MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_021213	GTTG	2	8	1879705	1879712	0 %	50 %	50 %	0 %	499144139
38002	NC_021213	CA	3	6	1879765	1879770	50 %	0 %	0 %	50 %	499144139
38003	NC_021213	CAAG	2	8	1879800	1879807	50 %	0 %	25 %	25 %	499144139
38004	NC_021213	AAT	2	6	1879906	1879911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144139
38005	NC_021213	CA	3	6	1879930	1879935	50 %	0 %	0 %	50 %	499144139
38006	NC_021213	TTC	2	6	1880008	1880013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144139
38007	NC_021213	TAT	2	6	1880034	1880039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144139
38008	NC_021213	CTT	2	6	1880069	1880074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144139
38009	NC_021213	ACT	2	6	1880104	1880109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144139
38010	NC_021213	CA	3	6	1880120	1880125	50 %	0 %	0 %	50 %	499144139
38011	NC_021213	TTTC	2	8	1880126	1880133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38012	NC_021213	TGC	2	6	1880138	1880143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38013	NC_021213	CCT	2	6	1880173	1880178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38014	NC_021213	AT	3	6	1880224	1880229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38015	NC_021213	A	7	7	1880262	1880268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38016	NC_021213	CGA	2	6	1880476	1880481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144140
38017	NC_021213	TTC	2	6	1880502	1880507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144140
38018	NC_021213	GCA	2	6	1880515	1880520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144140
38019	NC_021213	CAG	2	6	1880576	1880581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144140
38020	NC_021213	AGC	2	6	1880595	1880600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144140
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38022	NC_021213	CTG	2	6	1880654	1880659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144140
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38024	NC_021213	CTG	2	6	1880807	1880812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144140
38025	NC_021213	CTG	2	6	1880957	1880962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144140
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38030	NC_021213	TGA	2	6	1881210	1881215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144140
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38033	NC_021213	GCT	2	6	1881373	1881378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144140
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38035	NC_021213	TTGT	2	8	1881522	1881529	0 %	75 %	25 %	0 %	499144140
38036	NC_021213	GCT	2	6	1881583	1881588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144140
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38045	NC_021213	GAA	2	6	1882061	1882066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144140
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38050	NC_021213	TAT	2	6	1882310	1882315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144140
38051	NC_021213	AAAT	2	8	1882356	1882363	75 %	25 %	0 %	0 %	499144140
38052	NC_021213	AGT	2	6	1882411	1882416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38053	NC_021213	CTC	2	6	1882457	1882462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38054	NC_021213	AG	3	6	1882477	1882482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38055	NC_021213	TCT	2	6	1882523	1882528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38056	NC_021213	AAG	2	6	1882529	1882534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38057	NC_021213	ATC	2	6	1882537	1882542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38058	NC_021213	GTGG	2	8	1882551	1882558	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38059	NC_021213	GCC	2	6	1882600	1882605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144141
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38061	NC_021213	GAT	2	6	1882723	1882728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
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38067	NC_021213	GAT	2	6	1883095	1883100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
38068	NC_021213	CAG	2	6	1883106	1883111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144141
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38073	NC_021213	TGA	2	6	1883389	1883394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
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38082	NC_021213	TAA	2	6	1883735	1883740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38083	NC_021213	GTT	2	6	1883767	1883772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38084	NC_021213	AT	3	6	1883802	1883807	50 %	50 %	0 %	0 %	499144142
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38088	NC_021213	TCTGTG	2	12	1884118	1884129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	499144142
38089	NC_021213	CCT	2	6	1884159	1884164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144142
38090	NC_021213	CTC	3	9	1884215	1884223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144142
38091	NC_021213	TTG	2	6	1884281	1884286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144142
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38096	NC_021213	CAA	2	6	1884554	1884559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144142
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38100	NC_021213	TTTCT	2	10	1884737	1884746	0 %	80 %	0 %	20 %	499144142
38101	NC_021213	TCT	2	6	1884783	1884788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144142
38102	NC_021213	AAC	2	6	1884819	1884824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144142
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38104	NC_021213	A	6	6	1884843	1884848	100 %	0 %	0 %	0 %	499144142
