MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 48119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_021485	ATC	2	6	1909594	1909599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540086
43002	NC_021485	A	6	6	1909730	1909735	100 %	0 %	0 %	0 %	512540086
43003	NC_021485	CAAA	2	8	1909845	1909852	75 %	0 %	0 %	25 %	512540086
43004	NC_021485	T	7	7	1909895	1909901	0 %	100 %	0 %	0 %	512540086
43005	NC_021485	AT	3	6	1909922	1909927	50 %	50 %	0 %	0 %	512540086
43006	NC_021485	CTAAA	2	10	1909968	1909977	60 %	20 %	0 %	20 %	512540086
43007	NC_021485	ACT	2	6	1910008	1910013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540086
43008	NC_021485	AGA	2	6	1910032	1910037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512540086
43009	NC_021485	AAATA	2	10	1910167	1910176	80 %	20 %	0 %	0 %	512540086
43010	NC_021485	TTG	2	6	1910253	1910258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512540086
43011	NC_021485	ATT	2	6	1910312	1910317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540086
43012	NC_021485	AAT	2	6	1910336	1910341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43013	NC_021485	AAG	2	6	1910381	1910386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512540087
43014	NC_021485	T	6	6	1910393	1910398	0 %	100 %	0 %	0 %	512540087
43015	NC_021485	TCA	2	6	1910416	1910421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540087
43016	NC_021485	CTT	2	6	1910546	1910551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540087
43017	NC_021485	A	7	7	1910602	1910608	100 %	0 %	0 %	0 %	512540087
43018	NC_021485	AGT	2	6	1910617	1910622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540087
43019	NC_021485	TAT	2	6	1910666	1910671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540087
43020	NC_021485	TC	3	6	1910678	1910683	0 %	50 %	0 %	50 %	512540087
43021	NC_021485	A	6	6	1910762	1910767	100 %	0 %	0 %	0 %	512540087
43022	NC_021485	TCA	2	6	1910839	1910844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540087
43023	NC_021485	A	6	6	1910863	1910868	100 %	0 %	0 %	0 %	512540087
43024	NC_021485	TCT	2	6	1910875	1910880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540087
43025	NC_021485	CTT	2	6	1910915	1910920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540087
43026	NC_021485	TTC	2	6	1910922	1910927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540087
43027	NC_021485	CAT	2	6	1910951	1910956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540087
43028	NC_021485	CTT	2	6	1910990	1910995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540087
43029	NC_021485	TAC	2	6	1911044	1911049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540087
43030	NC_021485	T	6	6	1911065	1911070	0 %	100 %	0 %	0 %	512540087
43031	NC_021485	AAC	2	6	1911139	1911144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540087
43032	NC_021485	TGA	2	6	1911147	1911152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540087
43033	NC_021485	TTC	2	6	1911168	1911173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540087
43034	NC_021485	CTC	2	6	1911216	1911221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512540087
43035	NC_021485	ATA	2	6	1911283	1911288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540087
43036	NC_021485	TGTTTT	2	12	1911316	1911327	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	512540087
43037	NC_021485	TAG	2	6	1911386	1911391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540088
43038	NC_021485	CT	3	6	1911450	1911455	0 %	50 %	0 %	50 %	512540088
43039	NC_021485	ATC	2	6	1911469	1911474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540088
43040	NC_021485	TAA	2	6	1911537	1911542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540088
43041	NC_021485	TAG	2	6	1911569	1911574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540088
43042	NC_021485	CAAT	2	8	1911626	1911633	50 %	25 %	0 %	25 %	512540088
43043	NC_021485	AATT	2	8	1911700	1911707	50 %	50 %	0 %	0 %	512540088
43044	NC_021485	TTC	2	6	1911715	1911720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540088
43045	NC_021485	AGGTT	2	10	1911722	1911731	20 %	40 %	40 %	0 %	512540088
43046	NC_021485	AAC	2	6	1911796	1911801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540088
43047	NC_021485	TTA	2	6	1911806	1911811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540088
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43049	NC_021485	GCA	2	6	1911896	1911901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512540088
43050	NC_021485	GAT	2	6	1911918	1911923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540088
43051	NC_021485	CTG	2	6	1911982	1911987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540088
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43053	NC_021485	C	6	6	1912096	1912101	0 %	0 %	0 %	100 %	512540088
43054	NC_021485	CAC	2	6	1912303	1912308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512540089
43055	NC_021485	TCT	2	6	1912347	1912352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540089
43056	NC_021485	TTG	2	6	1912411	1912416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512540089
43057	NC_021485	GAT	2	6	1912445	1912450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540089
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43059	NC_021485	CCA	2	6	1912482	1912487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512540089
43060	NC_021485	TTC	2	6	1912511	1912516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540089
