MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI112 complete genome

Total Repeats: 45683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021507	TTG	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021507	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021507	T	7	7	46	52	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021507	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697425
5	NC_021507	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697425
6	NC_021507	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697425
7	NC_021507	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512697425
8	NC_021507	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	512697425
9	NC_021507	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512697425
10	NC_021507	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697425
11	NC_021507	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	512697425
12	NC_021507	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512697425
13	NC_021507	G	7	7	558	564	0 %	0 %	100 %	0 %	512697425
14	NC_021507	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697425
15	NC_021507	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697425
16	NC_021507	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697425
17	NC_021507	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	512697425
18	NC_021507	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697425
19	NC_021507	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	512697425
20	NC_021507	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	512697425
21	NC_021507	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697425
22	NC_021507	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	512697425
23	NC_021507	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697425
24	NC_021507	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512697425
25	NC_021507	ACGT	2	8	1047	1054	25 %	25 %	25 %	25 %	512697425
26	NC_021507	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697425
27	NC_021507	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697425
28	NC_021507	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	512697425
29	NC_021507	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	512697425
30	NC_021507	GTT	2	6	1517	1522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021507	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021507	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021507	AT	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021507	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	512697426
35	NC_021507	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697426
36	NC_021507	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697426
37	NC_021507	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697426
38	NC_021507	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697426
39	NC_021507	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	512697426
40	NC_021507	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697426
41	NC_021507	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697426
42	NC_021507	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697426
43	NC_021507	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	512697426
44	NC_021507	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697426
45	NC_021507	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697426
46	NC_021507	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697426
47	NC_021507	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697426
48	NC_021507	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512697426
49	NC_021507	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	512697426
50	NC_021507	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697426
51	NC_021507	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	512697426
52	NC_021507	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021507	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	512697427
54	NC_021507	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697427
55	NC_021507	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697427
56	NC_021507	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	512697427
57	NC_021507	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697427
58	NC_021507	A	8	8	2950	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	512697427
59	NC_021507	AAAG	2	8	2985	2992	75 %	0 %	25 %	0 %	512697427
60	NC_021507	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697427
61	NC_021507	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512697427
62	NC_021507	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697427
63	NC_021507	CAGA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	512697427
64	NC_021507	TTTA	2	8	3180	3187	25 %	75 %	0 %	0 %	512697427
65	NC_021507	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	512697427
66	NC_021507	A	6	6	3266	3271	100 %	0 %	0 %	0 %	512697427
67	NC_021507	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697427
68	NC_021507	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697427
69	NC_021507	GA	3	6	3367	3372	50 %	0 %	50 %	0 %	512697427
70	NC_021507	T	6	6	3404	3409	0 %	100 %	0 %	0 %	512697427
71	NC_021507	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697427
72	NC_021507	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697427
73	NC_021507	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	512697427
74	NC_021507	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	512697427
75	NC_021507	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	512697427
76	NC_021507	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697428
77	NC_021507	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	512697428
78	NC_021507	TG	3	6	3759	3764	0 %	50 %	50 %	0 %	512697428
79	NC_021507	A	6	6	3780	3785	100 %	0 %	0 %	0 %	512697428
80	NC_021507	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697428
81	NC_021507	A	7	7	3890	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	512697428
82	NC_021507	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021507	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021507	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021507	GTT	2	6	4057	4062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021507	A	7	7	4212	4218	100 %	0 %	0 %	0 %	512697429
