MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 48119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021485	GATTT	2	10	134643	134652	20 %	60 %	20 %	0 %	512538362
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3004	NC_021485	TTAT	2	8	134857	134864	25 %	75 %	0 %	0 %	512538362
3005	NC_021485	TAC	2	6	134939	134944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538362
3006	NC_021485	AGTTA	2	10	134948	134957	40 %	40 %	20 %	0 %	512538362
3007	NC_021485	TA	3	6	134956	134961	50 %	50 %	0 %	0 %	512538362
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3009	NC_021485	GCT	2	6	135033	135038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538362
3010	NC_021485	GCA	2	6	135057	135062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538362
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3012	NC_021485	A	6	6	135149	135154	100 %	0 %	0 %	0 %	512538363
3013	NC_021485	GGT	2	6	135168	135173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538363
3014	NC_021485	AGT	2	6	135183	135188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538363
3015	NC_021485	ATCA	2	8	135218	135225	50 %	25 %	0 %	25 %	512538363
3016	NC_021485	TATGA	2	10	135249	135258	40 %	40 %	20 %	0 %	512538363
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3020	NC_021485	TTA	2	6	135423	135428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538363
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3035	NC_021485	AAG	2	6	136117	136122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538363
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3044	NC_021485	A	6	6	136589	136594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_021485	TAT	2	6	138583	138588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021485	GAAA	2	8	138597	138604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021485	A	6	6	138614	138619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021485	GAAG	2	8	138627	138634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021485	TTA	2	6	138641	138646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021485	A	6	6	138648	138653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021485	AGA	2	6	138709	138714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021485	CTAGT	2	10	138731	138740	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3100	NC_021485	AGG	2	6	138778	138783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3103	NC_021485	AAACC	2	10	138881	138890	60 %	0 %	0 %	40 %	512538366
3104	NC_021485	A	7	7	138925	138931	100 %	0 %	0 %	0 %	512538366
3105	NC_021485	TAA	2	6	138980	138985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538366
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3107	NC_021485	T	7	7	139050	139056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021485	AAT	2	6	139059	139064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021485	ATAGA	2	10	139076	139085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021485	GTA	2	6	139105	139110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021485	CT	3	6	139153	139158	0 %	50 %	0 %	50 %	512538367
3112	NC_021485	GTT	2	6	139210	139215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538367
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3115	NC_021485	A	6	6	139371	139376	100 %	0 %	0 %	0 %	512538367
3116	NC_021485	CTG	2	6	139424	139429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538367
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3119	NC_021485	ATT	2	6	139742	139747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538368
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3122	NC_021485	A	7	7	139907	139913	100 %	0 %	0 %	0 %	512538368
3123	NC_021485	GAA	2	6	139917	139922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538368
3124	NC_021485	TGA	2	6	139925	139930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538368
3125	NC_021485	GC	3	6	139946	139951	0 %	0 %	50 %	50 %	512538368
3126	NC_021485	GTT	2	6	140022	140027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538368
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3129	NC_021485	ACTG	2	8	140078	140085	25 %	25 %	25 %	25 %	512538368
3130	NC_021485	AT	3	6	140090	140095	50 %	50 %	0 %	0 %	512538368
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3133	NC_021485	GTA	2	6	140166	140171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538368
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3135	NC_021485	TGGT	2	8	140221	140228	0 %	50 %	50 %	0 %	512538368
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3153	NC_021485	AAGC	2	8	141027	141034	50 %	0 %	25 %	25 %	512538368
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3156	NC_021485	ATAAA	2	10	141147	141156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_021485	A	6	6	141154	141159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_021485	GA	3	6	141164	141169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_021485	T	6	6	141179	141184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3160	NC_021485	ATG	2	6	141288	141293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538369
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3183	NC_021485	GA	3	6	142251	142256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3184	NC_021485	A	6	6	142260	142265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3185	NC_021485	T	6	6	142270	142275	0 %	100 %	0 %	0 %	512538370
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3188	NC_021485	CCT	2	6	142389	142394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3189	NC_021485	TTA	2	6	142404	142409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3190	NC_021485	A	7	7	142435	142441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3191	NC_021485	TTG	2	6	142459	142464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3192	NC_021485	AAAT	2	8	142475	142482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3193	NC_021485	ATCA	2	8	142499	142506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3194	NC_021485	TAA	2	6	142511	142516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3195	NC_021485	AT	3	6	142525	142530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3196	NC_021485	TTA	2	6	142538	142543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3197	NC_021485	ATGA	2	8	142581	142588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3198	NC_021485	A	7	7	142636	142642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3199	NC_021485	CGAT	2	8	142643	142650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3200	NC_021485	ATT	2	6	142679	142684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3201	NC_021485	TGAA	2	8	142696	142703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3202	NC_021485	GTTAA	2	10	142729	142738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3203	NC_021485	TTTA	2	8	142750	142757	25 %	75 %	0 %	0 %	512538371
