MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 48119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021485	TTG	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021485	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021485	T	7	7	46	52	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021485	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538240
5	NC_021485	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538240
6	NC_021485	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538240
7	NC_021485	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538240
8	NC_021485	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	512538240
9	NC_021485	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512538240
10	NC_021485	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538240
11	NC_021485	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	512538240
12	NC_021485	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512538240
13	NC_021485	G	7	7	558	564	0 %	0 %	100 %	0 %	512538240
14	NC_021485	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538240
15	NC_021485	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538240
16	NC_021485	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538240
17	NC_021485	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	512538240
18	NC_021485	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538240
19	NC_021485	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	512538240
20	NC_021485	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	512538240
21	NC_021485	G	6	6	782	787	0 %	0 %	100 %	0 %	512538240
22	NC_021485	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538240
23	NC_021485	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	512538240
24	NC_021485	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538240
25	NC_021485	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512538240
26	NC_021485	ACGT	2	8	1047	1054	25 %	25 %	25 %	25 %	512538240
27	NC_021485	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538240
28	NC_021485	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538240
29	NC_021485	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	512538240
30	NC_021485	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	512538240
31	NC_021485	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021485	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021485	AT	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021485	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	512538241
35	NC_021485	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538241
36	NC_021485	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538241
37	NC_021485	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538241
38	NC_021485	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538241
39	NC_021485	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	512538241
40	NC_021485	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538241
41	NC_021485	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538241
42	NC_021485	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538241
43	NC_021485	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	512538241
44	NC_021485	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538241
45	NC_021485	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538241
46	NC_021485	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538241
47	NC_021485	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538241
48	NC_021485	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512538241
49	NC_021485	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	512538241
50	NC_021485	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538241
51	NC_021485	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	512538241
52	NC_021485	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538242
53	NC_021485	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	512538242
54	NC_021485	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538242
55	NC_021485	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538242
56	NC_021485	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	512538242
57	NC_021485	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538242
58	NC_021485	A	8	8	2950	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	512538242
59	NC_021485	AAAG	2	8	2985	2992	75 %	0 %	25 %	0 %	512538242
60	NC_021485	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538242
61	NC_021485	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512538242
62	NC_021485	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538242
63	NC_021485	CAGA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	512538242
64	NC_021485	TTTA	2	8	3180	3187	25 %	75 %	0 %	0 %	512538242
65	NC_021485	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	512538242
66	NC_021485	A	6	6	3266	3271	100 %	0 %	0 %	0 %	512538242
67	NC_021485	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538242
68	NC_021485	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538242
69	NC_021485	GA	3	6	3367	3372	50 %	0 %	50 %	0 %	512538242
70	NC_021485	T	6	6	3404	3409	0 %	100 %	0 %	0 %	512538242
71	NC_021485	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538242
72	NC_021485	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538242
73	NC_021485	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	512538242
74	NC_021485	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	512538242
75	NC_021485	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	512538242
76	NC_021485	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538243
77	NC_021485	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	512538243
78	NC_021485	TG	3	6	3759	3764	0 %	50 %	50 %	0 %	512538243
79	NC_021485	A	6	6	3780	3785	100 %	0 %	0 %	0 %	512538243
80	NC_021485	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538243
81	NC_021485	A	7	7	3890	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	512538243
82	NC_021485	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021485	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021485	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021485	GTT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021485	A	7	7	4211	4217	100 %	0 %	0 %	0 %	512538244
87	NC_021485	ATA	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021485	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021485	CTA	2	6	4279	4284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021485	TCT	2	6	4398	4403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021485	TCT	2	6	4419	4424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021485	T	6	6	4426	4431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021485	ATA	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021485	TTGA	2	8	4444	4451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021485	CAG	2	6	4484	4489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538245
