MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1

Total Repeats: 87138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021313	GTCG	2	8	475864	475871	0 %	25 %	50 %	25 %	510880536
12502	NC_021313	CTC	2	6	475904	475909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880536
12503	NC_021313	GAG	2	6	475955	475960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880536
12504	NC_021313	GCG	2	6	476076	476081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_021313	TCGG	2	8	476089	476096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12506	NC_021313	CAG	2	6	476102	476107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12507	NC_021313	ACG	2	6	476108	476113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12508	NC_021313	GTTC	2	8	476114	476121	0 %	50 %	25 %	25 %	510880537
12509	NC_021313	GGA	2	6	476157	476162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880537
12510	NC_021313	ACC	2	6	476171	476176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880537
12511	NC_021313	CGT	2	6	476196	476201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12512	NC_021313	CGA	3	9	476208	476216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12513	NC_021313	CGC	2	6	476267	476272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880537
12514	NC_021313	CGG	2	6	476343	476348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880537
12515	NC_021313	CAA	2	6	476361	476366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	510880537
12516	NC_021313	CCT	2	6	476382	476387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880537
12517	NC_021313	CTCGAC	2	12	476473	476484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	510880537
12518	NC_021313	AAG	2	6	476503	476508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	510880537
12519	NC_021313	AGA	2	6	476522	476527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	510880537
12520	NC_021313	CGG	2	6	476580	476585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880537
12521	NC_021313	CGC	2	6	476610	476615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880537
12522	NC_021313	TCG	2	6	476657	476662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12523	NC_021313	TCGG	2	8	476720	476727	0 %	25 %	50 %	25 %	510880537
12524	NC_021313	GGC	2	6	476759	476764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880537
12525	NC_021313	CGA	3	9	476832	476840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12526	NC_021313	GCG	2	6	476867	476872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880537
12527	NC_021313	CGA	2	6	476922	476927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880537
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12529	NC_021313	CTG	2	6	476987	476992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12530	NC_021313	CG	3	6	477046	477051	0 %	0 %	50 %	50 %	510880537
12531	NC_021313	CGA	3	9	477069	477077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12532	NC_021313	GAG	2	6	477106	477111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880537
12533	NC_021313	CGA	2	6	477171	477176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12534	NC_021313	ACG	2	6	477179	477184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880537
12535	NC_021313	TCG	2	6	477188	477193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880537
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12539	NC_021313	CGA	2	6	477356	477361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_021313	GAC	2	6	477392	477397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_021313	TCG	2	6	477454	477459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880538
12542	NC_021313	CGA	2	6	477473	477478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880538
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12544	NC_021313	CCT	2	6	477551	477556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880538
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12551	NC_021313	GCG	2	6	477808	477813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880538
12552	NC_021313	CGTC	2	8	477815	477822	0 %	25 %	25 %	50 %	510880538
12553	NC_021313	CGG	2	6	477834	477839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880538
12554	NC_021313	AGCC	2	8	477845	477852	25 %	0 %	25 %	50 %	510880538
12555	NC_021313	AGA	2	6	477863	477868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	510880538
12556	NC_021313	CGA	2	6	477905	477910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880538
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12562	NC_021313	TCGT	2	8	478316	478323	0 %	50 %	25 %	25 %	510880539
12563	NC_021313	GAAG	2	8	478351	478358	50 %	0 %	50 %	0 %	510880539
12564	NC_021313	GCG	2	6	478359	478364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880539
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12568	NC_021313	CGGC	2	8	478405	478412	0 %	0 %	50 %	50 %	510880539
12569	NC_021313	AC	4	8	478478	478485	50 %	0 %	0 %	50 %	510880539
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12573	NC_021313	GA	3	6	478653	478658	50 %	0 %	50 %	0 %	510880539
12574	NC_021313	AGG	2	6	478668	478673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880539
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12582	NC_021313	ACCG	2	8	478874	478881	25 %	0 %	25 %	50 %	510880539
12583	NC_021313	CGATG	2	10	478897	478906	20 %	20 %	40 %	20 %	510880539
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12588	NC_021313	GA	3	6	479024	479029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_021313	AGCC	2	8	479112	479119	25 %	0 %	25 %	50 %	510880540
