MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus CA-347 plasmid

Total Repeats: 652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021552	TAA	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021552	ACT	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021552	TAA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021552	TTTA	2	8	88	95	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021552	TA	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021552	TAT	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021552	AAT	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021552	TAAA	2	8	157	164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021552	TAAA	2	8	173	180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021552	TTA	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021552	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021552	AAAG	2	8	268	275	75 %	0 %	25 %	0 %	514064934
13	NC_021552	CTAA	2	8	325	332	50 %	25 %	0 %	25 %	514064934
14	NC_021552	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064934
15	NC_021552	A	6	6	463	468	100 %	0 %	0 %	0 %	514064934
16	NC_021552	A	7	7	486	492	100 %	0 %	0 %	0 %	514064934
17	NC_021552	ACG	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514064934
18	NC_021552	TAAA	2	8	536	543	75 %	25 %	0 %	0 %	514064934
19	NC_021552	AGA	2	6	606	611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064934
20	NC_021552	GAAG	2	8	636	643	50 %	0 %	50 %	0 %	514064934
21	NC_021552	AAT	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064934
22	NC_021552	ATGA	2	8	781	788	50 %	25 %	25 %	0 %	514064934
23	NC_021552	TGA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064934
24	NC_021552	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514064934
25	NC_021552	ATT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064934
26	NC_021552	A	7	7	969	975	100 %	0 %	0 %	0 %	514064934
27	NC_021552	CTT	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064934
28	NC_021552	A	6	6	1057	1062	100 %	0 %	0 %	0 %	514064934
29	NC_021552	GAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064934
30	NC_021552	AATAT	2	10	1193	1202	60 %	40 %	0 %	0 %	514064934
31	NC_021552	AAT	2	6	1211	1216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064934
32	NC_021552	ATC	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021552	TGA	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021552	CGA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021552	A	7	7	1293	1299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021552	TGG	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514064935
37	NC_021552	TGA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064935
38	NC_021552	GAA	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064935
39	NC_021552	A	7	7	1458	1464	100 %	0 %	0 %	0 %	514064935
40	NC_021552	ATT	3	9	1505	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064935
41	NC_021552	T	7	7	1539	1545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021552	A	6	6	1559	1564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021552	TGTA	2	8	1592	1599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021552	TTAAA	2	10	1740	1749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021552	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021552	TTTG	2	8	1889	1896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021552	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021552	TAA	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021552	GA	3	6	2061	2066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021552	AC	3	6	2167	2172	50 %	0 %	0 %	50 %	514064936
51	NC_021552	TA	3	6	2183	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	514064936
52	NC_021552	T	6	6	2201	2206	0 %	100 %	0 %	0 %	514064936
53	NC_021552	ATAA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	514064936
54	NC_021552	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021552	GAA	2	6	2261	2266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021552	CCG	2	6	2443	2448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514064937
57	NC_021552	AGT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064937
58	NC_021552	TAC	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514064937
59	NC_021552	TAA	2	6	2609	2614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064937
60	NC_021552	CTT	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064937
61	NC_021552	T	6	6	2648	2653	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
62	NC_021552	T	7	7	2672	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
63	NC_021552	AT	3	6	2691	2696	50 %	50 %	0 %	0 %	514064937
64	NC_021552	T	6	6	2723	2728	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
65	NC_021552	TTA	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064937
66	NC_021552	TCT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064937
67	NC_021552	T	7	7	2828	2834	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
68	NC_021552	CTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064937
69	NC_021552	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
70	NC_021552	TTTC	2	8	2912	2919	0 %	75 %	0 %	25 %	514064937
71	NC_021552	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
72	NC_021552	TTC	2	6	2994	2999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064937
73	NC_021552	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064937
74	NC_021552	AAT	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064937
75	NC_021552	ATA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021552	TAAG	2	8	3117	3124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021552	ATTT	2	8	3142	3149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021552	AT	3	6	3152	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021552	ATGA	2	8	3190	3197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021552	AT	3	6	3210	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021552	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021552	TGA	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021552	T	7	7	3308	3314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021552	AAAG	2	8	3374	3381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021552	AAT	2	6	3392	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021552	TAGAT	2	10	3447	3456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021552	T	7	7	3463	3469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021552	TCT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021552	TTTTTG	2	12	3628	3639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021552	AT	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021552	AT	3	6	3684	3689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021552	A	6	6	3765	3770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021552	TTTC	2	8	3803	3810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021552	TATT	2	8	3819	3826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021552	TTTC	2	8	3827	3834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021552	TCG	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021552	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021552	GTA	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021552	AATT	2	8	3923	3930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021552	A	7	7	3978	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021552	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021552	ACG	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021552	TTAT	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021552	TAA	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021552	A	6	6	4288	4293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021552	GAA	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021552	ATT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021552	TAT	2	6	4496	4501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064938
109	NC_021552	GTT	2	6	4512	4517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514064938
110	NC_021552	GCT	3	9	4518	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514064938
111	NC_021552	CAG	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514064938
112	NC_021552	TTA	2	6	4554	4559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064938
113	NC_021552	TTA	2	6	4566	4571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064938
114	NC_021552	T	6	6	4575	4580	0 %	100 %	0 %	0 %	514064938
