MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 48119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021485	TTGG	2	8	179595	179602	0 %	50 %	50 %	0 %	512538397
4003	NC_021485	TTG	2	6	179711	179716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538397
4004	NC_021485	CGT	2	6	179893	179898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538397
4005	NC_021485	TAA	2	6	179931	179936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538397
4006	NC_021485	A	6	6	179935	179940	100 %	0 %	0 %	0 %	512538397
4007	NC_021485	GA	3	6	180005	180010	50 %	0 %	50 %	0 %	512538397
4008	NC_021485	AC	3	6	180098	180103	50 %	0 %	0 %	50 %	512538397
4009	NC_021485	TTC	2	6	180137	180142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538397
4010	NC_021485	GTT	2	6	180154	180159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538397
4011	NC_021485	GTT	2	6	180181	180186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538397
4012	NC_021485	TTG	2	6	180191	180196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538397
4013	NC_021485	CTT	2	6	180264	180269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538397
4014	NC_021485	CGT	2	6	180322	180327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538397
4015	NC_021485	CAA	2	6	180439	180444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538397
4016	NC_021485	GCC	2	6	180469	180474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512538397
4017	NC_021485	TCA	2	6	180493	180498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538397
4018	NC_021485	TC	3	6	180558	180563	0 %	50 %	0 %	50 %	512538397
4019	NC_021485	TGG	2	6	180576	180581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538397
4020	NC_021485	TAA	2	6	180687	180692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538397
4021	NC_021485	AATA	2	8	180715	180722	75 %	25 %	0 %	0 %	512538397
4022	NC_021485	AACG	2	8	180774	180781	50 %	0 %	25 %	25 %	512538397
4023	NC_021485	CTG	2	6	180797	180802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538397
4024	NC_021485	GAA	2	6	180805	180810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538397
4025	NC_021485	AGA	2	6	180867	180872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538397
4026	NC_021485	GTC	2	6	180884	180889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538397
4027	NC_021485	TAA	2	6	180897	180902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538397
4028	NC_021485	TTG	2	6	180923	180928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538397
4029	NC_021485	TTG	2	6	180932	180937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538397
4030	NC_021485	AGT	2	6	180954	180959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
4031	NC_021485	ATG	2	6	180995	181000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
4032	NC_021485	ATTG	2	8	181050	181057	25 %	50 %	25 %	0 %	512538397
4033	NC_021485	AGC	2	6	181098	181103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538397
4034	NC_021485	ATG	2	6	181136	181141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
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4036	NC_021485	CCG	2	6	181224	181229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512538397
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4038	NC_021485	TGAG	2	8	181409	181416	25 %	25 %	50 %	0 %	512538397
4039	NC_021485	AGA	2	6	181428	181433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538397
4040	NC_021485	GAA	2	6	181456	181461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538397
4041	NC_021485	GAA	2	6	181498	181503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538397
4042	NC_021485	AAG	2	6	181589	181594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538397
4043	NC_021485	TTG	2	6	181604	181609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538397
4044	NC_021485	CTG	2	6	181643	181648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538397
4045	NC_021485	AGT	2	6	181734	181739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
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4048	NC_021485	GTC	2	6	181879	181884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538397
4049	NC_021485	CTTA	2	8	181913	181920	25 %	50 %	0 %	25 %	512538397
4050	NC_021485	GCT	2	6	182014	182019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538397
4051	NC_021485	CTT	2	6	182063	182068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538397
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4053	NC_021485	AAG	2	6	182093	182098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538397
4054	NC_021485	ATG	2	6	182132	182137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
4055	NC_021485	GT	3	6	182165	182170	0 %	50 %	50 %	0 %	512538397
4056	NC_021485	CAC	2	6	182200	182205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512538397
4057	NC_021485	TGA	2	6	182211	182216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
4058	NC_021485	CAA	2	6	182260	182265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538397
4059	NC_021485	TGG	2	6	182289	182294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538397
4060	NC_021485	TTC	2	6	182351	182356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538397