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12593	NC_021313	CTCG	2	8	479260	479267	0 %	25 %	25 %	50 %	510880540
12594	NC_021313	GGCG	2	8	479276	479283	0 %	0 %	75 %	25 %	510880540
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12603	NC_021313	GAC	2	6	479571	479576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880540
12604	NC_021313	GAG	2	6	479583	479588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880540
12605	NC_021313	CCGC	2	8	479590	479597	0 %	0 %	25 %	75 %	510880540
12606	NC_021313	GAG	2	6	479616	479621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880540
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12611	NC_021313	CGA	2	6	479693	479698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880540
12612	NC_021313	GTTC	2	8	479787	479794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12613	NC_021313	CG	3	6	479917	479922	0 %	0 %	50 %	50 %	510880541
12614	NC_021313	TCG	2	6	479937	479942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880541
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12619	NC_021313	GAC	2	6	480092	480097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880541
12620	NC_021313	CGACGC	2	12	480145	480156	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	510880541
12621	NC_021313	CGA	2	6	480196	480201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880541
12622	NC_021313	AGG	2	6	480210	480215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880541
12623	NC_021313	CCT	2	6	480219	480224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880541
12624	NC_021313	CGG	2	6	480246	480251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880541
12625	NC_021313	ATG	3	9	480263	480271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	510880541
12626	NC_021313	TAC	2	6	480278	480283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	510880541
12627	NC_021313	CGG	2	6	480307	480312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880541
12628	NC_021313	GCT	2	6	480337	480342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880541
12629	NC_021313	CTC	2	6	480400	480405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880541
12630	NC_021313	AGG	2	6	480486	480491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880541
12631	NC_021313	GCG	2	6	480501	480506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880541
12632	NC_021313	ACG	2	6	480507	480512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880541
12633	NC_021313	GAT	2	6	480547	480552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	510880541
12634	NC_021313	GAT	2	6	480568	480573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	510880541
12635	NC_021313	TCCG	2	8	480585	480592	0 %	25 %	25 %	50 %	510880541
12636	NC_021313	TGC	2	6	480606	480611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880541
12637	NC_021313	CTCTGG	2	12	480629	480640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880541
12638	NC_021313	GGGCA	2	10	480650	480659	20 %	0 %	60 %	20 %	510880541
12639	NC_021313	CGG	2	6	480703	480708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880541
12640	NC_021313	ATC	2	6	480728	480733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	510880541
12641	NC_021313	GC	3	6	480742	480747	0 %	0 %	50 %	50 %	510880541
12642	NC_021313	GCT	2	6	480768	480773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880541
12643	NC_021313	GTTCGG	2	12	480775	480786	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	510880541
12644	NC_021313	TCC	2	6	480792	480797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880541
12645	NC_021313	TCC	2	6	480818	480823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880541
12646	NC_021313	GTTC	2	8	480868	480875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12647	NC_021313	ACG	2	6	480883	480888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12648	NC_021313	CGA	2	6	480890	480895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12649	NC_021313	CGAT	2	8	480903	480910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12650	NC_021313	AGG	2	6	480968	480973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12651	NC_021313	AGT	2	6	480977	480982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12652	NC_021313	CCG	2	6	481008	481013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12653	NC_021313	GC	3	6	481014	481019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12654	NC_021313	CGAAC	2	10	481071	481080	40 %	0 %	20 %	40 %	510880542
12655	NC_021313	GCT	2	6	481083	481088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880542
12656	NC_021313	GAG	2	6	481090	481095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880542
12657	NC_021313	GTC	2	6	481096	481101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880542
12658	NC_021313	TGT	2	6	481121	481126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	510880542
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12666	NC_021313	CGT	2	6	481314	481319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880542
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12671	NC_021313	AAG	2	6	481477	481482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	510880542
12672	NC_021313	TCG	3	9	481514	481522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880542
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12675	NC_021313	GGT	2	6	481834	481839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880542
