MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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20245	NC_021213	ACCGT	2	10	999828	999837	20 %	20 %	20 %	40 %	499143279
20246	NC_021213	GTTTC	2	10	999874	999883	0 %	60 %	20 %	20 %	499143279
20247	NC_021213	CAT	2	6	999913	999918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143279
20248	NC_021213	GCT	2	6	999981	999986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143279
20249	NC_021213	CCT	2	6	1000012	1000017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143279
20250	NC_021213	ATA	2	6	1000047	1000052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143279
20251	NC_021213	CAA	2	6	1000200	1000205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143280
20252	NC_021213	TTC	3	9	1000273	1000281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143280
20253	NC_021213	TGAC	2	8	1000303	1000310	25 %	25 %	25 %	25 %	499143280
20254	NC_021213	CAG	2	6	1000341	1000346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143280
20255	NC_021213	CTT	3	9	1000363	1000371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143280
20256	NC_021213	GTG	2	6	1000375	1000380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143280
20257	NC_021213	TGC	2	6	1000423	1000428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143280
20258	NC_021213	CAG	2	6	1000494	1000499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143280
20259	NC_021213	TTC	2	6	1000522	1000527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143280
20260	NC_021213	CTT	3	9	1000650	1000658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143280
20261	NC_021213	TTCTGT	2	12	1000687	1000698	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	499143280
20262	NC_021213	AAT	2	6	1000827	1000832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143280
20263	NC_021213	CTT	2	6	1000925	1000930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143281
20264	NC_021213	CTG	2	6	1000935	1000940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143281
20265	NC_021213	GGA	2	6	1001018	1001023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143281
20266	NC_021213	CTT	2	6	1001046	1001051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143281
20267	NC_021213	TCCG	2	8	1001053	1001060	0 %	25 %	25 %	50 %	499143281
20268	NC_021213	CAAG	2	8	1001132	1001139	50 %	0 %	25 %	25 %	499143281
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20270	NC_021213	TCA	2	6	1001185	1001190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143281
20271	NC_021213	ATG	2	6	1001194	1001199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143281
20272	NC_021213	CAT	2	6	1001292	1001297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143281
20273	NC_021213	TCA	2	6	1001356	1001361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143281
20274	NC_021213	TGA	2	6	1001400	1001405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143281
20275	NC_021213	GT	3	6	1001424	1001429	0 %	50 %	50 %	0 %	499143281
20276	NC_021213	TCT	2	6	1001461	1001466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143281
20277	NC_021213	T	6	6	1001519	1001524	0 %	100 %	0 %	0 %	499143281
20278	NC_021213	TCA	2	6	1001780	1001785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143282
20279	NC_021213	ATC	2	6	1001894	1001899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143282
20280	NC_021213	TCAA	2	8	1001927	1001934	50 %	25 %	0 %	25 %	499143282
20281	NC_021213	CTC	2	6	1002056	1002061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143282
20282	NC_021213	TAA	2	6	1002062	1002067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143282
20283	NC_021213	AAT	2	6	1002069	1002074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143282
20284	NC_021213	A	6	6	1002109	1002114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20285	NC_021213	TCAA	2	8	1002134	1002141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20286	NC_021213	ATT	2	6	1002143	1002148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20287	NC_021213	ACC	2	6	1002252	1002257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143283
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20290	NC_021213	CAG	2	6	1002350	1002355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143283
20291	NC_021213	TGA	2	6	1002380	1002385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143283
20292	NC_021213	CTT	2	6	1002428	1002433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143283
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20304	NC_021213	GAA	2	6	1002815	1002820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143283
20305	NC_021213	ACC	2	6	1002831	1002836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143283
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20307	NC_021213	GAT	2	6	1002874	1002879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143283
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20312	NC_021213	GCT	2	6	1003267	1003272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143283
20313	NC_021213	TTAA	2	8	1003318	1003325	50 %	50 %	0 %	0 %	499143283
20314	NC_021213	TTC	2	6	1003326	1003331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143283
20315	NC_021213	GTT	2	6	1003334	1003339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143283
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20317	NC_021213	GAT	2	6	1003416	1003421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143283
20318	NC_021213	CTG	2	6	1003427	1003432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143283
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20323	NC_021213	ACT	2	6	1003621	1003626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143283
20324	NC_021213	CAG	2	6	1003631	1003636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143283
20325	NC_021213	CTG	2	6	1003643	1003648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143283
20326	NC_021213	CTT	2	6	1003676	1003681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143283
20327	NC_021213	TCA	2	6	1003724	1003729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143283
20328	NC_021213	GT	3	6	1003761	1003766	0 %	50 %	50 %	0 %	499143283
20329	NC_021213	GAA	2	6	1003797	1003802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143283
20330	NC_021213	GTTG	2	8	1003810	1003817	0 %	50 %	50 %	0 %	499143283
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20337	NC_021213	ATC	2	6	1004156	1004161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143284
20338	NC_021213	GCAA	2	8	1004183	1004190	50 %	0 %	25 %	25 %	499143284
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20340	NC_021213	AGTA	2	8	1004311	1004318	50 %	25 %	25 %	0 %	499143284
20341	NC_021213	GCT	2	6	1004319	1004324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143284
20342	NC_021213	CAA	2	6	1004333	1004338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143284
20343	NC_021213	GTT	2	6	1004462	1004467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143284
20344	NC_021213	AAG	2	6	1004504	1004509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143284
20345	NC_021213	T	6	6	1004549	1004554	0 %	100 %	0 %	0 %	499143284
20346	NC_021213	TAT	2	6	1004572	1004577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143284
20347	NC_021213	TCT	2	6	1004628	1004633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143284
20348	NC_021213	CAAT	2	8	1004791	1004798	50 %	25 %	0 %	25 %	499143284
20349	NC_021213	TGA	2	6	1004806	1004811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143284
20350	NC_021213	CCG	2	6	1004898	1004903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499143284
20351	NC_021213	TCG	2	6	1004913	1004918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143284
20352	NC_021213	ACGA	2	8	1004960	1004967	50 %	0 %	25 %	25 %	499143284
20353	NC_021213	CAA	2	6	1005043	1005048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499143284
20354	NC_021213	CTTT	2	8	1005149	1005156	0 %	75 %	0 %	25 %	499143285
20355	NC_021213	CTT	2	6	1005189	1005194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143285
20356	NC_021213	ACC	2	6	1005325	1005330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143285
20357	NC_021213	GTG	2	6	1005373	1005378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143285
20358	NC_021213	CTG	2	6	1005409	1005414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143285
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20475	NC_021213	TA	3	6	1010796	1010801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20476	NC_021213	AT	3	6	1010814	1010819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20477	NC_021213	A	6	6	1010893	1010898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20478	NC_021213	A	7	7	1010936	1010942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20481	NC_021213	AAAT	2	8	1011034	1011041	75 %	25 %	0 %	0 %	499143291
20482	NC_021213	TGA	2	6	1011049	1011054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143291
20483	NC_021213	AGG	2	6	1011072	1011077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143291
20484	NC_021213	T	6	6	1011123	1011128	0 %	100 %	0 %	0 %	499143291
20485	NC_021213	GTG	2	6	1011138	1011143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143291
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