38105	NC_021213	AAG	2	6	1884864	1884869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144142
38106	NC_021213	TTTA	2	8	1884902	1884909	25 %	75 %	0 %	0 %	499144142
38107	NC_021213	TTCA	2	8	1884995	1885002	25 %	50 %	0 %	25 %	499144142
38108	NC_021213	GA	3	6	1885024	1885029	50 %	0 %	50 %	0 %	499144142
38109	NC_021213	AT	3	6	1885083	1885088	50 %	50 %	0 %	0 %	499144142
38110	NC_021213	CT	3	6	1885221	1885226	0 %	50 %	0 %	50 %	499144142
38111	NC_021213	GTT	2	6	1885230	1885235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144142
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38113	NC_021213	T	6	6	1885252	1885257	0 %	100 %	0 %	0 %	499144142
38114	NC_021213	TTG	2	6	1885286	1885291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144142
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38116	NC_021213	TAA	2	6	1885373	1885378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144142
38117	NC_021213	TCC	2	6	1885387	1885392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144142
38118	NC_021213	CCCGT	2	10	1885400	1885409	0 %	20 %	20 %	60 %	499144142
38119	NC_021213	TAA	2	6	1885441	1885446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38120	NC_021213	TTA	2	6	1885447	1885452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38121	NC_021213	ATT	2	6	1885464	1885469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38122	NC_021213	TTAG	2	8	1885496	1885503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38123	NC_021213	TAA	2	6	1885520	1885525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38124	NC_021213	TATC	2	8	1885559	1885566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38125	NC_021213	TC	3	6	1885648	1885653	0 %	50 %	0 %	50 %	499144143
38126	NC_021213	GAT	2	6	1885692	1885697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144143
38127	NC_021213	CTGG	2	8	1885716	1885723	0 %	25 %	50 %	25 %	499144143
38128	NC_021213	ATA	2	6	1885732	1885737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144143
38129	NC_021213	ATC	2	6	1885746	1885751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144143
38130	NC_021213	AAT	2	6	1885800	1885805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144143
38131	NC_021213	ACT	2	6	1885821	1885826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144143
38132	NC_021213	TGAGC	2	10	1885998	1886007	20 %	20 %	40 %	20 %	499144143
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38134	NC_021213	TAG	2	6	1886080	1886085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144143
38135	NC_021213	TCA	2	6	1886132	1886137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144143
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38137	NC_021213	CA	3	6	1886197	1886202	50 %	0 %	0 %	50 %	499144143
38138	NC_021213	TAG	2	6	1886233	1886238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38139	NC_021213	ATG	2	6	1886275	1886280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38140	NC_021213	GATT	2	8	1886306	1886313	25 %	50 %	25 %	0 %	499144144
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38142	NC_021213	ACA	2	6	1886416	1886421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144144
38143	NC_021213	ACG	2	6	1886451	1886456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144144
38144	NC_021213	GAT	2	6	1886469	1886474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144144
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38148	NC_021213	TCAA	2	8	1886943	1886950	50 %	25 %	0 %	25 %	499144144
38149	NC_021213	CCT	2	6	1886971	1886976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144144
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38151	NC_021213	TCAA	2	8	1887027	1887034	50 %	25 %	0 %	25 %	499144145
38152	NC_021213	CA	3	6	1887089	1887094	50 %	0 %	0 %	50 %	499144145
38153	NC_021213	TTTC	2	8	1887274	1887281	0 %	75 %	0 %	25 %	499144145
38154	NC_021213	ATC	2	6	1887320	1887325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144145
38155	NC_021213	CT	3	6	1887401	1887406	0 %	50 %	0 %	50 %	499144145
38156	NC_021213	TAG	2	6	1887429	1887434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144145
38157	NC_021213	CGT	2	6	1887436	1887441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144145
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38160	NC_021213	AT	3	6	1887764	1887769	50 %	50 %	0 %	0 %	499144145
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38178	NC_021213	TCTAAA	2	12	1888473	1888484	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	499144146
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38181	NC_021213	AAT	2	6	1888592	1888597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144147
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38183	NC_021213	CAAAG	2	10	1888706	1888715	60 %	0 %	20 %	20 %	499144147
38184	NC_021213	TAG	2	6	1888779	1888784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144147
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38188	NC_021213	TTC	2	6	1888826	1888831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144147
38189	NC_021213	GCA	2	6	1888836	1888841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144147
38190	NC_021213	CCT	2	6	1888879	1888884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144147
38191	NC_021213	ATT	2	6	1888919	1888924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144147
38192	NC_021213	TTTTG	2	10	1889179	1889188	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38193	NC_021213	GTC	2	6	1889197	1889202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38194	NC_021213	ACCA	2	8	1889218	1889225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38195	NC_021213	ATATC	2	10	1889282	1889291	40 %	40 %	0 %	20 %	499144148
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38199	NC_021213	AAG	2	6	1889577	1889582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38200	NC_021213	ACC	2	6	1889675	1889680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144149
