MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_021213	TTGA	2	8	1829338	1829345	25 %	50 %	25 %	0 %	499144086
37003	NC_021213	GTT	2	6	1829346	1829351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144086
37004	NC_021213	ATC	2	6	1829422	1829427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144086
37005	NC_021213	GGTC	2	8	1829494	1829501	0 %	25 %	50 %	25 %	499144086
37006	NC_021213	CTA	2	6	1829505	1829510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144086
37007	NC_021213	TCA	2	6	1829534	1829539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144086
37008	NC_021213	TCGG	2	8	1829579	1829586	0 %	25 %	50 %	25 %	499144086
37009	NC_021213	TGG	2	6	1829607	1829612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499144086
37010	NC_021213	TAA	2	6	1829738	1829743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144086
37011	NC_021213	CAGC	2	8	1829745	1829752	25 %	0 %	25 %	50 %	499144086
37012	NC_021213	GTCC	2	8	1829795	1829802	0 %	25 %	25 %	50 %	499144086
37013	NC_021213	ATG	2	6	1829921	1829926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144086
37014	NC_021213	AGG	2	6	1830042	1830047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499144086
37015	NC_021213	TTC	2	6	1830103	1830108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144086
37016	NC_021213	CGGT	2	8	1830149	1830156	0 %	25 %	50 %	25 %	499144086
37017	NC_021213	CCT	2	6	1830243	1830248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144086
37018	NC_021213	TGC	2	6	1830260	1830265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144086
37019	NC_021213	AGCTG	2	10	1830294	1830303	20 %	20 %	40 %	20 %	499144086
37020	NC_021213	CTG	2	6	1830318	1830323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144086
37021	NC_021213	ATGTCT	2	12	1830485	1830496	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	499144086
37022	NC_021213	CTAT	2	8	1830497	1830504	25 %	50 %	0 %	25 %	499144086
37023	NC_021213	T	6	6	1830526	1830531	0 %	100 %	0 %	0 %	499144086
37024	NC_021213	A	6	6	1830533	1830538	100 %	0 %	0 %	0 %	499144087
37025	NC_021213	GAC	2	6	1830667	1830672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144087
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37027	NC_021213	CAT	2	6	1830748	1830753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144087
37028	NC_021213	ACC	2	6	1830766	1830771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144087
37029	NC_021213	ATC	2	6	1830847	1830852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144087
37030	NC_021213	CAG	2	6	1830858	1830863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144087
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37032	NC_021213	CTC	2	6	1830907	1830912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144087
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37034	NC_021213	AG	3	6	1830977	1830982	50 %	0 %	50 %	0 %	499144087
37035	NC_021213	TGAA	2	8	1831160	1831167	50 %	25 %	25 %	0 %	499144087
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37040	NC_021213	TGA	2	6	1831369	1831374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144088
37041	NC_021213	CACC	2	8	1831378	1831385	25 %	0 %	0 %	75 %	499144088
37042	NC_021213	CAG	2	6	1831393	1831398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144088
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37051	NC_021213	CATC	2	8	1832238	1832245	25 %	25 %	0 %	50 %	499144089
37052	NC_021213	TCT	2	6	1832255	1832260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144089
37053	NC_021213	ATG	2	6	1832369	1832374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144089
37054	NC_021213	ACC	2	6	1832375	1832380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144089
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37056	NC_021213	CTCTGG	2	12	1832526	1832537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144089
37057	NC_021213	TTC	2	6	1832595	1832600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144089
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37059	NC_021213	TAT	2	6	1832636	1832641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144089
37060	NC_021213	A	7	7	1832656	1832662	100 %	0 %	0 %	0 %	499144089
37061	NC_021213	TAA	2	6	1832719	1832724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37062	NC_021213	GGT	2	6	1832737	1832742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37063	NC_021213	TCC	2	6	1832805	1832810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37064	NC_021213	ATT	2	6	1832813	1832818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37065	NC_021213	TGA	2	6	1832845	1832850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37066	NC_021213	TCT	2	6	1832868	1832873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37067	NC_021213	AAAATC	2	12	1832889	1832900	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37068	NC_021213	TCA	2	6	1833040	1833045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37069	NC_021213	CAA	2	6	1833054	1833059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37070	NC_021213	ACC	2	6	1833108	1833113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37071	NC_021213	CAT	2	6	1833115	1833120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37072	NC_021213	ATGA	2	8	1833158	1833165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37073	NC_021213	AGGTA	2	10	1833184	1833193	40 %	20 %	40 %	0 %	499144090
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37102	NC_021213	A	6	6	1834703	1834708	100 %	0 %	0 %	0 %	499144090
37103	NC_021213	TTA	2	6	1834725	1834730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144090
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37105	NC_021213	A	6	6	1834835	1834840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37106	NC_021213	TTC	2	6	1834900	1834905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144091
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37118	NC_021213	TAGA	2	8	1835513	1835520	50 %	25 %	25 %	0 %	499144091
37119	NC_021213	GTA	2	6	1835542	1835547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144091
