_021554	ACAACT	2	12	45980	45991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	514065003
1106	NC_021554	TCA	2	6	46023	46028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065003
1107	NC_021554	TCC	2	6	46032	46037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_021554	TA	3	6	46039	46044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021554	GTA	2	6	46056	46061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021554	GTA	2	6	46072	46077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021554	AAT	2	6	46088	46093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021554	ATC	2	6	46131	46136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021554	T	6	6	46137	46142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021554	T	7	7	46184	46190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021554	TA	3	6	46204	46209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021554	TTA	2	6	46246	46251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065004
1117	NC_021554	ATG	2	6	46321	46326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065004
1118	NC_021554	CTT	2	6	46349	46354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065004
1119	NC_021554	CAA	2	6	46378	46383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065004
1120	NC_021554	TGT	2	6	46478	46483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065004
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1122	NC_021554	TAC	2	6	46676	46681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065004
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1124	NC_021554	AT	3	6	46722	46727	50 %	50 %	0 %	0 %	514065004
1125	NC_021554	TGT	2	6	46785	46790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065004
1126	NC_021554	TA	4	8	46823	46830	50 %	50 %	0 %	0 %	514065004
1127	NC_021554	ATG	2	6	46840	46845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065004
1128	NC_021554	ATAA	2	8	46960	46967	75 %	25 %	0 %	0 %	514065004
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1130	NC_021554	TTG	2	6	47072	47077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065004
1131	NC_021554	TGTA	2	8	47085	47092	25 %	50 %	25 %	0 %	514065004
1132	NC_021554	CAA	2	6	47137	47142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065004
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1171	NC_021554	A	6	6	48540	48545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_021554	ATA	2	6	48577	48582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1173	NC_021554	A	8	8	48582	48589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1178	NC_021554	A	6	6	48754	48759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1261	NC_021554	TTG	2	6	52238	52243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065009
1262	NC_021554	TCT	2	6	52268	52273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065009
1263	NC_021554	TTC	2	6	52315	52320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065009
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1265	NC_021554	TTC	2	6	52369	52374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065009
1266	NC_021554	CTT	2	6	52398	52403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065009
1267	NC_021554	CCT	2	6	52422	52427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_021554	TAA	2	6	52447	52452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_021554	TAT	3	9	52511	52519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_021554	GGA	2	6	52539	52544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1279	NC_021554	TAT	2	6	52832	52837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_021554	ATT	3	9	52896	52904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_021554	CCA	2	6	52926	52931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1282	NC_021554	AT	3	6	52958	52963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1283	NC_021554	AAC	2	6	53029	53034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1284	NC_021554	TC	3	6	53041	53046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1285	NC_021554	TA	4	8	53057	53064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1293	NC_021554	ATT	2	6	53318	53323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065011
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1322	NC_021554	ATT	2	6	54659	54664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1360	NC_021554	TAA	2	6	56775	56780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1363	NC_021554	TTTTCT	2	12	56839	56850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	514065015
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1386	NC_021554	T	6	6	57942	57947	0 %	100 %	0 %	0 %	514065016
1387	NC_021554	TA	3	6	58008	58013	50 %	50 %	0 %	0 %	514065016
1388	NC_021554	GGAA	2	8	58125	58132	50 %	0 %	50 %	0 %	514065016
1389	NC_021554	CAT	2	6	58133	58138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065016
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1391	NC_021554	TCC	2	6	58187	58192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514065016
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1477	NC_021554	TTA	2	6	61945	61950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1484	NC_021554	ATAAA	2	10	62330	62339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1492	NC_021554	T	6	6	62533	62538	0 %	100 %	0 %	0 %	514065022
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