MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 41298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021213	GAA	2	6	841597	841602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_021213	TAA	2	6	841616	841621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143115
17003	NC_021213	GTG	2	6	841756	841761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143115
17004	NC_021213	TGAC	2	8	841818	841825	25 %	25 %	25 %	25 %	499143115
17005	NC_021213	TTG	2	6	841870	841875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143115
17006	NC_021213	ATAA	2	8	841892	841899	75 %	25 %	0 %	0 %	499143115
17007	NC_021213	CCA	2	6	841923	841928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143115
17008	NC_021213	AAG	2	6	841965	841970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143115
17009	NC_021213	GCGATA	2	12	841974	841985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	499143115
17010	NC_021213	TAA	2	6	842003	842008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143115
17011	NC_021213	GATAA	2	10	842073	842082	60 %	20 %	20 %	0 %	499143116
17012	NC_021213	AGT	2	6	842222	842227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143116
17013	NC_021213	TAA	2	6	842237	842242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143116
17014	NC_021213	AAG	2	6	842245	842250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143116
17015	NC_021213	TGAG	2	8	842251	842258	25 %	25 %	50 %	0 %	499143116
17016	NC_021213	GGT	2	6	842279	842284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143116
17017	NC_021213	AAAGCT	2	12	842331	842342	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	499143116
17018	NC_021213	CTG	2	6	842359	842364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143116
17019	NC_021213	ATG	2	6	842388	842393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143116
17020	NC_021213	A	7	7	842396	842402	100 %	0 %	0 %	0 %	499143116
17021	NC_021213	CTA	2	6	842410	842415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143116
17022	NC_021213	TGT	2	6	842457	842462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143116
17023	NC_021213	CTT	2	6	842488	842493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143116
17024	NC_021213	TTC	2	6	842504	842509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143116
17025	NC_021213	AGC	2	6	842624	842629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143116
17026	NC_021213	ATAA	2	8	842787	842794	75 %	25 %	0 %	0 %	499143116
17027	NC_021213	T	8	8	842855	842862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_021213	AG	3	6	842865	842870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17029	NC_021213	GTA	2	6	842898	842903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_021213	TCA	2	6	842912	842917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_021213	TGAT	2	8	842919	842926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_021213	AATC	2	8	842928	842935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17033	NC_021213	TTG	2	6	843148	843153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143117
17034	NC_021213	GAG	2	6	843154	843159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143117
17035	NC_021213	AG	3	6	843197	843202	50 %	0 %	50 %	0 %	499143117
17036	NC_021213	CAC	2	6	843262	843267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499143117
17037	NC_021213	GAG	2	6	843307	843312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143117
17038	NC_021213	ATTG	2	8	843345	843352	25 %	50 %	25 %	0 %	499143117
17039	NC_021213	TA	3	6	843369	843374	50 %	50 %	0 %	0 %	499143117
17040	NC_021213	T	6	6	843376	843381	0 %	100 %	0 %	0 %	499143117
17041	NC_021213	GAG	2	6	843384	843389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143117
17042	NC_021213	CTAG	2	8	843416	843423	25 %	25 %	25 %	25 %	499143117
17043	NC_021213	TA	3	6	843444	843449	50 %	50 %	0 %	0 %	499143118
17044	NC_021213	CTA	2	6	843486	843491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143118
17045	NC_021213	GAAG	2	8	843511	843518	50 %	0 %	50 %	0 %	499143118
17046	NC_021213	TTG	2	6	843575	843580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143118
17047	NC_021213	TGC	2	6	843652	843657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143118
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17049	NC_021213	ATC	2	6	843692	843697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143118
17050	NC_021213	TGT	2	6	843741	843746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499143118
17051	NC_021213	GAG	2	6	843773	843778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143118
17052	NC_021213	ATT	2	6	843881	843886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143119
17053	NC_021213	TTTTG	2	10	843914	843923	0 %	80 %	20 %	0 %	499143119
17054	NC_021213	CTTC	2	8	843972	843979	0 %	50 %	0 %	50 %	499143119
17055	NC_021213	TTA	2	6	844060	844065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143119
17056	NC_021213	TGAT	2	8	844074	844081	25 %	50 %	25 %	0 %	499143119
17057	NC_021213	TCAA	2	8	844134	844141	50 %	25 %	0 %	25 %	499143119
17058	NC_021213	TCT	2	6	844152	844157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143119
17059	NC_021213	GTA	2	6	844268	844273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143119
17060	NC_021213	CAT	2	6	844321	844326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143119
17061	NC_021213	GAG	2	6	844388	844393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143119
17062	NC_021213	TAG	2	6	844419	844424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143119
17063	NC_021213	GCCA	2	8	844559	844566	25 %	0 %	25 %	50 %	499143119
17064	NC_021213	ATA	2	6	844644	844649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143119
