MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 47580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_021486	TCA	2	6	1859788	1859793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545618
42003	NC_021486	CTC	3	9	1859819	1859827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512545618
42004	NC_021486	CAA	2	6	1859918	1859923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545618
42005	NC_021486	AAT	2	6	1859949	1859954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545618
42006	NC_021486	AGTC	2	8	1859957	1859964	25 %	25 %	25 %	25 %	512545618
42007	NC_021486	TCG	2	6	1860062	1860067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545618
42008	NC_021486	GC	3	6	1860105	1860110	0 %	0 %	50 %	50 %	512545618
42009	NC_021486	AAT	2	6	1860182	1860187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545618
42010	NC_021486	GCT	2	6	1860244	1860249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545618
42011	NC_021486	ATT	2	6	1860312	1860317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545618
42012	NC_021486	TCT	2	6	1860352	1860357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545618
42013	NC_021486	ACGC	2	8	1860381	1860388	25 %	0 %	25 %	50 %	512545618
42014	NC_021486	TAAA	2	8	1860435	1860442	75 %	25 %	0 %	0 %	512545618
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42016	NC_021486	TCA	2	6	1860451	1860456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545618
42017	NC_021486	CTT	2	6	1860491	1860496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545618
42018	NC_021486	CAA	2	6	1860558	1860563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545618
42019	NC_021486	ATC	2	6	1860717	1860722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545618
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42021	NC_021486	ATC	2	6	1860783	1860788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545618
42022	NC_021486	TCA	2	6	1860820	1860825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545618
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42052	NC_021486	ATG	3	9	1862412	1862420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545618
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42087	NC_021486	CTT	2	6	1864225	1864230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42088	NC_021486	AAC	2	6	1864231	1864236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42089	NC_021486	CT	3	6	1864238	1864243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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42099	NC_021486	GTT	3	9	1864791	1864799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545619
42100	NC_021486	T	7	7	1864820	1864826	0 %	100 %	0 %	0 %	512545619
42101	NC_021486	ATG	2	6	1864836	1864841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545619
42102	NC_021486	TCATT	2	10	1864858	1864867	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42103	NC_021486	A	6	6	1864925	1864930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42104	NC_021486	T	6	6	1864950	1864955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42105	NC_021486	T	7	7	1864965	1864971	0 %	100 %	0 %	0 %	512545620
42106	NC_021486	CAC	2	6	1865024	1865029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512545620
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42108	NC_021486	TTGACA	2	12	1865224	1865235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512545620
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42110	NC_021486	TGT	2	6	1865338	1865343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545620
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42112	NC_021486	TCA	2	6	1865419	1865424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545620
42113	NC_021486	CTT	2	6	1865537	1865542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545620
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42115	NC_021486	AGGT	2	8	1865685	1865692	25 %	25 %	50 %	0 %	512545620
42116	NC_021486	T	6	6	1865782	1865787	0 %	100 %	0 %	0 %	512545620
42117	NC_021486	CAT	2	6	1865795	1865800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545620
42118	NC_021486	TCA	2	6	1865842	1865847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545620
42119	NC_021486	TCA	2	6	1865881	1865886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545620
42120	NC_021486	TCA	2	6	1865908	1865913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545620
42121	NC_021486	CTT	2	6	1865948	1865953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545620
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42123	NC_021486	TAG	2	6	1865969	1865974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545620
42124	NC_021486	AGC	2	6	1866009	1866014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545620
42125	NC_021486	TCT	2	6	1866088	1866093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545620
42126	NC_021486	ATC	2	6	1866111	1866116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545620
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42133	NC_021486	TAT	2	6	1866898	1866903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42166	NC_021486	AT	3	6	1868187	1868192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42180	NC_021486	TC	3	6	1868994	1868999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42181	NC_021486	TTCT	2	8	1869000	1869007	0 %	75 %	0 %	25 %	512545623
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42221	NC_021486	CTCA	2	8	1870816	1870823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42222	NC_021486	TCA	2	6	1870836	1870841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42223	NC_021486	A	7	7	1870841	1870847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42224	NC_021486	TTTTA	2	10	1870864	1870873	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42225	NC_021486	CAT	2	6	1870925	1870930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545627
42226	NC_021486	ATG	2	6	1870948	1870953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545627
42227	NC_021486	TTC	2	6	1870968	1870973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545627
42228	NC_021486	CTC	2	6	1871054	1871059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512545627
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42230	NC_021486	ATTTG	2	10	1871092	1871101	20 %	60 %	20 %	0 %	512545627
42231	NC_021486	TCT	2	6	1871287	1871292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545627
42232	NC_021486	TGA	2	6	1871341	1871346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545627
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42342	NC_021486	T	7	7	1875781	1875787	0 %	100 %	0 %	0 %	512545631
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42351	NC_021486	CAAAT	2	10	1876089	1876098	60 %	20 %	0 %	20 %	512545631
