MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021176	CAGCG	2	10	677948	677957	20 %	0 %	40 %	40 %	488653143
14502	NC_021176	GCC	2	6	677970	677975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653143
14503	NC_021176	CAT	2	6	677995	678000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653143
14504	NC_021176	ATA	2	6	678026	678031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653143
14505	NC_021176	CCG	2	6	678063	678068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653143
14506	NC_021176	GCT	2	6	678100	678105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14507	NC_021176	GTA	2	6	678118	678123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653143
14508	NC_021176	TCA	2	6	678198	678203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653143
14509	NC_021176	AAGC	2	8	678212	678219	50 %	0 %	25 %	25 %	488653143
14510	NC_021176	GCA	2	6	678328	678333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14511	NC_021176	CG	3	6	678338	678343	0 %	0 %	50 %	50 %	488653143
14512	NC_021176	CGT	2	6	678379	678384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14513	NC_021176	CAG	2	6	678386	678391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14514	NC_021176	GC	3	6	678500	678505	0 %	0 %	50 %	50 %	488653143
14515	NC_021176	TCAT	2	8	678567	678574	25 %	50 %	0 %	25 %	488653143
14516	NC_021176	GTC	2	6	678702	678707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14517	NC_021176	CAG	2	6	678728	678733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14518	NC_021176	TTA	2	6	678792	678797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653143
14519	NC_021176	CAG	2	6	678800	678805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14520	NC_021176	GCA	2	6	678832	678837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14521	NC_021176	GTG	2	6	678990	678995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653143
14522	NC_021176	GGC	2	6	679064	679069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653143
14523	NC_021176	CTG	2	6	679076	679081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14524	NC_021176	TTC	2	6	679083	679088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653143
14525	NC_021176	CTT	2	6	679115	679120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653143
14526	NC_021176	AAT	2	6	679151	679156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653143
14527	NC_021176	TGCG	2	8	679164	679171	0 %	25 %	50 %	25 %	488653143
14528	NC_021176	G	6	6	679171	679176	0 %	0 %	100 %	0 %	488653143
14529	NC_021176	TTA	2	6	679215	679220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653143
14530	NC_021176	TGC	2	6	679245	679250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14531	NC_021176	GAT	2	6	679294	679299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653143
14532	NC_021176	CAG	2	6	679349	679354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14533	NC_021176	GCA	2	6	679363	679368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14534	NC_021176	ATT	2	6	679412	679417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653143
14535	NC_021176	CGC	2	6	679418	679423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653143
14536	NC_021176	TGA	2	6	679458	679463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653143
14537	NC_021176	AACGCC	2	12	679485	679496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	488653143
14538	NC_021176	AGC	2	6	679497	679502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14539	NC_021176	CAG	2	6	679511	679516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14540	NC_021176	GCA	2	6	679522	679527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14541	NC_021176	GAG	2	6	679608	679613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488653143
14542	NC_021176	CGT	2	6	679682	679687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14543	NC_021176	CGG	2	6	679733	679738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653143
14544	NC_021176	CCA	2	6	679768	679773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488653143
14545	NC_021176	GCCAG	2	10	679834	679843	20 %	0 %	40 %	40 %	488653143
14546	NC_021176	GAG	2	6	679854	679859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488653143
14547	NC_021176	CTG	2	6	679889	679894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14548	NC_021176	CGG	2	6	679908	679913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653143
14549	NC_021176	CGA	2	6	679918	679923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14550	NC_021176	AG	3	6	679955	679960	50 %	0 %	50 %	0 %	488653143
14551	NC_021176	GGTAG	2	10	679971	679980	20 %	20 %	60 %	0 %	488653143
14552	NC_021176	ATA	2	6	680153	680158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653143
14553	NC_021176	TGT	2	6	680224	680229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653143
14554	NC_021176	GTGA	2	8	680282	680289	25 %	25 %	50 %	0 %	488653143
14555	NC_021176	CAG	2	6	680363	680368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653143
14556	NC_021176	AAG	2	6	680385	680390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_021176	GACT	2	8	680445	680452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14558	NC_021176	TGAAGG	2	12	680484	680495	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_021176	AATG	2	8	680510	680517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_021176	CGG	2	6	680566	680571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_021176	ACT	2	6	680617	680622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_021176	ATT	2	6	680652	680657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_021176	GT	3	6	680740	680745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_021176	A	7	7	680758	680764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_021176	TAA	2	6	680824	680829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_021176	ATG	2	6	680839	680844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_021176	TCA	2	6	680906	680911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_021176	AT	3	6	680943	680948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_021176	A	6	6	680988	680993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_021176	TA	3	6	681023	681028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_021176	ATT	2	6	681074	681079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_021176	A	6	6	681145	681150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_021176	TAA	2	6	681176	681181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_021176	CCT	2	6	681203	681208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488653144
14575	NC_021176	CTG	2	6	681219	681224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653144
14576	NC_021176	GGCG	2	8	681227	681234	0 %	0 %	75 %	25 %	488653144
14577	NC_021176	CAA	2	6	681269	681274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653144
14578	NC_021176	ACT	2	6	681307	681312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653144
14579	NC_021176	GAC	2	6	681318	681323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653144
14580	NC_021176	GCA	2	6	681445	681450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653144
14581	NC_021176	CCT	2	6	681547	681552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488653144
