MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 48119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_021485	AT	3	6	2044449	2044454	50 %	50 %	0 %	0 %	512540229
46003	NC_021485	CAT	2	6	2044483	2044488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540229
46004	NC_021485	TCA	2	6	2044512	2044517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540229
46005	NC_021485	CAT	2	6	2044568	2044573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540229
46006	NC_021485	TCA	2	6	2044608	2044613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540229
46007	NC_021485	GCA	2	6	2044614	2044619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512540229
46008	NC_021485	ATA	2	6	2044695	2044700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540229
46009	NC_021485	TCTG	2	8	2044770	2044777	0 %	50 %	25 %	25 %	512540229
46010	NC_021485	AT	3	6	2044803	2044808	50 %	50 %	0 %	0 %	512540229
46011	NC_021485	TCTTAA	2	12	2044852	2044863	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512540229
46012	NC_021485	TCA	2	6	2044872	2044877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540229
46013	NC_021485	TGA	2	6	2044899	2044904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540229
46014	NC_021485	ACT	2	6	2044914	2044919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540229
46015	NC_021485	CTG	2	6	2045083	2045088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540229
46016	NC_021485	T	6	6	2045106	2045111	0 %	100 %	0 %	0 %	512540229
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46018	NC_021485	AATTGG	2	12	2045152	2045163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540229
46019	NC_021485	TAA	2	6	2045175	2045180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540229
46020	NC_021485	T	6	6	2045186	2045191	0 %	100 %	0 %	0 %	512540229
46021	NC_021485	TGC	2	6	2045225	2045230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540229
46022	NC_021485	TAG	2	6	2045341	2045346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540229
46023	NC_021485	ATTA	2	8	2045372	2045379	50 %	50 %	0 %	0 %	512540229
46024	NC_021485	ACA	2	6	2045415	2045420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540229
46025	NC_021485	TTGA	2	8	2045435	2045442	25 %	50 %	25 %	0 %	512540229
46026	NC_021485	TC	3	6	2045591	2045596	0 %	50 %	0 %	50 %	512540229
46027	NC_021485	A	7	7	2045597	2045603	100 %	0 %	0 %	0 %	512540229
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46029	NC_021485	GATTC	2	10	2045642	2045651	20 %	40 %	20 %	20 %	512540229
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46032	NC_021485	ACT	2	6	2045832	2045837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540229
46033	NC_021485	GCA	2	6	2045898	2045903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512540229
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46037	NC_021485	CGTC	2	8	2046013	2046020	0 %	25 %	25 %	50 %	512540229
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46041	NC_021485	TGTT	2	8	2046146	2046153	0 %	75 %	25 %	0 %	512540229
46042	NC_021485	AATC	2	8	2046163	2046170	50 %	25 %	0 %	25 %	512540229
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46051	NC_021485	TTGGC	2	10	2046547	2046556	0 %	40 %	40 %	20 %	512540229
46052	NC_021485	CTAA	2	8	2046569	2046576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46053	NC_021485	GCTG	2	8	2046581	2046588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46054	NC_021485	CTC	2	6	2046599	2046604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46055	NC_021485	CAA	2	6	2046679	2046684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540230
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46058	NC_021485	TAATT	2	10	2046973	2046982	40 %	60 %	0 %	0 %	512540230
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46061	NC_021485	TTAG	2	8	2047069	2047076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46062	NC_021485	A	8	8	2047100	2047107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46063	NC_021485	TAG	2	6	2047122	2047127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46087	NC_021485	AGATAA	2	12	2048489	2048500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	512540231
46088	NC_021485	TGACTT	2	12	2048570	2048581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512540231
46089	NC_021485	TCAA	2	8	2048645	2048652	50 %	25 %	0 %	25 %	512540231
46090	NC_021485	ATC	2	6	2048724	2048729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540231
46091	NC_021485	TAT	2	6	2048753	2048758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540231
46092	NC_021485	TAT	2	6	2048789	2048794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540231
46093	NC_021485	AATA	2	8	2048829	2048836	75 %	25 %	0 %	0 %	512540231
46094	NC_021485	CA	3	6	2048844	2048849	50 %	0 %	0 %	50 %	512540231
46095	NC_021485	AGT	2	6	2048877	2048882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540231
46096	NC_021485	CCT	2	6	2048933	2048938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512540231
46097	NC_021485	ACT	2	6	2048975	2048980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46098	NC_021485	T	6	6	2049009	2049014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46099	NC_021485	TAA	2	6	2049021	2049026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46100	NC_021485	ATGCC	2	10	2049049	2049058	20 %	20 %	20 %	40 %	512540232
