MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 47580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021486	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021486	T	7	7	46	52	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021486	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021486	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021486	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543720
6	NC_021486	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543720
7	NC_021486	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	512543720
8	NC_021486	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512543720
9	NC_021486	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543720
10	NC_021486	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	512543720
11	NC_021486	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512543720
12	NC_021486	G	7	7	558	564	0 %	0 %	100 %	0 %	512543720
13	NC_021486	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543720
14	NC_021486	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543720
15	NC_021486	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543720
16	NC_021486	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	512543720
17	NC_021486	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543720
18	NC_021486	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	512543720
19	NC_021486	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	512543720
20	NC_021486	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543720
21	NC_021486	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	512543720
22	NC_021486	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543720
23	NC_021486	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512543720
24	NC_021486	ATG	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543720
25	NC_021486	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543720
26	NC_021486	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543720
27	NC_021486	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	512543720
28	NC_021486	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	512543720
29	NC_021486	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021486	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021486	AT	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021486	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	512543721
33	NC_021486	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543721
34	NC_021486	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543721
35	NC_021486	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543721
36	NC_021486	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543721
37	NC_021486	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	512543721
38	NC_021486	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543721
39	NC_021486	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543721
40	NC_021486	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543721
41	NC_021486	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	512543721
42	NC_021486	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543721
43	NC_021486	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543721
44	NC_021486	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543721
45	NC_021486	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543721
46	NC_021486	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512543721
47	NC_021486	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	512543721
48	NC_021486	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543721
49	NC_021486	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	512543721
50	NC_021486	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543722
51	NC_021486	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	512543722
52	NC_021486	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543722
53	NC_021486	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543722
54	NC_021486	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	512543722
55	NC_021486	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543722
56	NC_021486	A	8	8	2950	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	512543722
57	NC_021486	A	7	7	2985	2991	100 %	0 %	0 %	0 %	512543722
58	NC_021486	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543722
59	NC_021486	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512543722
60	NC_021486	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543722
61	NC_021486	CAGA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	512543722
62	NC_021486	TTTA	2	8	3180	3187	25 %	75 %	0 %	0 %	512543722
63	NC_021486	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	512543722
64	NC_021486	A	6	6	3266	3271	100 %	0 %	0 %	0 %	512543722
65	NC_021486	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543722
66	NC_021486	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543722
67	NC_021486	GA	3	6	3367	3372	50 %	0 %	50 %	0 %	512543722
68	NC_021486	CAG	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543722
69	NC_021486	T	6	6	3404	3409	0 %	100 %	0 %	0 %	512543722
70	NC_021486	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543722
71	NC_021486	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543722
72	NC_021486	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	512543722
73	NC_021486	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	512543722
74	NC_021486	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	512543722
75	NC_021486	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543723
76	NC_021486	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	512543723
77	NC_021486	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543723
78	NC_021486	A	7	7	3890	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	512543723
79	NC_021486	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021486	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021486	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021486	GTT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021486	A	7	7	4211	4217	100 %	0 %	0 %	0 %	512543724
84	NC_021486	ATA	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021486	TAG	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021486	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021486	CTA	2	6	4279	4284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021486	CAT	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021486	TCT	2	6	4419	4424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021486	T	6	6	4426	4431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021486	ATA	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021486	TTGA	2	8	4444	4451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021486	CAG	2	6	4484	4489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543725
94	NC_021486	TTTA	2	8	4524	4531	25 %	75 %	0 %	0 %	512543725
95	NC_021486	GCT	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543725
96	NC_021486	A	7	7	4654	4660	100 %	0 %	0 %	0 %	512543725
97	NC_021486	AAAT	2	8	4734	4741	75 %	25 %	0 %	0 %	512543725
98	NC_021486	TGA	3	9	4794	4802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
99	NC_021486	TCAA	2	8	4900	4907	50 %	25 %	0 %	25 %	512543725
100	NC_021486	A	6	6	4928	4933	100 %	0 %	0 %	0 %	512543725
101	NC_021486	AGA	2	6	5040	5045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543725
102	NC_021486	GTT	2	6	5056	5061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543725
103	NC_021486	AAC	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543725
104	NC_021486	TGA	2	6	5112	5117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
105	NC_021486	TGA	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
106	NC_021486	AGT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
107	NC_021486	GAA	3	9	5218	5226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543725
108	NC_021486	TGA	3	9	5238	5246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
109	NC_021486	GCT	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543725
110	NC_021486	ATC	2	6	5318	5323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543725
111	NC_021486	ACTT	2	8	5338	5345	25 %	50 %	0 %	25 %	512543725
112	NC_021486	CTG	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543725
113	NC_021486	GCT	2	6	5407	5412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543725
114	NC_021486	TAT	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543725
115	NC_021486	ATG	2	6	5468	5473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
