MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_021213	CAAGC	3	15	1679519	1679533	40 %	0 %	20 %	40 %	499143954
34002	NC_021213	CT	3	6	1679537	1679542	0 %	50 %	0 %	50 %	499143954
34003	NC_021213	AAC	2	6	1679553	1679558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143954
34004	NC_021213	TGA	2	6	1679608	1679613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143954
34005	NC_021213	GAA	2	6	1679774	1679779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143954
34006	NC_021213	CAA	2	6	1679789	1679794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143954
34007	NC_021213	GAA	2	6	1679813	1679818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143954
34008	NC_021213	AGA	2	6	1679871	1679876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143954
34009	NC_021213	TTAC	2	8	1679880	1679887	25 %	50 %	0 %	25 %	499143954
34010	NC_021213	T	7	7	1679907	1679913	0 %	100 %	0 %	0 %	499143954
34011	NC_021213	A	8	8	1679919	1679926	100 %	0 %	0 %	0 %	499143954
34012	NC_021213	ATCA	2	8	1680014	1680021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34013	NC_021213	TTTTC	2	10	1680133	1680142	0 %	80 %	0 %	20 %	499143955
34014	NC_021213	ACA	2	6	1680156	1680161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143955
34015	NC_021213	CTTT	2	8	1680197	1680204	0 %	75 %	0 %	25 %	499143955
34016	NC_021213	T	6	6	1680202	1680207	0 %	100 %	0 %	0 %	499143955
34017	NC_021213	GAT	2	6	1680289	1680294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34018	NC_021213	GGAA	2	8	1680337	1680344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34019	NC_021213	CCT	2	6	1680358	1680363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34020	NC_021213	ATT	2	6	1680372	1680377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143956
34021	NC_021213	TTGG	2	8	1680393	1680400	0 %	50 %	50 %	0 %	499143956
34022	NC_021213	CGAAT	2	10	1680460	1680469	40 %	20 %	20 %	20 %	499143956
34023	NC_021213	GTT	2	6	1680497	1680502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143956
34024	NC_021213	CTG	3	9	1680548	1680556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143956
34025	NC_021213	TCAT	2	8	1680628	1680635	25 %	50 %	0 %	25 %	499143956
34026	NC_021213	ATAAC	2	10	1680688	1680697	60 %	20 %	0 %	20 %	499143956
34027	NC_021213	TCT	2	6	1680712	1680717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143956
34028	NC_021213	ATT	2	6	1680870	1680875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143956
34029	NC_021213	CATT	2	8	1680902	1680909	25 %	50 %	0 %	25 %	499143956
34030	NC_021213	T	6	6	1681037	1681042	0 %	100 %	0 %	0 %	499143956
34031	NC_021213	AAT	2	6	1681062	1681067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143956
34032	NC_021213	CTG	2	6	1681077	1681082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143956
34033	NC_021213	AATCAA	2	12	1681107	1681118	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	499143956
34034	NC_021213	CCT	2	6	1681181	1681186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143956
34035	NC_021213	AT	3	6	1681339	1681344	50 %	50 %	0 %	0 %	499143957
34036	NC_021213	ATC	2	6	1681359	1681364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143957
34037	NC_021213	AAC	2	6	1681425	1681430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143957
34038	NC_021213	AGT	2	6	1681433	1681438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143957
34039	NC_021213	TCC	2	6	1681468	1681473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143957
34040	NC_021213	TTA	2	6	1681498	1681503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143957
34041	NC_021213	CCA	2	6	1681504	1681509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143957
34042	NC_021213	ACA	2	6	1681518	1681523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143957
34043	NC_021213	TGC	2	6	1681575	1681580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143957
34044	NC_021213	CTG	2	6	1681583	1681588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143957
34045	NC_021213	CAA	2	6	1681595	1681600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143957
34046	NC_021213	ATCC	2	8	1681639	1681646	25 %	25 %	0 %	50 %	499143957
34047	NC_021213	GAC	2	6	1681763	1681768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143957
34048	NC_021213	CAA	2	6	1681817	1681822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143957
34049	NC_021213	ACC	2	6	1681875	1681880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143957
34050	NC_021213	TCC	2	6	1681881	1681886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143957
34051	NC_021213	CTT	2	6	1681931	1681936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143957
34052	NC_021213	TCA	2	6	1681981	1681986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143957
34053	NC_021213	TGC	2	6	1682034	1682039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143957
34054	NC_021213	TCC	2	6	1682091	1682096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143957
34055	NC_021213	T	6	6	1682117	1682122	0 %	100 %	0 %	0 %	499143957
34056	NC_021213	TCA	2	6	1682239	1682244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143957
34057	NC_021213	ATA	2	6	1682265	1682270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143957
34058	NC_021213	CTC	2	6	1682273	1682278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143957
34059	NC_021213	TAAA	2	8	1682319	1682326	75 %	25 %	0 %	0 %	499143957
34060	NC_021213	GTAC	2	8	1682374	1682381	25 %	25 %	25 %	25 %	499143957
34061	NC_021213	T	6	6	1682419	1682424	0 %	100 %	0 %	0 %	499143957
34062	NC_021213	TTTC	2	8	1682447	1682454	0 %	75 %	0 %	25 %	499143957
34063	NC_021213	TATT	2	8	1682457	1682464	25 %	75 %	0 %	0 %	499143957
34064	NC_021213	CTA	2	6	1682512	1682517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143957
34065	NC_021213	CGT	2	6	1682749	1682754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34066	NC_021213	CAT	2	6	1682755	1682760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34067	NC_021213	CTT	2	6	1682827	1682832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143958