46101	NC_021485	GAA	2	6	2049102	2049107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512540232
46102	NC_021485	GAT	2	6	2049120	2049125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540232
46103	NC_021485	ACTC	2	8	2049181	2049188	25 %	25 %	0 %	50 %	512540232
46104	NC_021485	ATCA	2	8	2049213	2049220	50 %	25 %	0 %	25 %	512540232
46105	NC_021485	TAT	2	6	2049323	2049328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540232
46106	NC_021485	GGA	2	6	2049348	2049353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512540232
46107	NC_021485	AAAATA	2	12	2049356	2049367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	512540232
46108	NC_021485	TTTA	2	8	2049388	2049395	25 %	75 %	0 %	0 %	512540233
46109	NC_021485	TCG	2	6	2049407	2049412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540233
46110	NC_021485	TAA	2	6	2049430	2049435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540233
46111	NC_021485	TTTC	2	8	2049490	2049497	0 %	75 %	0 %	25 %	512540233
46112	NC_021485	CACTT	2	10	2049506	2049515	20 %	40 %	0 %	40 %	512540233
46113	NC_021485	CAT	2	6	2049538	2049543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540233
46114	NC_021485	CT	3	6	2049545	2049550	0 %	50 %	0 %	50 %	512540233
46115	NC_021485	A	6	6	2049576	2049581	100 %	0 %	0 %	0 %	512540233
46116	NC_021485	TGC	3	9	2049614	2049622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540233
46117	NC_021485	GATTCT	2	12	2049624	2049635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512540233
46118	NC_021485	TAA	2	6	2049640	2049645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540233
46119	NC_021485	AGCT	2	8	2049709	2049716	25 %	25 %	25 %	25 %	512540233
46120	NC_021485	TA	3	6	2049724	2049729	50 %	50 %	0 %	0 %	512540233
46121	NC_021485	TGT	2	6	2049735	2049740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512540233
46122	NC_021485	TCC	2	6	2049822	2049827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512540233
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46124	NC_021485	CAC	2	6	2049850	2049855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512540233
46125	NC_021485	CAG	2	6	2049910	2049915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512540233
46126	NC_021485	CAT	2	6	2049929	2049934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540233
46127	NC_021485	TTG	2	6	2049965	2049970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512540233
46128	NC_021485	A	6	6	2049984	2049989	100 %	0 %	0 %	0 %	512540233
46129	NC_021485	AT	3	6	2050007	2050012	50 %	50 %	0 %	0 %	512540233
46130	NC_021485	T	6	6	2050028	2050033	0 %	100 %	0 %	0 %	512540233
46131	NC_021485	ATAA	2	8	2050056	2050063	75 %	25 %	0 %	0 %	512540233
46132	NC_021485	TGA	2	6	2050082	2050087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540233
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46134	NC_021485	AG	3	6	2050195	2050200	50 %	0 %	50 %	0 %	512540233
46135	NC_021485	CTT	2	6	2050225	2050230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540233
46136	NC_021485	TCCT	2	8	2050270	2050277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46137	NC_021485	A	6	6	2050283	2050288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46138	NC_021485	GTT	2	6	2050295	2050300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46139	NC_021485	AAC	2	6	2050303	2050308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46140	NC_021485	TAA	2	6	2050315	2050320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46141	NC_021485	CAT	2	6	2050321	2050326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46142	NC_021485	AT	3	6	2050359	2050364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46143	NC_021485	ATC	3	9	2050372	2050380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540234
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46146	NC_021485	TTA	2	6	2050491	2050496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540234
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46148	NC_021485	CAT	2	6	2050533	2050538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540234
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46151	NC_021485	CCAA	2	8	2050702	2050709	50 %	0 %	0 %	50 %	512540234
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46154	NC_021485	TAA	3	9	2050743	2050751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540234
46155	NC_021485	TAC	2	6	2050758	2050763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540234
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46174	NC_021485	CTT	2	6	2051749	2051754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540235
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46182	NC_021485	ACA	2	6	2052090	2052095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540235
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46200	NC_021485	ACG	3	9	2052968	2052976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512540235
