MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_021213	TTC	2	6	1630961	1630966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33002	NC_021213	A	6	6	1631004	1631009	100 %	0 %	0 %	0 %	499143905
33003	NC_021213	T	6	6	1631086	1631091	0 %	100 %	0 %	0 %	499143905
33004	NC_021213	TGCA	2	8	1631118	1631125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33005	NC_021213	ATT	2	6	1631147	1631152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33006	NC_021213	TAA	2	6	1631172	1631177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33007	NC_021213	A	6	6	1631213	1631218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33008	NC_021213	GAA	2	6	1631405	1631410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143906
33009	NC_021213	TGA	2	6	1631498	1631503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143906
33010	NC_021213	T	6	6	1631512	1631517	0 %	100 %	0 %	0 %	499143906
33011	NC_021213	AGATTT	2	12	1631531	1631542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	499143906
33012	NC_021213	TTG	2	6	1631617	1631622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143906
33013	NC_021213	ATA	2	6	1631699	1631704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143906
33014	NC_021213	AT	3	6	1631777	1631782	50 %	50 %	0 %	0 %	499143906
33015	NC_021213	A	6	6	1631846	1631851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33016	NC_021213	A	7	7	1631972	1631978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33017	NC_021213	T	7	7	1632030	1632036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33018	NC_021213	TGT	2	6	1632092	1632097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33019	NC_021213	AAG	2	6	1632176	1632181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143907
33020	NC_021213	T	6	6	1632236	1632241	0 %	100 %	0 %	0 %	499143907
33021	NC_021213	ACG	2	6	1632260	1632265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143907
33022	NC_021213	TTG	2	6	1632266	1632271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143907
33023	NC_021213	TG	3	6	1632277	1632282	0 %	50 %	50 %	0 %	499143907
33024	NC_021213	TAT	3	9	1632293	1632301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143907
33025	NC_021213	TCT	2	6	1632368	1632373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143907
33026	NC_021213	TCC	2	6	1632430	1632435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143908
33027	NC_021213	TTG	2	6	1632634	1632639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143908
33028	NC_021213	ACCA	2	8	1632778	1632785	50 %	0 %	0 %	50 %	499143908
33029	NC_021213	TAC	2	6	1632787	1632792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143908
33030	NC_021213	ATT	2	6	1632793	1632798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143908
33031	NC_021213	ACA	2	6	1632805	1632810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143908
33032	NC_021213	CTT	2	6	1632812	1632817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143908
33033	NC_021213	GAA	2	6	1632845	1632850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143908
33034	NC_021213	GTT	2	6	1632900	1632905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33035	NC_021213	GTCA	2	8	1633011	1633018	25 %	25 %	25 %	25 %	499143909
33036	NC_021213	CTT	3	9	1633055	1633063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143909
33037	NC_021213	AAT	2	6	1633077	1633082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143909
33038	NC_021213	TCC	2	6	1633115	1633120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143909
33039	NC_021213	AAT	2	6	1633176	1633181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143909
33040	NC_021213	ATA	2	6	1633188	1633193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143909
33041	NC_021213	A	6	6	1633238	1633243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33042	NC_021213	CAAA	2	8	1633255	1633262	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33043	NC_021213	CTT	2	6	1633301	1633306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33044	NC_021213	TGT	2	6	1633308	1633313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33045	NC_021213	GTG	2	6	1633333	1633338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33046	NC_021213	GAA	2	6	1633428	1633433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143910
33047	NC_021213	ACGC	2	8	1633509	1633516	25 %	0 %	25 %	50 %	499143910
33048	NC_021213	TCT	2	6	1633694	1633699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143910
33049	NC_021213	GTT	2	6	1633710	1633715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143910
33050	NC_021213	GACT	2	8	1633737	1633744	25 %	25 %	25 %	25 %	499143910
33051	NC_021213	AGCA	2	8	1633819	1633826	50 %	0 %	25 %	25 %	499143910
33052	NC_021213	GTG	2	6	1633830	1633835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143910
33053	NC_021213	CAT	2	6	1633836	1633841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143910
33054	NC_021213	TTTC	2	8	1633878	1633885	0 %	75 %	0 %	25 %	499143910
33055	NC_021213	AAT	2	6	1634007	1634012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143910
33056	NC_021213	CCA	2	6	1634050	1634055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143910
33057	NC_021213	GAC	2	6	1634063	1634068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143910
33058	NC_021213	AAC	2	6	1634070	1634075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143910
33059	NC_021213	TTG	2	6	1634104	1634109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143910
33060	NC_021213	TTC	2	6	1634112	1634117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143910
33061	NC_021213	ATG	2	6	1634143	1634148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143910
33062	NC_021213	TGT	2	6	1634246	1634251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143910
33063	NC_021213	ATG	2	6	1634372	1634377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33064	NC_021213	AGG	2	6	1634390	1634395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33065	NC_021213	CAT	2	6	1634484	1634489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143911
33066	NC_021213	TCCT	2	8	1634498	1634505	0 %	50 %	0 %	50 %	499143911
33067	NC_021213	ATG	2	6	1634585	1634590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143911
33068	NC_021213	T	6	6	1634602	1634607	0 %	100 %	0 %	0 %	499143911
33069	NC_021213	GTTG	2	8	1634621	1634628	0 %	50 %	50 %	0 %	499143911
33070	NC_021213	GTT	2	6	1634647	1634652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143911
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33072	NC_021213	C	6	6	1634793	1634798	0 %	0 %	0 %	100 %	499143911
33073	NC_021213	TCA	2	6	1634816	1634821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143911
33074	NC_021213	GTCT	2	8	1634932	1634939	0 %	50 %	25 %	25 %	499143911
33075	NC_021213	GGCA	2	8	1634978	1634985	25 %	0 %	50 %	25 %	499143911