96	NC_021485	TTTA	2	8	4524	4531	25 %	75 %	0 %	0 %	512538245
97	NC_021485	GCT	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538245
98	NC_021485	TGGTA	2	10	4596	4605	20 %	40 %	40 %	0 %	512538245
99	NC_021485	A	7	7	4654	4660	100 %	0 %	0 %	0 %	512538245
100	NC_021485	TAA	2	6	4734	4739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538245
101	NC_021485	TGA	3	9	4794	4802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538245
102	NC_021485	TCAA	2	8	4900	4907	50 %	25 %	0 %	25 %	512538245
103	NC_021485	A	6	6	4928	4933	100 %	0 %	0 %	0 %	512538245
104	NC_021485	AGA	2	6	5040	5045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538245
105	NC_021485	GTT	2	6	5056	5061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538245
106	NC_021485	AAC	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538245
107	NC_021485	TGA	2	6	5112	5117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538245
108	NC_021485	TGA	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538245
109	NC_021485	AG	3	6	5181	5186	50 %	0 %	50 %	0 %	512538245
110	NC_021485	AGT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538245
111	NC_021485	GAA	3	9	5218	5226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538245
112	NC_021485	TGA	3	9	5238	5246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538245
113	NC_021485	GCT	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538245
114	NC_021485	ATC	2	6	5318	5323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538245
115	NC_021485	ACTT	2	8	5338	5345	25 %	50 %	0 %	25 %	512538245
116	NC_021485	CTG	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538245
117	NC_021485	TAT	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538245
118	NC_021485	ATG	2	6	5468	5473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538245
119	NC_021485	AAG	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538245
120	NC_021485	GAA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538245
121	NC_021485	TAA	2	6	5590	5595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021485	TTA	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021485	TTG	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538246
124	NC_021485	ATA	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538246
125	NC_021485	A	6	6	5765	5770	100 %	0 %	0 %	0 %	512538246
126	NC_021485	AGA	2	6	5789	5794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538246
127	NC_021485	A	6	6	5839	5844	100 %	0 %	0 %	0 %	512538246
128	NC_021485	TTTAT	2	10	5845	5854	20 %	80 %	0 %	0 %	512538246
129	NC_021485	ACT	2	6	5862	5867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538246
130	NC_021485	TACT	3	12	5902	5913	25 %	50 %	0 %	25 %	512538246
131	NC_021485	ACA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538246
132	NC_021485	AT	3	6	5943	5948	50 %	50 %	0 %	0 %	512538246
133	NC_021485	GAT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538246
134	NC_021485	CTG	2	6	5998	6003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538246
135	NC_021485	TAT	2	6	6026	6031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538246
136	NC_021485	TTA	2	6	6103	6108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538246
137	NC_021485	ATG	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538246
138	NC_021485	ATT	3	9	6187	6195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538246
139	NC_021485	A	6	6	6214	6219	100 %	0 %	0 %	0 %	512538246
140	NC_021485	ATT	2	6	6259	6264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538247
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143	NC_021485	AT	3	6	6444	6449	50 %	50 %	0 %	0 %	512538247
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152	NC_021485	TCG	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538247
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173	NC_021485	TGCG	2	8	8193	8200	0 %	25 %	50 %	25 %	512538247
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265	NC_021485	TAT	2	6	12005	12010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538251
266	NC_021485	ATC	2	6	12029	12034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538251
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269	NC_021485	ATA	2	6	12083	12088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538251
270	NC_021485	TCA	2	6	12138	12143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538252
271	NC_021485	TGG	2	6	12165	12170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538252
272	NC_021485	TTG	2	6	12187	12192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538252
273	NC_021485	GTATTG	2	12	12230	12241	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512538252
274	NC_021485	CA	3	6	12242	12247	50 %	0 %	0 %	50 %	512538252
275	NC_021485	AGA	3	9	12279	12287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538252
276	NC_021485	AT	3	6	12288	12293	50 %	50 %	0 %	0 %	512538252
277	NC_021485	ATG	2	6	12314	12319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538252
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279	NC_021485	T	8	8	12387	12394	0 %	100 %	0 %	0 %	512538252
280	NC_021485	GAA	2	6	12409	12414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538252
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288	NC_021485	CT	4	8	12710	12717	0 %	50 %	0 %	50 %	512538252
289	NC_021485	T	6	6	12789	12794	0 %	100 %	0 %	0 %	512538252
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300	NC_021485	A	7	7	13177	13183	100 %	0 %	0 %	0 %	512538252
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392	NC_021485	A	7	7	16350	16356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_021485	GGC	2	6	16437	16442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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403	NC_021485	CAG	2	6	16925	16930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_021485	AGCG	2	8	16980	16987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
405	NC_021485	GGA	2	6	17050	17055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
406	NC_021485	AT	3	6	17109	17114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_021485	GGA	2	6	17115	17120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
408	NC_021485	CT	3	6	17140	17145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
409	NC_021485	GAA	2	6	17379	17384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_021485	TCGTG	2	10	17476	17485	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
413	NC_021485	CAT	2	6	17535	17540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_021485	GAAG	2	8	18399	18406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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