4061	NC_021485	TGA	2	6	182379	182384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
4062	NC_021485	TGA	2	6	182514	182519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
4063	NC_021485	TGA	2	6	182550	182555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
4064	NC_021485	GAT	3	9	182563	182571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
4065	NC_021485	TGA	2	6	182583	182588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538397
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4068	NC_021485	AAG	2	6	182657	182662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538397
4069	NC_021485	ATG	2	6	182754	182759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021485	GAA	2	6	182767	182772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021485	A	6	6	182868	182873	100 %	0 %	0 %	0 %	512538398
4072	NC_021485	TGA	2	6	182924	182929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538398
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4079	NC_021485	TACGGT	2	12	183267	183278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512538398
4080	NC_021485	TTG	2	6	183283	183288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538398
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4084	NC_021485	ATGG	2	8	183458	183465	25 %	25 %	50 %	0 %	512538398
4085	NC_021485	TGG	2	6	183521	183526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538398
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4087	NC_021485	TTA	2	6	183568	183573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538398
4088	NC_021485	TTG	2	6	183597	183602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538398
4089	NC_021485	CAT	2	6	183620	183625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538398
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4091	NC_021485	GTC	2	6	183682	183687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538398
4092	NC_021485	GTC	2	6	183691	183696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538398
4093	NC_021485	GTC	2	6	183715	183720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538398
4094	NC_021485	CTTG	2	8	183776	183783	0 %	50 %	25 %	25 %	512538398
4095	NC_021485	AGC	2	6	183938	183943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538398
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4099	NC_021485	TGCT	2	8	184204	184211	0 %	50 %	25 %	25 %	512538398
4100	NC_021485	TAC	2	6	184284	184289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538398
4101	NC_021485	GTGAAG	2	12	184312	184323	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512538398
4102	NC_021485	TACA	2	8	184384	184391	50 %	25 %	0 %	25 %	512538398
4103	NC_021485	AGA	2	6	184436	184441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538398
4104	NC_021485	ACA	2	6	184464	184469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538398
4105	NC_021485	TAA	2	6	184529	184534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538398
4106	NC_021485	A	6	6	184549	184554	100 %	0 %	0 %	0 %	512538398
4107	NC_021485	CTT	2	6	184568	184573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538398
4108	NC_021485	AAG	2	6	184632	184637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538398
4109	NC_021485	ACA	2	6	184683	184688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538398
4110	NC_021485	ATT	2	6	184800	184805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538398
4111	NC_021485	CAC	2	6	184815	184820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512538398
4112	NC_021485	TGA	2	6	184858	184863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538398
4113	NC_021485	GAA	2	6	184866	184871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538398
4114	NC_021485	ACA	3	9	184890	184898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538398
4115	NC_021485	AAG	2	6	184912	184917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538398
4116	NC_021485	ATG	3	9	184968	184976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538398
4117	NC_021485	GCT	2	6	185040	185045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538398
4118	NC_021485	TTC	2	6	185115	185120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538398
4119	NC_021485	TCG	2	6	185189	185194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538398
4120	NC_021485	TTA	2	6	185218	185223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538398
4121	NC_021485	AAG	2	6	185331	185336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538398
4122	NC_021485	TCAA	2	8	185337	185344	50 %	25 %	0 %	25 %	512538398
4123	NC_021485	GCT	2	6	185403	185408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538398
4124	NC_021485	GTT	2	6	185412	185417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538398
4125	NC_021485	GTC	2	6	185482	185487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538398
4126	NC_021485	GGT	2	6	185610	185615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538398
4127	NC_021485	TTA	2	6	185698	185703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538398
4128	NC_021485	GAA	2	6	185733	185738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538398
4129	NC_021485	GTT	2	6	185799	185804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538398
4130	NC_021485	TGA	2	6	185837	185842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538398
