MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

< Previous12...2425262728293031323334...201202Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021176	AGC	2	6	654628	654633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653127
14002	NC_021176	TTC	2	6	654642	654647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653127
14003	NC_021176	CG	3	6	654661	654666	0 %	0 %	50 %	50 %	488653127
14004	NC_021176	CG	3	6	654675	654680	0 %	0 %	50 %	50 %	488653127
14005	NC_021176	CGA	2	6	654812	654817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653127
14006	NC_021176	GCG	2	6	654893	654898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653127
14007	NC_021176	CTG	2	6	654915	654920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653127
14008	NC_021176	GC	3	6	654938	654943	0 %	0 %	50 %	50 %	488653127
14009	NC_021176	GC	3	6	654995	655000	0 %	0 %	50 %	50 %	488653127
14010	NC_021176	GGC	2	6	655031	655036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653127
14011	NC_021176	CGG	2	6	655052	655057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653127
14012	NC_021176	GGA	2	6	655113	655118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488653127
14013	NC_021176	GC	3	6	655127	655132	0 %	0 %	50 %	50 %	488653127
14014	NC_021176	TGC	2	6	655168	655173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653127
14015	NC_021176	CCG	2	6	655207	655212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653127
14016	NC_021176	ATA	2	6	655216	655221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653127
14017	NC_021176	AG	3	6	655360	655365	50 %	0 %	50 %	0 %	488653128
14018	NC_021176	GTC	2	6	655388	655393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653128
14019	NC_021176	CG	3	6	655420	655425	0 %	0 %	50 %	50 %	488653128
14020	NC_021176	CAG	2	6	655486	655491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653128
14021	NC_021176	CCG	2	6	655533	655538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653128
14022	NC_021176	GGC	2	6	655575	655580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653128
14023	NC_021176	CCG	2	6	655623	655628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653128
14024	NC_021176	GCG	2	6	655638	655643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653128
14025	NC_021176	CCG	2	6	655710	655715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653128
14026	NC_021176	GTCG	2	8	655756	655763	0 %	25 %	50 %	25 %	488653128
14027	NC_021176	GGTAAT	2	12	655804	655815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653128
14028	NC_021176	AAC	2	6	655850	655855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653128
14029	NC_021176	CCA	2	6	655902	655907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488653128
14030	NC_021176	GCGG	2	8	655908	655915	0 %	0 %	75 %	25 %	488653128
14031	NC_021176	CG	3	6	655927	655932	0 %	0 %	50 %	50 %	488653128
14032	NC_021176	GCA	2	6	655980	655985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653128
14033	NC_021176	GGT	2	6	656050	656055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653128
14034	NC_021176	ACC	3	9	656240	656248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488653128
14035	NC_021176	CGC	2	6	656298	656303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653128
14036	NC_021176	GGC	2	6	656389	656394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653128
14037	NC_021176	GAT	2	6	656470	656475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653128
14038	NC_021176	CTG	2	6	656482	656487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653128
14039	NC_021176	TGCC	2	8	656511	656518	0 %	25 %	25 %	50 %	488653128
14040	NC_021176	TAA	2	6	656574	656579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653128
14041	NC_021176	GGCG	2	8	656607	656614	0 %	0 %	75 %	25 %	488653128
14042	NC_021176	CG	4	8	656649	656656	0 %	0 %	50 %	50 %	488653128
14043	NC_021176	GCA	2	6	656694	656699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653128
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14045	NC_021176	GC	3	6	656772	656777	0 %	0 %	50 %	50 %	488653128
14046	NC_021176	CTTG	2	8	656831	656838	0 %	50 %	25 %	25 %	488653128
14047	NC_021176	T	6	6	656876	656881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_021176	CG	3	6	656920	656925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14049	NC_021176	AGC	2	6	657019	657024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_021176	GTT	2	6	657028	657033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_021176	GAAC	2	8	657035	657042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14052	NC_021176	TAAA	2	8	657058	657065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_021176	GC	3	6	657122	657127	0 %	0 %	50 %	50 %	488653129
14054	NC_021176	GCG	2	6	657134	657139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653129
14055	NC_021176	TAT	2	6	657209	657214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653129
14056	NC_021176	CG	3	6	657363	657368	0 %	0 %	50 %	50 %	488653129
14057	NC_021176	GCA	2	6	657398	657403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653129
14058	NC_021176	TGT	2	6	657408	657413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653129
14059	NC_021176	TGT	2	6	657465	657470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653129
14060	NC_021176	CGT	2	6	657504	657509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653129
14061	NC_021176	TGG	2	6	657530	657535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653129
14062	NC_021176	GCG	2	6	657549	657554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653129
14063	NC_021176	CGG	3	9	657589	657597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653129
14064	NC_021176	CTG	2	6	657608	657613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653129
14065	NC_021176	CTG	2	6	657617	657622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653129
14066	NC_021176	GCG	2	6	657650	657655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653129
14067	NC_021176	TGG	2	6	657684	657689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653129
14068	NC_021176	ATG	2	6	657707	657712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653129
14069	NC_021176	CGC	2	6	657720	657725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653129
14070	NC_021176	GCC	2	6	657739	657744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653129
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14072	NC_021176	GTAC	2	8	657829	657836	25 %	25 %	25 %	25 %	488653129
14073	NC_021176	TATCGC	2	12	657859	657870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488653129
14074	NC_021176	CTG	2	6	657887	657892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653129
