MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021176	CTG	2	6	746705	746710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653210
16002	NC_021176	GC	3	6	746720	746725	0 %	0 %	50 %	50 %	488653210
16003	NC_021176	TGG	2	6	746732	746737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653210
16004	NC_021176	TCA	2	6	746746	746751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653210
16005	NC_021176	CAGTA	2	10	746773	746782	40 %	20 %	20 %	20 %	488653210
16006	NC_021176	CGG	2	6	746808	746813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653210
16007	NC_021176	GGC	2	6	746850	746855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653210
16008	NC_021176	ATG	2	6	746856	746861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653210
16009	NC_021176	GCT	2	6	746870	746875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653210
16010	NC_021176	GCC	2	6	746880	746885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653210
16011	NC_021176	TTC	2	6	746957	746962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_021176	ATA	2	6	746963	746968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_021176	ATT	2	6	746972	746977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_021176	TCA	2	6	747024	747029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_021176	CAA	2	6	747118	747123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_021176	AAT	2	6	747166	747171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_021176	AAG	2	6	747261	747266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653211
16018	NC_021176	CGC	2	6	747309	747314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653211
16019	NC_021176	CGC	2	6	747432	747437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653211
16020	NC_021176	AAAAT	2	10	747516	747525	80 %	20 %	0 %	0 %	488653211
16021	NC_021176	TTC	2	6	747674	747679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653211
16022	NC_021176	CAA	2	6	747713	747718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653211
16023	NC_021176	AAT	2	6	747752	747757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653211
16024	NC_021176	GC	3	6	747797	747802	0 %	0 %	50 %	50 %	488653211
16025	NC_021176	ACG	4	12	747827	747838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653211
16026	NC_021176	CCAG	2	8	747861	747868	25 %	0 %	25 %	50 %	488653211
16027	NC_021176	CAT	2	6	747902	747907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653211
16028	NC_021176	CTT	2	6	747985	747990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653212
16029	NC_021176	GGC	2	6	748017	748022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653212
16030	NC_021176	GTT	3	9	748125	748133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653212
16031	NC_021176	TGC	2	6	748151	748156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653212
16032	NC_021176	CTG	2	6	748249	748254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653212
16033	NC_021176	ACGCG	2	10	748293	748302	20 %	0 %	40 %	40 %	488653212
16034	NC_021176	TAC	2	6	748361	748366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653212
16035	NC_021176	TGC	2	6	748367	748372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653212
16036	NC_021176	CGG	2	6	748458	748463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653212
16037	NC_021176	GC	3	6	748520	748525	0 %	0 %	50 %	50 %	488653212
16038	NC_021176	TGGC	2	8	748530	748537	0 %	25 %	50 %	25 %	488653212
16039	NC_021176	CTG	2	6	748555	748560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653212
16040	NC_021176	GGCT	2	8	748582	748589	0 %	25 %	50 %	25 %	488653212
16041	NC_021176	CTG	2	6	748633	748638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653212
16042	NC_021176	CCTG	2	8	748662	748669	0 %	25 %	25 %	50 %	488653212
16043	NC_021176	GGC	2	6	748685	748690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653212
16044	NC_021176	CTT	2	6	748716	748721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653212
16045	NC_021176	CG	3	6	748733	748738	0 %	0 %	50 %	50 %	488653212
16046	NC_021176	GC	3	6	748745	748750	0 %	0 %	50 %	50 %	488653212
16047	NC_021176	ATT	2	6	748859	748864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653212
16048	NC_021176	TGC	2	6	748865	748870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653212
16049	NC_021176	ATC	2	6	748876	748881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653212
16050	NC_021176	TTAT	2	8	748909	748916	25 %	75 %	0 %	0 %	488653212
16051	NC_021176	GC	3	6	749046	749051	0 %	0 %	50 %	50 %	488653212
16052	NC_021176	CATT	2	8	749083	749090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16053	NC_021176	GCC	2	6	749164	749169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16054	NC_021176	GC	3	6	749241	749246	0 %	0 %	50 %	50 %	488653213
16055	NC_021176	CTG	2	6	749343	749348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653213
16056	NC_021176	AATGCG	2	12	749361	749372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488653213
16057	NC_021176	CGT	2	6	749408	749413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653213
16058	NC_021176	GCA	3	9	749474	749482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653213
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16060	NC_021176	TGTC	2	8	749684	749691	0 %	50 %	25 %	25 %	488653213
16061	NC_021176	GCG	2	6	749704	749709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653213
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16064	NC_021176	TGC	2	6	749840	749845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653213
16065	NC_021176	GCG	2	6	749887	749892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653213
16066	NC_021176	CGG	2	6	749935	749940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653213
16067	NC_021176	GC	3	6	749971	749976	0 %	0 %	50 %	50 %	488653213
16068	NC_021176	TCTG	2	8	750017	750024	0 %	50 %	25 %	25 %	488653213