33076	NC_021213	AAG	2	6	1635039	1635044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143911
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33078	NC_021213	TTC	2	6	1635070	1635075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143911
33079	NC_021213	A	6	6	1635182	1635187	100 %	0 %	0 %	0 %	499143911
33080	NC_021213	CCA	2	6	1635193	1635198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143911
33081	NC_021213	TCT	2	6	1635203	1635208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143911
33082	NC_021213	ATG	2	6	1635209	1635214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143911
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33084	NC_021213	GTG	2	6	1635298	1635303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143911
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33086	NC_021213	GGCA	2	8	1635437	1635444	25 %	0 %	50 %	25 %	499143911
33087	NC_021213	TTC	2	6	1635481	1635486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143911
33088	NC_021213	ATCT	2	8	1635496	1635503	25 %	50 %	0 %	25 %	499143911
33089	NC_021213	A	6	6	1635555	1635560	100 %	0 %	0 %	0 %	499143911
33090	NC_021213	AATA	2	8	1635573	1635580	75 %	25 %	0 %	0 %	499143911
33091	NC_021213	TAG	2	6	1635582	1635587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143911
33092	NC_021213	A	7	7	1635603	1635609	100 %	0 %	0 %	0 %	499143911
33093	NC_021213	CTTT	2	8	1635623	1635630	0 %	75 %	0 %	25 %	499143911
33094	NC_021213	ATT	2	6	1635642	1635647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143911
33095	NC_021213	TGG	2	6	1635655	1635660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143911
33096	NC_021213	AAGG	2	8	1635688	1635695	50 %	0 %	50 %	0 %	499143911
33097	NC_021213	CATA	2	8	1635699	1635706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33098	NC_021213	TGC	2	6	1635739	1635744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143912
33099	NC_021213	TGC	2	6	1635781	1635786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143912
33100	NC_021213	GAT	2	6	1635817	1635822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143912
33101	NC_021213	CTTT	2	8	1635941	1635948	0 %	75 %	0 %	25 %	499143912
33102	NC_021213	TCT	2	6	1635971	1635976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143912
33103	NC_021213	ACCA	2	8	1635982	1635989	50 %	0 %	0 %	50 %	499143912
33104	NC_021213	GCT	2	6	1636016	1636021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143912
33105	NC_021213	TGG	2	6	1636046	1636051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143912
33106	NC_021213	ATGG	2	8	1636057	1636064	25 %	25 %	50 %	0 %	499143912
33107	NC_021213	AGC	2	6	1636096	1636101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143912
33108	NC_021213	AGA	2	6	1636253	1636258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143912
33109	NC_021213	CGT	2	6	1636284	1636289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143912
33110	NC_021213	GTT	2	6	1636309	1636314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143912
33111	NC_021213	CGA	2	6	1636320	1636325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143912
33112	NC_021213	CAA	2	6	1636437	1636442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143912
33113	NC_021213	ATG	2	6	1636461	1636466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143912
33114	NC_021213	AAACC	2	10	1636470	1636479	60 %	0 %	0 %	40 %	499143912
33115	NC_021213	CCA	2	6	1636499	1636504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143912
33116	NC_021213	AGTG	2	8	1636513	1636520	25 %	25 %	50 %	0 %	499143912
33117	NC_021213	ATC	2	6	1636549	1636554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143912
33118	NC_021213	GAT	2	6	1636624	1636629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143912
33119	NC_021213	TGA	2	6	1636641	1636646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143912
33120	NC_021213	ACA	2	6	1636661	1636666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143912
33121	NC_021213	CCA	2	6	1636739	1636744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143912
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33124	NC_021213	CAC	2	6	1636965	1636970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143912
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33141	NC_021213	CTTT	2	8	1637540	1637547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33142	NC_021213	T	6	6	1637549	1637554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33143	NC_021213	ATCTT	2	10	1637669	1637678	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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33149	NC_021213	TGA	2	6	1637874	1637879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143913
33150	NC_021213	CTT	2	6	1637974	1637979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143913
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33205	NC_021213	CCA	2	6	1640676	1640681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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33230	NC_021213	TCC	2	6	1641819	1641824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143915
33231	NC_021213	T	6	6	1641829	1641834	0 %	100 %	0 %	0 %	499143915
33232	NC_021213	T	6	6	1641933	1641938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33233	NC_021213	T	6	6	1641977	1641982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33234	NC_021213	TCTT	2	8	1642012	1642019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33235	NC_021213	ATTT	2	8	1642057	1642064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33236	NC_021213	CAT	2	6	1642166	1642171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143916
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33354	NC_021213	GAG	2	6	1647139	1647144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143920
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33360	NC_021213	GCCTT	2	10	1647338	1647347	0 %	40 %	20 %	40 %	499143920
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33431	NC_021213	TA	3	6	1650778	1650783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33432	NC_021213	TGAC	2	8	1650810	1650817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33433	NC_021213	ATT	2	6	1650834	1650839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33450	NC_021213	AT	3	6	1652477	1652482	50 %	50 %	0 %	0 %	499143926
33451	NC_021213	GAC	2	6	1652513	1652518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33454	NC_021213	TTC	2	6	1652744	1652749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143927
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33459	NC_021213	T	6	6	1652968	1652973	0 %	100 %	0 %	0 %	499143927
33460	NC_021213	CAA	2	6	1653062	1653067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143927
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