MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 48119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021485	GAA	2	6	23213	23218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021485	GGT	2	6	23287	23292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021485	GTC	2	6	23301	23306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021485	TCGTG	2	10	23310	23319	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
505	NC_021485	CAT	2	6	23369	23374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021485	TAA	2	6	23404	23409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021485	GGA	2	6	23413	23418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021485	ATC	2	6	23437	23442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021485	AC	3	6	23464	23469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_021485	TGGT	2	8	23479	23486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021485	CGC	2	6	23603	23608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_021485	AC	3	6	23633	23638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_021485	CAC	2	6	23648	23653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_021485	AGCC	2	8	23696	23703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
515	NC_021485	GAT	2	6	23719	23724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021485	CCT	2	6	23775	23780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_021485	TAAGGA	2	12	23784	23795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021485	AGG	2	6	23877	23882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021485	CAA	2	6	23991	23996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021485	TAA	2	6	24058	24063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021485	GTTAA	2	10	24065	24074	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021485	GAA	2	6	24111	24116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021485	ACG	2	6	24128	24133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021485	GTAA	2	8	24151	24158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021485	GAAG	2	8	24233	24240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021485	TAG	2	6	24299	24304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021485	GCGA	2	8	24307	24314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
528	NC_021485	AGG	2	6	24321	24326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021485	AGA	2	6	24386	24391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021485	AG	3	6	24414	24419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021485	TCG	2	6	24490	24495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021485	GGA	2	6	24503	24508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021485	CT	3	6	24529	24534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_021485	GGGAG	2	10	24584	24593	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021485	ACA	2	6	24621	24626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021485	ATG	2	6	24688	24693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021485	TGT	2	6	24758	24763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021485	GGA	2	6	24821	24826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021485	TC	3	6	24907	24912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_021485	ACC	2	6	25086	25091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_021485	AT	3	6	25107	25112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021485	AGC	2	6	25166	25171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021485	ATTC	2	8	25173	25180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_021485	TG	3	6	25297	25302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021485	AAG	2	6	25303	25308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021485	GAG	2	6	25318	25323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021485	GA	3	6	25448	25453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021485	ACA	2	6	25474	25479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021485	TA	3	6	25502	25507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021485	CTAA	2	8	25529	25536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_021485	GAG	2	6	25618	25623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021485	TAG	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021485	GA	3	6	25743	25748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021485	CT	3	6	25859	25864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_021485	GAT	2	6	25877	25882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021485	CGG	2	6	25968	25973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_021485	GA	3	6	26066	26071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021485	TAGG	2	8	26184	26191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021485	GTT	2	6	26228	26233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021485	TAC	2	6	26238	26243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021485	CCT	2	6	26326	26331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_021485	GGT	2	6	26462	26467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021485	TCG	2	6	26577	26582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021485	CGT	2	6	26657	26662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_021485	AGGGA	2	10	26795	26804	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021485	GA	3	6	26881	26886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021485	ACTAAT	2	12	26936	26947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
568	NC_021485	AGT	2	6	27113	27118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021485	TAG	2	6	27475	27480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021485	T	6	6	27563	27568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021485	CGT	2	6	27653	27658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021485	ATA	2	6	27758	27763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021485	CTC	2	6	27827	27832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_021485	AT	3	6	27926	27931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021485	CCG	2	6	28003	28008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_021485	TATT	2	8	28010	28017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021485	T	6	6	28107	28112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021485	GGA	2	6	28120	28125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021485	GCGT	2	8	28179	28186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
580	NC_021485	TCC	2	6	28203	28208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_021485	AGC	2	6	28230	28235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_021485	TCG	2	6	28244	28249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021485	CGG	2	6	28343	28348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021485	TAT	2	6	28371	28376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021485	TGT	2	6	28428	28433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021485	GGT	2	6	28508	28513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021485	GGT	2	6	28543	28548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021485	T	7	7	28701	28707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021485	AGA	2	6	28756	28761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021485	T	6	6	28853	28858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021485	AGT	2	6	28889	28894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021485	TAA	2	6	28896	28901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021485	A	7	7	28907	28913	100 %	0 %	0 %	0 %	512538255
594	NC_021485	CAG	2	6	28923	28928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538255
595	NC_021485	CTG	2	6	28956	28961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538255
596	NC_021485	TGA	2	6	28978	28983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538255
597	NC_021485	TGC	2	6	28999	29004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538255
598	NC_021485	CAA	2	6	29036	29041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538255
599	NC_021485	GCA	3	9	29042	29050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538255
600	NC_021485	CAA	2	6	29099	29104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538255
601	NC_021485	CAG	2	6	29147	29152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538255
602	NC_021485	TAA	2	6	29179	29184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538255
603	NC_021485	TTG	2	6	29187	29192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538255
604	NC_021485	ACTA	2	8	29246	29253	50 %	25 %	0 %	25 %	512538255
605	NC_021485	GTT	2	6	29303	29308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538255
606	NC_021485	GTT	2	6	29321	29326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538255
607	NC_021485	CAA	2	6	29351	29356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538255
608	NC_021485	AGC	2	6	29419	29424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538255
609	NC_021485	CAAG	2	8	29428	29435	50 %	0 %	25 %	25 %	512538255
610	NC_021485	ATA	2	6	29445	29450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538255
611	NC_021485	AGC	2	6	29452	29457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538255
612	NC_021485	AGC	2	6	29485	29490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538255
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614	NC_021485	AGCACA	2	12	29653	29664	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512538255
615	NC_021485	GCA	3	9	29666	29674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538255
616	NC_021485	CTT	2	6	29757	29762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538255
617	NC_021485	ACT	2	6	29768	29773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538255
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619	NC_021485	CTA	2	6	29796	29801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538255
620	NC_021485	GTA	2	6	29828	29833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538255
621	NC_021485	GTT	2	6	29861	29866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538255
622	NC_021485	TGT	2	6	29896	29901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538255
623	NC_021485	CTT	2	6	29967	29972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538255
624	NC_021485	ATG	2	6	30081	30086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538255
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626	NC_021485	AGT	2	6	30109	30114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538255
627	NC_021485	ATTA	2	8	30287	30294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021485	GGA	2	6	30361	30366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021485	TCA	2	6	30404	30409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538256
630	NC_021485	A	6	6	30425	30430	100 %	0 %	0 %	0 %	512538256
631	NC_021485	CAT	2	6	30527	30532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538256
632	NC_021485	CAA	2	6	30549	30554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538256
633	NC_021485	TTGG	2	8	30854	30861	0 %	50 %	50 %	0 %	512538256
634	NC_021485	TGA	2	6	30862	30867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538256
635	NC_021485	TGT	3	9	30868	30876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538256
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