MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 47580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35004	NC_021486	T	7	7	1552969	1552975	0 %	100 %	0 %	0 %	512545298
35005	NC_021486	CAA	2	6	1553051	1553056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545298
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35011	NC_021486	TCTT	2	8	1553186	1553193	0 %	75 %	0 %	25 %	512545298
35012	NC_021486	AATTA	2	10	1553218	1553227	60 %	40 %	0 %	0 %	512545298
35013	NC_021486	ATG	2	6	1553265	1553270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545298
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35015	NC_021486	AAT	2	6	1553472	1553477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545298
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35019	NC_021486	AATC	2	8	1553610	1553617	50 %	25 %	0 %	25 %	512545298
35020	NC_021486	AATC	2	8	1553733	1553740	50 %	25 %	0 %	25 %	512545298
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35025	NC_021486	T	7	7	1553834	1553840	0 %	100 %	0 %	0 %	512545298
35026	NC_021486	CAAT	2	8	1553895	1553902	50 %	25 %	0 %	25 %	512545298
35027	NC_021486	A	6	6	1553941	1553946	100 %	0 %	0 %	0 %	512545298
35028	NC_021486	AAT	2	6	1554055	1554060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35101	NC_021486	TTG	2	6	1557260	1557265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545302
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35105	NC_021486	AGTATT	2	12	1557493	1557504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512545304
35106	NC_021486	ATCC	2	8	1557547	1557554	25 %	25 %	0 %	50 %	512545304
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35110	NC_021486	A	6	6	1557713	1557718	100 %	0 %	0 %	0 %	512545304
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35116	NC_021486	TA	3	6	1557951	1557956	50 %	50 %	0 %	0 %	512545304
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35118	NC_021486	TGA	2	6	1558002	1558007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545304
35119	NC_021486	AAT	2	6	1558011	1558016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545304
35120	NC_021486	AT	3	6	1558037	1558042	50 %	50 %	0 %	0 %	512545304
35121	NC_021486	TGAT	2	8	1558088	1558095	25 %	50 %	25 %	0 %	512545304
35122	NC_021486	TTA	2	6	1558100	1558105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545304
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35124	NC_021486	TTTGC	2	10	1558209	1558218	0 %	60 %	20 %	20 %	512545304
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35152	NC_021486	TA	3	6	1559633	1559638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35170	NC_021486	TA	4	8	1560372	1560379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35172	NC_021486	AT	3	6	1560444	1560449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35173	NC_021486	T	7	7	1560458	1560464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35174	NC_021486	AAG	2	6	1560467	1560472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35178	NC_021486	A	7	7	1560648	1560654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35214	NC_021486	TCTA	2	8	1562105	1562112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35215	NC_021486	TAT	2	6	1562135	1562140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35218	NC_021486	A	7	7	1562213	1562219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35219	NC_021486	AAT	2	6	1562246	1562251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545308
35220	NC_021486	CTG	2	6	1562266	1562271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545308
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35223	NC_021486	TGAC	2	8	1562328	1562335	25 %	25 %	25 %	25 %	512545308
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35225	NC_021486	CAT	2	6	1562345	1562350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545308
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35232	NC_021486	CAA	2	6	1562707	1562712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545308
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35234	NC_021486	GTT	2	6	1562779	1562784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545308
35235	NC_021486	CAT	2	6	1562807	1562812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545308
35236	NC_021486	CAA	2	6	1562833	1562838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545308
35237	NC_021486	GCT	2	6	1562871	1562876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545308
35238	NC_021486	TCA	2	6	1562925	1562930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545308
35239	NC_021486	AT	3	6	1562931	1562936	50 %	50 %	0 %	0 %	512545308
35240	NC_021486	TCT	2	6	1563180	1563185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545308
35241	NC_021486	ATA	2	6	1563230	1563235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545308
35242	NC_021486	CTA	2	6	1563262	1563267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545308
35243	NC_021486	ACCA	2	8	1563328	1563335	50 %	0 %	0 %	50 %	512545308
35244	NC_021486	AATA	2	8	1563391	1563398	75 %	25 %	0 %	0 %	512545308
35245	NC_021486	GAA	2	6	1563409	1563414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545308
35246	NC_021486	CTG	2	6	1563439	1563444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545308
35247	NC_021486	ACCA	2	8	1563478	1563485	50 %	0 %	0 %	50 %	512545308
35248	NC_021486	TCA	2	6	1563508	1563513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545308
35249	NC_021486	ATAA	2	8	1563530	1563537	75 %	25 %	0 %	0 %	512545308
35250	NC_021486	TCT	2	6	1563600	1563605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545308
35251	NC_021486	TCAT	2	8	1563636	1563643	25 %	50 %	0 %	25 %	512545308
35252	NC_021486	GTA	2	6	1563680	1563685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545308
35253	NC_021486	GAA	2	6	1563719	1563724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545308
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35258	NC_021486	AGAT	2	8	1563876	1563883	50 %	25 %	25 %	0 %	512545308
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35263	NC_021486	CTT	2	6	1564045	1564050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545308
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35268	NC_021486	T	8	8	1564223	1564230	0 %	100 %	0 %	0 %	512545308
35269	NC_021486	T	6	6	1564271	1564276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35270	NC_021486	AT	3	6	1564315	1564320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35271	NC_021486	AAT	2	6	1564326	1564331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35272	NC_021486	AT	3	6	1564330	1564335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35273	NC_021486	TAA	2	6	1564348	1564353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35274	NC_021486	GAT	2	6	1564464	1564469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545309