43061	NC_021485	ATAG	2	8	1912523	1912530	50 %	25 %	25 %	0 %	512540089
43062	NC_021485	TTA	2	6	1912575	1912580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540089
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43065	NC_021485	CAAT	2	8	1912710	1912717	50 %	25 %	0 %	25 %	512540089
43066	NC_021485	AAT	2	6	1912741	1912746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540089
43067	NC_021485	ACCG	2	8	1912787	1912794	25 %	0 %	25 %	50 %	512540089
43068	NC_021485	CT	3	6	1912814	1912819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43069	NC_021485	TGA	2	6	1912859	1912864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540090
43070	NC_021485	CAA	2	6	1912887	1912892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540090
43071	NC_021485	CTA	2	6	1912899	1912904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540090
43072	NC_021485	CAA	2	6	1912926	1912931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512540090
43073	NC_021485	ATC	2	6	1912949	1912954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540090
43074	NC_021485	TTA	2	6	1912961	1912966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540090
43075	NC_021485	CTG	2	6	1913007	1913012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540090
43076	NC_021485	ATC	2	6	1913015	1913020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540090
43077	NC_021485	ATT	2	6	1913072	1913077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540090
43078	NC_021485	TCT	2	6	1913087	1913092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512540090
43079	NC_021485	TAT	2	6	1913124	1913129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540090
43080	NC_021485	AAT	2	6	1913161	1913166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540090
43081	NC_021485	AAT	3	9	1913236	1913244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540090
43082	NC_021485	TTTC	2	8	1913250	1913257	0 %	75 %	0 %	25 %	512540090
43083	NC_021485	TTGT	2	8	1913301	1913308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43084	NC_021485	TTTG	2	8	1913310	1913317	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43085	NC_021485	ATC	2	6	1913322	1913327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43086	NC_021485	TTTTTG	2	12	1913338	1913349	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43087	NC_021485	TGTTT	3	15	1913354	1913368	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43088	NC_021485	A	7	7	1913384	1913390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43089	NC_021485	ACT	2	6	1913420	1913425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43090	NC_021485	AGCT	2	8	1913426	1913433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43091	NC_021485	ATT	2	6	1913456	1913461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43092	NC_021485	ATAA	2	8	1913499	1913506	75 %	25 %	0 %	0 %	512540091
43093	NC_021485	AAACA	2	10	1913512	1913521	80 %	0 %	0 %	20 %	512540091
43094	NC_021485	TGC	2	6	1913530	1913535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540091
43095	NC_021485	ATT	2	6	1913665	1913670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540091
43096	NC_021485	GTT	2	6	1913673	1913678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512540091
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43098	NC_021485	TAA	2	6	1913812	1913817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540091
43099	NC_021485	T	6	6	1913827	1913832	0 %	100 %	0 %	0 %	512540091
43100	NC_021485	CAT	2	6	1913871	1913876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540091
43101	NC_021485	CCG	2	6	1913918	1913923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512540091
43102	NC_021485	ATAA	2	8	1913966	1913973	75 %	25 %	0 %	0 %	512540091
43103	NC_021485	T	6	6	1914025	1914030	0 %	100 %	0 %	0 %	512540091
43104	NC_021485	T	6	6	1914054	1914059	0 %	100 %	0 %	0 %	512540091
43105	NC_021485	GTC	2	6	1914121	1914126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512540091
43106	NC_021485	AAT	3	9	1914193	1914201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512540091
43107	NC_021485	CGA	2	6	1914275	1914280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512540091
43108	NC_021485	TGA	2	6	1914304	1914309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540091
43109	NC_021485	CAT	3	9	1914321	1914329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512540091
43110	NC_021485	CA	3	6	1914344	1914349	50 %	0 %	0 %	50 %	512540091
43111	NC_021485	AT	4	8	1914397	1914404	50 %	50 %	0 %	0 %	512540091
43112	NC_021485	TAG	2	6	1914459	1914464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512540091
43113	NC_021485	TA	3	6	1914507	1914512	50 %	50 %	0 %	0 %	512540091
43114	NC_021485	ATT	2	6	1914556	1914561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512540091
43115	NC_021485	TAAGA	2	10	1914570	1914579	60 %	20 %	20 %	0 %	512540091
43116	NC_021485	TCC	2	6	1914583	1914588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512540091
43117	NC_021485	GT	3	6	1914612	1914617	0 %	50 %	50 %	0 %	512540091
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43119	NC_021485	CTTC	2	8	1914638	1914645	0 %	50 %	0 %	50 %	512540091
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43240	NC_021485	GTT	2	6	1919597	1919602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43243	NC_021485	A	6	6	1919657	1919662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43244	NC_021485	TTGT	2	8	1919680	1919687	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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