14075	NC_021176	ACCT	2	8	657920	657927	25 %	25 %	0 %	50 %	488653129
14076	NC_021176	AAG	2	6	657930	657935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653129
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14079	NC_021176	GGCA	2	8	658117	658124	25 %	0 %	50 %	25 %	488653129
14080	NC_021176	ATC	2	6	658154	658159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653129
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14085	NC_021176	GGC	2	6	658331	658336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653129
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14087	NC_021176	CTG	2	6	658376	658381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653129
14088	NC_021176	TGA	2	6	658389	658394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653129
14089	NC_021176	CAT	2	6	658409	658414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653129
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14091	NC_021176	GCG	2	6	658513	658518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653130
14092	NC_021176	GGC	2	6	658523	658528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653130
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14094	NC_021176	TGA	2	6	658642	658647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653130
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14098	NC_021176	A	6	6	658821	658826	100 %	0 %	0 %	0 %	488653130
14099	NC_021176	CAT	2	6	658974	658979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653130
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14101	NC_021176	GCTGA	2	10	659079	659088	20 %	20 %	40 %	20 %	488653130
14102	NC_021176	GGAT	2	8	659122	659129	25 %	25 %	50 %	0 %	488653130
14103	NC_021176	CAG	2	6	659175	659180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653130
14104	NC_021176	CGA	2	6	659308	659313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653130
14105	NC_021176	GGCG	2	8	659453	659460	0 %	0 %	75 %	25 %	488653130
14106	NC_021176	A	7	7	659509	659515	100 %	0 %	0 %	0 %	488653130
14107	NC_021176	TAG	2	6	659533	659538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_021176	TCA	2	6	659620	659625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_021176	GTT	2	6	659632	659637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_021176	TAA	2	6	659680	659685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653131
14111	NC_021176	CTTC	2	8	659696	659703	0 %	50 %	0 %	50 %	488653131
14112	NC_021176	CGG	2	6	659707	659712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653131
14113	NC_021176	AAC	2	6	659903	659908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653131
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14115	NC_021176	TTC	2	6	659965	659970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653131
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14119	NC_021176	ATAC	2	8	660052	660059	50 %	25 %	0 %	25 %	488653131
14120	NC_021176	AAT	2	6	660115	660120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653131
14121	NC_021176	GAT	2	6	660162	660167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653131
14122	NC_021176	GCAGGC	2	12	660202	660213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488653131
14123	NC_021176	T	7	7	660254	660260	0 %	100 %	0 %	0 %	488653131
14124	NC_021176	CG	3	6	660304	660309	0 %	0 %	50 %	50 %	488653131
14125	NC_021176	CGG	3	9	660333	660341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653131
14126	NC_021176	ACG	2	6	660358	660363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653131
14127	NC_021176	CTC	3	9	660391	660399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488653131
14128	NC_021176	CGG	2	6	660423	660428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653131
14129	NC_021176	CCG	2	6	660467	660472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653131
14130	NC_021176	TAA	2	6	660558	660563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_021176	TGAGC	2	10	660632	660641	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14132	NC_021176	TGCG	2	8	660648	660655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14133	NC_021176	GAAA	2	8	660680	660687	75 %	0 %	25 %	0 %	488653132
14134	NC_021176	TAT	2	6	660731	660736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653132
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14136	NC_021176	T	6	6	660745	660750	0 %	100 %	0 %	0 %	488653132
14137	NC_021176	TTA	2	6	660765	660770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653132
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14139	NC_021176	CT	3	6	660912	660917	0 %	50 %	0 %	50 %	488653132
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14147	NC_021176	GGC	3	9	661397	661405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653132
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14157	NC_021176	ATG	2	6	661731	661736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653132
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14163	NC_021176	CAG	2	6	662056	662061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653133
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14166	NC_021176	TCG	2	6	662146	662151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653134
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14227	NC_021176	GCT	2	6	665202	665207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653135
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14231	NC_021176	GCGG	2	8	665351	665358	0 %	0 %	75 %	25 %	488653135
14232	NC_021176	GA	3	6	665439	665444	50 %	0 %	50 %	0 %	488653135
14233	NC_021176	GCG	2	6	665453	665458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653135
14234	NC_021176	CAT	2	6	665499	665504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653135
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14236	NC_021176	CAG	2	6	665635	665640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653135
14237	NC_021176	GAAA	2	8	665681	665688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14238	NC_021176	C	7	7	665694	665700	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14239	NC_021176	TA	4	8	665746	665753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14240	NC_021176	TAG	2	6	665794	665799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14242	NC_021176	A	7	7	665910	665916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14488	NC_021176	GCT	2	6	677218	677223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653142
14489	NC_021176	TGC	2	6	677235	677240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653142
14490	NC_021176	CTT	2	6	677248	677253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653142
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