17065	NC_021213	CCT	2	6	844651	844656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499143119
17066	NC_021213	TCTT	2	8	844664	844671	0 %	75 %	0 %	25 %	499143119
17067	NC_021213	AAG	2	6	844693	844698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143120
17068	NC_021213	TAC	2	6	844727	844732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143120
17069	NC_021213	AGG	2	6	844777	844782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143120
17070	NC_021213	GAG	2	6	844845	844850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499143120
17071	NC_021213	GAT	2	6	844890	844895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143120
17072	NC_021213	TGA	2	6	844907	844912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143120
17073	NC_021213	GAT	2	6	844926	844931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143120
17074	NC_021213	GGC	2	6	844953	844958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499143120
17075	NC_021213	AG	3	6	844965	844970	50 %	0 %	50 %	0 %	499143120
17076	NC_021213	TCT	2	6	845015	845020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143120
17077	NC_021213	GCT	2	6	845053	845058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143120
17078	NC_021213	AGT	2	6	845126	845131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143120
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17081	NC_021213	AAT	2	6	845192	845197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499143120
17082	NC_021213	CAG	2	6	845296	845301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143121
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17084	NC_021213	AGCC	2	8	845362	845369	25 %	0 %	25 %	50 %	499143121
17085	NC_021213	T	6	6	845378	845383	0 %	100 %	0 %	0 %	499143121
17086	NC_021213	GTA	2	6	845516	845521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143121
17087	NC_021213	CTTTAT	2	12	845535	845546	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	499143121
17088	NC_021213	ATT	2	6	845550	845555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499143121
17089	NC_021213	TA	4	8	845557	845564	50 %	50 %	0 %	0 %	499143121
17090	NC_021213	TA	3	6	845568	845573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_021213	TA	3	6	845600	845605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_021213	TA	3	6	845613	845618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_021213	TCA	2	6	845619	845624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17094	NC_021213	ATGA	2	8	845655	845662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_021213	ATT	2	6	845669	845674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_021213	TGA	2	6	845776	845781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143122
17097	NC_021213	TC	3	6	845799	845804	0 %	50 %	0 %	50 %	499143122
17098	NC_021213	CCTTC	2	10	845846	845855	0 %	40 %	0 %	60 %	499143122
17099	NC_021213	T	7	7	845878	845884	0 %	100 %	0 %	0 %	499143122
17100	NC_021213	TGG	2	6	845890	845895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499143122
17101	NC_021213	AAG	2	6	845910	845915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499143122
17102	NC_021213	T	7	7	845996	846002	0 %	100 %	0 %	0 %	499143122
17103	NC_021213	CTA	2	6	846015	846020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143122
17104	NC_021213	TAG	2	6	846157	846162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143122
17105	NC_021213	TCTA	2	8	846163	846170	25 %	50 %	0 %	25 %	499143122
17106	NC_021213	T	6	6	846254	846259	0 %	100 %	0 %	0 %	499143122
17107	NC_021213	CTTG	2	8	846281	846288	0 %	50 %	25 %	25 %	499143122
17108	NC_021213	GAAA	2	8	846305	846312	75 %	0 %	25 %	0 %	499143122
17109	NC_021213	TCT	2	6	846329	846334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143122
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17111	NC_021213	TTAT	2	8	846373	846380	25 %	75 %	0 %	0 %	499143122
17112	NC_021213	TCT	2	6	846383	846388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143122
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17114	NC_021213	TC	3	6	846433	846438	0 %	50 %	0 %	50 %	499143122
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17118	NC_021213	A	6	6	846568	846573	100 %	0 %	0 %	0 %	499143122
17119	NC_021213	CAT	2	6	846646	846651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143123
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17245	NC_021213	CCG	2	6	852569	852574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499143131
17246	NC_021213	CAGA	2	8	852594	852601	50 %	0 %	25 %	25 %	499143131
17247	NC_021213	TCT	2	6	852697	852702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499143131
17248	NC_021213	CAT	2	6	852707	852712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499143131
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17252	NC_021213	CTG	2	6	852903	852908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499143131
17253	NC_021213	GAC	2	6	852924	852929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143131
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17255	NC_021213	AGCAG	2	10	853026	853035	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17256	NC_021213	CAGC	2	8	853057	853064	25 %	0 %	25 %	50 %	499143132
17257	NC_021213	CAG	2	6	853075	853080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499143132
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17259	NC_021213	TTAT	2	8	853182	853189	25 %	75 %	0 %	0 %	499143132
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17266	NC_021213	A	7	7	853648	853654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17267	NC_021213	ATG	2	6	853674	853679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499143133
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