3204	NC_021485	TAA	2	6	142988	142993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538371
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3207	NC_021485	TATAT	2	10	143105	143114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3209	NC_021485	AT	3	6	143158	143163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3210	NC_021485	TTAAAA	2	12	143181	143192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3212	NC_021485	A	6	6	143296	143301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_021485	ATG	2	6	143322	143327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3230	NC_021485	CCT	2	6	144129	144134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512538373
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3233	NC_021485	ACA	2	6	144314	144319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538373
3234	NC_021485	TTGATA	2	12	144347	144358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512538373
3235	NC_021485	ACC	2	6	144490	144495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512538373
3236	NC_021485	ATTG	2	8	144526	144533	25 %	50 %	25 %	0 %	512538373
3237	NC_021485	AATA	2	8	144538	144545	75 %	25 %	0 %	0 %	512538373
3238	NC_021485	GCT	2	6	144548	144553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538373
3239	NC_021485	GTA	2	6	144595	144600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538373
3240	NC_021485	AACC	2	8	144662	144669	50 %	0 %	0 %	50 %	512538373
3241	NC_021485	TAA	2	6	144670	144675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538373
3242	NC_021485	ATAA	2	8	144746	144753	75 %	25 %	0 %	0 %	512538373
3243	NC_021485	CGA	2	6	144756	144761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538373
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3245	NC_021485	T	6	6	144824	144829	0 %	100 %	0 %	0 %	512538373
3246	NC_021485	AAG	2	6	144851	144856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538373
3247	NC_021485	T	7	7	144869	144875	0 %	100 %	0 %	0 %	512538373
3248	NC_021485	T	6	6	144877	144882	0 %	100 %	0 %	0 %	512538373
3249	NC_021485	ATC	2	6	144902	144907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538373
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3251	NC_021485	ATTG	2	8	145146	145153	25 %	50 %	25 %	0 %	512538373
3252	NC_021485	CTT	2	6	145170	145175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538373
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3376	NC_021485	GTT	2	6	150388	150393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538377
3377	NC_021485	GCTTT	2	10	150424	150433	0 %	60 %	20 %	20 %	512538377
3378	NC_021485	TCT	2	6	150465	150470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538377
3379	NC_021485	CTA	2	6	150478	150483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538377
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3381	NC_021485	ATT	2	6	150689	150694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_021485	AATAT	2	10	150698	150707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3383	NC_021485	TCT	2	6	150728	150733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3384	NC_021485	TGC	2	6	150881	150886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538378
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3397	NC_021485	ATTAC	2	10	151414	151423	40 %	40 %	0 %	20 %	512538378
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3403	NC_021485	AGA	2	6	151575	151580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3404	NC_021485	AAG	2	6	151603	151608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538379
3405	NC_021485	T	6	6	151619	151624	0 %	100 %	0 %	0 %	512538379
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3453	NC_021485	GGAA	2	8	153653	153660	50 %	0 %	50 %	0 %	512538380
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3472	NC_021485	AAC	2	6	154550	154555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3473	NC_021485	TAG	2	6	154577	154582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3474	NC_021485	TTAAAT	2	12	154592	154603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3475	NC_021485	AAAG	2	8	154607	154614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3476	NC_021485	AAAT	2	8	154629	154636	75 %	25 %	0 %	0 %	512538382
3477	NC_021485	TAA	2	6	154816	154821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538382
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3480	NC_021485	TTA	2	6	154879	154884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538382
3481	NC_021485	GAT	2	6	154919	154924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538382
3482	NC_021485	A	6	6	154932	154937	100 %	0 %	0 %	0 %	512538382
3483	NC_021485	ATA	2	6	155031	155036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538382
3484	NC_021485	AGA	2	6	155041	155046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538382
3485	NC_021485	A	6	6	155114	155119	100 %	0 %	0 %	0 %	512538382
3486	NC_021485	ATA	2	6	155148	155153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538382
3487	NC_021485	GCT	2	6	155159	155164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538382
3488	NC_021485	CTG	2	6	155172	155177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538382
3489	NC_021485	ATTT	2	8	155194	155201	25 %	75 %	0 %	0 %	512538382
3490	NC_021485	ACTT	2	8	155240	155247	25 %	50 %	0 %	25 %	512538382
3491	NC_021485	TAA	2	6	155254	155259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538382
3492	NC_021485	ATT	2	6	155291	155296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538382
3493	NC_021485	TTC	2	6	155350	155355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538382
3494	NC_021485	A	6	6	155477	155482	100 %	0 %	0 %	0 %	512538382
3495	NC_021485	ACA	2	6	155525	155530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538382
3496	NC_021485	TGT	2	6	155580	155585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538382
3497	NC_021485	CAAA	2	8	155598	155605	75 %	0 %	0 %	25 %	512538382
3498	NC_021485	ACA	2	6	155608	155613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538382
3499	NC_021485	GAT	2	6	155632	155637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538382
3500	NC_021485	GGA	2	6	155693	155698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512538382

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