14582	NC_021176	CGG	2	6	681575	681580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653144
14583	NC_021176	GCA	2	6	681608	681613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653144
14584	NC_021176	CTAC	2	8	681631	681638	25 %	25 %	0 %	50 %	488653144
14585	NC_021176	CTT	2	6	681650	681655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653144
14586	NC_021176	TGG	2	6	681661	681666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653144
14587	NC_021176	CTG	2	6	681741	681746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653144
14588	NC_021176	CGG	2	6	681767	681772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653144
14589	NC_021176	CAC	2	6	681821	681826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488653144
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14591	NC_021176	CGG	2	6	681905	681910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653144
14592	NC_021176	AAC	2	6	681927	681932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653144
14593	NC_021176	ATCT	2	8	681933	681940	25 %	50 %	0 %	25 %	488653144
14594	NC_021176	GCA	2	6	681994	681999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653144
14595	NC_021176	CAA	2	6	682025	682030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653144
14596	NC_021176	CGTC	2	8	682080	682087	0 %	25 %	25 %	50 %	488653144
14597	NC_021176	TAC	2	6	682188	682193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653144
14598	NC_021176	CAA	2	6	682196	682201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653144
14599	NC_021176	CTG	2	6	682236	682241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653144
14600	NC_021176	CGA	2	6	682280	682285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653144
14601	NC_021176	T	6	6	682355	682360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_021176	ACG	2	6	682385	682390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14603	NC_021176	GT	3	6	682458	682463	0 %	50 %	50 %	0 %	488653145
14604	NC_021176	T	6	6	682475	682480	0 %	100 %	0 %	0 %	488653145
14605	NC_021176	ACA	2	6	682512	682517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653145
14606	NC_021176	TGGT	2	8	682579	682586	0 %	50 %	50 %	0 %	488653145
14607	NC_021176	TGA	2	6	682643	682648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653145
14608	NC_021176	GACG	2	8	682778	682785	25 %	0 %	50 %	25 %	488653145
14609	NC_021176	TC	3	6	682976	682981	0 %	50 %	0 %	50 %	488653145
14610	NC_021176	GCG	2	6	683001	683006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653145
14611	NC_021176	ATC	2	6	683008	683013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653145
14612	NC_021176	AGG	2	6	683032	683037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488653145
14613	NC_021176	GCG	2	6	683065	683070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653145
14614	NC_021176	CCGA	2	8	683130	683137	25 %	0 %	25 %	50 %	488653145
14615	NC_021176	GGCAT	2	10	683176	683185	20 %	20 %	40 %	20 %	488653145
14616	NC_021176	GCG	2	6	683381	683386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653145
14617	NC_021176	AAG	2	6	683416	683421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653145
14618	NC_021176	CGC	2	6	683446	683451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653145
14619	NC_021176	AC	3	6	683524	683529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14620	NC_021176	AAGC	2	8	683537	683544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14621	NC_021176	ATG	2	6	683567	683572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653146
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14743	NC_021176	TGG	2	6	689024	689029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653152
14744	NC_021176	GCA	2	6	689034	689039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653152
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14859	NC_021176	CGA	2	6	694546	694551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653158
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14864	NC_021176	CCA	2	6	694645	694650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488653158
14865	NC_021176	CCG	2	6	694678	694683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653158
14866	NC_021176	CGG	2	6	694696	694701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653158
14867	NC_021176	G	7	7	694700	694706	0 %	0 %	100 %	0 %	488653158
14868	NC_021176	TCT	2	6	694727	694732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653159
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14883	NC_021176	GCT	3	9	695058	695066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653159
14884	NC_021176	GCT	3	9	695106	695114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653159
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14891	NC_021176	GCT	2	6	695304	695309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653159
14892	NC_021176	CGG	2	6	695345	695350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653159
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14895	NC_021176	GAC	2	6	695418	695423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14974	NC_021176	CGG	2	6	697812	697817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653163
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14981	NC_021176	TGG	2	6	697934	697939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653163
14982	NC_021176	TGC	2	6	697940	697945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653163
14983	NC_021176	CTG	2	6	697954	697959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653163
14984	NC_021176	GCTGGG	2	12	697977	697988	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	488653163
14985	NC_021176	CTG	3	9	698053	698061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653163
14986	NC_021176	CTG	2	6	698116	698121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653163
14987	NC_021176	GCT	2	6	698169	698174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653163
14988	NC_021176	ATC	2	6	698185	698190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653163
14989	NC_021176	CGG	2	6	698198	698203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653163
14990	NC_021176	GATGGC	2	12	698208	698219	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	488653163
14991	NC_021176	CTG	2	6	698220	698225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653163
14992	NC_021176	CT	3	6	698283	698288	0 %	50 %	0 %	50 %	488653163
14993	NC_021176	TGG	2	6	698303	698308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653163
14994	NC_021176	GCGG	2	8	698388	698395	0 %	0 %	75 %	25 %	488653163
14995	NC_021176	CGG	2	6	698469	698474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653163
14996	NC_021176	TGC	2	6	698519	698524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653163
14997	NC_021176	ACA	2	6	698543	698548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653163
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14999	NC_021176	GGC	2	6	698571	698576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653163
15000	NC_021176	CGG	2	6	698583	698588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653163

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