MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37501	NC_021213	ATG	2	6	1855449	1855454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144113
37502	NC_021213	TC	3	6	1855557	1855562	0 %	50 %	0 %	50 %	499144113
37503	NC_021213	TCA	2	6	1855633	1855638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144113
37504	NC_021213	AGTCA	2	10	1855639	1855648	40 %	20 %	20 %	20 %	499144113
37505	NC_021213	ACG	2	6	1855649	1855654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144113
37506	NC_021213	T	6	6	1855754	1855759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37507	NC_021213	GCCA	2	8	1855768	1855775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37508	NC_021213	CTC	2	6	1855935	1855940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144114
37509	NC_021213	GTA	2	6	1856005	1856010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144114
37510	NC_021213	GAA	3	9	1856013	1856021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144114
37511	NC_021213	GTA	2	6	1856039	1856044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144114
37512	NC_021213	AAG	2	6	1856064	1856069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144114
37513	NC_021213	AG	3	6	1856068	1856073	50 %	0 %	50 %	0 %	499144114
37514	NC_021213	AGA	2	6	1856159	1856164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144114
37515	NC_021213	GTT	2	6	1856185	1856190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144114
37516	NC_021213	CAG	2	6	1856229	1856234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144114
37517	NC_021213	GCTT	2	8	1856332	1856339	0 %	50 %	25 %	25 %	499144114
37518	NC_021213	GAAG	2	8	1856340	1856347	50 %	0 %	50 %	0 %	499144114
37519	NC_021213	T	6	6	1856369	1856374	0 %	100 %	0 %	0 %	499144114
37520	NC_021213	GCT	2	6	1856390	1856395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144114
37521	NC_021213	GCT	2	6	1856411	1856416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144114
37522	NC_021213	CAG	2	6	1856445	1856450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144114
37523	NC_021213	ATG	2	6	1856455	1856460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144114
37524	NC_021213	AGG	2	6	1856461	1856466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499144114
37525	NC_021213	AGGAG	2	10	1856510	1856519	40 %	0 %	60 %	0 %	499144114
37526	NC_021213	GA	3	6	1856536	1856541	50 %	0 %	50 %	0 %	499144114
37527	NC_021213	GAG	2	6	1856559	1856564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499144114
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37529	NC_021213	GGCT	2	8	1856715	1856722	0 %	25 %	50 %	25 %	499144114
37530	NC_021213	TTG	2	6	1856797	1856802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144114
37531	NC_021213	GCCAGA	2	12	1856875	1856886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144114
37532	NC_021213	TCA	2	6	1856915	1856920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144114
37533	NC_021213	ATA	2	6	1856928	1856933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144114
37534	NC_021213	ACA	2	6	1856954	1856959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144114
37535	NC_021213	CAGT	2	8	1856966	1856973	25 %	25 %	25 %	25 %	499144114
37536	NC_021213	T	7	7	1857002	1857008	0 %	100 %	0 %	0 %	499144114
37537	NC_021213	CTTT	2	8	1857020	1857027	0 %	75 %	0 %	25 %	499144114
37538	NC_021213	AAT	2	6	1857030	1857035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144114
37539	NC_021213	ATT	2	6	1857094	1857099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144114
37540	NC_021213	CTTTT	2	10	1857160	1857169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37541	NC_021213	GTT	2	6	1857184	1857189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37542	NC_021213	GTT	2	6	1857191	1857196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37543	NC_021213	CAG	2	6	1857234	1857239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144115
37544	NC_021213	CTT	2	6	1857463	1857468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144115
37545	NC_021213	CAG	2	6	1857499	1857504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144115
37546	NC_021213	CGC	2	6	1857562	1857567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144115
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37548	NC_021213	TGT	2	6	1857661	1857666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144115
37549	NC_021213	CAG	2	6	1857730	1857735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144115
37550	NC_021213	T	6	6	1857754	1857759	0 %	100 %	0 %	0 %	499144115
37551	NC_021213	CTTTT	2	10	1857785	1857794	0 %	80 %	0 %	20 %	499144115
37552	NC_021213	TAA	2	6	1857804	1857809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144115
37553	NC_021213	GACT	2	8	1857890	1857897	25 %	25 %	25 %	25 %	499144116
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37555	NC_021213	CAT	2	6	1857988	1857993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144116
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37557	NC_021213	GAAA	2	8	1858053	1858060	75 %	0 %	25 %	0 %	499144116
37558	NC_021213	GCT	2	6	1858067	1858072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144116
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37560	NC_021213	GAC	2	6	1858096	1858101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144116
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37565	NC_021213	TAT	2	6	1858237	1858242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144116