87	NC_021507	ATA	2	6	4236	4241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021507	TAG	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021507	ATT	2	6	4268	4273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021507	CTA	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021507	CAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021507	TCT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021507	T	6	6	4427	4432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021507	ATA	2	6	4436	4441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021507	TTGA	2	8	4445	4452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021507	CAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512697430
97	NC_021507	TTTA	2	8	4525	4532	25 %	75 %	0 %	0 %	512697430
98	NC_021507	GCT	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697430
99	NC_021507	A	7	7	4655	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	512697430
100	NC_021507	AAAT	2	8	4735	4742	75 %	25 %	0 %	0 %	512697430
101	NC_021507	TGA	3	9	4795	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
102	NC_021507	TCAA	2	8	4901	4908	50 %	25 %	0 %	25 %	512697430
103	NC_021507	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	512697430
104	NC_021507	AGA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697430
105	NC_021507	GTT	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697430
106	NC_021507	AAC	2	6	5080	5085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697430
107	NC_021507	TGA	2	6	5113	5118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
108	NC_021507	TGA	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
109	NC_021507	AGT	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
110	NC_021507	GAA	3	9	5219	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697430
111	NC_021507	TGA	3	9	5239	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
112	NC_021507	GCT	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697430
113	NC_021507	ATC	2	6	5319	5324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697430
114	NC_021507	ACTT	2	8	5339	5346	25 %	50 %	0 %	25 %	512697430
115	NC_021507	CTG	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697430
116	NC_021507	GCT	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697430
117	NC_021507	TAT	2	6	5416	5421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697430
118	NC_021507	ATG	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
119	NC_021507	AAG	2	6	5508	5513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697430
120	NC_021507	GAA	2	6	5528	5533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697430
121	NC_021507	TAG	2	6	5588	5593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
122	NC_021507	AAT	2	6	5596	5601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021507	TTA	2	6	5633	5638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021507	TTG	2	6	5687	5692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697431
125	NC_021507	ATA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697431
126	NC_021507	A	6	6	5766	5771	100 %	0 %	0 %	0 %	512697431
127	NC_021507	AGA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697431
128	NC_021507	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	512697431
129	NC_021507	TTTAT	2	10	5846	5855	20 %	80 %	0 %	0 %	512697431
130	NC_021507	ACT	2	6	5863	5868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697431
131	NC_021507	CTTA	2	8	5905	5912	25 %	50 %	0 %	25 %	512697431
132	NC_021507	ACA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697431
133	NC_021507	AT	3	6	5944	5949	50 %	50 %	0 %	0 %	512697431
134	NC_021507	GAT	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697431
135	NC_021507	CTG	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697431
136	NC_021507	TAT	2	6	6027	6032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697431
137	NC_021507	TTA	2	6	6104	6109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697431
138	NC_021507	ATG	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697431
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271	NC_021507	TCA	2	6	12139	12144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697437
272	NC_021507	TGG	2	6	12166	12171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512697437
273	NC_021507	TTG	2	6	12188	12193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697437
274	NC_021507	GTATTG	2	12	12231	12242	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512697437
275	NC_021507	CA	3	6	12243	12248	50 %	0 %	0 %	50 %	512697437
276	NC_021507	AGA	3	9	12280	12288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697437
277	NC_021507	AT	3	6	12289	12294	50 %	50 %	0 %	0 %	512697437
278	NC_021507	ATG	2	6	12315	12320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697437
279	NC_021507	AGA	2	6	12358	12363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697437
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287	NC_021507	AAT	2	6	12683	12688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697437
288	NC_021507	TC	3	6	12701	12706	0 %	50 %	0 %	50 %	512697437
289	NC_021507	CT	4	8	12711	12718	0 %	50 %	0 %	50 %	512697437
290	NC_021507	T	6	6	12790	12795	0 %	100 %	0 %	0 %	512697437
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293	NC_021507	A	6	6	13014	13019	100 %	0 %	0 %	0 %	512697437
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296	NC_021507	ATT	2	6	13124	13129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697437
297	NC_021507	AAG	3	9	13132	13140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697437
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300	NC_021507	A	7	7	13178	13184	100 %	0 %	0 %	0 %	512697437
301	NC_021507	TATT	2	8	13194	13201	25 %	75 %	0 %	0 %	512697437
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387	NC_021507	A	6	6	16117	16122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_021507	GA	3	6	16180	16185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
389	NC_021507	AAC	2	6	16209	16214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_021507	A	7	7	16217	16223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_021507	AG	3	6	16272	16277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
392	NC_021507	ACGA	2	8	16304	16311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
393	NC_021507	A	6	6	16351	16356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_021507	AAAT	2	8	16358	16365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_021507	GGC	2	6	16438	16443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_021507	TGA	2	6	16494	16499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_021507	CGA	2	6	16682	16687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_021507	GCA	2	6	16756	16761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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401	NC_021507	GTGA	2	8	16809	16816	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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