16069	NC_021176	GAT	2	6	750036	750041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653213
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16071	NC_021176	TTA	2	6	750290	750295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_021176	ATG	2	6	750310	750315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_021176	AGTT	2	8	750349	750356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_021176	CGC	2	6	750519	750524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_021176	AGC	2	6	750526	750531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16078	NC_021176	TGG	2	6	750632	750637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_021176	T	7	7	750700	750706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_021176	ATA	2	6	750721	750726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_021176	AAG	2	6	750747	750752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653214
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16083	NC_021176	GTG	2	6	750864	750869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653214
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16086	NC_021176	GC	3	6	751047	751052	0 %	0 %	50 %	50 %	488653214
16087	NC_021176	GGT	2	6	751067	751072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653214
16088	NC_021176	TAT	2	6	751125	751130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653214
16089	NC_021176	GACT	2	8	751136	751143	25 %	25 %	25 %	25 %	488653214
16090	NC_021176	CTG	2	6	751242	751247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653214
16091	NC_021176	ACG	2	6	751284	751289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653214
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16093	NC_021176	GATG	2	8	751382	751389	25 %	25 %	50 %	0 %	488653214
16094	NC_021176	GGT	2	6	751424	751429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653214
16095	NC_021176	CGATG	2	10	751442	751451	20 %	20 %	40 %	20 %	488653214
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16098	NC_021176	CGGTA	2	10	751562	751571	20 %	20 %	40 %	20 %	488653214
16099	NC_021176	CAA	2	6	751583	751588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653214
16100	NC_021176	TTG	2	6	751763	751768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_021176	GCA	2	6	751877	751882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_021176	TC	3	6	751886	751891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16103	NC_021176	CGT	2	6	751892	751897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_021176	TTG	2	6	751909	751914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_021176	ATT	2	6	752034	752039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_021176	GCA	2	6	752075	752080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_021176	AAG	2	6	752096	752101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_021176	AAG	2	6	752120	752125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_021176	CCA	2	6	752216	752221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16110	NC_021176	TGA	2	6	752274	752279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_021176	CG	5	10	752300	752309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16112	NC_021176	GAT	2	6	752338	752343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_021176	TTA	2	6	752382	752387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_021176	ATC	2	6	752427	752432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_021176	ATT	2	6	752441	752446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_021176	GAA	2	6	752498	752503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_021176	TGGATA	2	12	752577	752588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_021176	GAT	2	6	752599	752604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_021176	TCG	2	6	752784	752789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_021176	GTC	2	6	752815	752820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_021176	TAA	2	6	752851	752856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_021176	CGAA	2	8	752865	752872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16123	NC_021176	CGT	2	6	752909	752914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16124	NC_021176	CG	3	6	753071	753076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16125	NC_021176	CGG	2	6	753094	753099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_021176	A	6	6	753230	753235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_021176	ATC	2	6	753245	753250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16129	NC_021176	TGA	2	6	753303	753308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16131	NC_021176	CTT	2	6	753375	753380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16132	NC_021176	CGT	2	6	753463	753468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653215
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16239	NC_021176	GAGAG	2	10	758249	758258	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16240	NC_021176	GCG	2	6	758356	758361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653219
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16493	NC_021176	CGC	2	6	769953	769958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653229
16494	NC_021176	GAGG	2	8	769981	769988	25 %	0 %	75 %	0 %	488653229
16495	NC_021176	CGC	2	6	770024	770029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653229
16496	NC_021176	G	6	6	770070	770075	0 %	0 %	100 %	0 %	488653229
16497	NC_021176	CAT	2	6	770110	770115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653229
16498	NC_021176	ATGA	2	8	770158	770165	50 %	25 %	25 %	0 %	488653229
16499	NC_021176	AGCC	2	8	770241	770248	25 %	0 %	25 %	50 %	488653229
16500	NC_021176	TCG	2	6	770249	770254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653229

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