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38202	NC_021213	AAGGA	2	10	1889742	1889751	60 %	0 %	40 %	0 %	499144149
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38204	NC_021213	TGC	2	6	1889798	1889803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144149
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38213	NC_021213	TTG	3	9	1890338	1890346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144149
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38220	NC_021213	ATG	2	6	1890525	1890530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144149
38221	NC_021213	TGA	2	6	1890538	1890543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144149
38222	NC_021213	GTAC	2	8	1890549	1890556	25 %	25 %	25 %	25 %	499144149
38223	NC_021213	CCA	2	6	1890577	1890582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144149
38224	NC_021213	GCT	2	6	1890624	1890629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144149
38225	NC_021213	CTC	2	6	1890647	1890652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144149
38226	NC_021213	TGC	3	9	1890668	1890676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144149
38227	NC_021213	GCC	2	6	1890732	1890737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144149
38228	NC_021213	CGGA	2	8	1890743	1890750	25 %	0 %	50 %	25 %	499144149
38229	NC_021213	GTT	2	6	1890753	1890758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144149
38230	NC_021213	ACC	2	6	1890764	1890769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144149
38231	NC_021213	GCT	2	6	1890771	1890776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144149
38232	NC_021213	CAT	2	6	1890826	1890831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144149
38233	NC_021213	CCA	2	6	1890859	1890864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144149
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38235	NC_021213	T	6	6	1890959	1890964	0 %	100 %	0 %	0 %	499144149
38236	NC_021213	TAT	2	6	1890984	1890989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144149
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38240	NC_021213	A	6	6	1891149	1891154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38243	NC_021213	AGA	2	6	1891180	1891185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38244	NC_021213	GGTT	2	8	1891186	1891193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38245	NC_021213	AACC	2	8	1891197	1891204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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38250	NC_021213	TTC	2	6	1891315	1891320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38337	NC_021213	TGCC	2	8	1895741	1895748	0 %	25 %	25 %	50 %	499144150
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38344	NC_021213	CAA	2	6	1896076	1896081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144150
38345	NC_021213	AGT	2	6	1896121	1896126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144150
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38347	NC_021213	TCA	2	6	1896241	1896246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144150
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38349	NC_021213	CCG	2	6	1896447	1896452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144150
38350	NC_021213	CTA	2	6	1896555	1896560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144150
38351	NC_021213	T	6	6	1896576	1896581	0 %	100 %	0 %	0 %	499144150
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38453	NC_021213	ATA	2	6	1901079	1901084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144152
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38455	NC_021213	AT	3	6	1901263	1901268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38456	NC_021213	AAT	2	6	1901326	1901331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144153
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38459	NC_021213	T	6	6	1901509	1901514	0 %	100 %	0 %	0 %	499144153
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38462	NC_021213	A	7	7	1901737	1901743	100 %	0 %	0 %	0 %	499144153
38463	NC_021213	ATATC	2	10	1901789	1901798	40 %	40 %	0 %	20 %	499144153
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38469	NC_021213	CCTC	2	8	1901909	1901916	0 %	25 %	0 %	75 %	499144153
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38472	NC_021213	CAT	2	6	1902009	1902014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144153
38473	NC_021213	GCT	2	6	1902066	1902071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144153
38474	NC_021213	TTC	2	6	1902079	1902084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144153
38475	NC_021213	T	6	6	1902102	1902107	0 %	100 %	0 %	0 %	499144153
38476	NC_021213	A	6	6	1902116	1902121	100 %	0 %	0 %	0 %	499144153
38477	NC_021213	TAAT	2	8	1902123	1902130	50 %	50 %	0 %	0 %	499144153
38478	NC_021213	TAA	2	6	1902145	1902150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144153
38479	NC_021213	ATA	2	6	1902186	1902191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144153
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38481	NC_021213	A	6	6	1902230	1902235	100 %	0 %	0 %	0 %	499144153
38482	NC_021213	GA	3	6	1902236	1902241	50 %	0 %	50 %	0 %	499144153
38483	NC_021213	TC	3	6	1902250	1902255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38484	NC_021213	TCAT	2	8	1902261	1902268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38485	NC_021213	TAA	2	6	1902335	1902340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38486	NC_021213	CAA	2	6	1902344	1902349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38487	NC_021213	T	6	6	1902413	1902418	0 %	100 %	0 %	0 %	499144154
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