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42353	NC_021486	ATT	2	6	1876159	1876164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545631
42354	NC_021486	GAA	2	6	1876190	1876195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545631
42355	NC_021486	CAT	2	6	1876332	1876337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545631
42356	NC_021486	GAG	2	6	1876373	1876378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512545631
42357	NC_021486	TGA	2	6	1876428	1876433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545631
42358	NC_021486	CATT	3	12	1876456	1876467	25 %	50 %	0 %	25 %	512545631
42359	NC_021486	CAG	2	6	1876490	1876495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545631
42360	NC_021486	TTA	2	6	1876498	1876503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545631
42361	NC_021486	A	6	6	1876637	1876642	100 %	0 %	0 %	0 %	512545631
42362	NC_021486	CAA	3	9	1876688	1876696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545631
42363	NC_021486	TG	3	6	1876714	1876719	0 %	50 %	50 %	0 %	512545631
42364	NC_021486	CAC	2	6	1876757	1876762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512545631
42365	NC_021486	CAT	2	6	1876811	1876816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42366	NC_021486	T	7	7	1876845	1876851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42367	NC_021486	CTT	2	6	1876925	1876930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545632
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42369	NC_021486	CTG	2	6	1877063	1877068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545632
42370	NC_021486	A	6	6	1877144	1877149	100 %	0 %	0 %	0 %	512545632
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42372	NC_021486	TTG	2	6	1877312	1877317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545632
42373	NC_021486	CTT	2	6	1877342	1877347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545632
42374	NC_021486	ATC	2	6	1877370	1877375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545632
42375	NC_021486	TTC	2	6	1877418	1877423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545632
42376	NC_021486	GTA	2	6	1877459	1877464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545632
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42378	NC_021486	TTC	2	6	1877712	1877717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545632
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42382	NC_021486	ATA	2	6	1878015	1878020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545632
42383	NC_021486	TC	3	6	1878088	1878093	0 %	50 %	0 %	50 %	512545632
42384	NC_021486	TCA	2	6	1878157	1878162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545632
42385	NC_021486	ATG	2	6	1878187	1878192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545632
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42388	NC_021486	AT	3	6	1878441	1878446	50 %	50 %	0 %	0 %	512545632
42389	NC_021486	CCA	2	6	1878459	1878464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512545632
42390	NC_021486	ATT	2	6	1878475	1878480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545632
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42392	NC_021486	TCAT	2	8	1878498	1878505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42393	NC_021486	TTTTA	2	10	1878507	1878516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42394	NC_021486	T	6	6	1878582	1878587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42395	NC_021486	AAG	2	6	1878825	1878830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545633
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42406	NC_021486	GTT	2	6	1879600	1879605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545633
42407	NC_021486	CAA	2	6	1879628	1879633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545633
42408	NC_021486	AAT	2	6	1879682	1879687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545633
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42410	NC_021486	ATTTAA	2	12	1879719	1879730	50 %	50 %	0 %	0 %	512545633
42411	NC_021486	TAT	2	6	1879755	1879760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42412	NC_021486	TAT	2	6	1879769	1879774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42413	NC_021486	AAAG	2	8	1879778	1879785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42414	NC_021486	ACTA	2	8	1879828	1879835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42415	NC_021486	ATAGGC	2	12	1879861	1879872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512545634
42416	NC_021486	ATC	2	6	1879876	1879881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545634
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42432	NC_021486	TCT	2	6	1880856	1880861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545635
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42439	NC_021486	AT	3	6	1881291	1881296	50 %	50 %	0 %	0 %	512545635
42440	NC_021486	CTAAA	2	10	1881337	1881346	60 %	20 %	0 %	20 %	512545635
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42444	NC_021486	TTG	2	6	1881622	1881627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545635
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42452	NC_021486	AGT	2	6	1881986	1881991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545636
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42454	NC_021486	TC	3	6	1882047	1882052	0 %	50 %	0 %	50 %	512545636
42455	NC_021486	A	6	6	1882131	1882136	100 %	0 %	0 %	0 %	512545636
42456	NC_021486	TCA	2	6	1882208	1882213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545636
42457	NC_021486	A	6	6	1882232	1882237	100 %	0 %	0 %	0 %	512545636
42458	NC_021486	TCT	2	6	1882244	1882249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545636
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42461	NC_021486	CAT	2	6	1882320	1882325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545636
42462	NC_021486	CTT	2	6	1882359	1882364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545636
42463	NC_021486	TAC	2	6	1882413	1882418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545636
42464	NC_021486	T	6	6	1882434	1882439	0 %	100 %	0 %	0 %	512545636
42465	NC_021486	AAC	2	6	1882508	1882513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545636
42466	NC_021486	TGA	2	6	1882516	1882521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545636
42467	NC_021486	TTC	2	6	1882537	1882542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545636
42468	NC_021486	CTC	2	6	1882585	1882590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512545636
42469	NC_021486	ATA	2	6	1882652	1882657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545636
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