37120	NC_021213	GGAT	2	8	1835549	1835556	25 %	25 %	50 %	0 %	499144091
37121	NC_021213	CTG	2	6	1835571	1835576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144091
37122	NC_021213	CTT	2	6	1835602	1835607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144091
37123	NC_021213	GAA	2	6	1835636	1835641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144091
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37125	NC_021213	TCA	2	6	1835727	1835732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144091
37126	NC_021213	ATG	2	6	1835753	1835758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144091
37127	NC_021213	GTCA	2	8	1835854	1835861	25 %	25 %	25 %	25 %	499144091
37128	NC_021213	CTT	2	6	1835908	1835913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144091
37129	NC_021213	TCT	2	6	1835931	1835936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144091
37130	NC_021213	TGC	2	6	1835978	1835983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144091
37131	NC_021213	TTA	2	6	1836053	1836058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144091
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37149	NC_021213	TC	3	6	1837258	1837263	0 %	50 %	0 %	50 %	499144091
37150	NC_021213	TAA	2	6	1837298	1837303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144091
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37152	NC_021213	ACC	2	6	1837353	1837358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37153	NC_021213	TTG	2	6	1837360	1837365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144092
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37188	NC_021213	CAA	2	6	1838955	1838960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144092
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37190	NC_021213	A	7	7	1839008	1839014	100 %	0 %	0 %	0 %	499144092
37191	NC_021213	CT	3	6	1839025	1839030	0 %	50 %	0 %	50 %	499144092
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37193	NC_021213	AGTT	2	8	1839076	1839083	25 %	50 %	25 %	0 %	499144092
37194	NC_021213	AACG	2	8	1839118	1839125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37195	NC_021213	ATAAA	2	10	1839150	1839159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37196	NC_021213	ATTG	2	8	1839161	1839168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37197	NC_021213	CAAT	2	8	1839181	1839188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37198	NC_021213	CTT	2	6	1839206	1839211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37200	NC_021213	TGCCA	2	10	1839282	1839291	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37201	NC_021213	TCG	2	6	1839319	1839324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144093
37202	NC_021213	TGGT	2	8	1839337	1839344	0 %	50 %	50 %	0 %	499144093
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37220	NC_021213	TCTTT	2	10	1840180	1840189	0 %	80 %	0 %	20 %	499144094
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37222	NC_021213	CTC	2	6	1840240	1840245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144094
37223	NC_021213	AAT	2	6	1840265	1840270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144094
37224	NC_021213	TCA	2	6	1840295	1840300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144094
37225	NC_021213	T	6	6	1840416	1840421	0 %	100 %	0 %	0 %	499144094
37226	NC_021213	TTC	2	6	1840453	1840458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144094
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37228	NC_021213	ACA	2	6	1840481	1840486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144094
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37230	NC_021213	T	6	6	1840609	1840614	0 %	100 %	0 %	0 %	499144094
37231	NC_021213	CAT	2	6	1840679	1840684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144094
37232	NC_021213	CTT	2	6	1840713	1840718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144094
37233	NC_021213	CGT	2	6	1840864	1840869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144095
37234	NC_021213	CACT	2	8	1841014	1841021	25 %	25 %	0 %	50 %	499144096
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37236	NC_021213	TTA	2	6	1841056	1841061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144096
37237	NC_021213	TCA	2	6	1841163	1841168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144096
37238	NC_021213	A	7	7	1841192	1841198	100 %	0 %	0 %	0 %	499144096
37239	NC_021213	TTC	2	6	1841338	1841343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144097
37240	NC_021213	AGA	2	6	1841363	1841368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144097
37241	NC_021213	TCA	2	6	1841377	1841382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144097
37242	NC_021213	TCT	2	6	1841509	1841514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144097
37243	NC_021213	GAC	2	6	1841526	1841531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144097
37244	NC_021213	ATC	2	6	1841697	1841702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144097
37245	NC_021213	ATA	2	6	1841706	1841711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144097
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37249	NC_021213	TCC	2	6	1841932	1841937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144098
37250	NC_021213	GCA	2	6	1841957	1841962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144098
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37289	NC_021213	A	6	6	1843771	1843776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37290	NC_021213	CCAT	2	8	1843866	1843873	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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37308	NC_021213	T	7	7	1844714	1844720	0 %	100 %	0 %	0 %	499144102
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37311	NC_021213	T	6	6	1844826	1844831	0 %	100 %	0 %	0 %	499144102
37312	NC_021213	TAT	2	6	1844895	1844900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37321	NC_021213	CTTT	2	8	1845608	1845615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37322	NC_021213	T	6	6	1845817	1845822	0 %	100 %	0 %	0 %	499144104