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12677	NC_021313	ACTGG	2	10	481926	481935	20 %	20 %	40 %	20 %	510880543
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12679	NC_021313	CTG	2	6	481987	481992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880543
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12685	NC_021313	TCG	2	6	482198	482203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880543
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12690	NC_021313	TCG	2	6	482369	482374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880543
12691	NC_021313	TGC	2	6	482414	482419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880543
12692	NC_021313	CGT	2	6	482439	482444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880543
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12701	NC_021313	CTG	2	6	482687	482692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12702	NC_021313	GTC	2	6	482716	482721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12739	NC_021313	GCG	2	6	484098	484103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880545
12740	NC_021313	CGA	2	6	484207	484212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880545
12741	NC_021313	GGC	2	6	484298	484303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880545
12742	NC_021313	GCCA	2	8	484310	484317	25 %	0 %	25 %	50 %	510880545
12743	NC_021313	TCG	2	6	484368	484373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880545
12744	NC_021313	CGA	2	6	484408	484413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880545
12745	NC_021313	TCG	2	6	484416	484421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880545
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12750	NC_021313	GGT	2	6	484581	484586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12751	NC_021313	GGT	2	6	484606	484611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12752	NC_021313	GGTC	2	8	484653	484660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12753	NC_021313	GTC	2	6	484747	484752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880546
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12765	NC_021313	GACC	2	8	485088	485095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12766	NC_021313	GT	3	6	485134	485139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12767	NC_021313	GAA	2	6	485146	485151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12768	NC_021313	ACGGA	2	10	485153	485162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12769	NC_021313	TCG	2	6	485243	485248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880547
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12775	NC_021313	CGAGC	2	10	485446	485455	20 %	0 %	40 %	40 %	510880547
12776	NC_021313	CGA	2	6	485475	485480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880547
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12779	NC_021313	TCG	2	6	485654	485659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880547
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12813	NC_021313	GCT	2	6	487061	487066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12968	NC_021313	TGG	2	6	491600	491605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12969	NC_021313	GCC	2	6	491675	491680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12970	NC_021313	TC	3	6	491698	491703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12971	NC_021313	CCG	2	6	491704	491709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12972	NC_021313	GTA	2	6	491732	491737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12973	NC_021313	CAG	2	6	491766	491771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12975	NC_021313	T	6	6	491866	491871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12976	NC_021313	TCG	2	6	491936	491941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880553
12977	NC_021313	CGT	2	6	491943	491948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880553
12978	NC_021313	CAC	2	6	491991	491996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880553
12979	NC_021313	TCG	2	6	492140	492145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880553
12980	NC_021313	CGA	2	6	492219	492224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880553
12981	NC_021313	GCC	2	6	492265	492270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880553
12982	NC_021313	CGGC	2	8	492323	492330	0 %	0 %	50 %	50 %	510880553
12983	NC_021313	ACGCG	2	10	492335	492344	20 %	0 %	40 %	40 %	510880553
12984	NC_021313	GCGA	2	8	492367	492374	25 %	0 %	50 %	25 %	510880553
12985	NC_021313	AGG	2	6	492386	492391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880553
12986	NC_021313	TCGC	2	8	492447	492454	0 %	25 %	25 %	50 %	510880553
12987	NC_021313	CGA	2	6	492471	492476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880553
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12989	NC_021313	TCC	2	6	492759	492764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12990	NC_021313	ACC	2	6	492834	492839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12991	NC_021313	GCC	2	6	492866	492871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12992	NC_021313	CCG	2	6	492901	492906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880554
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12999	NC_021313	GGA	2	6	493226	493231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880554
13000	NC_021313	GAAC	2	8	493289	493296	50 %	0 %	25 %	25 %	510880554

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