MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_021213	T	7	7	1258437	1258443	0 %	100 %	0 %	0 %	499143516
25502	NC_021213	CTT	2	6	1258480	1258485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25503	NC_021213	TAC	2	6	1258556	1258561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143517
25504	NC_021213	CTT	2	6	1258732	1258737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143517
25505	NC_021213	GAA	2	6	1258813	1258818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143517
25506	NC_021213	AATC	2	8	1258850	1258857	50 %	25 %	0 %	25 %	499143517
25507	NC_021213	TCT	2	6	1259025	1259030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143517
25508	NC_021213	CTC	2	6	1259051	1259056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143517
25509	NC_021213	A	6	6	1259060	1259065	100 %	0 %	0 %	0 %	499143517
25510	NC_021213	CAAAGA	2	12	1259083	1259094	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	499143517
25511	NC_021213	AAT	2	6	1259111	1259116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143517
25512	NC_021213	ATC	2	6	1259138	1259143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143517
25513	NC_021213	AAAAT	2	10	1259208	1259217	80 %	20 %	0 %	0 %	499143517
25514	NC_021213	GAT	2	6	1259239	1259244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143517
25515	NC_021213	TAT	2	6	1259311	1259316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143517
25516	NC_021213	GCATC	2	10	1259377	1259386	20 %	20 %	20 %	40 %	499143517
25517	NC_021213	A	6	6	1259426	1259431	100 %	0 %	0 %	0 %	499143517
25518	NC_021213	AAGGCT	2	12	1259469	1259480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	499143517
25519	NC_021213	CAT	2	6	1259531	1259536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143517
25520	NC_021213	CAA	2	6	1259768	1259773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143517
25521	NC_021213	AAT	2	6	1259818	1259823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143517
25522	NC_021213	GTT	2	6	1259850	1259855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143517
25523	NC_021213	CAG	2	6	1259947	1259952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143517
25524	NC_021213	TCT	2	6	1259976	1259981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143517
25525	NC_021213	ATCT	2	8	1259984	1259991	25 %	50 %	0 %	25 %	499143517
25526	NC_021213	CTG	2	6	1260008	1260013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143517
25527	NC_021213	T	6	6	1260040	1260045	0 %	100 %	0 %	0 %	499143517
25528	NC_021213	CAT	2	6	1260115	1260120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143517
25529	NC_021213	TCA	2	6	1260177	1260182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143517
25530	NC_021213	TCA	2	6	1260184	1260189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143517
25531	NC_021213	CTG	2	6	1260196	1260201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143517
25532	NC_021213	TTG	2	6	1260236	1260241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143517
25533	NC_021213	GCA	2	6	1260447	1260452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143517
25534	NC_021213	AATATC	3	18	1260512	1260529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	499143517
25535	NC_021213	AGA	2	6	1260570	1260575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143517
25536	NC_021213	GTA	2	6	1260659	1260664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143517
25537	NC_021213	AAG	2	6	1260705	1260710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143517
25538	NC_021213	ATC	2	6	1260713	1260718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143517
25539	NC_021213	TGA	2	6	1260729	1260734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143517
25540	NC_021213	CTTCT	2	10	1260788	1260797	0 %	60 %	0 %	40 %	499143517
25541	NC_021213	TTC	2	6	1260824	1260829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143517
25542	NC_021213	CTAT	2	8	1260987	1260994	25 %	50 %	0 %	25 %	499143517
25543	NC_021213	A	7	7	1261070	1261076	100 %	0 %	0 %	0 %	499143517
25544	NC_021213	TTGC	2	8	1261099	1261106	0 %	50 %	25 %	25 %	499143517
25545	NC_021213	ATA	2	6	1261145	1261150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143517
25546	NC_021213	AAC	2	6	1261193	1261198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143517
25547	NC_021213	ATC	2	6	1261238	1261243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143517
25548	NC_021213	CAAT	2	8	1261306	1261313	50 %	25 %	0 %	25 %	499143517
25549	NC_021213	AGT	2	6	1261316	1261321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143517
25550	NC_021213	CTC	2	6	1261331	1261336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143517
25551	NC_021213	TCCAG	2	10	1261348	1261357	20 %	20 %	20 %	40 %	499143517
25552	NC_021213	AAT	2	6	1261367	1261372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143517
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25554	NC_021213	T	6	6	1261606	1261611	0 %	100 %	0 %	0 %	499143517
25555	NC_021213	TA	3	6	1261641	1261646	50 %	50 %	0 %	0 %	499143517
25556	NC_021213	TGT	2	6	1261650	1261655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25557	NC_021213	ATT	2	6	1261656	1261661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25558	NC_021213	ATA	2	6	1261722	1261727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25559	NC_021213	GC	3	6	1261861	1261866	0 %	0 %	50 %	50 %	499143518
25560	NC_021213	ACG	2	6	1262025	1262030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143518
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25562	NC_021213	ACA	2	6	1262102	1262107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143518
25563	NC_021213	TGG	2	6	1262123	1262128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143518
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25565	NC_021213	CTG	2	6	1262164	1262169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143518
