MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 47580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021486	GGA	2	6	22877	22882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021486	AT	3	6	22936	22941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021486	GGA	2	6	22942	22947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021486	CT	3	6	22967	22972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_021486	GAA	2	6	23206	23211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021486	GGT	2	6	23280	23285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021486	GTC	2	6	23294	23299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021486	TCGTG	2	10	23303	23312	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
509	NC_021486	CAT	2	6	23362	23367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021486	TAA	2	6	23397	23402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021486	GGA	2	6	23406	23411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021486	G	7	7	23413	23419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021486	ATC	2	6	23430	23435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021486	AC	3	6	23457	23462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_021486	TGGT	2	8	23472	23479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021486	CGC	2	6	23596	23601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_021486	AC	3	6	23626	23631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_021486	CAC	2	6	23641	23646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_021486	AGCC	2	8	23689	23696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
520	NC_021486	GAT	2	6	23712	23717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021486	CCT	2	6	23768	23773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_021486	TAAGGA	2	12	23777	23788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021486	AGG	2	6	23870	23875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021486	TAA	2	6	24051	24056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021486	GTTAA	2	10	24058	24067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021486	GAA	2	6	24104	24109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021486	ACG	2	6	24121	24126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021486	G	6	6	24136	24141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021486	GTAA	2	8	24144	24151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021486	GAAG	2	8	24226	24233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021486	TAG	2	6	24292	24297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021486	GCGA	2	8	24300	24307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_021486	AGG	2	6	24314	24319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021486	AGA	2	6	24379	24384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021486	AG	3	6	24407	24412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021486	TCG	2	6	24483	24488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021486	GGA	2	6	24496	24501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021486	CT	3	6	24522	24527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_021486	GGGAG	2	10	24577	24586	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021486	ACA	2	6	24614	24619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021486	ATG	2	6	24681	24686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021486	TGT	2	6	24751	24756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021486	GGA	2	6	24814	24819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021486	TC	3	6	24900	24905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_021486	ACC	2	6	25079	25084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_021486	AT	3	6	25100	25105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021486	AGC	2	6	25159	25164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021486	ATTC	2	8	25166	25173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_021486	GAA	2	6	25295	25300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021486	GAG	2	6	25311	25316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021486	GA	3	6	25441	25446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021486	ACA	2	6	25467	25472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021486	TA	3	6	25495	25500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021486	CTAA	2	8	25522	25529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_021486	GAG	2	6	25611	25616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021486	TAG	2	6	25624	25629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021486	GA	3	6	25736	25741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021486	CT	3	6	25852	25857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_021486	GAT	2	6	25870	25875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021486	CGG	2	6	25961	25966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021486	GA	3	6	26059	26064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021486	TAGG	2	8	26177	26184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021486	GTT	2	6	26221	26226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021486	TAC	2	6	26231	26236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_021486	CCT	2	6	26319	26324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_021486	GGT	2	6	26455	26460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021486	TCG	2	6	26570	26575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_021486	CGT	2	6	26650	26655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021486	AGGGA	2	10	26788	26797	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021486	GA	3	6	26874	26879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021486	ACTAAT	2	12	26929	26940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
572	NC_021486	AGT	2	6	27106	27111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021486	TAG	2	6	27468	27473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021486	CGT	2	6	27644	27649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_021486	ATA	2	6	27749	27754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021486	CTC	2	6	27818	27823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_021486	AT	3	6	27917	27922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021486	CCG	2	6	27994	27999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_021486	TATT	2	8	28001	28008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021486	T	6	6	28098	28103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021486	GGA	2	6	28111	28116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021486	GCGT	2	8	28170	28177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_021486	TCC	2	6	28194	28199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_021486	AGC	2	6	28221	28226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021486	TCG	2	6	28235	28240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_021486	CGG	2	6	28334	28339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021486	TAT	2	6	28362	28367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021486	TGT	2	6	28419	28424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021486	GGT	2	6	28499	28504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021486	GGT	2	6	28534	28539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021486	T	7	7	28692	28698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021486	AGA	2	6	28747	28752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021486	T	6	6	28844	28849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021486	AGT	2	6	28880	28885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021486	TAA	2	6	28887	28892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021486	A	7	7	28898	28904	100 %	0 %	0 %	0 %	512543736
597	NC_021486	CAG	2	6	28914	28919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543736
598	NC_021486	CTG	2	6	28947	28952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543736
599	NC_021486	TGA	2	6	28969	28974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543736
600	NC_021486	TGC	2	6	28990	28995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543736
601	NC_021486	CAA	2	6	29027	29032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543736
602	NC_021486	GCA	3	9	29033	29041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543736
603	NC_021486	CAA	2	6	29090	29095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543736
604	NC_021486	CAG	2	6	29138	29143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543736
605	NC_021486	TAA	2	6	29170	29175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543736
606	NC_021486	TTG	2	6	29178	29183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543736
607	NC_021486	ACTA	2	8	29237	29244	50 %	25 %	0 %	25 %	512543736
608	NC_021486	GTT	2	6	29294	29299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543736
609	NC_021486	GTT	2	6	29312	29317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543736
610	NC_021486	CAA	2	6	29342	29347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543736
611	NC_021486	AGC	2	6	29410	29415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543736
612	NC_021486	CAAG	2	8	29419	29426	50 %	0 %	25 %	25 %	512543736
613	NC_021486	ATA	2	6	29436	29441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543736
614	NC_021486	AGC	2	6	29443	29448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543736
615	NC_021486	AGC	2	6	29476	29481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543736
616	NC_021486	AGC	3	9	29590	29598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543736
617	NC_021486	GCA	3	9	29657	29665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543736
618	NC_021486	CTT	2	6	29748	29753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543736
619	NC_021486	ACT	2	6	29759	29764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543736
620	NC_021486	CTA	2	6	29781	29786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543736
621	NC_021486	GTA	2	6	29813	29818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543736
622	NC_021486	GTT	2	6	29846	29851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543736
623	NC_021486	TGT	2	6	29881	29886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543736
624	NC_021486	CTT	2	6	29952	29957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543736
625	NC_021486	AAC	2	6	30028	30033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543736
626	NC_021486	ATG	2	6	30066	30071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543736
627	NC_021486	GTG	2	6	30072	30077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512543736
628	NC_021486	AGT	2	6	30094	30099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543736
629	NC_021486	ATTA	2	8	30272	30279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021486	ATTT	2	8	30286	30293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021486	GGA	2	6	30346	30351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021486	TCA	2	6	30389	30394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543737
633	NC_021486	A	6	6	30410	30415	100 %	0 %	0 %	0 %	512543737
634	NC_021486	CAT	2	6	30512	30517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543737
635	NC_021486	CAA	2	6	30534	30539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543737
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