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37567	NC_021213	TTTATT	2	12	1858347	1858358	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37568	NC_021213	T	6	6	1858382	1858387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37569	NC_021213	CTT	2	6	1858388	1858393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37570	NC_021213	A	6	6	1858394	1858399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37571	NC_021213	ATG	2	6	1858412	1858417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37573	NC_021213	CAC	2	6	1858436	1858441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37574	NC_021213	GGA	2	6	1858562	1858567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499144117
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37580	NC_021213	AAGG	2	8	1858803	1858810	50 %	0 %	50 %	0 %	499144117
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37583	NC_021213	GACC	2	8	1858951	1858958	25 %	0 %	25 %	50 %	499144117
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37587	NC_021213	ATA	2	6	1859199	1859204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144117
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37589	NC_021213	ATA	2	6	1859264	1859269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37590	NC_021213	A	7	7	1859286	1859292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37591	NC_021213	TA	3	6	1859359	1859364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37592	NC_021213	CAT	2	6	1859390	1859395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37593	NC_021213	CGT	2	6	1859417	1859422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37594	NC_021213	AG	3	6	1859447	1859452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37595	NC_021213	TCC	2	6	1859458	1859463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144118
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37602	NC_021213	TCT	2	6	1859653	1859658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144118
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37605	NC_021213	TTG	2	6	1860008	1860013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37606	NC_021213	GTT	2	6	1860116	1860121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144119
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37616	NC_021213	TTCC	2	8	1860683	1860690	0 %	50 %	0 %	50 %	499144119
37617	NC_021213	CGA	2	6	1860704	1860709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144119
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37619	NC_021213	CTGA	2	8	1860771	1860778	25 %	25 %	25 %	25 %	499144119
37620	NC_021213	ATG	2	6	1860811	1860816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144119
37621	NC_021213	ATCGA	2	10	1860823	1860832	40 %	20 %	20 %	20 %	499144119
37622	NC_021213	TCT	2	6	1860854	1860859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144119
37623	NC_021213	CTG	2	6	1860951	1860956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144119
37624	NC_021213	CTC	2	6	1860963	1860968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144119
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37635	NC_021213	GCA	2	6	1861493	1861498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37639	NC_021213	AGA	2	6	1861637	1861642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144120
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37656	NC_021213	AGCC	2	8	1862645	1862652	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37657	NC_021213	AGTA	2	8	1862670	1862677	50 %	25 %	25 %	0 %	499144122
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37662	NC_021213	TAGA	2	8	1862900	1862907	50 %	25 %	25 %	0 %	499144122
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37702	NC_021213	TATG	2	8	1865069	1865076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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37733	NC_021213	GACCA	2	10	1866760	1866769	40 %	0 %	20 %	40 %	499144126
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37795	NC_021213	AT	4	8	1869931	1869938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37796	NC_021213	TA	3	6	1869950	1869955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37797	NC_021213	AT	3	6	1869982	1869987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37798	NC_021213	T	6	6	1870012	1870017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37840	NC_021213	A	7	7	1872058	1872064	100 %	0 %	0 %	0 %	499144130
37841	NC_021213	GGAA	2	8	1872103	1872110	50 %	0 %	50 %	0 %	499144131
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37845	NC_021213	TGCACC	2	12	1872303	1872314	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499144131
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37849	NC_021213	CCAA	2	8	1872462	1872469	50 %	0 %	0 %	50 %	499144131
37850	NC_021213	CAC	2	6	1872522	1872527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144131
37851	NC_021213	ACC	2	6	1872540	1872545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144131
37852	NC_021213	A	6	6	1872660	1872665	100 %	0 %	0 %	0 %	499144131
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37855	NC_021213	ATC	2	6	1872928	1872933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144132
37856	NC_021213	AAG	2	6	1873026	1873031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144132
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37859	NC_021213	CTA	2	6	1873142	1873147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144132
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37861	NC_021213	CTTT	2	8	1873209	1873216	0 %	75 %	0 %	25 %	499144132
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37870	NC_021213	GCTG	2	8	1873761	1873768	0 %	25 %	50 %	25 %	499144133
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37881	NC_021213	TCC	2	6	1874137	1874142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144133
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37905	NC_021213	CAA	2	6	1875288	1875293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38000	NC_021213	A	6	6	1879583	1879588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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