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4133	NC_021485	TCT	2	6	186053	186058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538398
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4135	NC_021485	GTCCT	2	10	186142	186151	0 %	40 %	20 %	40 %	512538398
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4140	NC_021485	ACTT	2	8	186262	186269	25 %	50 %	0 %	25 %	512538398
4141	NC_021485	TTA	2	6	186286	186291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538398
4142	NC_021485	ATT	2	6	186369	186374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538398
4143	NC_021485	ACA	2	6	186420	186425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538398
4144	NC_021485	T	7	7	186465	186471	0 %	100 %	0 %	0 %	512538399
4145	NC_021485	T	6	6	186496	186501	0 %	100 %	0 %	0 %	512538399
4146	NC_021485	T	6	6	186514	186519	0 %	100 %	0 %	0 %	512538399
4147	NC_021485	ATA	2	6	186522	186527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538399
4148	NC_021485	CT	3	6	186528	186533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4149	NC_021485	TAT	2	6	186544	186549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538400
4150	NC_021485	TGG	2	6	186587	186592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538400
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4152	NC_021485	AAGT	2	8	186712	186719	50 %	25 %	25 %	0 %	512538400
4153	NC_021485	TTG	2	6	186725	186730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538400
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4155	NC_021485	TGA	2	6	186775	186780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538400
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4159	NC_021485	A	6	6	186927	186932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_021485	ATA	2	6	186955	186960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_021485	ATA	2	6	186982	186987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_021485	TAC	2	6	186995	187000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4164	NC_021485	ATTTT	2	10	187049	187058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_021485	AT	3	6	187062	187067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4167	NC_021485	AGCAA	2	10	187100	187109	60 %	0 %	20 %	20 %	512538401
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4229	NC_021485	GA	3	6	189538	189543	50 %	0 %	50 %	0 %	512538404
4230	NC_021485	TTTA	2	8	189545	189552	25 %	75 %	0 %	0 %	512538404
4231	NC_021485	AGT	2	6	189567	189572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538404
4232	NC_021485	TA	4	8	189668	189675	50 %	50 %	0 %	0 %	512538404
4233	NC_021485	AAGA	2	8	189694	189701	75 %	0 %	25 %	0 %	512538404
4234	NC_021485	TAA	2	6	189771	189776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538405
4235	NC_021485	AAAT	2	8	189780	189787	75 %	25 %	0 %	0 %	512538405
4236	NC_021485	CAA	2	6	189791	189796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538405
4237	NC_021485	AAG	2	6	189808	189813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538405
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4239	NC_021485	A	6	6	189867	189872	100 %	0 %	0 %	0 %	512538405
4240	NC_021485	GAA	2	6	189905	189910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538405
4241	NC_021485	AAAAT	2	10	189915	189924	80 %	20 %	0 %	0 %	512538405
4242	NC_021485	ATA	2	6	189939	189944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538405
4243	NC_021485	TTG	2	6	190059	190064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538406
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4245	NC_021485	TCT	2	6	190086	190091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538406
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4371	NC_021485	TAA	2	6	195713	195718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538415
4372	NC_021485	GCTTGT	2	12	195766	195777	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	512538415
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4402	NC_021485	TAC	2	6	196872	196877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4404	NC_021485	TAT	2	6	196905	196910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4474	NC_021485	T	7	7	199925	199931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4485	NC_021485	GAG	2	6	200643	200648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4486	NC_021485	GTT	2	6	200669	200674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538423
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4493	NC_021485	TTA	2	6	200917	200922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538423
4494	NC_021485	TGGT	2	8	200935	200942	0 %	50 %	50 %	0 %	512538423
4495	NC_021485	TTG	2	6	200962	200967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538423
4496	NC_021485	GGA	2	6	200976	200981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512538423
4497	NC_021485	T	6	6	200991	200996	0 %	100 %	0 %	0 %	512538423
4498	NC_021485	TTCT	2	8	201014	201021	0 %	75 %	0 %	25 %	512538423
4499	NC_021485	TCAGT	2	10	201028	201037	20 %	40 %	20 %	20 %	512538423
4500	NC_021485	CAA	2	6	201100	201105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538423

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