MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 47580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_021486	TCA	2	6	1508104	1508109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545244
34003	NC_021486	ATTCA	2	10	1508184	1508193	40 %	40 %	0 %	20 %	512545244
34004	NC_021486	T	6	6	1508249	1508254	0 %	100 %	0 %	0 %	512545244
34005	NC_021486	TGC	2	6	1508256	1508261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545244
34006	NC_021486	TCT	2	6	1508296	1508301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545244
34007	NC_021486	TCA	2	6	1508317	1508322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545244
34008	NC_021486	TA	3	6	1508342	1508347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34009	NC_021486	AAT	2	6	1508400	1508405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_021486	GT	3	6	1508465	1508470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_021486	CTTC	3	12	1508474	1508485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34012	NC_021486	CAT	2	6	1508500	1508505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34013	NC_021486	A	6	6	1508523	1508528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34014	NC_021486	GA	3	6	1508531	1508536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34015	NC_021486	TAA	2	6	1508541	1508546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34016	NC_021486	AC	3	6	1508555	1508560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34017	NC_021486	TAAA	2	8	1508654	1508661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34018	NC_021486	TA	3	6	1508716	1508721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34019	NC_021486	ATT	2	6	1508776	1508781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545245
34020	NC_021486	TTG	2	6	1508793	1508798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545245
34021	NC_021486	CTCAT	2	10	1508834	1508843	20 %	40 %	0 %	40 %	512545245
34022	NC_021486	ATTT	2	8	1508860	1508867	25 %	75 %	0 %	0 %	512545245
34023	NC_021486	TTA	2	6	1508966	1508971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545245
34024	NC_021486	CAAAT	2	10	1508989	1508998	60 %	20 %	0 %	20 %	512545245
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34031	NC_021486	AAG	2	6	1509375	1509380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545245
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34034	NC_021486	TAA	2	6	1509502	1509507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545245
34035	NC_021486	TTCA	2	8	1509536	1509543	25 %	50 %	0 %	25 %	512545245
34036	NC_021486	TA	3	6	1509606	1509611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34037	NC_021486	GTAA	2	8	1509623	1509630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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34039	NC_021486	TTTTCT	2	12	1509661	1509672	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34040	NC_021486	CTT	2	6	1509676	1509681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34041	NC_021486	A	7	7	1509691	1509697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34043	NC_021486	TAA	2	6	1509735	1509740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34044	NC_021486	ATTT	2	8	1509780	1509787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34045	NC_021486	AAC	2	6	1509802	1509807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34046	NC_021486	AATT	2	8	1509904	1509911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34047	NC_021486	TG	3	6	1509948	1509953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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34062	NC_021486	A	6	6	1510996	1511001	100 %	0 %	0 %	0 %	512545247
34063	NC_021486	AT	3	6	1511041	1511046	50 %	50 %	0 %	0 %	512545247
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34092	NC_021486	ATT	2	6	1512339	1512344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34093	NC_021486	AATAA	2	10	1512352	1512361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34094	NC_021486	TGT	2	6	1512397	1512402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545250
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34102	NC_021486	TTA	2	6	1512924	1512929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34103	NC_021486	ATTA	2	8	1512937	1512944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34104	NC_021486	TGT	2	6	1513060	1513065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545251
34105	NC_021486	GCA	2	6	1513142	1513147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545251
34106	NC_021486	ACG	2	6	1513248	1513253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545251
34107	NC_021486	TGATAT	2	12	1513258	1513269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512545251
34108	NC_021486	AGA	2	6	1513306	1513311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545251
34109	NC_021486	ACT	2	6	1513346	1513351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545251
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34111	NC_021486	AG	3	6	1513420	1513425	50 %	0 %	50 %	0 %	512545251
34112	NC_021486	CAGT	2	8	1513444	1513451	25 %	25 %	25 %	25 %	512545251
34113	NC_021486	TTA	2	6	1513484	1513489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545251
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34117	NC_021486	AAG	2	6	1513658	1513663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545251
34118	NC_021486	GAA	2	6	1513691	1513696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545251
34119	NC_021486	TCA	2	6	1513714	1513719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545251
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34121	NC_021486	ATA	2	6	1513760	1513765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545251
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34123	NC_021486	T	6	6	1513858	1513863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34124	NC_021486	AC	3	6	1513872	1513877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34125	NC_021486	AAC	2	6	1513883	1513888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34126	NC_021486	ACT	2	6	1513934	1513939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545252
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34240	NC_021486	TCT	2	6	1519012	1519017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545257
34241	NC_021486	CAT	2	6	1519052	1519057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545257
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34246	NC_021486	TTTG	2	8	1519362	1519369	0 %	75 %	25 %	0 %	512545258
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34358	NC_021486	CAA	2	6	1524147	1524152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545263
34359	NC_021486	AAT	2	6	1524231	1524236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545263
34360	NC_021486	ATCAA	2	10	1524250	1524259	60 %	20 %	0 %	20 %	512545263
34361	NC_021486	CTT	2	6	1524320	1524325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545263
34362	NC_021486	TTTC	2	8	1524336	1524343	0 %	75 %	0 %	25 %	512545263
34363	NC_021486	AT	3	6	1524373	1524378	50 %	50 %	0 %	0 %	512545263
34364	NC_021486	T	7	7	1524426	1524432	0 %	100 %	0 %	0 %	512545263
34365	NC_021486	TTC	2	6	1524436	1524441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545263
