MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 47580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_021486	CT	3	6	1884183	1884188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42502	NC_021486	TGA	2	6	1884228	1884233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545639
42503	NC_021486	CAA	2	6	1884256	1884261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545639
42504	NC_021486	CTA	2	6	1884268	1884273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545639
42505	NC_021486	CAA	2	6	1884295	1884300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545639
42506	NC_021486	ATC	2	6	1884318	1884323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545639
42507	NC_021486	TTA	2	6	1884330	1884335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545639
42508	NC_021486	CTG	2	6	1884376	1884381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545639
42509	NC_021486	ATC	2	6	1884384	1884389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545639
42510	NC_021486	ATT	2	6	1884441	1884446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545639
42511	NC_021486	TCT	2	6	1884456	1884461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545639
42512	NC_021486	TAT	2	6	1884493	1884498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545639
42513	NC_021486	AAT	2	6	1884530	1884535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545639
42514	NC_021486	AAT	3	9	1884605	1884613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545639
42515	NC_021486	TTTC	2	8	1884619	1884626	0 %	75 %	0 %	25 %	512545639
42516	NC_021486	TGTA	2	8	1884651	1884658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42517	NC_021486	TTGT	2	8	1884670	1884677	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42518	NC_021486	TTTG	2	8	1884679	1884686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42519	NC_021486	ATC	2	6	1884691	1884696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42520	NC_021486	AT	3	6	1884697	1884702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42521	NC_021486	TTTTTG	2	12	1884707	1884718	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42522	NC_021486	TGTTT	3	15	1884723	1884737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42523	NC_021486	A	7	7	1884753	1884759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42524	NC_021486	ACT	2	6	1884789	1884794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42525	NC_021486	AGCT	2	8	1884795	1884802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42526	NC_021486	ATT	2	6	1884825	1884830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42527	NC_021486	ATAA	2	8	1884868	1884875	75 %	25 %	0 %	0 %	512545640
42528	NC_021486	AAACA	2	10	1884881	1884890	80 %	0 %	0 %	20 %	512545640
42529	NC_021486	TGC	2	6	1884899	1884904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545640
42530	NC_021486	ATT	2	6	1885034	1885039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545640
42531	NC_021486	GTT	2	6	1885042	1885047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545640
42532	NC_021486	CTT	2	6	1885154	1885159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545640
42533	NC_021486	TAA	2	6	1885181	1885186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545640
42534	NC_021486	T	6	6	1885196	1885201	0 %	100 %	0 %	0 %	512545640
42535	NC_021486	CAT	2	6	1885240	1885245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42536	NC_021486	CCG	2	6	1885287	1885292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512545640
42537	NC_021486	ATAA	2	8	1885335	1885342	75 %	25 %	0 %	0 %	512545640
42538	NC_021486	T	6	6	1885394	1885399	0 %	100 %	0 %	0 %	512545640
42539	NC_021486	T	6	6	1885423	1885428	0 %	100 %	0 %	0 %	512545640
42540	NC_021486	GTC	2	6	1885490	1885495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545640
42541	NC_021486	AAT	3	9	1885562	1885570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545640
42542	NC_021486	TGA	2	6	1885673	1885678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545640
42543	NC_021486	CAT	3	9	1885690	1885698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42544	NC_021486	CA	3	6	1885713	1885718	50 %	0 %	0 %	50 %	512545640
42545	NC_021486	AT	4	8	1885766	1885773	50 %	50 %	0 %	0 %	512545640
42546	NC_021486	TAG	2	6	1885828	1885833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545640
42547	NC_021486	TA	3	6	1885876	1885881	50 %	50 %	0 %	0 %	512545640
42548	NC_021486	TTTC	2	8	1885916	1885923	0 %	75 %	0 %	25 %	512545640
42549	NC_021486	ATT	2	6	1885925	1885930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545640
42550	NC_021486	TAAGA	2	10	1885939	1885948	60 %	20 %	20 %	0 %	512545640
42551	NC_021486	TCC	2	6	1885952	1885957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512545640
42552	NC_021486	GT	3	6	1885981	1885986	0 %	50 %	50 %	0 %	512545640
42553	NC_021486	TAA	2	6	1885996	1886001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545640
42554	NC_021486	CTTC	2	8	1886007	1886014	0 %	50 %	0 %	50 %	512545640
42555	NC_021486	CATAT	2	10	1886021	1886030	40 %	40 %	0 %	20 %	512545640
42556	NC_021486	A	6	6	1886035	1886040	100 %	0 %	0 %	0 %	512545640
42557	NC_021486	CCATAT	2	12	1886077	1886088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42558	NC_021486	CAC	2	6	1886110	1886115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512545640
42559	NC_021486	TTA	2	6	1886139	1886144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545640
42560	NC_021486	CAT	2	6	1886185	1886190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42561	NC_021486	TCA	2	6	1886250	1886255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42562	NC_021486	AAT	2	6	1886289	1886294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545640
42563	NC_021486	T	6	6	1886328	1886333	0 %	100 %	0 %	0 %	512545640
42564	NC_021486	TCC	2	6	1886345	1886350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512545640