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46203	NC_021485	TAT	2	6	2053088	2053093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46204	NC_021485	CCCA	2	8	2053114	2053121	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46205	NC_021485	TAACTT	2	12	2053203	2053214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512540236
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46217	NC_021485	GCTTG	2	10	2053724	2053733	0 %	40 %	40 %	20 %	512540236
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46224	NC_021485	TGA	2	6	2054045	2054050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540236
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46226	NC_021485	TGGT	2	8	2054115	2054122	0 %	50 %	50 %	0 %	512540236
46227	NC_021485	ACA	2	6	2054168	2054173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540236
46228	NC_021485	TAA	2	6	2054277	2054282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540236
46229	NC_021485	TCA	2	6	2054315	2054320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540236
46230	NC_021485	T	6	6	2054471	2054476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46231	NC_021485	AT	3	6	2054495	2054500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46232	NC_021485	TAAAAA	2	12	2054540	2054551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46233	NC_021485	ACTTT	2	10	2054565	2054574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46234	NC_021485	A	6	6	2054577	2054582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46235	NC_021485	TGA	2	6	2054604	2054609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46236	NC_021485	GAA	2	6	2054634	2054639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46237	NC_021485	GAA	2	6	2054679	2054684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512540237
46238	NC_021485	AAAC	2	8	2054685	2054692	75 %	0 %	0 %	25 %	512540237
46239	NC_021485	AC	3	6	2054698	2054703	50 %	0 %	0 %	50 %	512540237
46240	NC_021485	CGA	2	6	2054733	2054738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512540237
46241	NC_021485	ACT	2	6	2054740	2054745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540237
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46245	NC_021485	A	6	6	2054941	2054946	100 %	0 %	0 %	0 %	512540238
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46249	NC_021485	T	6	6	2055109	2055114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46250	NC_021485	AT	3	6	2055121	2055126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46251	NC_021485	TTA	2	6	2055197	2055202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46252	NC_021485	TGG	2	6	2055212	2055217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46253	NC_021485	AT	3	6	2055265	2055270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46254	NC_021485	TGT	2	6	2055298	2055303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512540239
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46475	NC_021485	CAAT	2	8	2065489	2065496	50 %	25 %	0 %	25 %	512540253
46476	NC_021485	ACA	2	6	2065522	2065527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540253
46477	NC_021485	TGAT	2	8	2065531	2065538	25 %	50 %	25 %	0 %	512540253
46478	NC_021485	CT	3	6	2065596	2065601	0 %	50 %	0 %	50 %	512540253
46479	NC_021485	TCA	2	6	2065604	2065609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540253
46480	NC_021485	GATTAT	2	12	2065629	2065640	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512540253
46481	NC_021485	ATT	2	6	2065656	2065661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540253
46482	NC_021485	TCG	2	6	2065682	2065687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540253
46483	NC_021485	AAC	2	6	2065698	2065703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540253
46484	NC_021485	TAA	2	6	2065717	2065722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540253
46485	NC_021485	AAAT	2	8	2065760	2065767	75 %	25 %	0 %	0 %	512540253
46486	NC_021485	CAT	2	6	2065785	2065790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540254
46487	NC_021485	TTTTAT	2	12	2065818	2065829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	512540254
46488	NC_021485	T	6	6	2065858	2065863	0 %	100 %	0 %	0 %	512540254
46489	NC_021485	A	7	7	2065895	2065901	100 %	0 %	0 %	0 %	512540254
46490	NC_021485	AACATA	2	12	2066057	2066068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512540254
46491	NC_021485	TTC	2	6	2066219	2066224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540254
46492	NC_021485	TAA	2	6	2066240	2066245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540254
46493	NC_021485	TGG	2	6	2066250	2066255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512540254
46494	NC_021485	GC	3	6	2066271	2066276	0 %	0 %	50 %	50 %	512540254
46495	NC_021485	TTA	2	6	2066315	2066320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540254
46496	NC_021485	AGC	2	6	2066385	2066390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512540254
46497	NC_021485	ATC	2	6	2066421	2066426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540254
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46499	NC_021485	A	6	6	2066514	2066519	100 %	0 %	0 %	0 %	512540254
46500	NC_021485	GTCA	2	8	2066570	2066577	25 %	25 %	25 %	25 %	512540254

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