37323	NC_021213	ACA	2	6	1845875	1845880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144104
37324	NC_021213	T	7	7	1845954	1845960	0 %	100 %	0 %	0 %	499144104
37325	NC_021213	TAT	2	6	1845993	1845998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144104
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37327	NC_021213	CCG	2	6	1846107	1846112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37328	NC_021213	GGA	2	6	1846142	1846147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499144105
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37332	NC_021213	TCCTT	2	10	1846357	1846366	0 %	60 %	0 %	40 %	499144105
37333	NC_021213	CCTT	2	8	1846443	1846450	0 %	50 %	0 %	50 %	499144105
37334	NC_021213	TTA	2	6	1846467	1846472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144105
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37340	NC_021213	CA	3	6	1846663	1846668	50 %	0 %	0 %	50 %	499144105
37341	NC_021213	CAT	2	6	1846682	1846687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144105
37342	NC_021213	GTC	2	6	1846812	1846817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144105
37343	NC_021213	GCC	2	6	1846827	1846832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144105
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37345	NC_021213	TGT	2	6	1846900	1846905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144105
37346	NC_021213	TGGGC	2	10	1846936	1846945	0 %	20 %	60 %	20 %	499144105
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37350	NC_021213	TGAT	2	8	1847265	1847272	25 %	50 %	25 %	0 %	499144105
37351	NC_021213	TTC	2	6	1847366	1847371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144105
37352	NC_021213	TTGG	2	8	1847473	1847480	0 %	50 %	50 %	0 %	499144105
37353	NC_021213	TGA	2	6	1847495	1847500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144105
37354	NC_021213	CTG	2	6	1847507	1847512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144105
37355	NC_021213	AAC	2	6	1847637	1847642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144106
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37366	NC_021213	CCA	2	6	1848598	1848603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144106
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37370	NC_021213	AATA	2	8	1848740	1848747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37371	NC_021213	A	7	7	1848772	1848778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37372	NC_021213	AT	3	6	1848806	1848811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37373	NC_021213	TCA	2	6	1848815	1848820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37374	NC_021213	ATA	2	6	1848870	1848875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37375	NC_021213	CTAAA	2	10	1848878	1848887	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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37381	NC_021213	TAAGG	2	10	1849092	1849101	40 %	20 %	40 %	0 %	499144107
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37421	NC_021213	ACC	2	6	1851160	1851165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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37471	NC_021213	CCA	2	6	1853669	1853674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144112
37472	NC_021213	TGA	2	6	1853693	1853698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144112
37473	NC_021213	CCG	2	6	1853878	1853883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144112
37474	NC_021213	ACA	2	6	1853888	1853893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144112
37475	NC_021213	GAC	2	6	1853903	1853908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144112
37476	NC_021213	TC	3	6	1853915	1853920	0 %	50 %	0 %	50 %	499144112
37477	NC_021213	ATTT	2	8	1853982	1853989	25 %	75 %	0 %	0 %	499144112
37478	NC_021213	CGTC	2	8	1854299	1854306	0 %	25 %	25 %	50 %	499144113
37479	NC_021213	CTT	2	6	1854368	1854373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144113
37480	NC_021213	AGA	2	6	1854404	1854409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144113
37481	NC_021213	CAA	2	6	1854425	1854430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144113
37482	NC_021213	CTG	2	6	1854437	1854442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144113
37483	NC_021213	CCA	2	6	1854467	1854472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144113
37484	NC_021213	TGTC	2	8	1854485	1854492	0 %	50 %	25 %	25 %	499144113
37485	NC_021213	TCT	2	6	1854587	1854592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144113
37486	NC_021213	TCA	2	6	1854628	1854633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144113
37487	NC_021213	TTC	2	6	1854666	1854671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144113
37488	NC_021213	ACG	2	6	1854738	1854743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144113
37489	NC_021213	TCT	2	6	1854748	1854753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144113
37490	NC_021213	T	6	6	1854789	1854794	0 %	100 %	0 %	0 %	499144113
37491	NC_021213	CCAA	2	8	1854846	1854853	50 %	0 %	0 %	50 %	499144113
37492	NC_021213	GCT	2	6	1854872	1854877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144113
37493	NC_021213	GT	3	6	1854881	1854886	0 %	50 %	50 %	0 %	499144113
37494	NC_021213	ATC	2	6	1854936	1854941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144113
37495	NC_021213	CAC	2	6	1854998	1855003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144113
37496	NC_021213	ACGCTC	2	12	1855200	1855211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499144113
37497	NC_021213	CGC	2	6	1855212	1855217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144113
37498	NC_021213	CTT	2	6	1855223	1855228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144113
37499	NC_021213	CAAC	2	8	1855356	1855363	50 %	0 %	0 %	50 %	499144113
37500	NC_021213	TCT	2	6	1855393	1855398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144113

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