116	NC_021486	AAG	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543725
117	NC_021486	GAA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543725
118	NC_021486	TAG	2	6	5587	5592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
119	NC_021486	AAT	2	6	5595	5600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021486	TTA	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021486	TTG	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543726
122	NC_021486	ATA	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543726
123	NC_021486	A	7	7	5765	5771	100 %	0 %	0 %	0 %	512543726
124	NC_021486	AGA	2	6	5789	5794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543726
125	NC_021486	AGT	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543726
126	NC_021486	ATTT	2	8	5844	5851	25 %	75 %	0 %	0 %	512543726
127	NC_021486	ACT	2	6	5862	5867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543726
128	NC_021486	CTTA	2	8	5904	5911	25 %	50 %	0 %	25 %	512543726
129	NC_021486	ACA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543726
130	NC_021486	AT	3	6	5943	5948	50 %	50 %	0 %	0 %	512543726
131	NC_021486	GAT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543726
132	NC_021486	CTG	2	6	5998	6003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543726
133	NC_021486	TAT	2	6	6026	6031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543726
134	NC_021486	TTA	2	6	6103	6108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543726
135	NC_021486	ATG	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543726
136	NC_021486	ATT	3	9	6187	6195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543726
137	NC_021486	A	6	6	6214	6219	100 %	0 %	0 %	0 %	512543726
138	NC_021486	ATT	2	6	6259	6264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543727
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269	NC_021486	TCA	2	6	12133	12138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543733
270	NC_021486	TGG	2	6	12160	12165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512543733
271	NC_021486	TTG	2	6	12182	12187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543733
272	NC_021486	GTATTG	2	12	12225	12236	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512543733
273	NC_021486	CA	3	6	12237	12242	50 %	0 %	0 %	50 %	512543733
274	NC_021486	AGA	3	9	12274	12282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543733
275	NC_021486	AT	3	6	12283	12288	50 %	50 %	0 %	0 %	512543733
276	NC_021486	ATG	2	6	12309	12314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543733
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278	NC_021486	T	8	8	12382	12389	0 %	100 %	0 %	0 %	512543733
279	NC_021486	GAA	2	6	12404	12409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543733
280	NC_021486	TGA	2	6	12442	12447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543733
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282	NC_021486	TTC	2	6	12555	12560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543733
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286	NC_021486	TC	3	6	12695	12700	0 %	50 %	0 %	50 %	512543733
287	NC_021486	CT	4	8	12705	12712	0 %	50 %	0 %	50 %	512543733
288	NC_021486	T	6	6	12784	12789	0 %	100 %	0 %	0 %	512543733
289	NC_021486	ACTAT	2	10	12915	12924	40 %	40 %	0 %	20 %	512543733
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293	NC_021486	ATA	2	6	13026	13031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543733
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299	NC_021486	A	7	7	13172	13178	100 %	0 %	0 %	0 %	512543733
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370	NC_021486	TGAG	2	8	15556	15563	25 %	25 %	50 %	0 %	512543735
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375	NC_021486	AATT	2	8	15739	15746	50 %	50 %	0 %	0 %	512543735
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377	NC_021486	ATG	2	6	15832	15837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543735
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379	NC_021486	AAG	3	9	15886	15894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543735
380	NC_021486	A	6	6	15897	15902	100 %	0 %	0 %	0 %	512543735
381	NC_021486	TCA	2	6	15907	15912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_021486	T	6	6	15917	15922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_021486	ATGAAG	2	12	15982	15993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
384	NC_021486	AAG	2	6	16010	16015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
385	NC_021486	ACATGA	2	12	16021	16032	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
386	NC_021486	GTTA	2	8	16071	16078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
387	NC_021486	ATA	2	6	16085	16090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_021486	A	7	7	16099	16105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_021486	A	6	6	16112	16117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_021486	GA	3	6	16175	16180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
391	NC_021486	TAG	2	6	16189	16194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
392	NC_021486	TAA	2	6	16203	16208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_021486	A	8	8	16213	16220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_021486	AG	3	6	16269	16274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
395	NC_021486	ACGA	2	8	16301	16308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
396	NC_021486	A	6	6	16348	16353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_021486	GGC	2	6	16434	16439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_021486	TGA	2	6	16490	16495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
399	NC_021486	GTTA	2	8	16592	16599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
400	NC_021486	CGA	2	6	16678	16683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_021486	GCA	2	6	16752	16757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_021486	CGC	2	6	16799	16804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_021486	GTGA	2	8	16805	16812	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
404	NC_021486	TGT	2	6	16838	16843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_021486	TAAC	2	8	16888	16895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
407	NC_021486	CAG	2	6	16921	16926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_021486	AGCG	2	8	16976	16983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
409	NC_021486	GGA	2	6	17046	17051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
410	NC_021486	AT	3	6	17105	17110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_021486	GGA	2	6	17111	17116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
412	NC_021486	CT	3	6	17136	17141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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417	NC_021486	CAT	2	6	17531	17536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_021486	ATC	2	6	17599	17604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_021486	AC	3	6	17626	17631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
423	NC_021486	TGGT	2	8	17641	17648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
424	NC_021486	CGC	2	6	17765	17770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_021486	AC	3	6	17795	17800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
426	NC_021486	CAC	2	6	17810	17815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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428	NC_021486	GAT	2	6	17881	17886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_021486	CCT	2	6	17937	17942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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431	NC_021486	AGG	2	6	18039	18044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_021486	GAA	2	6	18273	18278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_021486	ACG	2	6	18290	18295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_021486	GTAA	2	8	18313	18320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
437	NC_021486	GAAG	2	8	18395	18402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
438	NC_021486	TAG	2	6	18461	18466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_021486	GCGA	2	8	18469	18476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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446	NC_021486	GGGAG	2	10	18746	18755	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_021486	AGC	2	6	19328	19333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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