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34370	NC_021486	TCT	2	6	1524871	1524876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545263
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34372	NC_021486	GTTTA	2	10	1524903	1524912	20 %	60 %	20 %	0 %	512545263
34373	NC_021486	AAT	2	6	1524976	1524981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545263
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34375	NC_021486	TAAT	2	8	1525019	1525026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34376	NC_021486	T	7	7	1525029	1525035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34377	NC_021486	TTAA	2	8	1525044	1525051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34378	NC_021486	TAAAA	2	10	1525082	1525091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34379	NC_021486	A	6	6	1525088	1525093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34380	NC_021486	ATT	2	6	1525143	1525148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34381	NC_021486	AAT	2	6	1525156	1525161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34382	NC_021486	ATA	2	6	1525163	1525168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34383	NC_021486	CA	3	6	1525229	1525234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34384	NC_021486	AAG	2	6	1525248	1525253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34385	NC_021486	ATA	2	6	1525294	1525299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34386	NC_021486	ATT	2	6	1525307	1525312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34387	NC_021486	AT	3	6	1525316	1525321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34388	NC_021486	TA	3	6	1525337	1525342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34389	NC_021486	AATA	2	8	1525344	1525351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34390	NC_021486	AGGA	2	8	1525357	1525364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34391	NC_021486	T	7	7	1525373	1525379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34392	NC_021486	TGT	3	9	1525424	1525432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512545264
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34411	NC_021486	GATTT	2	10	1526105	1526114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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34425	NC_021486	TGT	2	6	1526619	1526624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34427	NC_021486	TTTC	2	8	1526747	1526754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34428	NC_021486	ATT	2	6	1526769	1526774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34429	NC_021486	ACA	2	6	1526775	1526780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34442	NC_021486	AAT	2	6	1527579	1527584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545266
34443	NC_021486	T	6	6	1527608	1527613	0 %	100 %	0 %	0 %	512545266
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34451	NC_021486	GCT	2	6	1527850	1527855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545266
34452	NC_021486	ATA	2	6	1527880	1527885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545266
34453	NC_021486	TAG	2	6	1527915	1527920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545266
34454	NC_021486	AAT	2	6	1527927	1527932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545266
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34457	NC_021486	ATAA	2	8	1528003	1528010	75 %	25 %	0 %	0 %	512545266
34458	NC_021486	ATG	2	6	1528070	1528075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545266
34459	NC_021486	AAT	2	6	1528153	1528158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545266
34460	NC_021486	CTT	2	6	1528212	1528217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512545267
34461	NC_021486	ATG	2	6	1528266	1528271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545267
34462	NC_021486	GAT	3	9	1528293	1528301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512545267
34463	NC_021486	AGA	2	6	1528341	1528346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512545267
34464	NC_021486	ATA	2	6	1528369	1528374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545267
34465	NC_021486	CAAT	2	8	1528406	1528413	50 %	25 %	0 %	25 %	512545267
34466	NC_021486	TCACT	2	10	1528470	1528479	20 %	40 %	0 %	40 %	512545267
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34469	NC_021486	TCC	2	6	1528571	1528576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512545267
34470	NC_021486	CAA	2	6	1528578	1528583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512545267
34471	NC_021486	ACT	2	6	1528685	1528690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545267
34472	NC_021486	CGA	2	6	1528712	1528717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545267
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34474	NC_021486	GGT	2	6	1528964	1528969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512545267
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34476	NC_021486	AATA	2	8	1529051	1529058	75 %	25 %	0 %	0 %	512545267
34477	NC_021486	CAT	2	6	1529070	1529075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545267
34478	NC_021486	GCAT	2	8	1529084	1529091	25 %	25 %	25 %	25 %	512545267
34479	NC_021486	AAAG	2	8	1529114	1529121	75 %	0 %	25 %	0 %	512545267
34480	NC_021486	ACG	2	6	1529219	1529224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545267
34481	NC_021486	ACC	2	6	1529233	1529238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512545267
34482	NC_021486	GCT	2	6	1529291	1529296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512545267
34483	NC_021486	CGA	2	6	1529342	1529347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545267
34484	NC_021486	AAT	2	6	1529387	1529392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512545267
34485	NC_021486	TCC	2	6	1529425	1529430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34486	NC_021486	TAT	2	6	1529458	1529463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34487	NC_021486	TA	3	6	1529480	1529485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34488	NC_021486	T	6	6	1529504	1529509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34489	NC_021486	AAAT	2	8	1529512	1529519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34490	NC_021486	T	7	7	1529519	1529525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34491	NC_021486	CAT	2	6	1529557	1529562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34492	NC_021486	TAC	2	6	1529567	1529572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34493	NC_021486	GATT	2	8	1529585	1529592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34494	NC_021486	TTA	3	9	1529638	1529646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34495	NC_021486	CAA	2	6	1529686	1529691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34496	NC_021486	AG	3	6	1529706	1529711	50 %	0 %	50 %	0 %	512545268
34497	NC_021486	A	6	6	1529944	1529949	100 %	0 %	0 %	0 %	512545268
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34499	NC_021486	CGA	2	6	1530168	1530173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512545268
34500	NC_021486	TACC	2	8	1530188	1530195	25 %	25 %	0 %	50 %	512545268

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