42565	NC_021486	TA	3	6	1886353	1886358	50 %	50 %	0 %	0 %	512545640
42566	NC_021486	AAT	2	6	1886419	1886424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545640
42567	NC_021486	TATTT	2	10	1886523	1886532	20 %	80 %	0 %	0 %	512545640
42568	NC_021486	AGCA	2	8	1886558	1886565	50 %	0 %	25 %	25 %	512545640
42569	NC_021486	GA	3	6	1886602	1886607	50 %	0 %	50 %	0 %	512545640
42570	NC_021486	GAA	2	6	1886811	1886816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545640
42571	NC_021486	TGT	2	6	1886841	1886846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545640
42572	NC_021486	TAT	2	6	1886890	1886895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545640
42573	NC_021486	TCT	2	6	1886943	1886948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545640
42574	NC_021486	AGG	2	6	1886969	1886974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512545640
42575	NC_021486	ACT	2	6	1887009	1887014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42576	NC_021486	ATCTTT	2	12	1887020	1887031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	512545640
42577	NC_021486	ATC	2	6	1887035	1887040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42578	NC_021486	CCTCT	2	10	1887083	1887092	0 %	40 %	0 %	60 %	512545640
42579	NC_021486	AGT	2	6	1887137	1887142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545640
42580	NC_021486	T	6	6	1887142	1887147	0 %	100 %	0 %	0 %	512545640
42581	NC_021486	CAT	2	6	1887148	1887153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42582	NC_021486	ATA	2	6	1887226	1887231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545640
42583	NC_021486	CAT	2	6	1887245	1887250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545640
42584	NC_021486	AT	3	6	1887249	1887254	50 %	50 %	0 %	0 %	512545640
42585	NC_021486	AT	3	6	1887423	1887428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42586	NC_021486	TAT	2	6	1887450	1887455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42587	NC_021486	ATTA	2	8	1887470	1887477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42588	NC_021486	TA	4	8	1887476	1887483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42589	NC_021486	AT	3	6	1887502	1887507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42590	NC_021486	TATT	2	8	1887553	1887560	25 %	75 %	0 %	0 %	512545641
42591	NC_021486	AAAC	2	8	1887616	1887623	75 %	0 %	0 %	25 %	512545641
42592	NC_021486	TAAT	2	8	1887645	1887652	50 %	50 %	0 %	0 %	512545641
42593	NC_021486	TGT	2	6	1887676	1887681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545641
42594	NC_021486	AGTG	2	8	1887735	1887742	25 %	25 %	50 %	0 %	512545641
42595	NC_021486	AAC	2	6	1887892	1887897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545641
42596	NC_021486	ATA	2	6	1887926	1887931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545641
42597	NC_021486	AG	3	6	1887964	1887969	50 %	0 %	50 %	0 %	512545641
42598	NC_021486	CTA	2	6	1887981	1887986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545641
42599	NC_021486	ACG	2	6	1888069	1888074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545641
42600	NC_021486	GCA	2	6	1888130	1888135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545641
42601	NC_021486	AAC	2	6	1888160	1888165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545641
42602	NC_021486	CTG	2	6	1888179	1888184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545641
42603	NC_021486	GA	4	8	1888192	1888199	50 %	0 %	50 %	0 %	512545641
42604	NC_021486	TGC	2	6	1888213	1888218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545641
42605	NC_021486	TTTA	2	8	1888306	1888313	25 %	75 %	0 %	0 %	512545641
42606	NC_021486	ATA	2	6	1888382	1888387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545641
42607	NC_021486	TCA	2	6	1888395	1888400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545641
42608	NC_021486	ATC	2	6	1888453	1888458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545641
42609	NC_021486	AGGT	2	8	1888461	1888468	25 %	25 %	50 %	0 %	512545641
42610	NC_021486	TCA	2	6	1888470	1888475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545641
42611	NC_021486	CAA	2	6	1888503	1888508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545641
42612	NC_021486	ATA	2	6	1888511	1888516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545641
42613	NC_021486	AAT	2	6	1888528	1888533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545641
42614	NC_021486	ATT	2	6	1888555	1888560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545641
42615	NC_021486	T	8	8	1888559	1888566	0 %	100 %	0 %	0 %	512545641
42616	NC_021486	GATA	2	8	1888594	1888601	50 %	25 %	25 %	0 %	512545641
42617	NC_021486	T	7	7	1888641	1888647	0 %	100 %	0 %	0 %	512545641
42618	NC_021486	TAA	2	6	1888684	1888689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545641
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42620	NC_021486	AAT	2	6	1888750	1888755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545641
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42741	NC_021486	GATTAC	2	12	1894032	1894043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512545648
42742	NC_021486	GTGA	2	8	1894069	1894076	25 %	25 %	50 %	0 %	512545648
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42859	NC_021486	GTT	2	6	1900077	1900082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545652
42860	NC_021486	AAAT	2	8	1900168	1900175	75 %	25 %	0 %	0 %	512545652
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42977	NC_021486	AAT	2	6	1906136	1906141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545659
42978	NC_021486	TTCT	2	8	1906161	1906168	0 %	75 %	0 %	25 %	512545659
42979	NC_021486	TTA	2	6	1906194	1906199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545659
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42981	NC_021486	TGAT	2	8	1906331	1906338	25 %	50 %	25 %	0 %	512545659
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