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35276	NC_021486	ATA	2	6	1564606	1564611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545309
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35294	NC_021486	CTG	2	6	1565193	1565198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545310
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35301	NC_021486	AG	3	6	1565588	1565593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35302	NC_021486	AT	3	6	1565597	1565602	50 %	50 %	0 %	0 %	512545311
35303	NC_021486	ATA	2	6	1565686	1565691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545311
35304	NC_021486	AAGG	2	8	1565694	1565701	50 %	0 %	50 %	0 %	512545311
35305	NC_021486	TAG	2	6	1565795	1565800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545311
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35309	NC_021486	CT	3	6	1565956	1565961	0 %	50 %	0 %	50 %	512545311
35310	NC_021486	TTTA	2	8	1566016	1566023	25 %	75 %	0 %	0 %	512545311
35311	NC_021486	GCT	2	6	1566026	1566031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545311
35312	NC_021486	AGA	3	9	1566098	1566106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545311
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35316	NC_021486	GGA	2	6	1566255	1566260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512545311
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35319	NC_021486	ATC	2	6	1566369	1566374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545311
35320	NC_021486	TTA	2	6	1566450	1566455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545311
35321	NC_021486	TAA	2	6	1566516	1566521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35322	NC_021486	CATA	2	8	1566536	1566543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35323	NC_021486	AT	3	6	1566557	1566562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35324	NC_021486	GAT	2	6	1566564	1566569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35325	NC_021486	ATTAAT	2	12	1566702	1566713	50 %	50 %	0 %	0 %	512545312
35326	NC_021486	ACA	2	6	1566759	1566764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545312
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35328	NC_021486	AAT	4	12	1566782	1566793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545312
35329	NC_021486	T	7	7	1566825	1566831	0 %	100 %	0 %	0 %	512545312
35330	NC_021486	TAA	2	6	1566848	1566853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545312
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35332	NC_021486	TCA	3	9	1566880	1566888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545312
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35335	NC_021486	ACG	2	6	1566970	1566975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545312
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35337	NC_021486	A	6	6	1567128	1567133	100 %	0 %	0 %	0 %	512545312
35338	NC_021486	TTA	2	6	1567155	1567160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545312
35339	NC_021486	AT	3	6	1567292	1567297	50 %	50 %	0 %	0 %	512545312
35340	NC_021486	CAAA	2	8	1567348	1567355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35341	NC_021486	T	7	7	1567384	1567390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35342	NC_021486	CTAG	2	8	1567427	1567434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35343	NC_021486	TAAA	2	8	1567446	1567453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35344	NC_021486	TTA	2	6	1567454	1567459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35345	NC_021486	TAC	2	6	1567588	1567593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35346	NC_021486	A	6	6	1567595	1567600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35347	NC_021486	AATA	2	8	1567627	1567634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35348	NC_021486	AGG	2	6	1567644	1567649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35349	NC_021486	TCA	2	6	1567685	1567690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545313
35350	NC_021486	T	6	6	1567744	1567749	0 %	100 %	0 %	0 %	512545313
35351	NC_021486	GAT	2	6	1567785	1567790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545313
35352	NC_021486	T	6	6	1567793	1567798	0 %	100 %	0 %	0 %	512545313
35353	NC_021486	ACA	2	6	1567806	1567811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545313
35354	NC_021486	TA	3	6	1567840	1567845	50 %	50 %	0 %	0 %	512545313
35355	NC_021486	AAAG	2	8	1567947	1567954	75 %	0 %	25 %	0 %	512545313
35356	NC_021486	GTT	2	6	1568007	1568012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545313
35357	NC_021486	CAT	2	6	1568112	1568117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545313
35358	NC_021486	AGTAT	2	10	1568125	1568134	40 %	40 %	20 %	0 %	512545313
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35464	NC_021486	TCA	2	6	1572748	1572753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35465	NC_021486	CTTT	2	8	1572770	1572777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35466	NC_021486	T	7	7	1572775	1572781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35467	NC_021486	TTTC	2	8	1572793	1572800	0 %	75 %	0 %	25 %	512545320
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35470	NC_021486	ATTT	2	8	1572902	1572909	25 %	75 %	0 %	0 %	512545320
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35472	NC_021486	T	7	7	1572931	1572937	0 %	100 %	0 %	0 %	512545320
35473	NC_021486	CAT	2	6	1573097	1573102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545320
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35476	NC_021486	AAT	2	6	1573194	1573199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545320
35477	NC_021486	TCT	2	6	1573222	1573227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545320
35478	NC_021486	AAG	2	6	1573281	1573286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545320
35479	NC_021486	TA	3	6	1573347	1573352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35480	NC_021486	TAA	2	6	1573363	1573368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35481	NC_021486	TTTC	2	8	1573378	1573385	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35482	NC_021486	AATT	2	8	1573435	1573442	50 %	50 %	0 %	0 %	512545321
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35485	NC_021486	ACC	2	6	1573708	1573713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512545321
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35488	NC_021486	CTGA	2	8	1573794	1573801	25 %	25 %	25 %	25 %	512545321
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