25566	NC_021213	TATCT	2	10	1262308	1262317	20 %	60 %	0 %	20 %	499143519
25567	NC_021213	T	6	6	1262370	1262375	0 %	100 %	0 %	0 %	499143519
25568	NC_021213	TC	3	6	1262462	1262467	0 %	50 %	0 %	50 %	499143519
25569	NC_021213	TGA	2	6	1262503	1262508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143519
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25577	NC_021213	A	6	6	1262803	1262808	100 %	0 %	0 %	0 %	499143519
25578	NC_021213	CAG	2	6	1262879	1262884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25583	NC_021213	ATC	2	6	1263109	1263114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143520
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25585	NC_021213	TAG	2	6	1263203	1263208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143520
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25588	NC_021213	TCAG	2	8	1263275	1263282	25 %	25 %	25 %	25 %	499143520
25589	NC_021213	TAT	2	6	1263289	1263294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143520
25590	NC_021213	ATT	2	6	1263351	1263356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143520
25591	NC_021213	ATC	2	6	1263362	1263367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143520
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25593	NC_021213	TC	3	6	1263475	1263480	0 %	50 %	0 %	50 %	499143520
25594	NC_021213	TAC	2	6	1263529	1263534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143520
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25599	NC_021213	TTGA	2	8	1263698	1263705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25600	NC_021213	GTA	2	6	1263771	1263776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143521
25601	NC_021213	CA	3	6	1264013	1264018	50 %	0 %	0 %	50 %	499143521
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25605	NC_021213	ATTCGT	2	12	1264187	1264198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	499143521
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25610	NC_021213	TATCA	2	10	1264659	1264668	40 %	40 %	0 %	20 %	499143521
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25612	NC_021213	A	7	7	1264745	1264751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25613	NC_021213	TTC	2	6	1264768	1264773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25614	NC_021213	CACG	2	8	1264805	1264812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25615	NC_021213	AT	3	6	1264871	1264876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25616	NC_021213	TGG	2	6	1264882	1264887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25618	NC_021213	TTA	2	6	1265099	1265104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25620	NC_021213	T	6	6	1265130	1265135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25621	NC_021213	AAC	2	6	1265212	1265217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25623	NC_021213	T	6	6	1265254	1265259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25624	NC_021213	ATT	2	6	1265272	1265277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25626	NC_021213	GTAT	2	8	1265328	1265335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25627	NC_021213	A	6	6	1265346	1265351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25972	NC_021213	GCA	2	6	1282737	1282742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143539
25973	NC_021213	T	7	7	1282783	1282789	0 %	100 %	0 %	0 %	499143539
25974	NC_021213	TCA	2	6	1282800	1282805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143539
25975	NC_021213	CCG	2	6	1282867	1282872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499143539
25976	NC_021213	TTC	2	6	1282904	1282909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143539
25977	NC_021213	TCC	2	6	1282932	1282937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143539
25978	NC_021213	GA	3	6	1282971	1282976	50 %	0 %	50 %	0 %	499143539
25979	NC_021213	TCA	2	6	1283064	1283069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143539
25980	NC_021213	TAA	2	6	1283083	1283088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143539
25981	NC_021213	AGT	2	6	1283107	1283112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143539
25982	NC_021213	TA	3	6	1283141	1283146	50 %	50 %	0 %	0 %	499143539
25983	NC_021213	GTCG	2	8	1283154	1283161	0 %	25 %	50 %	25 %	499143539
25984	NC_021213	T	6	6	1283162	1283167	0 %	100 %	0 %	0 %	499143539
25985	NC_021213	TAT	2	6	1283177	1283182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143539
25986	NC_021213	T	6	6	1283204	1283209	0 %	100 %	0 %	0 %	499143539
25987	NC_021213	ATATA	2	10	1283239	1283248	60 %	40 %	0 %	0 %	499143539
25988	NC_021213	ATG	2	6	1283302	1283307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25989	NC_021213	TCA	2	6	1283308	1283313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25990	NC_021213	TCT	2	6	1283534	1283539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143540
25991	NC_021213	CTA	2	6	1283617	1283622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143540
25992	NC_021213	T	6	6	1283665	1283670	0 %	100 %	0 %	0 %	499143540
25993	NC_021213	A	6	6	1283682	1283687	100 %	0 %	0 %	0 %	499143540
25994	NC_021213	TC	3	6	1283691	1283696	0 %	50 %	0 %	50 %	499143540
25995	NC_021213	TTC	2	6	1283733	1283738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143540
25996	NC_021213	CTT	2	6	1283750	1283755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143540
25997	NC_021213	CTT	2	6	1283804	1283809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143540
25998	NC_021213	A	6	6	1283853	1283858	100 %	0 %	0 %	0 %	499143540
25999	NC_021213	TTTA	2	8	1283882	1283889	25 %	75 %	0 %	0 %	499143540
26000	NC_021213	CGA	2	6	1283928	1283933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143540

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