115	NC_021552	TAT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064938
116	NC_021552	TTAG	2	8	4653	4660	25 %	50 %	25 %	0 %	514064938
117	NC_021552	ATG	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064938
118	NC_021552	AG	3	6	4780	4785	50 %	0 %	50 %	0 %	514064938
119	NC_021552	A	6	6	4788	4793	100 %	0 %	0 %	0 %	514064938
120	NC_021552	TGAA	2	8	4798	4805	50 %	25 %	25 %	0 %	514064938
121	NC_021552	ATA	2	6	4867	4872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064938
122	NC_021552	TTAC	2	8	4920	4927	25 %	50 %	0 %	25 %	514064938
123	NC_021552	TAATTT	2	12	4942	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064938
124	NC_021552	TCT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064938
125	NC_021552	TTG	2	6	5008	5013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514064938
126	NC_021552	TAT	2	6	5039	5044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064938
127	NC_021552	TA	3	6	5046	5051	50 %	50 %	0 %	0 %	514064938
128	NC_021552	TTTA	2	8	5060	5067	25 %	75 %	0 %	0 %	514064938
129	NC_021552	TTA	3	9	5065	5073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064938
130	NC_021552	TGTGA	2	10	5154	5163	20 %	40 %	40 %	0 %	514064939
131	NC_021552	T	6	6	5201	5206	0 %	100 %	0 %	0 %	514064939
132	NC_021552	AGA	2	6	5207	5212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064939
133	NC_021552	A	6	6	5245	5250	100 %	0 %	0 %	0 %	514064939
134	NC_021552	TGA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064939
135	NC_021552	GAA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064939
136	NC_021552	AGA	2	6	5294	5299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064939
137	NC_021552	TG	3	6	5305	5310	0 %	50 %	50 %	0 %	514064939
138	NC_021552	CAT	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514064939
139	NC_021552	TA	3	6	5374	5379	50 %	50 %	0 %	0 %	514064939
140	NC_021552	ATT	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064939
141	NC_021552	TTA	2	6	5428	5433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064939
142	NC_021552	AG	3	6	5448	5453	50 %	0 %	50 %	0 %	514064939
143	NC_021552	TCT	2	6	5492	5497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021552	A	6	6	5512	5517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021552	TA	3	6	5524	5529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021552	GAC	2	6	5536	5541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021552	TAA	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021552	TC	3	6	5599	5604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021552	AG	3	6	5621	5626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021552	CAT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021552	TCA	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_021552	GCTGT	2	10	5683	5692	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_021552	TAT	2	6	5697	5702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021552	CAA	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021552	TAAT	2	8	5730	5737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021552	A	6	6	5762	5767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021552	ACT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_021552	TA	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021552	TAG	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021552	TTC	2	6	5921	5926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064940
161	NC_021552	TGT	2	6	5932	5937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514064940
162	NC_021552	TTC	2	6	5970	5975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064940
163	NC_021552	CATT	2	8	6016	6023	25 %	50 %	0 %	25 %	514064940
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165	NC_021552	AATT	2	8	6084	6091	50 %	50 %	0 %	0 %	514064940
166	NC_021552	AT	3	6	6116	6121	50 %	50 %	0 %	0 %	514064940
167	NC_021552	AAT	2	6	6230	6235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064940
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169	NC_021552	TAT	2	6	6260	6265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064940
170	NC_021552	ATT	3	9	6274	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064940
171	NC_021552	T	7	7	6300	6306	0 %	100 %	0 %	0 %	514064940
172	NC_021552	CTTTT	2	10	6321	6330	0 %	80 %	0 %	20 %	514064940
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179	NC_021552	TCA	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514064940
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183	NC_021552	TTG	2	6	6917	6922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021552	ATGAT	2	10	6950	6959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021552	AG	3	6	6984	6989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021552	ATT	2	6	7021	7026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021552	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_021552	TAA	2	6	7267	7272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064942
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198	NC_021552	TAGCT	2	10	7474	7483	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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207	NC_021552	TGA	2	6	7732	7737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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214	NC_021552	ATA	2	6	7895	7900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
215	NC_021552	TATT	2	8	7922	7929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_021552	TTTA	2	8	8241	8248	25 %	75 %	0 %	0 %	514064943
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234	NC_021552	TAT	2	6	8866	8871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_021552	ATTT	2	8	10072	10079	25 %	75 %	0 %	0 %	514064944
270	NC_021552	CTCAA	2	10	10262	10271	40 %	20 %	0 %	40 %	514064944
271	NC_021552	AATTA	2	10	10274	10283	60 %	40 %	0 %	0 %	514064944
272	NC_021552	TGGA	2	8	10318	10325	25 %	25 %	50 %	0 %	514064944
273	NC_021552	ATG	2	6	10375	10380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064944
274	NC_021552	A	6	6	10402	10407	100 %	0 %	0 %	0 %	514064944
275	NC_021552	TCT	2	6	10423	10428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064944
276	NC_021552	ATT	2	6	10431	10436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064944
277	NC_021552	ACAGGT	2	12	10474	10485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514064944
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279	NC_021552	GGT	2	6	10511	10516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514064944
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281	NC_021552	TAA	2	6	10604	10609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064944
282	NC_021552	A	6	6	10613	10618	100 %	0 %	0 %	0 %	514064944
283	NC_021552	AATAT	2	10	10691	10700	60 %	40 %	0 %	0 %	514064945
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285	NC_021552	AAG	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064945
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417	NC_021552	TA	4	8	16381	16388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_021552	AACAA	2	10	16393	16402	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
419	NC_021552	A	7	7	16413	16419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_021552	ATT	2	6	16429	16434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_021552	TATTT	2	10	16448	16457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_021552	TAA	2	6	16468	16473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_021552	GTT	2	6	16493	16498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_021552	TTA	2	6	16556	16561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064952
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431	NC_021552	AT	3	6	16800	16805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_021552	A	6	6	16873	16878	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
433	NC_021552	ATT	2	6	16884	16889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064953
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442	NC_021552	AAT	2	6	17134	17139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064953
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450	NC_021552	ATT	2	6	17310	17315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064953
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452	NC_021552	TTA	2	6	17341	17346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064953
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