MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 48119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021485	AATTGA	2	12	311365	311376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512538532
7002	NC_021485	ATCA	2	8	311398	311405	50 %	25 %	0 %	25 %	512538532
7003	NC_021485	CAA	2	6	311453	311458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538532
7004	NC_021485	CGT	2	6	311474	311479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538532
7005	NC_021485	AAG	2	6	311499	311504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538532
7006	NC_021485	AAC	2	6	311628	311633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538532
7007	NC_021485	TTC	2	6	311673	311678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538532
7008	NC_021485	TGC	2	6	311746	311751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538532
7009	NC_021485	ATT	2	6	311869	311874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538532
7010	NC_021485	AGA	2	6	311887	311892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538532
7011	NC_021485	TTC	2	6	311906	311911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538532
7012	NC_021485	ATT	2	6	311990	311995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_021485	TA	3	6	312012	312017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_021485	TTG	2	6	312047	312052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021485	TTTA	2	8	312082	312089	25 %	75 %	0 %	0 %	512538533
7016	NC_021485	ATG	2	6	312202	312207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538533
7017	NC_021485	TAA	2	6	312366	312371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538534
7018	NC_021485	TGG	2	6	312385	312390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538534
7019	NC_021485	CAG	2	6	312396	312401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538534
7020	NC_021485	AAT	2	6	312470	312475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538534
7021	NC_021485	CTG	2	6	312477	312482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538534
7022	NC_021485	CTG	2	6	312804	312809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538534
7023	NC_021485	GAA	2	6	312812	312817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538534
7024	NC_021485	TCT	2	6	312822	312827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538534
7025	NC_021485	TAT	2	6	312853	312858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538534
7026	NC_021485	A	6	6	312918	312923	100 %	0 %	0 %	0 %	512538534
7027	NC_021485	CTGG	2	8	313107	313114	0 %	25 %	50 %	25 %	512538534
7028	NC_021485	CTG	2	6	313203	313208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538534
7029	NC_021485	TA	3	6	313247	313252	50 %	50 %	0 %	0 %	512538534
7030	NC_021485	TCTT	2	8	313308	313315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7031	NC_021485	ATCAA	2	10	313465	313474	60 %	20 %	0 %	20 %	512538535
7032	NC_021485	ATG	2	6	313476	313481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538535
7033	NC_021485	TAA	2	6	313493	313498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538535
7034	NC_021485	AGA	2	6	313643	313648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538535
7035	NC_021485	GAA	2	6	313662	313667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538535
7036	NC_021485	A	6	6	313682	313687	100 %	0 %	0 %	0 %	512538535
7037	NC_021485	ACTG	2	8	313700	313707	25 %	25 %	25 %	25 %	512538535
7038	NC_021485	AAGG	2	8	313719	313726	50 %	0 %	50 %	0 %	512538535
7039	NC_021485	TAG	2	6	313789	313794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538535
7040	NC_021485	ATC	2	6	313812	313817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538535
7041	NC_021485	TTG	2	6	313831	313836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538535
7042	NC_021485	AGC	2	6	313844	313849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538535
7043	NC_021485	ACG	2	6	313898	313903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538535
7044	NC_021485	ATT	2	6	313947	313952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538535
7045	NC_021485	GGT	2	6	313953	313958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538535
7046	NC_021485	GAT	2	6	314049	314054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538535
7047	NC_021485	CAG	2	6	314241	314246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538535
7048	NC_021485	ATTA	2	8	314366	314373	50 %	50 %	0 %	0 %	512538535
7049	NC_021485	GTA	2	6	314437	314442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538535
7050	NC_021485	TGAAAT	2	12	314588	314599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512538535
7051	NC_021485	ACTTAT	2	12	314610	314621	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512538535
7052	NC_021485	AAAAT	2	10	314821	314830	80 %	20 %	0 %	0 %	512538535
7053	NC_021485	TGAT	2	8	314836	314843	25 %	50 %	25 %	0 %	512538535
7054	NC_021485	AAG	2	6	314854	314859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538535
7055	NC_021485	TTA	2	6	314928	314933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538536
7056	NC_021485	CGT	2	6	314951	314956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538536
7057	NC_021485	CTAT	2	8	314977	314984	25 %	50 %	0 %	25 %	512538536
7058	NC_021485	G	6	6	315026	315031	0 %	0 %	100 %	0 %	512538536
7059	NC_021485	GAA	2	6	315149	315154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538536
7060	NC_021485	AAG	2	6	315213	315218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538536
7061	NC_021485	GCA	2	6	315248	315253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538536
7062	NC_021485	TAA	2	6	315274	315279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538536
7063	NC_021485	TGC	2	6	315364	315369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538536
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7065	NC_021485	TTA	2	6	315419	315424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538536
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7067	NC_021485	TAA	2	6	315439	315444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538536
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7069	NC_021485	AGA	2	6	315520	315525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538536
7070	NC_021485	TGA	2	6	315544	315549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538536
7071	NC_021485	GAAGG	2	10	315593	315602	40 %	0 %	60 %	0 %	512538536
7072	NC_021485	TGG	2	6	315638	315643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538536
7073	NC_021485	TGA	2	6	315685	315690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538536
7074	NC_021485	TAA	2	6	315742	315747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_021485	TAG	2	6	315788	315793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_021485	AGG	2	6	315805	315810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_021485	TGC	2	6	316031	316036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538537