34068	NC_021213	CAG	2	6	1682986	1682991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143958
34069	NC_021213	CCTG	2	8	1683123	1683130	0 %	25 %	25 %	50 %	499143958
34070	NC_021213	ACC	2	6	1683146	1683151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143958
34071	NC_021213	CAAA	2	8	1683172	1683179	75 %	0 %	0 %	25 %	499143958
34072	NC_021213	TCT	3	9	1683180	1683188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143958
34073	NC_021213	TCT	2	6	1683192	1683197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143958
34074	NC_021213	GTT	2	6	1683204	1683209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143958
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34077	NC_021213	CA	3	6	1683367	1683372	50 %	0 %	0 %	50 %	499143958
34078	NC_021213	CTG	2	6	1683388	1683393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143958
34079	NC_021213	TGC	2	6	1683539	1683544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143958
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34086	NC_021213	AGG	2	6	1683953	1683958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34089	NC_021213	CACGGA	2	12	1684134	1684145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143959
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34091	NC_021213	TGA	2	6	1684173	1684178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143959
34092	NC_021213	CGA	2	6	1684283	1684288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143959
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34097	NC_021213	AG	3	6	1684629	1684634	50 %	0 %	50 %	0 %	499143960
34098	NC_021213	TTGG	2	8	1684694	1684701	0 %	50 %	50 %	0 %	499143960
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34101	NC_021213	GAT	2	6	1684730	1684735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143960
34102	NC_021213	CTT	2	6	1684738	1684743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143960
34103	NC_021213	CCA	2	6	1684806	1684811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143960
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34105	NC_021213	TAA	2	6	1684945	1684950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143960
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34107	NC_021213	GTTT	2	8	1684987	1684994	0 %	75 %	25 %	0 %	499143960
34108	NC_021213	AGCA	2	8	1685045	1685052	50 %	0 %	25 %	25 %	499143960
34109	NC_021213	CTA	2	6	1685080	1685085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143960
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34112	NC_021213	C	7	7	1685267	1685273	0 %	0 %	0 %	100 %	499143960
34113	NC_021213	AGG	2	6	1685319	1685324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143960
34114	NC_021213	ACT	2	6	1685331	1685336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143960
34115	NC_021213	ACC	3	9	1685396	1685404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143960
34116	NC_021213	CAA	2	6	1685527	1685532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143960
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34118	NC_021213	TGT	2	6	1685585	1685590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143960
34119	NC_021213	TGA	2	6	1685611	1685616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143960
34120	NC_021213	TGA	2	6	1685843	1685848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143960
34121	NC_021213	GATA	2	8	1685923	1685930	50 %	25 %	25 %	0 %	499143960
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34126	NC_021213	CTGG	2	8	1686205	1686212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34127	NC_021213	GCTT	2	8	1686219	1686226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34128	NC_021213	TAG	2	6	1686243	1686248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34133	NC_021213	AAT	2	6	1686340	1686345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34477	NC_021213	GTC	2	6	1702267	1702272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143978
34478	NC_021213	TCC	2	6	1702278	1702283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143978
34479	NC_021213	TAA	2	6	1702300	1702305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143978
34480	NC_021213	TTTA	2	8	1702316	1702323	25 %	75 %	0 %	0 %	499143978
34481	NC_021213	AT	3	6	1702350	1702355	50 %	50 %	0 %	0 %	499143978
34482	NC_021213	CTT	2	6	1702363	1702368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143978
34483	NC_021213	T	7	7	1702367	1702373	0 %	100 %	0 %	0 %	499143978
34484	NC_021213	TTC	2	6	1702442	1702447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143978
34485	NC_021213	TCA	2	6	1702530	1702535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143978
34486	NC_021213	T	6	6	1702537	1702542	0 %	100 %	0 %	0 %	499143978
34487	NC_021213	AATA	2	8	1702545	1702552	75 %	25 %	0 %	0 %	499143978
34488	NC_021213	TGT	2	6	1702565	1702570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143978
34489	NC_021213	TTA	2	6	1702587	1702592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143978
34490	NC_021213	TAT	2	6	1702648	1702653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143978
34491	NC_021213	GTT	2	6	1702662	1702667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143978
34492	NC_021213	ACT	2	6	1702763	1702768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143978
34493	NC_021213	AGT	2	6	1702790	1702795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143978
34494	NC_021213	A	6	6	1702801	1702806	100 %	0 %	0 %	0 %	499143978
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34496	NC_021213	ATAA	2	8	1702908	1702915	75 %	25 %	0 %	0 %	499143978
34497	NC_021213	A	6	6	1702914	1702919	100 %	0 %	0 %	0 %	499143978
34498	NC_021213	TTC	2	6	1702964	1702969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143978
34499	NC_021213	TA	3	6	1703009	1703014	50 %	50 %	0 %	0 %	499143978
34500	NC_021213	CATT	2	8	1703041	1703048	25 %	50 %	0 %	25 %	499143978

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