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7079	NC_021485	AGT	2	6	316182	316187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538537
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7081	NC_021485	GGA	2	6	316227	316232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512538537
7082	NC_021485	TGG	2	6	316243	316248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538537
7083	NC_021485	TCA	2	6	316305	316310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538537
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7085	NC_021485	TAT	2	6	316598	316603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538537
7086	NC_021485	TGT	2	6	316664	316669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538537
7087	NC_021485	TG	3	6	316754	316759	0 %	50 %	50 %	0 %	512538537
7088	NC_021485	GCC	2	6	316870	316875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512538537
7089	NC_021485	TGA	2	6	316931	316936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538537
7090	NC_021485	GA	3	6	316978	316983	50 %	0 %	50 %	0 %	512538537
7091	NC_021485	TGGA	2	8	317022	317029	25 %	25 %	50 %	0 %	512538537
7092	NC_021485	TCGT	2	8	317050	317057	0 %	50 %	25 %	25 %	512538537
7093	NC_021485	AGA	2	6	317075	317080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538537
7094	NC_021485	TAGTAA	2	12	317148	317159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512538537
7095	NC_021485	A	6	6	317169	317174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_021485	ATA	2	6	317179	317184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_021485	T	6	6	317192	317197	0 %	100 %	0 %	0 %	512538538
7098	NC_021485	TTG	2	6	317218	317223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538538
7099	NC_021485	TTACCA	3	18	317224	317241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538538
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7101	NC_021485	GTA	2	6	317281	317286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538538
7102	NC_021485	ATT	2	6	317295	317300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538538
7103	NC_021485	GAT	2	6	317320	317325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538538
7104	NC_021485	CAT	2	6	317333	317338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538538
7105	NC_021485	ACT	2	6	317382	317387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538538
7106	NC_021485	TGACT	2	10	317392	317401	20 %	40 %	20 %	20 %	512538538
7107	NC_021485	GATA	2	8	317414	317421	50 %	25 %	25 %	0 %	512538538
7108	NC_021485	AGA	3	9	317433	317441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538538
7109	NC_021485	TAGG	2	8	317538	317545	25 %	25 %	50 %	0 %	512538538
7110	NC_021485	CAT	2	6	317547	317552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538538
7111	NC_021485	GTG	2	6	317597	317602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538538
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7113	NC_021485	AGT	2	6	317709	317714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538538
7114	NC_021485	GCT	2	6	317791	317796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538538
7115	NC_021485	AGTACC	2	12	317799	317810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512538538
7116	NC_021485	TCA	2	6	317840	317845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538538
7117	NC_021485	AGT	2	6	317853	317858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538538
7118	NC_021485	TTA	2	6	317923	317928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538538
7119	NC_021485	CCG	2	6	317953	317958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512538538
7120	NC_021485	ACT	2	6	317994	317999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538538
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7122	NC_021485	CAG	2	6	318134	318139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538538
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7243	NC_021485	CTG	2	6	323600	323605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538543
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7246	NC_021485	TAA	2	6	323775	323780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538543
7247	NC_021485	AAC	2	6	323804	323809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538543
7248	NC_021485	TAAC	2	8	323816	323823	50 %	25 %	0 %	25 %	512538543
7249	NC_021485	TCA	2	6	323836	323841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538543
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7252	NC_021485	TAA	2	6	323916	323921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538543
7253	NC_021485	TGC	2	6	323922	323927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538543
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7255	NC_021485	AATGGT	2	12	324055	324066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538543
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7258	NC_021485	T	6	6	324243	324248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7259	NC_021485	CT	3	6	324312	324317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7260	NC_021485	TAA	2	6	324348	324353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7261	NC_021485	T	6	6	324387	324392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7263	NC_021485	GTT	2	6	324514	324519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538544
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7352	NC_021485	T	6	6	328534	328539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7353	NC_021485	TTA	2	6	328574	328579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7489	NC_021485	ATTG	2	8	335134	335141	25 %	50 %	25 %	0 %	512538555
7490	NC_021485	ATC	2	6	335148	335153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538555
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7492	NC_021485	TAA	2	6	335518	335523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538556
7493	NC_021485	A	7	7	335530	335536	100 %	0 %	0 %	0 %	512538556
7494	NC_021485	TATC	2	8	335618	335625	25 %	50 %	0 %	25 %	512538556
7495	NC_021485	ATC	2	6	335667	335672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538556
7496	NC_021485	ACT	2	6	335695	335700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538556
7497	NC_021485	ACA	2	6	335709	335714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538556
7498	NC_021485	ATG	2	6	335736	335741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538556
7499	NC_021485	TTAA	2	8	335789	335796	50 %	50 %	0 %	0 %	512538556
7500	NC_021485	AAAC	2	8	335857	335864	75 %	0 %	0 %	25 %	512538556

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